過渡的複合体が関わる生命現象の統合的理解－生理的準安定状態を捉える新技術－

2013 年度 実績報告書

• 研究領域: 過渡的複合体が関わる生命現象の統合的理解－生理的準安定状態を捉える新技術－
• 研究課題/領域番号: 21121001
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 嶋田 一夫 東京大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (70196476)
• 研究分担者: 神田 大輔 九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (80186618)
• 研究期間 (年度): 2009-07-23 – 2014-03-31
• キーワード: 構造生物学 / 核磁気共鳴法 / Ｘ線結晶構造解析 / 一分子計測学 / ケミカル・バイオロジ

研究概要

本年度の総括班は、引き続き領域内の共同研究の促進と成果の公開を目標に、以下の活動を行った。
全体班会議（2013年5月9-11日　於　リゾナーレ八ヶ岳）を開催し、領域参加者全員の研究成果を共有するとともに、共同研究を促進した。また、総括班会議を開催し、領域の終了を迎えるにあたり成果の取りまとめの方策について議論した。
ニュースレターを発行し、紙面を通じて領域内の交流促進、情報の提供を行った。
領域の成果を一般に公開するため、第51回生物物理年会においてワークショップ「過渡的複合体が関わる生命現象の統合的理解」を開催し、総括班の神田、早坂らが講演を行った（2013年10月29日、於　京都国際会館）。
若手育成支援の一環として、総括班員の白川らが中心となり、in-cell NMRトレーニングコース2014を開催した（2014年3月18-19日、於　理化学研究所・鶴見キャンパス）。

現在までの達成度 (区分)

理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] Functional dynamics of cell surface membrane proteins (2014)
  • 著者名/発表者名: Nishida N, Osawa M, Takeuchi K, Imai S, Stampoulis P, Kofuku Y, Ueda T, Shimada I
  • 雑誌名: J Magn Reson 巻: 241 ページ: 86-96
  • DOI: 10.1016/j.jmr.2013.11.007
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] dentification of a binding element for the cytoplasmic regulator FROUNT in the membrane-proximal C-terminal region of chemokine receptors CCR2 and CCR5 (2014)
  • 著者名/発表者名: Toda E, Terashima Y, Esaki K, Yoshinaga S, Sugihara M, Kofuku Y, Shimada I, Suwa M, Kanegasaki S, Terasawa H, Matsushima K.
  • 雑誌名: Biochem J 巻: 457 ページ: 313-322
  • DOI: 10.1042/BJ20130827
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure-based approach to improve a small-molecule inhibitor by the use of a competitive peptide ligand. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ono K, Takeuchi K, Ueda H, Morita Y, Tanimura R, Shimada I, Takahashi H.
  • 雑誌名: Angew Chem Int Ed Engl 巻: 53 ページ: 2597
  • DOI: 10.1002/anie.201310749
  • 査読あり
• [雑誌論文] A gel-encapsulated bioreactor system for NMR studies of protein-protein interactions in living mammalian cells. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kubo S, Nishida N, Udagawa Y, Takarada O, Ogino S, Shimada I.
  • 雑誌名: Angew Chem Int Ed Engl 巻: 52 ページ: 1208-1211
  • DOI: 10.1002/anie.201207243
  • 査読あり
• [雑誌論文] Backbone resonance assignments for the cytoplasmic region of the Mg(2+) transporter MgtE in the Mg (2+)-unbound state (2013)
  • 著者名/発表者名: Maruyama T, Imai S, Osawa M, Hattori M, Ishitani R, Nureki O, Shimada I.
  • 雑誌名: Biomol NMR Assign 巻: 7 ページ: 93-96
  • DOI: 10.1007/s12104-012-9385-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure of the mouse sex peptide pheromone ESP1 reveals a molecular basis for specific binding to the class C G-protein-coupled vomeronasal receptor (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoshinaga S, Sato T, Hirakane M, Esaki K, Hamaguchi T, Haga-Yamanaka S, Tsunoda M, Kimoto H, Shimada I, Touhara K, Terasawa H.
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 288 ページ: 16064-16072
  • DOI: 10.1074/jbc.M112.436782
  • 査読あり
• [雑誌論文] Backbone resonance assignments for G protein α(i3) subunit in the GDP-bound state (2013)
  • 著者名/発表者名: Mase Y, Yokogawa M, Osawa M, Shimada I.
  • 雑誌名: Biomol NMR Assign
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nuclear magnetic resonance approaches for characterizing interactions between the bacterial chaperonin GroEL and unstructured proteins. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nishida N, Yagi-Utsumi M, Motojima F, Yoshida M, Shimada I, Kato K.
  • 雑誌名: J Biosci Bioeng 巻: 116 ページ: 160-164
  • DOI: 10.1016/j.jbiosc.2013.02.012.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Backbone and side-chain (1)H, (15)N and (13)C resonance assignments of the microtubule-binding domain of yeast cytoplasmic dynein in the high and low-affinity states. (2013)
  • 著者名/発表者名: Takarada O, Nishida N, Kikkawa M, Shimada I.
  • 雑誌名: Biomol NMR Assign
  • 査読あり
• [雑誌論文] Perdeuteration and methyl-selective (1)H, (13)C-labeling by using a Kluyveromyces lactis expression system (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyazawa-Onami M, Takeuchi K, Takano T, Sugiki T, Shimada I, Takahashi H.
  • 雑誌名: J Biomol NMR 巻: 57 ページ: 297-304
  • DOI: 10.1007/s10858-013-9789-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rapid identification of ligand-binding sites by using an assignment-free NMR approach (2013)
  • 著者名/発表者名: Kodama Y, Takeuchi K, Shimba N, Ishikawa K, Suzuki E, Shimada I, Takahashi H.
  • 雑誌名: J Med Chem 巻: 56 ページ: 9342-9350
  • DOI: 10.1021/jm4014357
  • 査読あり
• [学会発表] Functional Equilibrium of Membrane Proteins
  • 著者名/発表者名: 嶋田一夫
  • 学会等名: 54th Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference
  • 発表場所: Asilomar, California, USA
  • 招待講演
• [学会発表] Functional Equilibrium of Membrane Proteins
  • 著者名/発表者名: 嶋田一夫
  • 学会等名: International Conference on Structural Genomics 2013
  • 発表場所: 北海道札幌市
  • 招待講演
• [学会発表] Functional Equilibrium of GPCR
  • 著者名/発表者名: 嶋田一夫
  • 学会等名: Symposium “Perspectives of NMR in drug discovery
  • 発表場所: Novartis, Basel, Switzerland
  • 招待講演
• [学会発表] Functional Equilibrium of GPCR
  • 著者名/発表者名: 嶋田一夫
  • 学会等名: 5th Asia-Pacific NMR Symposium in conjunction with ANZNAG2013
  • 発表場所: Brisbane, Australia
  • 招待講演
• [学会発表] NMR を用いた高分子量タンパク質複合体の相互作用解析法の開発と応用
  • 著者名/発表者名: 嶋田一夫
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 兵庫県神戸市
  • 招待講演
• [備考] 過渡的複合体 領域HP
  • URL: http://ishimada.f.u-tokyo.ac.jp/public_html/tmc/