統合的多階層生体機能学領域の確立とその応用

2012 年度 実績報告書

• 研究領域: 統合的多階層生体機能学領域の確立とその応用
• 研究課題/領域番号: 22136001
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 倉智 嘉久 大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (30142011)
• 研究分担者: 井上 隆司 福岡大学, 医学部, 教授 (30232573) ; 鈴木 洋史 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (80206523) ; 北野 宏明 沖縄科学技術大学院大学, その他の研究科, 教授 (80500256)
• 研究期間 (年度): 2010-06-23 – 2015-03-31
• キーワード: システム生物学 / 生理学 / 生物物理 / 心臓 / 不整脈 / 薬物動態 / 全身循環 / 代謝

研究概要

三年目である本年度も領域代表者を中心とする総括班で、領域全体の統括と運営を実施した。本領域の研究インフラであるオープンプラットフォーム開発の順調な進展を受け、全身薬物動態と心臓の電気活動の統合モデルの構築を推進し、多階層生体システムの本格的な解析が領域をあげて実施された。
総括班会議は計8回開催し、領域運営や共同研究の推進の方策を議論した。喫緊の課題に対し、領域内から選抜した班員によるタスクフォースを結成し、総括班統括の下、プロジェクトを進めた。例えば、モデルの多階層化に伴う計算量の増加を見越して、研究プラットフォームの「京」を含むハイパフォーマンスコンピューティング(HPC)システム対応に着手した。年度の前期と後期に領域全体会議を開催し、領域全体の研究状況把握、短期・中期的な問題意識の発掘と共有、そして本年度実施された中間外部審査に向けた成果の取りまとめを行った。領域全体会議に連携させて、若手中心の研究成果発表会も実施し、若手研究者のスキルアップと人脈作りのサポートを行った。
領域主催の第二回の多階層生体機能学国際シンポジウムを開催した。この国際シンポジウムでは、統合的生命科学の国際的リーダーを招聘し、当該研究分野の現状や課題、方法論の統一化やコラボレーションの可能性について議論した。また、心臓の電気的興奮活動の制御と破綻（不整脈）、および小分子体内動態の最新の研究成果を報告し、生命の多階層性の統合的理解に向けた議論をおこなった。海外からゲスト講演者を招聘し、計8題の特別講演を実施した。彼らとはシンポジウム後も連携をとっている。またさらに班員が中心となるシンポジウムを関連学会で計3回実施し、研究成果の発信に努めた。
領域ホームページにおいて領域メンバーによる最新の研究成果や関連学会の近状を報告し、またニューズレターを発行し領域の成果の解説を行った。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当該領域は、「5年以内に心臓/循環器系の電気現象の分子から生体レベルまでの垂直統合モデルと全身薬物動態の分子レベルモデルを統合した、創薬ならびに臨床への応用が期待できる統合モデルの構築と解析を可能にするプラットフォームを実現する」ことをコミットメントしている。領域総括班である本課題の研究目的は、領域目標を達成するために三つの研究項目からなる領域を運営することにある。年次計画3年目の到達目標である「構築されたプラットフォームでの多階層生体システムの解析」は完全に達成し、4年目の到達目標である「研究プラットフォーム標準化に向けた普及活動の本格化」は次年度開始後直ちに実施出来る状況にある。また外部評価委員による本領域に対する中間評価によっても、A（研究領域の設定目的に照らして、期待どおりの進展が認められる）と判断された。従って、本課題は「おおむね順調に進展している」と考えられる。

今後の研究の推進方策

おおむね順調に進展している本課題では、研究を推進する上での重大な問題点は認められない。当初の計画以上の進展を目指し、シミュレーションプラットフォームの普及戦略、デベロッパーズミーティングの実施や研究成果のより積極的な発信に努める。また多階層生体システムにおけるシステム理論に関する議論を行い、本研究領域で取り上げている心臓や薬物動態以外の研究者にも波及するような汎用性のある成果の発信を目指す。さらに、これまでも成果の発表、HP上での成果の解説、公開シンポジウムの開催などを行なってきたが、より平易な言葉での領域の研究がもたらす未来を説明する書籍の執筆や高校生など一般向けの出張講義等を実施し、より一層社会への貢献に努めていく。

研究成果

• [雑誌論文] Adding Protein Context to the Human Protein-Protein Interaction Network to Reveal Meaningful Interactions (2013)
  • 著者名/発表者名: Martin H. Schaefer, Tiago J. S. Lopes, Nancy Mah, Jason E. Shoemaker, Yukiko Matsuoka, Jean-Fred Fontaine, Caroline Louis-Jeune, Amie J. Eisfeld, Gabriele Neumann, Carol Perez-Iratxeta, Yoshihiro Kawaoka, Hiroaki Kitano, Miguel A. Andrade-Navarro
  • 雑誌名: PLOS Computational Biology 巻: 9 ページ: 1
  • DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002860
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of dosage-sensitive genes in Saccharomyces cerevisiae using the genetic tug-of-war method (2013)
  • 著者名/発表者名: Koji Makanae, Reiko Kintaka, Takashi Makino, Hiroaki Kitano and Hisao Moriya
  • 雑誌名: Genome Research 巻: 23 ページ: 300-311
  • DOI: 10.1101/gr.146662.112
  • 査読あり
• [雑誌論文] RANKL subcellular trafficking and regulatory mechanisms in osteocytes (2013)
  • 著者名/発表者名: Masashi Honma, Yuki Ikebuchi, Yoshiaki Kariya, Madoka Hayashi, Naoki Hayashi, Shigeki Aoki, Hiroshi Suzuki
  • 雑誌名: Journal of Bone and Mineral Research 巻: 28(9) ページ: 1936-1949
  • DOI: 10.1002/jbmr.1941.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ticlopidine, a Cholestatic Liver Injury-Inducible Drug, Causes Dysfunction of Bile Formation via Diminished Biliary Secretion of Phospholipids: Involvement of Biliary-Excreted Glutathione-Conjugated Ticlopidine Metabolites (2013)
  • 著者名/発表者名: Takashi Yoshikado, Tappei Takada, Hideaki Yamamoto, Jeng Kae Tan, Kousei Ito, Tomofumi Santa, Hiroshi Suzuki
  • 雑誌名: Molecular Pharmacology 巻: 83(2) ページ: 552-562
  • DOI: 10.1124/mol.112.081752.
  • 査読あり
• [雑誌論文] A computational model of a circulation current that controls electrochemical properties in the mammalian cochlea (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumiaki Nin, Hiroshi Hibino, Shingo Murakami, Toshihiro Suzuki, Yasuo Hisa, Yoshihisa Kurachi
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences of USA 巻: 109 ページ: 9191-9196
  • DOI: 10.1073/pnas.1120067109
  • 査読あり
• [雑誌論文] A framework for mapping, visualisation and automatic model creation of signal-transduction networks (2012)
  • 著者名/発表者名: Carl-Fredrik Tiger, Falko Krause, Gunnar Cedersund, Robert Palmer, Edda Klipp, Stefan Hohmann, Hiroaki Kitano and Marcus Krantz
  • 雑誌名: Molecular Systems Biology 巻: 8 ページ: 578
  • DOI: 10.1038/msb.2012.12
  • 査読あり
• [雑誌論文] Software support for SBGN maps: SBGN-ML and LibSBGN (2012)
  • 著者名/発表者名: Martijn P. van Iersel, Alice C. Villéger, Tobias Czauderna, Sarah E. Boyd, Frank T. Bergmann, Augustin Luna, Emek Demir, Anatoly Sorokin, Ugur Dogrusoz, Yukiko Matsuoka, Akira Funahashi, Mirit I. Aladjem, Huaiyu Mi, Stuart L. Moodie, Hiroaki Kitano, Nicolas Le Novère, and Falk Schreiber
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 28(15) ページ: 2016-2021
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bts270
  • 査読あり
• [雑誌論文] CTen: a web-based platform for identifying enriched cell types from heterogeneous microarray data (2012)
  • 著者名/発表者名: Jason E Shoemaker, Tiago JS Lopes, Samik Ghosh, Yukiko Matsuoka, Yoshihiro Kawaoka and Hiroaki Kitano
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 13(1) ページ: 460
  • DOI: 10.1186/1471-2164-13-460
  • 査読あり
• [雑誌論文] Integrated network analysis reveals a novel role for the cell cycle in 2009 pandemic influenza virus-induced inflammation in macaque lungs (2012)
  • 著者名/発表者名: Jason E Shoemaker, Satoshi Fukuyama, Amie J Eisfeld, Yukiko Muramoto, Shinji Watanabe, Tokiko Watanabe, Yukiko Matsuoka, Hiroaki Kitano and Yoshihiro Kawaoka
  • 雑誌名: BMC Systems Biology 巻: 6 ページ: 117
  • DOI: 10.1186/1752-0509-6-117
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Self-limiting regulation of vasoconstrictor-activated TRPC3/C6/C7 channels coupled with PI(4,5)P2-diacylglycerol signaling (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuko Imai, Kyohei Itsuki, Yasushi Okamura, Ryuji Inoue, and Masayuki X. Mori
  • 雑誌名: Journal of Physiology (Lond) 巻: 590(5) ページ: 1101-1119
  • DOI: 10.1113/jphysiol.2011.221358
  • 査読あり
• [雑誌論文] Critical role of TRPC1-mediated Ca2+ entry in decidualization of human endometrial stromal cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiro Kawarabayashi, Lin Hai, Akira Honda, Shinji Horiuchi, Hiroshi Tsujioka, Jun Ichikawa, Ryuji Inoue
  • 雑誌名: Molecular Endocrinology 巻: 26(5) ページ: 846-858
  • DOI: 10.1210/me.2011-1259
  • 査読あり
• [雑誌論文] Decreased extra-renal urate excretion is a common cause of hyperuricemia (2012)
  • 著者名/発表者名: Kimiyoshi Ichida, Hirotaka Matsuo, Tappei Takada, et al (Hiroshi Suzuki)
  • 雑誌名: Nature Communication 巻: 3 ページ: 1-7
  • DOI: 10.1038/ncomms1756.
  • 査読あり
• [学会発表] 第III群坑不整脈薬によるhERGチャネル阻害とファシリテーション作用の心筋活動電位への影響：シミュレーション研究 (2013)
  • 著者名/発表者名: 古谷和春、津元国親、陳以珊、倉智嘉久
  • 学会等名: 第90回日本生理学会大会
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京都）
  • 年月日: 20130329-20130329
• [学会発表] ホスホリパーゼC活性と連動した受容体作動型TRPCチャネルのキネティクス解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 齊 郷平、今井裕子、安部喜八郎、井上隆司、森 誠之
  • 学会等名: 第90回日本生理学会大会・シンポジウム
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京都）
  • 年月日: 20130329-20130329
• [学会発表] 腸管狭窄線維化の進行における消化管筋線維芽細胞TRPC4, C6チャネルの役割 (2013)
  • 著者名/発表者名: 倉原（海）琳、住吉美保、井上隆司
  • 学会等名: 第90回日本生理学会大会
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京都）
  • 年月日: 20130329-20130329
• [学会発表] cGMP依存性キナーゼのN末領域に存在する酸性アミノ酸はTRPC6との相互作用に必須である (2013)
  • 著者名/発表者名: 本田 啓、井上隆司
  • 学会等名: 第90回日本生理学会大会
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京都）
  • 年月日: 20130329-20130329
• [学会発表] 消化管筋線維芽細胞TRPC6チャネルがTGF-b1/SMAD/MAPK/PI3K情報伝達に果たす役割 (2013)
  • 著者名/発表者名: 住吉美保、倉原 琳、井上隆司
  • 学会等名: 第90回日本生理学会大会
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京都）
  • 年月日: 20130329-20130329
• [学会発表] アセチルコリン感受性カリウム電流の短期脱感作のシミュレーション解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 村上慎吾、稲野辺厚、倉智嘉久
  • 学会等名: 第90回日本生理学会大会
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京都）
  • 年月日: 20130328-20130328
• [学会発表] 骨髄間質細胞周期制御における膜電位の役割 ―TRPC6チャネル関与の可能性― (2013)
  • 著者名/発表者名: 市川 純、井上隆司
  • 学会等名: 第90回日本生理学会大会
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京都）
  • 年月日: 20130328-20130328
• [学会発表] 心筋Naチャネル遮断による催不整脈リスクは虚血境界領域のNaチャネルリモデリングで説明できる. (2013)
  • 著者名/発表者名: 津元国親、芦原貴司、原口亮、中沢一雄、倉智嘉久
  • 学会等名: 第90回日本生理学会大会
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京都）
  • 年月日: 20130327-20130327
• [学会発表] Druggability of TRP channels in cardiovascular disease (2013)
  • 著者名/発表者名: Ryuji Inoue
  • 学会等名: Collaboration Symposium with the Japanese Pharmacological Society. The 90th Annual meeting of the Physiological Society of Japan
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京都）
  • 年月日: 20130327-20130327
• [学会発表] アストロサイトのカリウム緩衝機能のモデル解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 村上慎吾、倉智嘉久
  • 学会等名: 第86回日本薬理学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡県）
  • 年月日: 20130322-20130322
• [学会発表] Facilitation of hERG channel by Class III anti-arrhythmic agents: the Molecular Mechanism and Therapeutic Significance (2013)
  • 著者名/発表者名: 古谷和春、津元国親、陳以珊、倉智嘉久
  • 学会等名: 第86回日本薬理学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡県）
  • 年月日: 20130321-20130321
• [学会発表] アセチルコリン感受性カリウム電流の短期脱感作のモデル解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 村上慎吾、稲野辺厚、倉智嘉久
  • 学会等名: 第86回日本薬理学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡県）
  • 年月日: 20130321-20130321
• [学会発表] Pathophysiological mechanism involved in mechanotransduction at podocyte TRPC6 channel signaling complex (2013)
  • 著者名/発表者名: Ryuji Inoue, Jun Ichikawa, Midori Nakagawa
  • 学会等名: Symposium 6 “New therapeutic insights for chronic kidney disease provided by the podocytology. The 86th Annual Meeting of the Japanese Pharmacological Society. Symposium
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡県）
  • 年月日: 20130321-20130321
• [学会発表] Effects of block and facilitation of HERG channel by class III anti-arrhythmic agents on cardiac action potential: a simulation study (2013)
  • 著者名/発表者名: 古谷和春、津元国親、倉智嘉久
  • 学会等名: 第77回日本循環器学会学術集会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県）
  • 年月日: 20130317-20130317
• [学会発表] Systems Drug Design and Software Platform for drug efficacy and adverse effects prediction (2013)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: FDA Workshop: Systems Pharmacology for the Prediction of Tyrosine Kinase Inhibitor non-QT Cardiotoxicity
  • 発表場所: FDA White Oak Campus (USA)
  • 年月日: 20130228-20130228
  • 招待講演
• [学会発表] PIP2 dynamics undelying muscarinic or vasopression receptor-activated TRPC3, C6 and C7 currents (2013)
  • 著者名/発表者名: Kyohei Itsuki, Yuko Imai, Yasushi Okamura, Ryuji Inoue, and Masayuki X. Mori
  • 学会等名: 57th Annual Meeting of Biophysical Society
  • 発表場所: Philadelphia, Pennsylvania (USA)
  • 年月日: 20130203-20130203
• [学会発表] システムズバイオロジーのための京コンピュータへの期待 (2013)
  • 著者名/発表者名: 北野宏明
  • 学会等名: 第4回スーパーコンピュータ「京」と創薬・医療の産学連携セミナー -HPCI計算生命科学推進プログラム-
  • 発表場所: フクラシア東京ステーション
  • 年月日: 20130125-20130125
  • 招待講演
• [学会発表] Sphingolipid signaling modulates Kir channels functions (2013)
  • 著者名/発表者名: Kazuharu Furutani, Yoshihisa Kurachi
  • 学会等名: Cespi Nagoya Symposium - Frontiers in Structural Physiology
  • 発表場所: 名古屋大学豊田講堂（愛知県）
  • 年月日: 20130122-20130122
• [学会発表] 虚血誘発性細胞内NaチャネルリモデリングによるI群抗不整脈薬の催不整脈作用の増強 (2013)
  • 著者名/発表者名: 津元国親、芦原貴司、原口 亮、中沢一雄、倉智嘉久
  • 学会等名: 平成24年度科学研究費補助金・新学術領域研究「多階層生体機能学」第6回全体会議
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学（沖縄県）
  • 年月日: 20130117-20130117
  • 招待講演
• [学会発表] 抗不整脈薬のhERGファシリテーション作用：分子機序と不整脈治療における意義 (2013)
  • 著者名/発表者名: 古谷和春、津元国親、陳 以珊、倉智嘉久
  • 学会等名: 平成24年度科学研究費補助金・新学術領域研究「多階層生体機能学」第6回全体会議
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学（沖縄県）
  • 年月日: 20130117-20130117
  • 招待講演
• [学会発表] アセチルコリン感受性カリウム電流におけるshort term desensitization のシミュレーション解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 村上慎吾、稲野辺厚、倉智嘉久
  • 学会等名: 平成24年度科学研究費補助金・新学術領域研究「多階層生体機能学」第6回全体会議
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学（沖縄県）
  • 年月日: 20130117-20130117
  • 招待講演
• [学会発表] 心筋Brick wall 2D model構築とシミュレーション (2013)
  • 著者名/発表者名: 津元国親，芦原貴司，原口 亮，稲田 慎，中沢一雄，倉智嘉久
  • 学会等名: 平成24年度科学研究費補助金・新学術領域研究「多階層生体機能学」第6回全体会議
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学（沖縄県）
  • 年月日: 20130117-20130117
  • 招待講演
• [学会発表] アストロサイトのカリウム緩衝機能のモデル解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 村上慎吾、倉智嘉久
  • 学会等名: 平成24年度科学研究費補助金・新学術領域研究「多階層生体機能学」第6回全体会議
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学（沖縄県）
  • 年月日: 20130116-20130116
  • 招待講演
• [学会発表] スフィンゴ脂質によるKirチャネル機能制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 古谷和春、倉智嘉久
  • 学会等名: 平成24年度筋生理の集い
  • 発表場所: 東京慈恵会医科大学高木会館（東京都）
  • 年月日: 20121222-20121222
  • 招待講演
• [学会発表] Data-Driven Network-Based Biomarker Discovery (2012)
  • 著者名/発表者名: 北野宏明
  • 学会等名: 第35回 日本分子生物学会年会バイオテクノロジーセミナー
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡）
  • 年月日: 20121212-20121212
  • 招待講演
• [学会発表] Systems Toxicology (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: An invited talk at DSTO
  • 発表場所: Defence Science and Technology Organisation (DSTO), Department of Defence, Australian Government (Australia)
  • 年月日: 20121204-20121204
  • 招待講演
• [学会発表] 陳旧性心筋梗塞下におけるI群抗不整脈薬の催不整脈作用の機序：心筋Naチャネルの 虚血誘発性細胞内リモデリングとの関連において (2012)
  • 著者名/発表者名: 津元国親、芦原貴司、原口亮、中沢一雄、倉智嘉久
  • 学会等名: 第22回日本循環薬理学会
  • 発表場所: 富山国際会議場（富山県）
  • 年月日: 20121130-20121130
• [学会発表] TRPC6チャネルを制御するI型cGMP依存性キナーゼのTRPC6相互作用部位の解明 (2012)
  • 著者名/発表者名: 本田 啓、井上隆司
  • 学会等名: 第22回日本循環薬理学会
  • 発表場所: 富山国際会議場（富山県）
  • 年月日: 20121130-20121130
• [学会発表] 抗不整脈薬のhERGチャネルファシリテーション作用：分子機序と不整脈治療における意義 (2012)
  • 著者名/発表者名: 古谷和春、津元国親、倉智嘉久
  • 学会等名: 生理研研究会「心血管イオンチャネル・トランスポーター研究の新展開 -基礎研究と臨床研究の融合-」
  • 発表場所: 岡崎コンファランスセンター（愛知県)
  • 年月日: 20121121-20121121
  • 招待講演
• [学会発表] TRPC6チャネルを巡る機械刺激受容伝達異常と家族性腎糸球体硬化症 (2012)
  • 著者名/発表者名: 井上隆司、市川純、中川緑
  • 学会等名: 生理研研究会「イオンチャネル・トランスポーターと心血管機能：細胞機能の分子機序とその統合的理解」
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター（岡崎、愛知）
  • 年月日: 20121121-20121121
• [学会発表] 抗不整脈薬のhERGチャネルファシリテーション作用：分子機序と不整脈治療における意義 (2012)
  • 著者名/発表者名: 古谷和春、津元国親、陳以珊、山川祐子、倉智嘉久
  • 学会等名: 第122回日本薬理学会近畿部会
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター（大阪府）
  • 年月日: 20121116-20121116
• [学会発表] Reconstitution of Cardiac G Protein-Gated Potassium Current：Effect of Muscarinic Agonists and RGS4 on Voltage-Dependent Response (2012)
  • 著者名/発表者名: 陳以珊、古谷和春、稲野辺厚、倉智嘉久
  • 学会等名: 第122回薬理学会近畿部会
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター（大阪府）
  • 年月日: 20121116-20121116
• [学会発表] 心筋虚血下におけるI群抗不整脈薬の催不整脈性の機序にNaチャネルの細胞内リモデリングが関与する可能性について (2012)
  • 著者名/発表者名: 津元国親、芦原貴司、原口亮、中沢一雄、倉智嘉久
  • 学会等名: 第122回日本薬理学会近畿部会
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター（大阪府）
  • 年月日: 20121116-20121116
• [学会発表] アセチルコリン感受性K+電流におけるshort term desensitization の機序のモデル検討 (2012)
  • 著者名/発表者名: 村上慎吾、稲野辺厚、倉智 嘉久
  • 学会等名: 第122回日本薬理学会近畿部会
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター（大阪府）
  • 年月日: 20121116-20121116
• [学会発表] システムバイオロジー概論 (2012)
  • 著者名/発表者名: 北野宏明
  • 学会等名: 第6回KASTシステムバイオロジー概論講座
  • 発表場所: かながわサイエンスパーク（神奈川）
  • 年月日: 20121102-20121102
  • 招待講演
• [学会発表] Arrhythmogenic significance of TRPM4 channel evaluated by a new experimental approach (2012)
  • 著者名/発表者名: Ryuji Inoue, Hu Yaopeng, Yubin Duan, Lin Hai. Jun Ichikawa
  • 学会等名: International Conference of Physiological Sciences 2012. Symposium 3
  • 発表場所: Suzhou (China)
  • 年月日: 20121102-20121102
• [学会発表] Multilevel Modeling and Simulation of Physiological Systems on PhysioDesigner (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshiyuki Asai, Takeshi Abe, Hideki Oka, Yoshiyuki Kido, Li Li, Taishin Nomuran, Yoshihisa Kurachi, Hiroaki Kitano
  • 学会等名: INCF Japan Node International Symposium ADVANCES IN NEUROINFORMATICS 2012
  • 発表場所: 理化学研究所（埼玉県）
  • 年月日: 20121030-20121030
• [学会発表] 虚血心筋におけるNaチャネルの細胞内分布変化がI群抗不整脈薬の催不整脈性の機序に関与する可能性について (2012)
  • 著者名/発表者名: 津元国親、芦原貴司、原口亮、中沢一雄、倉智嘉久
  • 学会等名: 第28回心電情報処理ワークショップ
  • 発表場所: 熱海後楽園ホテル（静岡県）
  • 年月日: 20121028-20121028
• [学会発表] Effects of block and facilitation of HERG channel by anti-arrhythmic agents on cardiac action potential: a simulation study (2012)
  • 著者名/発表者名: 古谷和春、津元国親、倉智嘉久
  • 学会等名: 第29回国際心臓研究学会(ISHR)日本部会総会
  • 発表場所: 九州大学医学部百年講堂（福岡県)
  • 年月日: 20121026-20121026
• [学会発表] Systems biomedicine and their computational platforms (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: FOSBE 2012
  • 発表場所: Institute for Advanced Biosciences, Keio University（山形）
  • 年月日: 20121021-20121021
  • 招待講演
• [学会発表] 線維化促進因子TGF-β1下流における消化管筋線維芽細胞TRPC4,C6チャネルの役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 倉原（海）琳、住吉美保、井上隆司
  • 学会等名: 第63回西日本生理学会
  • 発表場所: 全労済ソレイユ（大分）
  • 年月日: 20121019-20121019
• [学会発表] DAG活性化型TRPCチャネルとPIP2動態のキネティクス解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 齊 郷平、森 誠之、今井裕子、岡村康司、安部喜八郎、井上隆司
  • 学会等名: 第63回西日本生理学会
  • 発表場所: 全労済ソレイユ（大分）
  • 年月日: 20121019-20121019
• [学会発表] TRPM4チャネル発現増加による不整脈誘発機構の検討 (2012)
  • 著者名/発表者名: 胡 耀鵬、段 玉斌、倉原 琳、市川 純、井上隆司
  • 学会等名: 第63回西日本生理学会
  • 発表場所: 全労済ソレイユ（大分）
  • 年月日: 20121019-20121019
• [学会発表] 心筋Naチャネルの細胞内局在によって発生するPhase-2リエントリー：ブルガダ症候群との関連において (2012)
  • 著者名/発表者名: 津元国親、芦原貴司、原口亮、中沢一雄、倉智嘉久
  • 学会等名: 第29回日本心電学会学術集会
  • 発表場所: 幕張メッセ国際会議場・ホテルニューオータニ幕張（千葉県）
  • 年月日: 20121012-20121012
• [学会発表] 薬物によるhERGチャネルのファシリテーション作用：分子機序とその意義 (2012)
  • 著者名/発表者名: 古谷和春、津元国親、倉智嘉久
  • 学会等名: 第29回日本心電学会学術集会
  • 発表場所: 幕張メッセ国際会議場・ホテルニューオータニ幕張（千葉県）
  • 年月日: 20121012-20121012
• [学会発表] システム創薬とGarudaプラットフォームの概要 (2012)
  • 著者名/発表者名: 北野宏明
  • 学会等名: BioJapan 2012
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川）
  • 年月日: 20121011-20121011
• [学会発表] VPH in industrial research (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: VPH 2012
  • 発表場所: Savoy Place (London, UK)
  • 年月日: 20120920-20120920
  • 招待講演
• [学会発表] A platform for multilevel modeling of physiological systems: Template and instance framework for large scale models (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshiyuki Asai, Takeshi Abe, Hideki Oka, Masao Okita, Hagihara Ken-ichi, Yukiko Matsuoka, Samik Ghosh, Yoshihisa Kurachi, Hiroaki Kitano
  • 学会等名: 生体医工学シンポジウム2012
  • 発表場所: 大阪大学（大阪府）
  • 年月日: 20120907-20120907
• [学会発表] Systems Biology powered by Artificial Intelligence (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: PRICAI-2012: 12th Pacific Rim International Conference on Artificial Intelligence
  • 発表場所: Pullman Hotel (Kuching, Malaysia)
  • 年月日: 20120907-20120907
  • 招待講演
• [学会発表] TRPCとG蛋白質受容体刺激によるPIP2-DAG シグナルの連動性 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森 誠之、齊 郷平、井上隆司
  • 学会等名: 生理研研究会「膜機能分子の機能・構造ゆらぎの時空間スペクトル解析」
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター（岡崎、愛知）
  • 年月日: 20120906-20120907
• [学会発表] The role of TRPC1/C6 channels and STIM/Orai for cell cycle progression in bone marrow stromal cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Jun Ichikawa, Ryuji Inoue
  • 学会等名: International Ion Channel Conference (IICC)
  • 発表場所: Jeju (Korea)
  • 年月日: 20120824-20120824
• [学会発表] Biological Robustness (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: Seminar at University of Toronto
  • 発表場所: University of Toronto (Toronto, Canada)
  • 年月日: 20120820-20120820
  • 招待講演
• [学会発表] In silico assessment of the clinical relevance of HERG channel modulations (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazuharu Furutani, Kunichika Tsumoto, Yoshihisa Kurachi
  • 学会等名: The 13th international conference on system biology (ICSB 2012)
  • 発表場所: University of Toronto (Toronto, Canada)
  • 年月日: 20120819-20120819
• [学会発表] DrVSP、収縮作動薬によるPIP2 枯渇に対するTRPC3/C6/C7 チャネルの抑制的作用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 今井裕子、斎 郷平、岡村康司、森 誠之、井上隆司
  • 学会等名: 第54回日本平滑筋学会総会
  • 発表場所: 東京慈恵会医科大学（東京）
  • 年月日: 20120803-20120803
• [学会発表] 炎症性腸疾患線維化狭窄における消化管筋線維芽細胞TRPC4,C6チャネルの役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 倉原（海） 琳、住吉美保、井上隆司
  • 学会等名: 第54回日本平滑筋学会総会シンポジウム
  • 発表場所: 東京慈恵会医科大学（東京）
  • 年月日: 20120803-20120803
• [学会発表] HD-Physiology, Garuda, and Computational drug side-effects prediction (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: Talk at FDA
  • 発表場所: FDA (Silver Spring, USA)
  • 年月日: 20120717-20120717
  • 招待講演
• [学会発表] Systems Drug Design and Garuda Software Platform. Network Biology SIG: On the Analysis and Visualization of Network in Biology (NetBio SIG) (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: ISMB 2012
  • 発表場所: Long Beach Convention Center (CA, USA)
  • 年月日: 20120713-20120713
  • 招待講演
• [学会発表] 心筋Na+チャネルの細胞内分布変化がI群抗不整脈薬の効果に影響を及ぼす可能性について (2012)
  • 著者名/発表者名: 津元国親, 芦原貴司, 原口亮, 中沢一雄, 倉智嘉久
  • 学会等名: 第121回日本薬理学会近畿部会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県）
  • 年月日: 20120629-20120629
• [学会発表] ヒト子宮内膜間質細胞の脱落膜化過程におけるTRPC1の役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 瓦林靖広、倉原（海）琳、本田啓、市川純、井上隆司
  • 学会等名: 生理研研究会「第8回TRPチャネル研究会」
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター（岡崎、愛知）
  • 年月日: 20120615-20120615
• [学会発表] TRPM4チャネルの催不整脈性の再検討 (2012)
  • 著者名/発表者名: Hu Yaopeng、Duan Yubin、市川純、倉原琳、井上隆司
  • 学会等名: 生理研研究会「第8回TRPチャネル研究会」
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター（岡崎、愛知）
  • 年月日: 20120614-20120614
• [学会発表] Software Platform for Systems Drug Discovery (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: Bio-IT World Asia Conference 2012
  • 発表場所: Marina Bay Sands (Singapore)
  • 年月日: 20120608-20120608
  • 招待講演
• [学会発表] Will engineering play the lead role in drug discovery in 2030? (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 学会等名: BioMelbourne breakfast
  • 発表場所: Cinema 1 (Melbourne, Australia)
  • 年月日: 20120605-20120605
  • 招待講演
• [学会発表] Multilevel modeling on PhysioDesigner (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshiyuki Asai, Takeshi Abe, Tatsuhide Okamoto, Hideki Oka, Taishin Nomura, Yoshihisa Kurachi, Hiroaki Kitano
  • 学会等名: 第51回日本生体医工学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡県）
  • 年月日: 20120511-20120511
• [学会発表] 代数微分方程式で記述された心筋線維モデルにおける興奮伝導シミュレーション (2012)
  • 著者名/発表者名: 津元国親, 淺井義之, 古谷和春, 倉智嘉久
  • 学会等名: 第51回日本生体医工学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡県）
  • 年月日: 20120511-20120511
• [図書] Software Platform for Metabolic Network Reconstruction of Mycobacterium tuberculosis. Systems Biology of Tuberculosis. (2013)
  • 著者名/発表者名: Samik Ghosh, Yukiko Matsuoka, Yoshiyuki Asai, Hiroaki Kitano, Anshu Bhardwaj, Vinod Scaria, Rohit Vashisht, Anup Shah, Anupam Kumar Mondal, Priti Vishnoi, Kumari Sonal, Akanksha Jain, Priyanka Priyadarshini, Kausik Bhattacharyya, Vikas Kumar, Anurag Passi, Pratibha Sharma, Samir Brahmachari
  • 総ページ数: 226
  • 出版者: Springer
• [図書] がんの多様性の数理. 実験医学2013年1月号 (2013)
  • 著者名/発表者名: 北野宏明
  • 総ページ数: 127
  • 出版者: 羊土社
• [図書] 不整脈学、分担執筆（第1章心筋の電気生理/3.パッチクランプの黎明といま、p8-11） (2012)
  • 著者名/発表者名: 古谷和春、倉智嘉久
  • 総ページ数: 614
  • 出版者: 南江堂
• [図書] 不整脈学、分担執筆（第16章不整脈学への道/1.パッチクランプでみえたもの、p588-591） (2012)
  • 著者名/発表者名: 倉智嘉久、古谷和春
  • 総ページ数: 614
  • 出版者: 南江堂
• [図書] Patch Clamp Techniques: From Beginning to Advanced Protocols (Springer Protocols Handbooks)、分担執筆（Chapter23、Heterologous Expression Systems and Analyses of Ion Channels、p353-370） (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazuharu Furutani, Yoshihisa Kurachi
  • 総ページ数: 450
  • 出版者: Springer
• [図書] Cancer Systems Biology: A Robustness-Based Approach. HANDBOOK OF SYSTEMS BIOLOGY CONCEPTS AND INSIGHTS (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kitano
  • 総ページ数: 552
  • 出版者: Academic Press
• [図書] The pathophysiological implications of TRP channels in cardiac arrhythmia. In: "Cardiac Arrhythmias -New Considerations-" (2012)
  • 著者名/発表者名: Ryuji Inoue, Yubin Duan, Yaopeng Hu, Jun Ichikawa
  • 総ページ数: 544
  • 出版者: Open Access Publisher
• [図書] Lipid-mediated mechanisms involved in the mechanical activation of TRPC6 and TRPV4 channels in the vascular tone regulation. In: "Mechanosensitivity in Cells and Tissues" (2012)
  • 著者名/発表者名: Ryuji Inoue, Yaopeng Hu, Yubin Duan and Kyohei Itsuki
  • 総ページ数: 429
  • 出版者: Springer
• [備考] HD-Physiology
  • URL: http://hd-physiology.jp/
• [備考] PhysioDesigner
  • URL: http://www.physiodesigner.org/
• [産業財産権] 相互作用予測装置、相互作用予測方法、および、プログラム (2012)
  • 発明者名: 北野宏明, Kun- Yi Hsin, Samik Ghosh
  • 権利者名: システム・バイオロジー研究機構, 沖縄科学技術大学院大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 特願2012-134261
  • 出願年月日: 2012-06-13
• [産業財産権] データ通信システム、データ解析装置、データ通信方法、および、プログラム (2012)
  • 発明者名: 北野宏明, Samik Ghosh, 松岡由希子
  • 権利者名: 沖縄科学技術大学院大学他
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 特願2012-245326
  • 出願年月日: 2012-11-07
• [産業財産権] General-Purpose Simulation System Using Social Network Interface (2012)
  • 発明者名: Yoshiyuki Asai et al.
  • 権利者名: OIST; SBI; Osaka University
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: US仮出願、61671049
  • 出願年月日: 2012-07-12
  • 外国