秩序形成のロジックの総括研究

2014 年度 実績報告書

• 研究領域: ミクロからマクロへ階層を超える秩序形成のロジック
• 研究課題/領域番号: 22127001
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 武田 洋幸 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (80179647)
• 研究分担者: 上野 直人 基礎生物学研究所, 形態形成研究部門, 教授 (40221105)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: 器官形成 / 体軸形成 / 数理モデル / 力学的パラメーター / パターン形成

研究実績の概要

総括班は、班員間の積極的な研究交流を促進し、領域全体の研究を発展させることを目的に活動を行った。具体的に以下のことを実施した。
＜共同研究体制の構築とその円滑な推進＞・領域会議をH26年6月18-19日（兵庫県淡路市）に開催した（一部の班員への旅費支援を含む）②研究室間交流制度を用いて班員間の技術交流を促進した。特に繰越期でのH27年度にかけて班員交流の支援を継続した。③夏合宿をH26年8月26-27(兵庫県淡路市）に実施し、数理モデルの導入を目指している実験研究グループと、それをサポートする理論系研究グループの相互理解・連携を促進した。
＜当該研究領域の活性化と成果の発信＞　① 国外関連研究者の招聘とテクニカルセミナー：新技術に精通した国内外の研究者を招聘し、班員に対してのテクニカルセミナーを実施した（8回）。② ホームページ：領域ホームページ（http://www.morphologic.jp/）「モルフォ・ロジック：秩序形成ロジック」（和文），「MorphoLogic: Logic of Biological Pattern Formation」（英文）を通して、領域の成果発信を行った。③成果公開シンポジウム#1：基礎生物学研究所にて、　The 62th NIBB conference "Force in development" （2014年11月17-19日）を基礎生物学研究所と共催で開催した（研究分担者上野班員が担当）。④成果公開シンポジウム#2：シンガポールにて新学術領域研究「モルフォロジック」とシンガポールMechanobiology Institute と合同シンポジウム（H26年12月2-4日）を開催した。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [国際共同研究] Mechanobiology Institute, NUS(シンガポール)
  • 国名: シンガポール
  • 外国機関名: Mechanobiology Institute, NUS
• [雑誌論文] Development of the pancreas in medaka, Oryzias latipes, from embryo to adult (2015)
  • 著者名/発表者名: Takayoshi Otsuka, Tatsuya Tsukahara & Takeda, H.
  • 雑誌名: Development, Growth&Differentiation 巻: 57 ページ: 557-569
  • DOI: 10.1111/dgd.12237
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] G protein-coupled receptors Flop1 and Flop2 inhibit Wnt/β-catenin signaling and are essential for head formation in Xenopus. (2015)
  • 著者名/発表者名: Miyagi, A., Negishi, T., Yamamoto, T.S., and Ueno, N.
  • 雑誌名: Developmental Biology 巻: 407 ページ: 131-144
  • DOI: 10.1016/j.ydbio.2015.08.001.
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Phosphorylation-dependent ubiquitination of paraxial protocadherin (PAPC) controls gastrulation cell movements. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kai, M., Ueno, N. and Kinoshita, N.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 ページ: e0115111
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0115111
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The medaka dhc2 mutant reveals conserved and distinct mechanisms of Hedgehog signaling in teleosts. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, T., Tsukahara, T., Ishiguro, T., Hagiwara, H., Taira, M. & Takeda, H.
  • 雑誌名: BMC Developmental Biology 巻: 15 ページ: 9
  • DOI: 10.1186/s12861-015-0057-x
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Large hypomethylated domains serve as strong repressive machinery for key developmental genes in vertebrates. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakamura, R., Tsukahara, T., Qu, W., Ichikawa, K., Otsuka, T., Ogoshi, K., Saito, T.L., Matsushima, K., Sugano, S., Hashimoto, S., Suzuki, Y., Morishita, S. & Takeda, H.
  • 雑誌名: Development 巻: 141 ページ: 2568-2580
  • DOI: 10.1242/dev.108548
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Six1 is a key regulator of the developmental and evolutionary architecture of sensory neurons in craniates. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yajima, H., Suzuki, M., Ochi, H., Ikeda, K., Sato, S., Yamamura, K., Ogino, H., Ueno, N. and Kawakami, K.
  • 雑誌名: BMC Biology 巻: 12 ページ: 40
  • DOI: 10.1186/1741-7007-12-40
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] Deciphering the genetic code for the vertebrate pluripotent epigenome‐Insights from the medaka genome (2016)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Takeda
  • 学会等名: 3rd Medaka Strategic Meeting and 17th Australia & New Zealand Zebrafish Metting
  • 発表場所: メルボルン（オーストラリア）
  • 年月日: 2016-02-03
  • 国際学会
• [学会発表] Sequence-based logic for the vertebrate pluripotent epigenome (2015)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Takeda
  • 学会等名: 4th International Symposium of the mathematics on Chromatin Live dynamics
  • 発表場所: JMSアステールプラザ（広島県広島市）
  • 年月日: 2015-12-01
  • 招待講演
• [学会発表] 器官形成におけるカルシウムダイナミクス (2015)
  • 著者名/発表者名: 上野直人
  • 学会等名: 第13回糖鎖科学コンソーシアムシンポジウム
  • 発表場所: ウインクあいち(愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2015-10-19
  • 招待講演
• [学会発表] Cell and Tissue Dynamics of Neural Tube Formation. (2015)
  • 著者名/発表者名: Naoto Ueno, Makoto Suzuki, Hiroshi Koyama and Yasuhiro Inoue.
  • 学会等名: iCeMS International Symposium
  • 発表場所: 京都大学（京都府京都市）
  • 年月日: 2015-09-23
  • 招待講演
• [学会発表] Calcium Dynamics Shapes the Neural Tube. (2015)
  • 著者名/発表者名: Naoto Ueno and Makoto Suzuki
  • 学会等名: he 3rd Asia-Pacific Developmental Biology Conference
  • 発表場所: 西安（中国）
  • 年月日: 2015-09-13
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Genomics and epigenomics in fish genomes (2015)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Takeda
  • 学会等名: The 7th Internatinal Symposium of Integrative
  • 発表場所: 蘭州（中国）
  • 年月日: 2015-08-25
  • 国際学会
• [学会発表] Prepatterning of Developmental Gene Expression in Vertebrates - interplay between genetic and epigenetic mechanismｓ (2015)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Takeda
  • 学会等名: UT -NTU Joint Symposium - Frontier of Biological Sciences
  • 発表場所: 台北（台湾）
  • 年月日: 2015-03-09
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Logic oｆ the epigenetic code in the vertebrate genome (2015)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Takeda
  • 学会等名: Finnish-Japanese joint symposium on Morphogenesis and Signaling.
  • 発表場所: ヘルシンキ（フィンランド）
  • 年月日: 2015-03-04
  • 招待講演
• [学会発表] Vertebrate PCP and nose morphogenesis (2015)
  • 著者名/発表者名: Naoto Ueno
  • 学会等名: Finnish-Japanese joint symposium on Morphogenesis and Signaling.
  • 発表場所: ヘルシンキ（フィンランド）
  • 年月日: 2015-03-03
  • 招待講演
• [学会発表] epigenetic regulation of key developmental genes - A genome-wide approach in the medaka genome (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Takeda
  • 学会等名: 2nd Strategical Meeting for Medaka Research
  • 発表場所: セビリア（スぺイン）
  • 年月日: 2014-04-11
  • 国際学会
• [備考] ミクロからマクロへ階層を超える秩序形成のロジック
  • URL: http://www.morphologic.jp/
• [学会・シンポジウム開催] シンガポール国立大学合同シンポジウム (2014)
  • 発表場所: シンガポール（シンガポール）
  • 年月日: 2014-12-02 – 2014-12-04
• [学会・シンポジウム開催] Force in Development (2014)
  • 発表場所: 岡崎カンファレンスセンター（愛知県岡崎市）
  • 年月日: 2014-11-17 – 2014-11-19