翻訳速度調節機構を基盤としたパラメトリック生物学の創成の促進・発展

2022 年度 実績報告書

• 研究領域: 翻訳速度調節機構を基盤としたパラメトリック生物学の創成
• 研究課題/領域番号: 20H05782
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 土居 雅夫 京都大学, 薬学研究科, 教授 (20432578)
• 研究期間 (年度): 2020-10-02 – 2023-03-31
• キーワード: 翻訳 / パラメトリック制御

研究実績の概要

翻訳パラメトリック生物学の創成に向け、総括班として領域方針の策定・企画・評価を行った。特にA01班（土居、京大、翻訳速度制御を介した睡眠・代謝・体内時計のパラメトリック制御）、A02班（岩崎、理研、新規Disome-Seq法: パラメトリックなリボソーム渋滞の網羅的探索）、A03班（原田、阪大・細胞内局所パラメトリック翻訳における物理化学的調節機構）、A04班（池内、東大、柔軟な神経らしさを作り出すパラメトリック翻訳制御）の4班間で行う共同研究の支援を行った。コアメンバーによる月例会議の他、全体の領域会議を令和4年5月16日に領域アドバイザーの梅田眞郷京都大学名誉教授ならびに本間さと札幌花園病院睡眠医療センターセンター長の臨席のもと開催した。初年度発足させたParametric Translation Club（http://parametric-translation.pharm.kyoto-u.ac.jp/club.html）では領域外からの日本人研究者５名を交えた研究討論会を令和4年6月7日に開催した他、令和4年11月12日には海外からの研究者５名を招待してのシンポジウムを第32回Tokyo RNA clubとの共催にて行った。さらに、領域ホームページを利用して領域内の研究成果を広く対外的に発信するとともに（http://parametric-translation.pharm.kyoto-u.ac.jp/）、学術変革領域B「時計タンパク質学（吉種代表）」と本領域「パラメトリク翻訳」の共同企画シンポジウムとして、第12回都医学研シンポジウム(参加者179名)を令和5年3月8日に開催し領域内外での研究協力を推進した。このように、当初の総括班の計画を計画通りに推し進めることができた。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] Minimal upstream reading frame of Per2 mediates phase fitness of the circadian clock to day/night physiological body temperature rhythm (2023)
  • 著者名/発表者名: Miyake T, Inoue Y, Shao X, Seta T, Aoki Y, Nguyen Pham KT, Shichino Y, Sasaki J, Sasaki T, Ikawa M, Yamaguchi Y, Okamura H, Iwasaki S, Doi M
  • 雑誌名: Cell Rep 巻: 42 ページ: 112157
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112157
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] ニコチンアミドモノヌクレオチドを用いた加齢性ドライアイ治療へNicotinamide mononucleotide for the potential treatment of age-associated dry eye disease (2023)
  • 著者名/発表者名: 蕭穗文、土居雅夫
  • 雑誌名: MEDCHEM NEWS 巻: 33 ページ: 16-20
• [雑誌論文] イントラクライン機構の再活性化による加齢性ドライアイ軽減―NAD+とサーカディアンリズムが鍵― (2023)
  • 著者名/発表者名: 上原日佳梨、土居雅夫
  • 雑誌名: Geriatric Medicine（老年医学） 巻: 61 ページ: 35-38
• [雑誌論文] Optimising the method for visualising mouse meibomian gland using eyelid whole-mount lipid staining (2022)
  • 著者名/発表者名: Hamada Y, Sasaki L, Uehara H, Suzuki T, Kinoshita S, Otsuka K, Kihara A, Yamaguchi Y, Miyake T, Doi M
  • 雑誌名: Ocul. Surf 巻: 26 ページ: 268-270
  • DOI: 10.1016/j.jtos.2022.10.002
  • 査読あり
• [雑誌論文] The identification of novel small extracellular vesicle (sEV) production modulators using luciferase-based sEV quantification method (2022)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto A, Takahashi Y, Inuki S, Nakagawa S, Nakao K, Ohno H, Doi M, Takakura Y
  • 雑誌名: J. Extracell. Biol 巻: 1 ページ: e62
  • DOI: 10.1002/jex2.62
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Nmu/Nms/Gpr176 triple-deficient mice show enhanced light-resetting of circadian locomotor activity (2022)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi Y, Murai I, Takeda M, Doi S, Seta T, Hanada R, Kangawa K, Okamura H, Miyake T, Doi M
  • 雑誌名: Biol. Pharm. Bull 巻: 45 ページ: 1172-1179
  • DOI: 10.1248/bpb.b22-00260
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Circadian protection against bacterial skin infection by epidermal CXCL14-mediated innate immunity (2022)
  • 著者名/発表者名: Tsujihana K, Tanegashima K, Santo Y, Yamada H, Akazawa S, Nakao R, Tominaga K, Saito R, Nishito Y, Hata R, Nakamura T, Murai I, Kono Y, Sugawa M, Tanioka M, Egawa G, Doi M, Isa T, Kabashima K, Hara T, Okamura H
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 119 ページ: e2116027119
  • DOI: 10.1073/pnas.2116027119
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A light-induced small G-protein gem limits the circadian clock phase-shift magnitude by inhibiting voltage-dependent calcium channels. (2022)
  • 著者名/発表者名: Matsuo M, Seo K, Taruno A, Mizoro Y, Yamaguchi Y, Doi M, Nakao R, Kori H, Abe T, Ohmori H, Tominaga K, Okamura H
  • 雑誌名: Cell Rep 巻: 39 ページ: 110844
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110844
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] NAD+によるイントラクラインを介した加齢性ドライアイ軽減法 (2022)
  • 著者名/発表者名: 土居雅夫，佐々木玲奈, 濵田悠貴, 鑓水大介
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 40 ページ: 2168-2171
• [学会発表] Reactivation of circadian clock-regulated intracrine activity ameliorates meibomian gland dysfunction and its associated dry eye disease (2023)
  • 著者名/発表者名: Masao Doi
  • 学会等名: 第100回日本生理学会大会
• [学会発表] 体内時計のパラメトリック制御の理解に向けて (2023)
  • 著者名/発表者名: 土居雅夫
  • 学会等名: 2022年度文部科学省学術変革領域研究 学術研究支援基盤形成 先端モデル動物支援プラットフォーム成果発表会
• [学会発表] イントラクライン機構によるマイボーム腺局所ステロイド合成 (2023)
  • 著者名/発表者名: 鈴木智、佐々木玲奈、木下茂、土居雅夫
  • 学会等名: 角膜カンファ2023（第47回日本角膜学会総会, 第39回日本角膜移植学会）
• [学会発表] 翻訳速度調節機構を基盤としたパラメトリック生物学の創成へ (2023)
  • 著者名/発表者名: 土居雅夫
  • 学会等名: 第12回 都医学研シンポジウム
• [学会発表] 生理的な微小温度変化がもたらすmRNA翻訳速度調節を介した概日時計制御機構 (2023)
  • 著者名/発表者名: 三宅崇仁、井ノ上雄一、土居雅夫
  • 学会等名: 第12回 都医学研シンポジウム
• [学会発表] 神経分化における細胞内温度計測 (2023)
  • 著者名/発表者名: 原田慶恵
  • 学会等名: 第12回 都医学研シンポジウム
• [学会発表] 翻訳網羅解析 (2023)
  • 著者名/発表者名: 岩崎信太郎
  • 学会等名: 第12回 都医学研シンポジウム
• [学会発表] Circadian steroidogenesis and ageing-associated disease (2022)
  • 著者名/発表者名: Masao Doi
  • 学会等名: XVII EUROPEAN BIOLOGICAL RHYTHMS SOCIETY CONGRESS
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Circadian intracrine activity governs age-associated meibomian gland dysfunction and evaporative dry eye disease (2022)
  • 著者名/発表者名: Masao Doi
  • 学会等名: Sapporo Symposium on BIOLOGICAL RHYTHM 2022
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Nmu/Nms/Gpr176 triple-deficient mice show enhanced light-resetting of circadian locomotor activity (2022)
  • 著者名/発表者名: Shotaro Doi, Yoshiaki Yamaguchi, Masao Doi
  • 学会等名: Sapporo Symposium on BIOLOGICAL RHYTHM 2022
  • 国際学会
• [学会発表] Gpr19 is a circadian clock-controlled orphan GPCR with a role in modulating free-running period and light resetting capacity of the circadian clock (2022)
  • 著者名/発表者名: Huihua Zhou, Yoshiaki Yamaguchi, Masao Doi
  • 学会等名: Sapporo Symposium on BIOLOGICAL RHYTHM 2022
  • 国際学会
• [学会発表] Identification and functional characterization of N-linked glycosylation of the orphan G protein-coupled receptor Gpr176 (2022)
  • 著者名/発表者名: Kaho Tanaka, Tianyu Wang and Masao Doi
  • 学会等名: 第17回GPCR研究会
• [学会発表] イントラクライン機構の再活化による加齢性ドライアイ軽減―NAD+とサーカディアンリズムが鍵― (2022)
  • 著者名/発表者名: 土居雅夫
  • 学会等名: 2022年度生理学研究会臓器連関による生体恒常性維持機構と生体活動の統合的理解
• [学会発表] 微小な温度変化がもたらすmRNA翻訳速度調節と概日時計制御 (2022)
  • 著者名/発表者名: 三宅崇仁、井ノ上雄一、土居雅夫
  • 学会等名: 温熱生理学研究会2022
  • 招待講演
• [備考] 学術変革領域(B) パラメトリク翻訳
  • URL: http://parametric-translation.pharm.kyoto-u.ac.jp/index.html
• [備考] 京都大学大学院薬学研究科医薬創成情報科学専攻システムバイオロジー分野
  • URL: https://systems-biology.pharm.kyoto-u.ac.jp/