遺伝情報収納・発現・継承の時空間場

2012 年度 研究成果報告書

• 研究領域: 遺伝情報収納・発現・継承の時空間場
• 研究課題/領域番号: 20114001
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 平岡 泰 大阪大学, 生命機能研究科, 教授 (10359078)
• 連携研究者: 大山 隆 早稲田大学, 教育・総合科学学術院, 教授 (60268513) ; 徳永 万喜洋 東京工業大学, 生命理工学研究科, 教授 (00192659) ; 胡桃坂 仁志 早稲田大学, 理工学術院, 教授 (80300870) ; 小布施 力史 北海道大学, 先端生命科学研究院, 教授 (00273855) ; 末盛 博文 京都大学, 再生医科学研究所, 准教授 (90261198) ; 木村 暁 国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 准教授 (10365447)
• 研究期間 (年度): 2008-11-13 – 2014-03-31
• キーワード: 分子細胞生物学

研究概要

総括班として行う本研究課題は、研究領域全体が円滑に推進するように、領域班会議や異分野融合勉強会を行い、領域内の連携に努めた。関連分野の国際シンポジウムを開催し、研究分野を活性化した。ホームページの公開やニュースレターの発行を通して、領域で得られた成果や関連する分野の最新情報を、研究者や国民に広く発信した。また、技術講習会や研究会などの開催を通して、若手研究者の育成を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Human inactive X chromosome is compacted through a PRC2-independent SMCHD1-HBiX1 pathway (2013)
  • 著者名/発表者名: Nozawa RS, Nagao K, Igami K, Shibata S, Shirai N, Nozaki N, Sado T, Kimura H, and Obuse C
  • 雑誌名: Nat. Struct. Mol. Biol 巻: 20 ページ: 566-573
  • DOI: doi: 10.1038/nsmb.2532.
  • 査読あり
• [雑誌論文] A co-localization model of paired ChIP-seq data using a large ENCODE data set enables comparison of multiple samples (2013)
  • 著者名/発表者名: Maehara K, Odawara J, Harada A, Yoshimi T, Nagao K, Obuse C, Akashi K, Tachibana T, Sakata T, and Ohkawa Y
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 41 ページ: 54-62
  • DOI: doi:10.1093/nar/gks1010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Vertebrate Spt2 is a novel nucleolar histone chaperone that assists in ribosomal DNA transcription (2013)
  • 著者名/発表者名: Osakabe A, Tachiwana H, Takaku M, Hori T, Obuse C, Kimura H, Fukagawa T, Kurumizaka H
  • 雑誌名: J. Cell Sci 巻: 126 ページ: 1323-1332
  • DOI: doi:10.1242/jcs.112623
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nap1 regulates proper CENP-B binding to nucleosomes (2013)
  • 著者名/発表者名: Tachiwana H, Miya Y, Shono N, Ohzeki J, Osakabe A, Otake K, Larionov V, Earnshaw WC, Kimura H, Masumoto H, Kurumizaka H
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 5 ページ: 2869-2880
  • DOI: doi:10.1093/nar/gks1464
  • 査読あり
• [雑誌論文] Human PSF concentrates DNA and stimulates duplex capture in DMC1-mediated homologous pairing (2012)
  • 著者名/発表者名: Morozumi Y, Ino R, Takaku M, Hosokawa M, Chuma S, Kurumizaka H
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 40 ページ: 3031-3041
  • DOI: doi:10.1093/nar/gkr1229
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meiosis-specific non-coding RNA mediates robust pairing of homologous chromosomes in meiosis (2012)
  • 著者名/発表者名: Ding D-Q, Okamasa K, Yamane M, Tsutsumi C, Haraguchi T, Yamamoto M, and Hiraoka Y
  • 雑誌名: Science 巻: 336 ページ: 732-736
  • DOI: doi:10.1126/science.1219518
  • 査読あり
• [雑誌論文] Lamin B receptor recognizes specific modifications of histone H4 in heterochromatin formation (2012)
  • 著者名/発表者名: Hirano Y, Hizume K, Kimura H, Takeyasu K, Haraguchi T, Hiraoka Y
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 287 ページ: 42654-42663
  • DOI: doi:10.1074/jbc.M112.397950
  • 査読あり
• [雑誌論文] Histone chaperone activity of Fanconi anemia proteins, FANCD2 and FANCI, is required for DNA crosslink repair (2012)
  • 著者名/発表者名: Sato K, Ishiai M, Toda K, Furukoshi S, Osakabe A, Tachiwana H, Takizawa Y, Kagawa W, Kitao H, Dohmae N, Obuse C, Kimura H, Takata M, Kurumizaka H
  • 雑誌名: EMBO J 巻: 31 ページ: 3524-3536
  • DOI: doi:10.1038/emboj.2012.197
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chd2 interacts with H3.3 to determine myogenic cell fate (2012)
  • 著者名/発表者名: Harada A, Okada S, Konno D, Odawara J, Yoshimi T, Yoshimura S, Kumamaru H, Saiwai H, Tsubota T, Kurumizaka H, Akashi K, Tachibana T, Imbalzano AN, Ohkawa Y
  • 雑誌名: EMBO J 巻: 31 ページ: 2994-3007
  • DOI: doi:10.1038/emboj.2012.136
  • 査読あり
• [雑誌論文] Halenaquinone, a chemical compound that specifically inhibits the secondary DNA binding of RAD51 (2011)
  • 著者名/発表者名: Takaku M, Kainuma T, Ishida-Takaku T, Ishigami S, Suzuki H, Tashiro S, van Soest RWM, Nakao Y, Kurumizaka H
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 6 ページ: 427-436
  • DOI: doi:10.1111/j.1365-2443.2011.01494.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structures of human nucleosomes containing major histone H3 variants (2011)
  • 著者名/発表者名: Tachiwana H, Osakabe A, Shiga T, Miya Y, Kimura H, Kagawa W, Kurumizaka H
  • 雑誌名: Acta Cryst 巻: D67 ページ: 578-583
  • DOI: doi:10.1107/S0907444911014818
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inner nuclear membrane protein Ima1 is dispensable for intranuclear positioning of centromeres (2011)
  • 著者名/発表者名: Hiraoka Y, Maekawa H, Asakawa H, Chikashige Y, Kojidani T, Osakada H, Matsuda A, Haraguchi T
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 16 ページ: 1000-1011
  • DOI: doi:10.1111/j.1365-2443.2011.01544.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] The involvement of SLX4 in interstrand cross-link repair is regulated by the Fanconi anemia pathway (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto KN, Kobayashi S, Tsuda M, Kurumizaka H, Takata M, Kono K, Jiricny J, Takeda S, Hirota K
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 108 ページ: 6492-6496
  • DOI: doi:10.1073/pnas.1018487108
  • 査読あり
• [雑誌論文] Physical breakdown of the nuclear envelope is not necessary for breaking its barrier function (2011)
  • 著者名/発表者名: Asakawa H, Hiraoka Y, Haraguchi T
  • 雑誌名: Nucleus 巻: 2 ページ: 523-526
  • DOI: doi:10.4161/nucl.2.6.16117
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the human centromeric nucleosome containing CENP-A (2011)
  • 著者名/発表者名: Tachiwana H, Kagawa W, Shiga T, Osakabe A, Miya Y, Saito K, Hayashi-Takanaka Y, Oda T, Sato M, Park S-Y, Kimura H, Kurumizaka H
  • 雑誌名: Nature 巻: 476 ページ: 232-235
  • DOI: doi:10.1038/nature10258
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tracking epigenetic histone modifications in single cells using Fab-based live endogenous modification labeling (2011)
  • 著者名/発表者名: Hayashi-Takanaka Y, Yamagata K, Wakayama T, Stasevich TJ, Kainuma T, Tsurimoto T, Tachibana M, Shinkai Y, Kurumizaka H, Nozaki N, and Kimura H
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 39 ページ: 6475-6488
  • DOI: doi:10.1093/nar/gkr343
  • 査読あり
• [雑誌論文] Human POGZ modulates dissociation of HP1alpha from mitotic chromosome arms through Aurora B activation (2010)
  • 著者名/発表者名: Nozawa R, Nagao K, Masuda H, Iwasaki O, Hirota T, Nozaki N, Kimura H. and Obuse C
  • 雑誌名: Nat. Cell Biol 巻: 12 ページ: 719-727
  • DOI: doi:10.1038/ncb2075
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis of instability of the nucleosome containing a testis-specific histone variant, human H3T (2010)
  • 著者名/発表者名: Tachiwana H, Kagawa W, Osakabe A, Kawaguchi K, Shiga T, Hayashi -Takanaka Y, Kimura H, and Kurumizaka H
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 107 ページ: 10454-10459
  • DOI: doi:10.1073/pnas.1003064107
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nucleosome formation activity of human sNASP (2010)
  • 著者名/発表者名: Osakabe A, Tachiwana H, Matsunaga T, Shiga T, Nozawa R, Obuse C, and Kurumizaka H
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 285 ページ: 11913-11921
  • DOI: doi:10.1074/jbc.M109.083238
  • 査読あり
• [雑誌論文] The putative nuclear localization signal of the human RAD52 protein is a potential sumoylation site (2010)
  • 著者名/発表者名: Saito K, Kagawa W, Suzuki T, Suzuki H, Yokoyama S, Saitoh H, Tashiro S, Dohmae N, and Kurumizaka H
  • 雑誌名: J. Biochem 巻: 147 ページ: 833-842
  • DOI: doi:10.1093/jb/mvq020
  • 査読あり
• [雑誌論文] GEMIN2 promotes accumulation of RAD51 at double-strand breaks in homologous recombination (2010)
  • 著者名/発表者名: Takizawa Y, Qing Y, Takaku M, Ishida T, Morozumi Y, Tsujita T, Kogame T, Hirota K, Takahashi M, Shibata T, Kurumizaka H, and Takeda S
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 38 ページ: 5059-5074
  • DOI: doi:10.1093/nar/gkq271
  • 査読あり
• [雑誌論文] Highly efficient chromatin transcription induced by superhelically curved DNA segments: the underlying mechanism revealed by a yeast system (2010)
  • 著者名/発表者名: Tanase J, Morohashi N, Fujita M, Nishikawa J, Shimizu M, and Ohyama T
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 49 ページ: 2351-2358
  • DOI: doi:10.1021/bi901950w
  • 査読あり
• [雑誌論文] Membrane proteins Bqt3 and Bqt4 anchor telomeres to the nuclear envelope to ensure chromosomal bouquet formation (2009)
  • 著者名/発表者名: Chikashige Y, Yamane M, Okamasa K, Tsutsumi C, Kojidani T, Sato M, Haraguchi T, Hiraoka Y
  • 雑誌名: J. Cell Biol 巻: 187 ページ: 413-427
  • DOI: doi:10.1083/jcb.200902122
  • 査読あり
• [雑誌論文] The SUN rises on meiotic chromosome dynamics (2009)
  • 著者名/発表者名: Hiraoka Y, and Dernburg A
  • 雑誌名: Dev. Cell 巻: 17 ページ: 598-605
  • DOI: doi:10.1016/j.devcel.2009.10.014
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cell-size-dependent spindle elongation in the Caenorhabditis elegans early embryo (2009)
  • 著者名/発表者名: Hara Y, and Kimura A
  • 雑誌名: Curr. Biol 巻: 19 ページ: 1549-1554
  • DOI: doi:10.1016/j.cub.2009.07.050
  • 査読あり
• [雑誌論文] Positions of pluripotency genes and hepatocyte-specific genes in the nucleus before and after mouse ES cell differentiation
  • 著者名/発表者名: Udagawa K, and Ohyama T
  • 雑誌名: Genet. Mol. Res 巻: (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] Dynamics of proteins in the nucleus by single molecule analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: Tokunaga M, Sakata-Sogawa K
  • 学会等名: International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: Awaji, Hyogo, Japan, Awaji Yumebutai International Conference Cemter, Japan
  • 年月日: 20110124-26
• [学会発表] The Cell Nucleus: A Physicochemical Field for Genetic Activities of the Chromosome (2011)
  • 著者名/発表者名: Hiraoka Y, Chikashige Y, Haraguchi T
  • 学会等名: International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: Awaji Yumebutai International Conference Cemter, Japan
  • 年月日: 2011-01-26
• [学会発表] Atomic Resolution Structures of the Human Nucleosomes Containing Histone Variants (2011)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka H
  • 学会等名: International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: Awaji Yumebutai International Conference Cemter, Japan
  • 年月日: 2011-01-25
• [学会発表] Proteomic Approach Identification and Characterization Hetereochromatic HP1-binding Proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: Obuse C
  • 学会等名: International Symposium Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: Awaji Yumebutai International Conference Cemter, Japan
  • 年月日: 2011-01-25
• [学会発表] Changes Expression Of Chromatin Modification Factors During The Early Embryonic Germ Layer Determination (2011)
  • 著者名/発表者名: Suemori H
  • 学会等名: International Symposium Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: Awaji Yumebutai International Conference Cemter, Japan
  • 年月日: 2011-01-25
• [学会発表] Structure of yeast interphase chromosomes and the genome folding principle (2011)
  • 著者名/発表者名: Ohyama T, Kimura H, Nishikawa J, Shimooka Y, Arakawa J, Seki M, Miura O, Sugiyama S, Yamada S
  • 学会等名: International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: Awaji Yumebutai International Conference Cemter, Japan
  • 年月日: 2011-01-24
• [学会発表] Size-dependency/independency in the spatial organization of the cell: nuclear positioning and chromosome dynamics in C. elegans embryos (2011)
  • 著者名/発表者名: Kimura A
  • 学会等名: International Symposium Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: Awaji Yumebutai International Conference Center, Japan
  • 年月日: 2011-01-24
• [図書] 遺伝情報の時空間場の理解に向けて. 実験医学 増刊 細胞核-遺伝情報制御と疾患 (2009)
  • 著者名/発表者名: 平岡 泰
  • 総ページ数: 27,.2708-2714
  • 出版者: 羊土社
• [備考]
  • URL: http://www.genofield.osaka-u.ac.jp/pfga_index.html
• [備考] (1)平岡泰(1)産経新聞朝刊1面電子透かし(東日本管内)、2012年5月16日「遺伝情報組み換えメカニズムの解明に大きな前進」 MSNトピックス(電子版):以下に同様の報道神戸新聞2012年5月11日、日刊工業新聞2012年5月11日、日経産業新聞2012年5月11日、科学新聞2012年5月18日
• [備考] (2)胡桃坂仁志(1)日本経済新聞、2010年5月25日「不妊・がん関与?変異体 早大 たんぱく質構造解明」:以下に同様の報道日刊工業新聞2010年5月25日、化学工業日報2010年5月26日、日経産業新聞2010年5月27日、日刊工業新聞2010年5月28日、科学新聞2010年6月4日
• [備考] (2)胡桃坂仁志(2)日本経済新聞、2011年7月13日「ヒト染色体の中心構造を詳細に解明 早大教授ら」:以下に同様の報道日経産業新聞2011年7月12日、化学工業日報2010年7月11日
• [備考] (2)胡桃坂仁志(3)日刊工業新聞、2012年7月25日「がん化抑制因子特定 遺伝子の修復機能解明 早大」:以下に同様の報道化学工業日報、2012年7月25日
• [備考] (3)小布施力史(1)北海道医療新聞、 2010年7月2日「POGZがオーロラBを制御」
• [備考] (3)小布施力史(2)北海道新聞、2013年4月1日「(性染色体の仕組み解明 iPS細胞作製に期待):以下に同様の報道北海道医療新聞2013年4月5日
• [産業財産権] 顕微鏡システム (2010)
  • 発明者名: 宮脇成礼、徳永万喜洋、十川久美子、江部康平、堀博文
  • 権利者名: オリンパスソフトウェアテクノロジー(株)、東京大学、(独)理化学研究所
  • 産業財産権番号: 特許権、特願2010-145571
  • 出願年月日: 2010-06-25