統合的多階層生体機能学領域の確立とその応用

2010 年度 実績報告書

• 研究領域: 統合的多階層生体機能学領域の確立とその応用
• 研究課題/領域番号: 22136001
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 倉智 嘉久 大阪大学, 医学系研究科, 教授 (30142011)
• 研究分担者: 北野 宏明 沖縄科学技術研究基盤整備機構, オープンバイオロジーユニット, 研究員 (80500256) ; 井上 隆司 福岡大学, 医学部, 教授 (30232573) ; 鈴木 洋史 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (80206523) ; 大槻 純男 東北大学, 薬学研究科, 准教授 (60323036)
• キーワード: システム生物学 / 生理学 / 生物物理 / 心臓 / 不整脈 / 薬物動態 / 全身循環 / 代謝

研究概要

初年度である本年度は研究体勢の確立を目指した。研究開始後直ちに総括班会議をおこない、領域計画の再確認と共同研究体制を具体化した。さらに本領域の参画研究者が一同に会する領域全体会議(第一回)を開いた。この会議では、本新学術領域研究の方向性を明確にし、5年間の到達目標と研究方法、計画班の役割の確認をおこなった。
さらに公開シンポジウムを開催した。このシンポジウムでは新たにスタートする本研究プロジェクトの計画概要や具体的到達目標、期待される波及効果等を広く説明し、関連分野研究者に領域の情報を提供して便宜を図るとともに、統合的生命科学の現状や課題、医療や産業の分野で何が求められているのか議論を深めることができた。
年度の後半には、研究項目毎の研究会議を開催し具体的研究課題に関して意見交換をおこなった。いくつかの領域内共同研究がスタートしている。年度末には再度、領域全体会議(第二回)を開催し、研究状況の把握や問題意識の共有、次年度以降の領域推進に関するロードマップの決定をおこなった。さらに公募研究班を迎え入れる準備をおこなった。
また、本領域の発足や、参画研究者情報、各研究分野から上がった成果、及びそれを統合した理論を速やかに提供できる環境の構築をおこなった。具体的には、領域のホームページをウェブ上に公開し、またニュースレターの作成を始めた。このような方法により、領域内の研究成果に領域外の研究者や一般市民がアクセスできる状態を構築し、評価や批判的議論を得られるように、そして関心を持つ研究者の利便性を図る取組みをおこなった。

研究成果

• [雑誌論文] Dual signaling pathways of arterial constriction by extracellular UTP in the rat (2011)
  • 著者名/発表者名: Megumi Sugihara, Hiromitsu Morita, Miho Matsuda, Hisanori Umebayashi, Shunichi Kajioka, Shinichi Ito, Motohiro Nishida, Ryosuke Inoue, Toshiko Futatsuki, Jun Yamazaki, Yasuo Mori, Ryuji Inoue, Yushi Ito, Kihachiro Abe, Masato Hirata
  • 雑誌名: Journal of Pharmacological Sciences 巻: 115(3) ページ: 293-308
  • DOI: 10.1254/jphs.10281FP
  • 査読あり
• [雑誌論文] Roles of Subcellular Na^+ Channel Distributions in the Mechanism of Cardiac Conduction (2011)
  • 著者名/発表者名: Kunichika Tsumoto, Takashi Ashihara, Ryo Haraguchi, Kazuo Nakazawa, Yoshihisa Kurachi
  • 雑誌名: Biophysical Journal 巻: 100(3) ページ: 554-563
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transmural dispersion of repolarization determines scroll wave behavior during ventricular tachyarrhythmias (2011)
  • 著者名/発表者名: Ryo Haraguchi, Takashi Ashihara, Tsunetoyo Namba, Kunichika Tsumoto, Murakami Shingo, Yoshihisa Kurachi, Takanori Ikeda, Kazuo Nakazawa
  • 雑誌名: Circulation Journal 巻: 75(1) ページ: 80-88
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation of cardiovascular TRP channel functions along the NO-cGMP-PKG axis (2011)
  • 著者名/発表者名: Ryuii Inoue, Juan Shi, Zhong Jian, Yuko Imai
  • 雑誌名: Expert Review of Clinical Pharmacology 巻: 3(3) ページ: 347-360
  • 査読あり
• [雑誌論文] NPC2 regulates biliary cholesterol secretion via stimulation of ABCGS/G8-mediated cholesterol transport (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshihide Yamanashi, Tappei Takada, Takashi Yoshikado, Jun-ichi Shoda, Hiroshi Suzuki
  • 雑誌名: Gastroenterology 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Serum Metabolomics Reveals γ-Glutamyl Dipeptides as Biomarkers for Discrimination among Different Forms of Liver Disease (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomoyoshi Soga, Masahiro Sugimoto, Masashi Honma, Masayo Mori, Kaori Igarashi, Kasumi Kashikura, Satsuki Ikeda, Akiyoshi Hirayama, Takehito Yamamoto, Haruhiko Yoshida, Motoyuki Otsuka, Shoji Tsuji, Yutaka Yatomi, Tadayuki Sakuragawa, Hisayoshi Watanabe, Kouei Nihei, Takafumi Saito, Sumio Kawata, Hiroshi Suzuki, Masaru Tomita, Makoto Suematsu
  • 雑誌名: Journal of Hepatology 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rab27a and Rab27b are involved in stimulation-dependent RANKL release from secretory lysosomes in osteoblastic cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshiaki Kariya, Masashi Honma, Akiko Hanamura, Shigeki Aoki, Tadashi Ninomiya, Yuko Nakamichi, Nobuyuki Udagawa, Hiroshi Suzuki
  • 雑誌名: Journal of Bone and Mineral Research 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Simultaneous absolute quantification of 11 cytochrome P450 isoforms in human liver microsomes by liquid chromatography tandem mass spectrometry with in silico target peptide selection (2011)
  • 著者名/発表者名: Hirotaka Kawakami, Sumio Ohtsuki, Junichi Kamiie, Takashi Suzuki, Takaaki Abe, Tetsuya Terasaki
  • 雑誌名: Journal of Pharmaceutical Sciences 巻: 100 ページ: 341-352
  • 査読あり
• [雑誌論文] A structural determinant for the control of PIP_2 sensitivity in G protein-gated inward rectifier K^+ channels (2010)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Inanobe, Atsushi Nakagawa, Takanori Matsuura, Yoshihisa Kurachi
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: 285(49) ページ: 38517-38523
  • 査読あり
• [雑誌論文] Large-scale analysis of network bistability for human cancers (2010)
  • 著者名/発表者名: Tetsuya Shiraishi, Shinako Matsuyama, Hiroaki Kitano
  • 雑誌名: PLoS Computational Biology 巻: 16(7) ページ: e1000851
  • 査読あり
• [雑誌論文] A comprehensive molecular interaction map of the budding yeast cell cycle. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kazunari Kaizu, Samik Ghosh, Yukiko Matsuoka, Hisao Moriya, Yuki Shimizu-Yoshida, Hiroaki Kitano
  • 雑誌名: Molecular Systems Biology 巻: 6 ページ: 415
  • 査読あり
• [雑誌論文] A comprehensive map of the mTOR signaling network (2010)
  • 著者名/発表者名: Etienne Caron, Samik Ghosh, Yukiko Matsuoka, Dariel Ashton-Beaucagel, Marc Therrien, Sebastien Lemieux, Claude Perreault, Philippe P Roux, Hiroaki Kitano
  • 雑誌名: Molecular Systems Biology 巻: 6 ページ: 453
  • 査読あり
• [雑誌論文] システムバイオロジーにおける情報基盤 (2010)
  • 著者名/発表者名: 北野宏明、松岡由希子、Samik Ghosh
  • 雑誌名: 計測と制御 巻: 49(8) ページ: 507-512
  • 査読あり
• [雑誌論文] 細胞シミュレータCellDesignerの設計と実装 (2010)
  • 著者名/発表者名: 舟橋啓、松岡由希子、上樂明也、瀧沢大夢、広井賀子、Samik Ghosh、菊池紀広、北野宏明
  • 雑誌名: 計測と制御 巻: 49(8) ページ: 531-536
  • 査読あり
• [雑誌論文] Connecting the dots : role of standardization and technology sharing in biological simulation (2010)
  • 著者名/発表者名: Samik Ghosh, Yukiko Matsuoka, Hiroaki Kitano
  • 雑誌名: Drug Discovery Today 巻: 15 ページ: 1024-1031
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inhibition of TRPC6 Channel Activity contributes to the Anti-hypertrophic Effects of Natriuretic Peptides-guanylyl cyclase-A signaling in the heart (2010)
  • 著者名/発表者名: Hideyuki Kinoshita, Koichiro Kuwahara, Motohiro Nishida, Jian Zhong, Xianglu Rong, Shigeki Kiyonaka, Yoshihiro Kuwabara, Hitoshi Kurose, Ryuji Inoue, Yasuo Mori, Yuhao Li, Yasuaki Nakagawa, Masao Murakami, Masaki Harada, Shinji Yasuno, Satoru Usami, Masataka Fujiwara, Yuko Yamada, Takeya Minami, Kenji Ueshima, Eric N.Olson, Kazuwa Nakao
  • 雑誌名: Circulation Research 巻: 106(12) ページ: 1849-1860
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phosphorylation of TRPC6 channels at Thr^<69> is required for anti-hypertrophic effects of phosphodiesterase 5 inhibition (2010)
  • 著者名/発表者名: Motohiro Nishida, Kenta Watanabe, Yoji Sato, Michio Nakaya, Naoyuki Kitajima, Tomomi Ide, Ryuji Inoue, Hitoshi Kurose
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: 285(17) ページ: 13244-13253
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ca^<2+> Influx and protein scaffolding via TRPC3 sustain PKCβ and ERK activation in B cells (2010)
  • 著者名/発表者名: Takuro Numaga, Motohiro Nishida, Shigeki Kiyonaka, Kenta Kato, Masahiro Katano, Emiko Mori, Tomohiro Kurosaki, Ryuii Inoue, Masaki Hikida, James W Putney, Jr, Yasuo Mori
  • 雑誌名: Journal of Cell Science 巻: 123(6) ページ: 927-938
  • 査読あり
• [雑誌論文] Itraconazole-induced cholestasis : involvement of the inhibition of bile canalicular phospholipid translocator MDR3/ABCB4 (2010)
  • 著者名/発表者名: Takashi Yoshikado, Tappei Takada, Takehito Yamamoto, Hiroko Yamaji, Kousei Ito, Tomofumi Santa, Hiromitsu Yokota, Yutaka Yatomi, Haruhiko Yoshida, Jun Goto, Shoji Tsuji, Hiroshi Suzuki
  • 雑誌名: Molecular Pharmacology 巻: 79(2) ページ: 241-250
  • 査読あり
• [学会発表] 膜脂質メッセンジャーを介した受容体・機械刺激Ca^<2+>応答の統合制御機構 (2011)
  • 著者名/発表者名: 井上隆司、今井裕子、斎郷平、市川純、森誠之
  • 学会等名: 第88回日本生理学会大会シンポジウム「脂質メディエーターの細胞機能と疾患」
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜(招待講演)
  • 年月日: 2011-03-29
• [学会発表] 定量的標的プロテオミクスによるファーマコプロテオミクスアプローチ (2011)
  • 著者名/発表者名: 大槻純男
  • 学会等名: 日本薬学会第131年会
  • 発表場所: ツインメッセ静岡、静岡(招待講演)
  • 年月日: 2011-03-29
• [学会発表] Systems Drug Discovery and Platform Design. (2011)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: 15^<th> Human Genome Meeting : Genomics of Human Diversity and Heritable Disorders
  • 発表場所: Dubai International Convention & Exhibition Centre, Dubai, UAE(招待講演)
  • 年月日: 2011-03-17
• [学会発表] Systems Medicine and Systems Drug Design as the Grand Challenge in 21st Century (2011)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: BioComplexity Symposium : Systems Biology Approach to Systems Drug Discovery and Systems Medicine
  • 発表場所: NUHS Tower Block, Singapore(招待講演)
  • 年月日: 2011-02-14
• [学会発表] システムバイオロジーと創薬・医療応用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 北野宏明
  • 学会等名: 「生命をはかる」研究会 第33回研究会
  • 発表場所: 東陽テクニカ(東京都)(招待講演)
  • 年月日: 2011-02-07
• [学会発表] Systems Drug Design (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: Systems Biology at the Interface of Metabolism and Signal Transduction
  • 発表場所: VU University Amsterdam, The Netherlands(招待講演)
  • 年月日: 2010-12-17
• [学会発表] Quantitative semi-simultaneous imaging of Ca^<2+> and Ca^<2+>-dependent calmodulin interactions by FRET (2010)
  • 著者名/発表者名: Masayuki Mori, Yuko Imai, Kyohei Isuki, Ryuji Inoue
  • 学会等名: The 9^<th> Korea--Japan Joint Symposium of Brain Sciences, and Cardiac and Smooth Muscles
  • 発表場所: Keitenkaku, Kagoshima(招待講演)
  • 年月日: 2010-11-26
• [学会発表] システム創薬-がんのシステム的理解と創薬への応用- (2010)
  • 著者名/発表者名: 北野宏明
  • 学会等名: 神奈川科学技術アカデミー(KAST)教育講座 システムバイオロジー講座
  • 発表場所: 神奈川科学技術アカデミー(KAST),神奈川(招待講演)
  • 年月日: 2010-11-18
• [学会発表] PISCS (pharmacokinetic interaction significance classification system) : toward seamless drug-interaction alert (2010)
  • 著者名/発表者名: Akihiro Hisaka
  • 学会等名: Pharmaceutical sciences world congress (PSWC 2010)
  • 発表場所: Morial Convention Center, New Orleans, USA.
  • 年月日: 2010-11-15
• [学会発表] Systems Robustness and Systems Failures in Biology, Medicine, and Engineering (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: A^*STAR Scientific Conference 2010
  • 発表場所: A^*STAR, Singapore(招待講演)
  • 年月日: 2010-11-10
• [学会発表] Systems Biology and Drug Discovery (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: National University of Singapore, Biochemistry Seminar
  • 発表場所: National University of Singapore, Singapore(招待講演)
  • 年月日: 2010-11-08
• [学会発表] 定量的標的プロテオミクスによって拓かれる新しい創薬研究への展開 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大槻純男
  • 学会等名: 創剤フォーラム第16回シンポジウム
  • 発表場所: アルカディア市ヶ谷、東京(招待講演)
  • 年月日: 2010-10-22
• [学会発表] An Open-flow Paradigm for Curation and Enrichment of Biological Pathways. (2010)
  • 著者名/発表者名: Samik Ghosh, Yukiko Matsuoka, Hiroaki Kitano
  • 学会等名: International Conference on Systems Biology (ICSB) 2010
  • 発表場所: Edinburgh International Conference Centre, UK
  • 年月日: 2010-10-12
• [学会発表] PathText : Integrating Text Mining Resources with Biological Pathway Visualizations. (2010)
  • 著者名/発表者名: Brian Kemper, Takuya Matsuzaki, Yukiko Matsuoka, Yoshimasa Tsuruoka, Hiroaki Kitano, Jun'ichi Tsujii, Sophia Ananiadou
  • 学会等名: International Conference on Systems Biology (ICSB) 2010
  • 発表場所: Edinburgh International Conference Centre, UK
  • 年月日: 2010-10-12
• [学会発表] Posttraslational regulation of Abcc2 through sumoylation (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Suzuki, Shuichi Sekine, Toshiharu Horie, Kousei Ito
  • 学会等名: Falk Symposium 175 : XXI International Bile Acid Meeting
  • 発表場所: Freiburg, Germany
  • 年月日: 2010-10-07
• [学会発表] Systems drug discovery and software platform for healthcare research and services. (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: International Conference on Bioinformatics (InCoB)
  • 発表場所: Waseda University, Tokyo(招待講演)
  • 年月日: 2010-09-27
• [学会発表] 多階層統合生体シミュレーションから生命機能の理解と予測医学の実現を目指して (2010)
  • 著者名/発表者名: 北野宏明、井上隆司、鈴木洋史、倉智嘉久
  • 学会等名: 新学術領域研究「多階層生体機能学」キックオフシンポジウム
  • 発表場所: 大阪大学中之島センター佐治敬三ホール、大阪(招待講演)
  • 年月日: 2010-09-25
• [学会発表] 次世代のファーマコプロテオミクスと中枢神経作用薬の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大槻純男
  • 学会等名: 第20回日本臨床精神神経薬理学会・第40回日本神経精神薬理学会年会合同年会
  • 発表場所: 仙台国際センター、仙台(招待講演)
  • 年月日: 2010-09-17
• [学会発表] Multiplexed-MRM法による膜タンパク質群の一斉定量とファーマコプロテオミクスへの応用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大槻純男
  • 学会等名: 日本分析化学会第59年会
  • 発表場所: 東北大学川内キャンパス、仙台(招待講演)
  • 年月日: 2010-09-16
• [学会発表] Nappによるモデリングとシミュレーションの紹介 (2010)
  • 著者名/発表者名: 樋坂章博
  • 学会等名: 第3回日本ファーマコメトリクス研究会
  • 発表場所: 昭和大学、東京
  • 年月日: 2010-09-03
• [学会発表] タンパク質の定量によって拓かれる新しい創薬研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大槻純男
  • 学会等名: 第23回バイオメディカル分析科学シンポジウム
  • 発表場所: ホテル大観荘、松島(招待講演)
  • 年月日: 2010-07-23
• [学会発表] Hitting Robustness (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: 16^<th> World Congress on Basic and Clinical Pharmacology (WorldPharma 2010)
  • 発表場所: Bella Center, Copenhagen, Denmark(招待講演)
  • 年月日: 2010-07-19
• [学会発表] 心血管CaチャネルTRPC6の機能と制御-受容体機械刺激応答性のリン酸化を介した統合的制御機構- (2010)
  • 著者名/発表者名: 井上隆司
  • 学会等名: 第13回札幌高血圧セミナー
  • 発表場所: ホテルニューオータニ札幌、札幌(招待講演)
  • 年月日: 2010-07-09
• [学会発表] Rationale of Garuda and introduction to Garuda-2 workshop (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: Garuda Two Workshop
  • 発表場所: Manchester Interdisciplinary Biocentre, UK(招待講演)
  • 年月日: 2010-07-05
• [備考]
  • URL: http://hd-physiology.jp/
• [備考]
  • URL: http://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/pharma2/singaku/
• [産業財産権] ネットワークモデル統合装置、ネットワークモデル統合システム、ネットワークモデル統合方法、および、プログラム (2010)
  • 発明者名: 北野宏明、松岡由希子、サミックゴーシュ
  • 権利者名: 独立行政法人沖縄科学技術研究基盤整備機構、特定非営利活動法人システム・バイオロジー研究機構
  • 産業財産権番号: 特願2010-224308
  • 出願年月日: 2010-10-01