マトリョーシカ型進化原理（総括班）

2014 年度 実績報告書

• 研究領域: マトリョーシカ型進化原理
• 研究課題/領域番号: 23117001
• 研究機関: 国立感染症研究所
• 研究代表者: 野崎 智義 国立感染症研究所, その他部局等, その他 (60198588)
• 研究分担者: 洲崎 敏伸 神戸大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (00187692) ; 坪井 敬文 愛媛大学, 学内共同利用施設等, 教授 (00188616) ; 守屋 繁春 独立行政法人理化学研究所, その他部局等, 研究員 (00321828) ; 津久井 久美子 国立感染症研究所, その他部局等, 研究員 (00420092) ; 松崎 素道 東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (00511396) ; 橘 裕司 東海大学, 医学部, 教授 (10147168) ; 石田 健一郎 筑波大学, 生命環境科学研究科(系), 教授 (30282198) ; 小保方 潤一 京都府立大学, 生命環境科学研究科(系), 教授 (50185667) ; 橋本 哲男 筑波大学, 生命環境科学研究科(系), 教授 (50208451) ; 金子 修 長崎大学, 熱帯医学研究所, 教授 (50325370) ; 稲垣 祐司 筑波大学, 生命環境科学研究科(系), 准教授 (50387958) ; 井上 勲 筑波大学, 生命環境科学研究科(系), 教授 (70168433) ; 永井 宏樹 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (80222173) ; 黒田 誠 国立感染症研究所, その他部局等, その他 (80317411) ; 永宗 喜三郎 国立感染症研究所, その他部局等, その他 (90314418)
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: 共生 / 寄生 / オルガネラ / 微生物 / 進化

研究実績の概要

領域班会議を2 回、７月と1 月に開催し、研究の進捗状況を相互確認した。特に支援班が支援すべき項目・内容に関して、領域全体の方向性に従って調整を行った。今後の国際シンポの開催・テーマ・招聘者、アウトリーチ活動などに関して、担当者を中心として総括班会議にて決定した。
研究支援活動として、ゲノミクス・メタゲノミクス支援では、班員から提案された要望から、領域全体の利益に合致するものを総括班が選定した上で、次世代シーケンサーを用いたゲノム・メタゲノム解析の支援を行った。コムギ胚芽無細胞合成系を用いたタンパク質合成支援では、通常の発現系で合成が困難なタンパク質の発現・合成・精製支援を行った。
国際・国内学会等の場でのコンセプトの宣伝としては、6月にチェコにてCanadian Institute for Advanced Researchの国際会議へ参加した。更に、広報活動として、ニュースレターの作成、ホームページの作成、アウトリーチ活動はサイエンスカフェにより成果を社会に還元した

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

計画通り順調に達成された。

今後の研究の推進方策

次年度は以下の計画を行う。
A. 領域班会議：領域班会議を2 回、9月と1 月に開催し、研究の進捗状況を相互確認する。研究領域全体の目標を常に整理し、問題点を領域全体で議論し、具体的方策をつくる。支援班・国際シンポ等の開催・テーマ・招聘者・広報活動などに関して議論・決定する。
B. 研究支援活動：ゲノミクス・メタゲノミクス支援では、班員から提案された要望から、領域全体の利益に合致するものを総括班が選定した上で、次世代シーケンサーを用いたゲノム・メタゲノム解析の支援を行う。コムギ胚芽無細胞合成系を用いたタンパク質合成支援では、通常の発現系で合成が困難なタンパク質の発現・合成・精製支援を行う。イメージング支援では、オルガネラ成立、分裂・輸送、相互作用等に関してリアルタイムイメージング（共焦点レーザー顕微鏡）・微細局在解析（超解像顕微鏡・クライオ電子顕微鏡）の技術支援を行う。
C. シンポジウム・広報活動：5月には、Canadian Institute for Advanced Reserachのビクトリアでの会議への参加を行う。9月には筑波において、本領域の二度目のマトリョーシカ型生物学の国際シンポジウム（マトリョーシカ型生物学研究会共催）を行う。10月のInternational Society for Evolutionary Protistologyの学会へ参加する。ホームページ・ニュースレターの作成により成果を社会に還元する。

研究成果

• [雑誌論文] A novel Mitosomal beta-barrel Outer Membrane Protein in Entamoeba (2015)
  • 著者名/発表者名: Santos HJ, Imai K, Makiuchi T, Tomii K, Horton P, Nozawa A, Ibrahim M, Tozawa Y, *Nozaki T.
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 5 ページ: 8545
  • DOI: 10.1038/srep08545
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Mechanisms of interferon-beta-induced inhibition of Toxoplasma gondii growth in murine macrophages and embryonic fibroblasts: role of immunity-related GTPase M1. (2015)
  • 著者名/発表者名: Mahmoud ME, Ui F, Salman D, Nishimura M, *Nishikawa Y
  • 雑誌名: Cell Microbiol 巻: - ページ: -
  • DOI: 10.1111/cmi.12423
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] MitoFates: Improved Prediction of Mitochondrial Targeting Sequences and Their Cleavage Sites. (2015)
  • 著者名/発表者名: Fukasawa Y, Tsuji J, Fu SC, Tomii K, Horton P, *Imai K.
  • 雑誌名: Mol Cell Proteomics 巻: 14 ページ: 1113-1126
  • DOI: 10.1074/mcp.M114.043083
  • 査読あり
• [雑誌論文] Amoebal endosymbiont Parachlamydia acanthamoebae Bn9 can grow in immortal human epithelial HEp-2 cells at low temperature; an in vitro model system to study chlamydial evolution. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yamane C, Yamazaki T, Nakamura S, Matsuo J, Ishida K, Yamazaki S, Oguri S, Shouji N, Hayashi Y, Yoshida M, Yimin, Yamaguchi H
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 ページ: e0116486
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0116486
  • 査読あり
• [雑誌論文] Native structure of a type IV secretion system core complex essential for Legionella pathogenesis (2014)
  • 著者名/発表者名: Kubori T, Koike M, Bui XT, Higaki S, Aizawa S, *Nagai H
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 巻: 111 ページ: 11804-11809
  • DOI: 10.1073/pnas.1404506111
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Aphid gene of bacterial origin encodes a protein transported to an obligate endosymbiont. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakabachi A, Ishida K, Hongoh Y, Ohkuma M, Miyagishima SY.
  • 雑誌名: Curr Biol 巻: 24 ページ: R640-R641
  • DOI: 10.1016/j.cub.2014.06.038
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Palpitomonas bilix represents a basal cryptist lineage: insight into the character evolution in Cryptista. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yabuki A, Kamikawa R, Ishikawa SA, Kolisko M, Kim E, Tanabe AS, Kume K, Ishida K, Inagki Y
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 4 ページ: 4641
  • DOI: 10.1038/srep04641
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Complete genome of a nonphotosynthetic cyanobacterium in a diatom reveals recent adaptations to an intracellular lifestyle (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakayama T, Kamikawa R, Tanifuji G, Kashiyama Y, Ohkouchi N, Archibald JM, Inagaki Y
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 巻: 111 ページ: 11407-11412
  • DOI: 10.1073/pnas.1405222111
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Expression and localization of rhoptry neck protein 5 in merozoites and sporozoites of Plasmodium yoelii. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mutungi JK, Yahata K, Sakaguchi M, *Kaneko O.
  • 雑誌名: Parasitol Int 巻: 63 ページ: 794-801
  • DOI: 10.1016/j.parint.2014.07.013
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Glycogen production for biofuels by the euryhaline cyanobacteria Synechococcus sp. strain PCC 7002 from an oceanic environment. (2014)
  • 著者名/発表者名: Aikawa S, Nishida A, Ho SH, Chang JS, Hasunuma T, Kondo A
  • 雑誌名: Biotechnol Biofuels 巻: 7 ページ: 88
  • DOI: 10.1186/1754-6834-7-88
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bacterial population succession and adaptation affected by insecticide application and soil spraying history (2014)
  • 著者名/発表者名: Itoh H, Navarro R, Takeshita K, Tago K, Hayatsu M, Hori T, *Kikuchi Y
  • 雑誌名: Front Microbiol 巻: 5 ページ: 457
  • DOI: 10.3389/fmicb.2014.00457
  • 査読あり
• [雑誌論文] Polyploidy of endosymbiotically derived genomes in complex algae (2014)
  • 著者名/発表者名: Hirakawa Y, Ishida K
  • 雑誌名: Genome Biol Evo 巻: 6 ページ: 974-980
  • DOI: 10.1093/gbe/evu071
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [備考] http://www.matryoshka-evolution.jp/