アプタマー生物学の創成による脳内恒常性維持機構の解明

2022 年度 実績報告書

• 研究領域: アプタマー生物学の創成
• 研究課題/領域番号: 22H05035
• 研究機関: 東京農工大学
• 研究代表者: 塚越 かおり 東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (20708474)
• 研究分担者: 橋本 翔子 国立研究開発法人理化学研究所, 脳神経科学研究センター, 客員研究員 (50632890) ; 堀 由起子 東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 准教授 (80610683)
• 研究期間 (年度): 2022-05-20 – 2025-03-31
• キーワード: アプタマー / 脳内ホメオスタシス

研究実績の概要

総括班のミッションは、計画研究間での共同研究を円滑に進めることで、本研究領域における最大の挑戦であるアプタマー技術の分子生物学分野への融合を促進することである。そこで本年度、総括班は、「アプタマー生物学」研究領域の実現に必須の領域内共同研究の推進、アドバイザーを交えた領域会議の開催、国内外に情報を発信するための領域ホームページの開設と運営を行うことを目的とし活動した。まず、オンラインミーティングにより、研究メンバーによるキックオフミーティングを採択後直ちに実施した。その後、領域メンバーが利用できるSlack を開設するなど、オンラインツールを活用しながら計画班間での共同研究を推進した。具体的には、計画研究A01班-C01班間共同研究、計画研究B01班-C01班間共同研究が開始されている。結果、アプタマー候補クローンの取得という成果取得に貢献した。また10月に総括班代表の所属先を会場とし、アドバイザー・研究者全員が出席する領域会議を開催した。さらに第41回日本認知症学会学術集会/第37回日本老年精神医学会にて、領域研究についてのシンポジウムが採択され、領域研究者全員が研究発表・議論を行った。並行して領域の概要や活動、成果を発表するための領域ホームページを作成し、公開した。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

予定していた共同研究、領域会議、領域ホームページの公開を全て実施した。加えて、領域研究者で公募シンポジウムも実施することができた。

今後の研究の推進方策

引き続き年一回以上の領域会議を行い、領域研究全体を推進する。また共同研究が円滑に進むようオンラインミーティングやオンラインツールを活用した情報共有を行う。

研究成果

• [雑誌論文] Identification of novel amyloidosis in dogs: α-S1-casein acquires amyloidogenicity in mammary tumor by overexpression and N-terminal truncation (2023)
  • 著者名/発表者名: Tomoaki Murakami, Toshisuke Kaku, Kaori Tsukakoshi, Susumu Iwaide, Yoshiyuki Itoh, Miki Hisada, Kohji Nomura, Rikako Kubo, Kazunori Ikebukuro, Yukiko Sassa-O’Brien, Fuyuki Kametani
  • 雑誌名: Vet Pathol 巻: 60 (2) ページ: 203-213
  • DOI: 10.1177/03009858221148511
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Effects of G-Quadruplex Ligands on the Topology, Stability, and Immunostimulatory Properties of G-Quadruplex-Based CpG Oligodeoxynucleotides (2022)
  • 著者名/発表者名: Anh Thi Tram Tu, Kazuaki Hoshi, Yue Ma, Taiji Oyama, Satoko Suzuki, Kaori Tsukakoshi, Kazuo Nagasawa, Kazunori Ikebukuro, Tomohiko Yamazaki
  • 雑誌名: ACS Chem Biol 巻: 17 (7) ページ: 1703-1713
  • DOI: 10.1021/acschembio.1c00904
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Development of Alkaline Phosphatase-Fused Mouse Prion Protein and Its Application in Toxic Aβ Oligomer Detection (2022)
  • 著者名/発表者名: Kaori Tsukakoshi, Rikako Kubo, Kazunori Ikebukuro
  • 雑誌名: Int J Mol Sci 巻: 23 (23) ページ: 14588
  • DOI: 10.3390/ijms232314588
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The state of water molecules induces changes in the topologies and interactions of G-quadruplex DNA aptamers in hydrated ionic liquid (2022)
  • 著者名/発表者名: Kyoko Fujita, Takuya Honda, Kaori Tsukakoshi, Hiroyuki Ohno, Kazunori Ikebukuro
  • 雑誌名: Journal of Molecular Liquids 巻: 366 ページ: 120175
  • DOI: 10.1016/j.molliq.2022.120175.
  • 査読あり
• [雑誌論文] CpG Methylation Altered the Stability and Structure of the i-Motifs Located in the CpG Islands (2022)
  • 著者名/発表者名: Daiki Oshikawa, Shintaro Inaba, Yudai Kitagawa, Kaori Tsukakoshi, Kazunori Ikebukuro
  • 雑誌名: Int J Mol Sci 巻: 23 (12) ページ: 6467
  • DOI: 10.3390/ijms23126467
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Enhancement of DNAzymatic activity using iterative in silico maturation (2022)
  • 著者名/発表者名: Renzo A Fenati, Zifei Chen, Yasuko Yamagishi, Kaori Tsukakoshi, Kazunori Ikebukuor, Anjay Manian, Salvy P Russo, Tomohiko Yamazaki, Amanda V Ellis
  • 雑誌名: J Mater Chem B 巻: 10 (43) ページ: 8960-8969
  • DOI: 10.1039/d2tb01638a
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Development of a Lateral Flow Assay for Bevacizumab Using an Anti-Idiotype DNA Aptamer as a Capture Molecule (2022)
  • 著者名/発表者名: Kenichiro TODOROKI, Ryota ISOBE, Tomohiro YAMADA, Taro SAITO, Yutaka SHIMIZU, Kaori TSUKAKOSHI, Eiji SUGIYAMA, Hajime MIZUNO, Hideki HAYASHI, Kazunori IKEBUKURO
  • 雑誌名: Chromatography 巻: 43 (2) ページ: 73-77
  • DOI: 10.15583/jpchrom.2022.008
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] An isogenic panel of App knock-in mouse models: profiling β-secretase inhibition and endosomal abnormalities (2022)
  • 著者名/発表者名: Watamura, N. Sato, K. Shiihashi, G. Iwasaki, A. Kamano, N. Takahashi, M. Sekiguchi, M. Mihira, N. Fujioka, R. Nagata, K._Hashimoto, S._Saito, T. Ohshima, T. Saido, TC. & Sasaguri, H.
  • 雑誌名: Sci Adv 巻: 8 (23) ページ: eabm6155
  • DOI: 10.1126/sciadv.abm6155
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tau-binding protein PRMT8 facilitates vacuole degeneration in the brain (2022)
  • 著者名/発表者名: Ishii, A. Matsuba, Y. Mihira, N. Kamano, N. Saito, T. Muramatsu, S. Yokosuka, M. Saido, TC. & Hashimoto, S.
  • 雑誌名: J. Biochem. 巻: 172(4) ページ: mvac058
  • DOI: 10.1093/jb/mvac058
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mechanical detection of interactions between proteins related to intermediate filament and transcriptional regulation in living cells (2022)
  • 著者名/発表者名: Yamagishi, A., Mizusawa, M., Uchida, K., Iijima, M., Kuroda, S., Fukazawa, K., Ishihara, K., Nakamura, C.
  • 雑誌名: Biosens. Bioelectron. 巻: 216 ページ: 114603
  • DOI: 10.1016/j.bios.2022.114603
  • 査読あり
• [雑誌論文] Neuronal glutathione loss leads to neurodegeneration involving gasdermin activation (2022)
  • 著者名/発表者名: Hashimoto S, Matsuba Y, Takahashi M, et al.
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 13 ページ: 1109
  • DOI: 10.1038/s41598-023-27653-w
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] タンパク質機能を制御するDNAアプタマーの開発：「アプタマー生物学」の創成へ (2022)
  • 著者名/発表者名: 塚越 かおり, 小林 俊一, 守屋 里紗, 仲 和奏, 池袋 一典
  • 学会等名: 第41回日本認知症学会学術集会
• [学会発表] 生きた細胞を操作・解析するナノニードル技術 (2022)
  • 著者名/発表者名: 山岸 彩奈, 中村 史
  • 学会等名: 第41回日本認知症学会学術集会
• [学会発表] CAPON-nNOS相互作用による神経変性誘導について (2022)
  • 著者名/発表者名: 橋本 翔子, 西道 隆臣
  • 学会等名: 第41回日本認知症学会学術集会
• [学会発表] NF-κB経路を介したKLK7発現制御機構の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 堀 由起子, 須藤 優喜, 宋 家禎, 富田 泰輔
  • 学会等名: 第41回日本認知症学会学術集会
• [備考] 「アプタマー生物学の創成」領域ホームページ
  • URL: https://web.tuat.ac.jp/~aptamericbiology/index.html