揺らぎが機能を決める生命分子の科学の研究に関する総括

2012 年度 研究成果報告書

• 研究領域: 揺らぎが機能を決める生命分子の科学
• 研究課題/領域番号: 20107001
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 理工系
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 寺嶋 正秀 京都大学, 大学院・理学研究科, 教授 (00188674)
• 研究分担者: 片岡 幹雄 奈良先端科学技術大学院大学, 物質創成科学研究科 (30150254) ; 上岡 龍一 崇城大学, 生物生命学部, 教授 (70099076) ; 岡本 祐幸 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70185487) ; 加藤 晃一 大学共同利用機関法人自然科学研究機構, 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 教授 (20211849) ; 芳坂 貴弘 北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 教授 (30263619) ; 平田 文男 分子科学研究所, 理論・計算分子科学研究領域, 教授 (90218785) ; 桑島 邦博 大学共同利用機関法人自然科学研究機構, 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 教授 (70091444)
• 研究期間 (年度): 2008-11-13 – 2014-03-31
• キーワード: 揺らぎ / 生体分子 / 反応 / 機能

研究概要

(1) ホームページを作成し、情報交換システムにより研究進展をリアルタイムで把握し、協力研究を推進する提言を行った。 (2) ニュースレターを毎月発行し、班員の活動報告、業績報告、シンポジウム報告、受賞報告などを、広く知らしめる活動を実施した。(3) 総括班会議を開催し、新学術領域研究の運営と方針について話し合った。(4) 公開シンポジウムを開催し、これからの領域としての計画と公募について多くの分野の研究者に周知した。(5) 公開国際シンポジウムを開催し、外国人評価員のMiller教授を含めて、合同総括班会議を行い、来年度の予定について議論した。(6) 公募班メンバーを加えた合同班会議を開催した。 (7)各種の学会において揺らぎに関するシンポジウムを行った。 (8)揺らぎの啓蒙活動を行った。

研究成果

• [雑誌論文] The molten globule of β(2)-microglobulin accumulated at pH 4 and its role in protein folding (2013)
  • 著者名/発表者名: A. Mukaiyama, T. Nakamura, K. Makabe, K. Maki, Y. Goto, K. Kuwajima
  • 雑誌名: J. Mol. Biol. 巻: 425 ページ: 273-291
  • DOI: DOI:10.1016/j.jmb.2012.11.002
  • 査読あり
• [雑誌論文] Time-Resolved Tracking of Interprotein Signal Transduction: Synechocystis PixD-PixE complex as a Sensor of Light Intensity (2012)
  • 著者名/発表者名: K. Tanaka, Y. Nakasone, K. Okajima, M. Ikeuchi, S. Tokutomi, M. Terazima
  • 雑誌名: J.Am.Chem.Soc 巻: 134 ページ: 8336-8339
  • DOI: DOI:10.1021/ja301540r
  • 査読あり
• [雑誌論文] temperature and pressure dependence of complex systems (2012)
  • 著者名/発表者名: Generalized-ensemble algorithms for studying Y. Mori, Y. Okamoto
  • 雑誌名: Molecular Simulation 巻: 38 ページ: 452-457
  • DOI: DOI:10.1080/08927022.2011.651139
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protein encapsulation within synthetic molecular hosts (2012)
  • 著者名/発表者名: D. Fujita, M. Yagi-Utsumi, Y. Yamaguchi, Takashi Kumasaka, Masaki Takata, M. Noda, S. Uchiyama, K.Kato, M. Fujita et al.
  • 雑誌名: Nature Commun 巻: 3 ページ: 1093-
  • DOI: DOI:10.1038/ncomms2093
  • 査読あり
• [雑誌論文] Watching a signaling protein function in real time via 100-ps time-resolved Laue crystallography (2012)
  • 著者名/発表者名: F. Schotte, H. Sun Cho, V. R. I. Kaila, H. Kamikubo, N. Dashdorj, E. R. Henry, T. J. Graber, M. Kataoka, P. A. Anfinrud
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 109 ページ: 19256-19261
  • DOI: DOI:10.1073/pnas.1210938109
  • 査読あり
• [雑誌論文] Selective accumulation and growth inhibition of hybrid liposomes to human hepatocellular carcinoma cells in relation to fluidity of plasma membranes (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Komizu, H. Ueoka, R. Ueoka, Biochem
  • 雑誌名: Biophys. Res. Commun 巻: 418 ページ: 81-86
  • DOI: DOI:10.1016/j.bbrc.2011.12.134
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solvent and Salt Effects on Structural Stability of Human Telomere (2011)
  • 著者名/発表者名: Y. Maruyama, T. Matsushita, R. Ueoka, F. Hirata
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B 巻: 115 ページ: 2408-2416
  • DOI: DOI:10.1021/jp1096019
  • 査読あり
• [雑誌論文] Position-specific incorporation of fluorescent non-natural amino acids into maltose-binding protein for detection of ligand binding by FRET and fluorescence quenching (2009)
  • 著者名/発表者名: I. Iijima, T. Hohsaka
  • 雑誌名: Chem Bio Chem 巻: 10 ページ: 999-1006
  • DOI: DOI:10.1002/cbic.200800703
  • 査読あり
• [学会発表] Molecular mechanisms of cytotoxicity of HAMLET and other protein-oleic acid complexes (2012)
  • 著者名/発表者名: K. Kuwajima
  • 学会等名: 12th KIAS Conference on Protein Structure
  • 発表場所: Seoul, Korea
  • 年月日: 20121011-13
• [学会発表] Ligand Binding by Protein Probed with the 3D-RISM Microscope (2012)
  • 著者名/発表者名: F. Hirata
  • 学会等名: The ACS Symposium on "Continuum Solvation Modeling in Biological Systems
  • 発表場所: Philadelphia, USA
  • 年月日: 20120819-23
• [学会発表] Membrane-Targeted Nanotherapy with Hybrid Liposomes for Cancer Cells Leading to Apoptosis (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Matsumoto, R. Ueoka
  • 学会等名: The International Conference on Statistical Mechanics of Liquids: From Water to Biomolecules
  • 発表場所: 岡崎,日本
  • 年月日: 20120212-14
• [学会発表] Generalized-ensemble algorithms for classical and quantum simulations (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Okamoto
  • 学会等名: International Workshop on Recent Advances in Computational and Theoretical Chemistry
  • 発表場所: Nagoya, Japan
  • 年月日: 2012-11-09
• [学会発表] Protein dynamics and hydration water (2012)
  • 著者名/発表者名: M. Kataoka
  • 学会等名: 10th International Conference on Quasielastic Neutron Scattering
  • 発表場所: Nikko, Japan
  • 年月日: 2012-10-04
• [学会発表] 非天然アミノ酸の導入によるタンパク質の部位特異的PEG化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 渡邉 貴嘉・山口 純・芳坂 貴弘
  • 学会等名: 第6回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 札幌, 日本
  • 年月日: 2012-09-06
• [学会発表] NMR analysis of specific carbohydrate-carbohydrate interaction between gangliosides (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Uekusa, S. Sonnino, K. Kato
  • 学会等名: 26 International Carbohydrate Symposium
  • 発表場所: Madrid, スペイン
  • 年月日: 2012-07-25
• [学会発表] A strange reaction of a photosensor protein: PixD (2011)
  • 著者名/発表者名: M.Terazima
  • 学会等名: Third Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences
  • 発表場所: Jeju, Korea
  • 年月日: 20110226-0301
• [図書] アミロイド蓄積開始機構の解明と治療薬開発への展開 (2012)
  • 著者名/発表者名: 柳澤勝彦, 松崎勝巳, 加藤晃一
  • 総ページ数: 138-158
  • 出版者: 最新医学, 67
• [図書] Protein dynamics studied by neutron incoherent scattering (2011)
  • 著者名/発表者名: M. Kataoka, H.Nakagawa
  • 総ページ数: 517-538
  • 出版者: Neutrons in Soft Matter
• [図書] 揺らぎと生体機能総論, メディカルバイオ別冊 (2010)
  • 著者名/発表者名: 寺嶋正秀、揺らぎと生体機能、寺嶋正秀監修
  • 総ページ数: 6-9
  • 出版者: オーム社
• [図書] 人工タンパク質の合成と応用, 超分子サイエンス&テクノロジー (2009)
  • 著者名/発表者名: 芳坂貴弘
  • 総ページ数: 890-895
  • 出版者: エヌティーエス
• [備考]
  • URL: http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/hikari/yuragi/
• [産業財産権] 焼酎蒸留粕からのエタノール抽出残さ、エタノール抽出物及びそれらの製造方法 (2012)
  • 発明者名: 上岡龍一、家藤治幸、廣瀬茂
  • 権利者名: 上岡龍一、家藤治幸、廣瀬茂
  • 産業財産権番号: 特許、特許4071062
  • 取得年月日: 2012-06-29
• [産業財産権] 残余双極子相互作用の解析法及び残余双極子相互作用解析用試薬 (2009)
  • 発明者名: 藤田誠、佐藤宗太、諸原理、加藤晃一、山口芳樹
  • 権利者名: 藤田誠、佐藤宗太、諸原理、加藤晃一、山口芳樹
  • 産業財産権番号: 特許、特願2009-057080
  • 出願年月日: 2009-03-10