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本特定領域発足に際して、第一回の領域全体班会議および総括班会議を平成19年9月14日に京都で開催した。領域全体班会議では、すべての計画研究者が会合し、本領域で遂行予定の研究内容についての英語でのプレゼンテーションに基づき、活発な議論を行った。総括班会議では、今後の領域運営についての議論を行い、ウェブサイトでのホームページによる広報活動を進めること、各年度内に、計画研究者および関連領域の国外研究者招聘により、公開国際シンポジウムを開催することを決定した。この決定に基づき、ただちに日本免疫学会ホームページにリンクした特定領域研究「免疫系自己」のホームページを立ち上げ、さらに平成21年2月20日に京都で「Immunological Self」のタイトルで公開国際シンポジウムを英語を公用語として開催した。同シンポジウムには、米国、フランス、オランダおよびベルギーから5名の関連領域で著名な国外研究者がスピーカーとして参加し、のべ約100名の参加者とともに、活発な議論が展開された。会議後の懇親会では、参加者と国外研究者の間で自由な討議が活発に行われた。後日、参加した国外研究者から、きわめてレベルの高い有意義なシンポジウムであったとの手紙をいただいている。また、同日総括班会議を行い、今年度より開始された公募研究や、今後の領域運営についての議論を行った。
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