「細胞内ロジスティクス:病態の理解に向けた細胞内物流システムの融合研究」の運営

2008 年度 実績報告書

• 研究領域: 細胞内ロジスティクス：病態の理解に向けた細胞内物流システムの融合研究
• 研究課題/領域番号: 20113001
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 吉森 保 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (60191649)
• キーワード: オルガネラ / メンブレントラフィック / 細胞内ロジスティクス / 病態の理解 / 情報科学 / ケミカルバイオロジー / 融合研究 / 高次生体システム

研究概要

細胞内の多くのオルガネラや細胞膜を膜ダイナミクスによって結ぶ物流ネットワーク・メンブレントラフィックの実態は、単なる物質運搬ではなく、経済用語のロジスティクス、すなわち「原材料の調達から製品消費までのものの流れの総合的なマネジメント」により近い。この細胞内ロジスティクスは個々の細胞の生存のみならず神経、内分泌、免疫などの高次生体システムをも担い、その障害や破綻は疾患の原因となる。本領域ではその根底にある分子基盤の解明による病態の理解を目指し、分子細胞生物学的なアプローチと共に情報科学・工学及びケミカルバイオロジーとの融合研究を展開する。本研究(総括班)は、融合研究である本領域が的確に推進され、大きな成果を挙げられるような体制を整える役割を担う。今年度は以下の活動を行った。
まず第1回総括班会議を開催し、毎年行う全体班会議の責任者の決定や、融合研究推進の具体策の検討を行った。また、ケミカルバイオロジーとの融合研究として実施する、各計画班が対象とする物流経路に影響を及ぼす化合物の網羅的探索のため、多検体の生細胞を自動で培養・ライブ蛍光観察・記録するBioStationCT(ニコン)を購入し、本領域の融合研究・研究支援の中核である牧野内、清水両計画研究代表者が所属する理化学研究所和光キャンパスに設置した。それを用いた解析に必要な消耗品類も購入した。さらか、平成20年度に終了した特定領域「メンブレントラフィック」と共催で公開シンポジウムを実施し、127名が参加し活発な討論が行われた。

研究成果

• [雑誌論文] Effect of Helicobacter pylori's vacuolating cytotoxin on the autophagy pathway in gastric epithelial cells (2009)
  • 著者名/発表者名: Terebiznik MR, Raju D, Vazquez CL, Torbricki K, Kulkarni R, Blanke SR, Yoshimori T, Colombo MI, Jones NL.
  • 雑誌名: Autophagy Apr 19 ; 5(3)(Epub ahead of print)
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Atg16L Complex Specifies the Site of LC3 Lipidation for Membrane Biogenesis in Autophagy (2008)
  • 著者名/発表者名: Fujita N, Itoh T, Fukuda M, Noda T, Yoshimori T.
  • 雑誌名: Mol Biol Cell 19 ページ: 2092-2100
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dynein-dependent Movement of Autophagosomes Mediates Efficient Encounters with Lysosomes (2008)
  • 著者名/発表者名: Kimura S, Noda T, Yoshimori T.
  • 雑誌名: Cell Struct Funct 33 ページ: 109-122
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional Analysis of α5β1 Integrin and Lipid Rafts in Invasion of Epithelial Cells by Porphyromonas gingivalis using Fluorescent Beads Coated with Bacterial Membrane Vesicle (2008)
  • 著者名/発表者名: Tsuda K, Furuta N, Inaba H, Kawai S, Hanada K, Yoshimori T, Amano A.
  • 雑誌名: Cell Struct Funct 33 ページ: 123-132
  • 査読あり
• [雑誌論文] Golgi-resident small GTPase Rab33B interacts with Atg16L and modulates autophagosome formation (2008)
  • 著者名/発表者名: Itoh T, Fujita N, Kanno E, Yamamoto A, Yoshimori T, Fukuda M.
  • 雑誌名: Mol. Biol Cell 19 ページ: 2916-2925
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ubc4/5 and c-Cb1 Continue to Ubiquitinate EGF Receptor after Intemalization to Facilitate Polyubiquitination and Degradation (2008)
  • 著者名/発表者名: Umebayashi K, Stenmark H, Yoshimori T.
  • 雑誌名: Mol Biol Cell 19 ページ: 3454-3462
  • 査読あり
• [雑誌論文] Autophagic control of listeria through intracellular innate immune recognition in drosophila (2008)
  • 著者名/発表者名: Yano T, Mita S, Ohmori H, Oshima Y, Fujimoto Y, Ueda R, Takada H, Goldman WE, Fukase K, Silverman N, Yoshimori T, Kurata S.
  • 雑誌名: Nat Immunol 9 ページ: 908-916
  • 査読あり
• [雑誌論文] An Atg4B Mutant Hampers the Lipidation of LC3 Paralogues and Causes Defects in Autophagosome Closure (2008)
  • 著者名/発表者名: Fujita N, Hayashi M, Fukumoto H, Omori H, Yamamoto A, Noda T, Yoshimori T.
  • 雑誌名: Mol Biol Cell 19 ページ: 14651-4659
  • 査読あり
• [雑誌論文] DAP-kinase is a mediator of endoplasmic reticulum stress-induced caspase activation and autophagic cell death (2008)
  • 著者名/発表者名: Gozuacik D, Bialik S, Raveh T, Mitou G, Shohat G, Sabanay H, Mizushima N, Yoshimori T, Kimchi A.
  • 雑誌名: Cell Death Differ 15 ページ: 1875-1886
  • 査読あり
• [雑誌論文] Loss of the autophagy protein Atg16L1 enhances endotoxin-induced IL-1 beta production (2008)
  • 著者名/発表者名: Saitoh T, Fujita N, Jang MH, Uematsu S, Yang BG, Satoh T, Omori H, Noda T, Yamamoto N, Komatsu M, Tanaka K, Kawai T, Tsujimura T, Takeuchi O, Yoshimori T, Akira S.(*These authors contributed equally to this work.)
  • 雑誌名: Nature 456 ページ: 1264-268
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nucleotide-Dependent Conformational Changes and Assembly of the AAA ATPase SKD1/VPS4B (2008)
  • 著者名/発表者名: Inoue M, Kamikubo H, Kataoka M, Kato R, Yoshimori T, Wakatsuki S, Kawasaki M.
  • 雑誌名: Traffic 9 ページ: 2180-2189
  • 査読あり
• [学会発表] 分解系ロジスティクスの疾患における役割と作動機構 (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉森保
  • 学会等名: 特定領域研究「トラフィック」終了・新学術領域研究「ロジスティクス」発足合同シンポジウム
  • 発表場所: 航空会館(東京)
  • 年月日: 2009-01-29
• [学会発表] Autophagy as a Cellular Defense System against Pathogens and Unfolding Proteins (2008)
  • 著者名/発表者名: Tamotsu Yoshimori
  • 学会等名: BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)Symposium 3S3 : Intracellular Logistics : Approach to Pathophy siology of Membrane Traffic
  • 発表場所: 神戸ポーピアホテル
  • 年月日: 20081209-12
• [学会発表] Molecular Machinery of Autophagy and Its Role in Diseases (2008)
  • 著者名/発表者名: Tamotsu Yoshimori
  • 学会等名: 11th Western Pacific Cingress on Chemotherapy and Infectious Diseases, Symposium 9 : Invasive Group A Streptococcal Infections
  • 発表場所: Taipei, Taiwan
  • 年月日: 20081129-1203
• [学会発表] Mechanistic Insight into Membrane Dynamics in Mammalian Autophagy (2008)
  • 著者名/発表者名: Tamotsu Yoshimori
  • 学会等名: Center for the Study of Inflammatory Bowel Disease 18th Annual Workshop on Autophagy in Immunity
  • 発表場所: Boston, USA
  • 年月日: 20081114-15
• [学会発表] Autophagy : Molecular Machinery and Role in Cellular Defense (2008)
  • 著者名/発表者名: Tamotsu Yoshimori
  • 学会等名: Korean Society of Medical Biochemistry and Molecular Biology Annual International Conference : In Commemoration of the 60th KSMBMB Anniversary, Symposium SY17 : Autophagy and Human Diseases
  • 発表場所: Seoul, Korea
  • 年月日: 20081029-31
• [学会発表] 細胞内自己消化システム・オートファジーによる生体防御 (2008)
  • 著者名/発表者名: 吉森保
  • 学会等名: 日本細菌学会関東支部総会特別講演
  • 発表場所: 生命の森リゾート(千葉)
  • 年月日: 2008-10-24
• [図書] Methods Enzymol. 452 (2009)
  • 著者名/発表者名: Kimura S, Fujita N, Noda T, Yoshimori T.
  • 総ページ数: 1-12
  • 出版者: Academic Press
• [図書] 分子細胞生物学辞典(第2版) (2008)
  • 著者名/発表者名: 吉森保
  • 総ページ数: 173-175
  • 出版者: (株)東京化学同人
• [備考]
  • URL: http://www.biken.osaka-u.ac.jp/act/act_yoshimor.php