「転写サイクル」領域の総括

2014 年度 実績報告書

• 研究領域: 高精細アプローチで迫る転写サイクル機構の統一的理解
• 研究課題/領域番号: 24118001
• 研究機関: 東京工業大学
• 研究代表者: 山口 雄輝 東京工業大学, 生命理工学研究科, 教授 (50345360)
• 研究分担者: 十川 久美子 東京工業大学, 生命理工学研究科, 准教授 (20291073) ; 中村 春木 大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (80134485) ; 松本 直通 横浜市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (80325638) ; 高橋 陽介 広島大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (90183855) ; 緒方 一博 横浜市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (90260330) ; 伊藤 敬 長崎大学, 医歯(薬)学総合研究科, 教授 (90306275)
• 研究期間 (年度): 2012-06-28 – 2017-03-31
• キーワード: 遺伝子

研究実績の概要

本領域では、先端的な解析技術の開発・導入、および、ウェットとドライ（情報科学・計算科学）の融合、という2つをドラインビングフォースとして、転写制御の全体像を定量的に明らかにすることを目指している。総括班は、開発された技術を領域内外に普及させる活動や、ウェットとドライの融合を促進する場の醸成等を通じて、転写サイクル研究を推進する。研究支援の具体的な活動内容は以下のとおりである。
（1）先端的技術の領域内共同システムの構築と運用。H25年度までに次世代シーケンサー、１分子蛍光顕微鏡、構造解析装置の領域内共同利用システムを確立したので、H26年度はその利用率の向上を図るためチュートリアルの整備等を行った。
（2）トレーニングワークショップ（TWS）の開催。H26年度は実施しなかったが、その代わり、ウェットとドライの融合を図る試みとして、全体班会議（下記）でパネルディスカッションを実施した。
（3）領域内の研究交流ならびに若手支援。H26年度は当初計画に従い、H26年8月に第3回全体班会議を磯部（群馬県）で開催した。また、H26年11月には国際シンポジウムを東京で開催し、領域の内外から約200名の聴衆を集めた。国際シンポジウムにはRobert G. Roeder先生をはじめとする6名の著名な研究者を講演者として領域外から招いた。さらに、若手中心の研究発表の場として、転写研究会ならびに新学術「転写代謝」領域との共催で「冬の若手ワークショップ」をH27年2月に伊香保（群馬県）で開催した。また「若手海外派遣」を今年度も実施し、領域内公募を経て大学院生1名がドイツの国際会議に参加し発表するのを支援した。
（4）広報活動。領域ウェブサイトを通じて、引き続き積極的な情報発信を行った。また、H27年1月にはニュースレターを発刊した。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

H26年度は国際シンポジウムを開催したのをはじめ、班会議や若手主体のワークショップの開催、その他研究会の共催、国内外研究者によるセミナーの開催支援等を積極的に行ない、班員間での融合的研究の促進や領域内外の情報交換を昨年度、一昨年度以上に行うことができた。先端的技術の領域内共同システムの構築と運用や若手支援、若手支援、広報活動も計画通りに進めることができた。

今後の研究の推進方策

総括班が担う研究支援活動を以下に列挙する。
1．先端的技術の領域内共同利用システムの構築。本領域では、次世代シーケンサーや１分子顕微鏡、構造解析用の装置を総括班の経費で購入し、各分野に習熟した松本、十川、緒方がそれぞれの機器の管理・運用を技術支援を行っている。H24年度に機器を導入し、H25年度に運用を開始、H26年度にはその利用率の向上を図るためチュートリアルの整備等を行った。H27年度は、広報や講習会等の開催を通じて、機器の利用率をさらに高めていく。
2．トレーニングワークショップや講習会の開催。革新的な技術をいち早く導入し、従来の方法では解析不能な対象に挑むためには、その技術の原理を理解する必要がある。しかしバイオインフォマティクスや計算科学等は、生物分野の多くの研究者にとってなじみが薄いので、これらの手法に関する原理やテクニックを学ぶためのトレーニングワークショップや講習会を今年度も開催する予定である。
3．若手研究者育成のための情報交換の機会の提供。通常の全体班会議を年１回開催するほか、若手主体のワークショップを開催し、若手に発表の機会を与える。さらに、領域の若手研究者が海外で研究発表を行う際の旅費の支援も引き続き行う。
4．広報活動。領域のウェブサイトを通じて研究者のみならず一般社会に向けて、領域の活動内容を発信してきた。H27年度も引き続き、領域ウェブサイトを頻繁に更新して情報発信に務める。さらにニュースレターも発行して、領域の諸活動や研究成果の広報に務める。

研究成果

• [雑誌論文] A novel allosteric mechanism on protein-DNA interactions underlying the phosphorylation-dependent regulation of Ets1 target gene expressions (2015)
  • 著者名/発表者名: Shiina M, Hamada K, Inoue-Bungo T, Shimamura M, Uchiyama A, Baba S, Sato K, Yamamoto M, Ogata K
  • 雑誌名: J Mol Biol 巻: 427(8) ページ: 1655-1669
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2014.07.020
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification and in vivo functional characterization of novel compound heterozygous BMP1 variants in osteogenesis imperfecta (2015)
  • 著者名/発表者名: Cho SY, Asharani PV, Kim OH, Iida A, Miyake N, Matsumoto N, Nishimura G, Ki CS, Hong G, Kim SJ, Sohn YB, Park SW, Lee J, Kwun Y, Carney TJ, Huh R, Ikegawa S, Jin DK
  • 雑誌名: Human Mutation 巻: 36(2) ページ: 191-195
  • DOI: 10.1002/humu.22731
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Phosphatase protection assay: 14-3-3 binding protects the phosphate group of RSG from λ protein phosphatase (2015)
  • 著者名/発表者名: Ito, T. and Takahashi, Y.
  • 雑誌名: Bio-Protocol 巻: 5 ページ: e1395
  • DOI: bio-protocol.org/e1395
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] GRIN1 mutations cause encephalopathy with infantile-onset epilepsy, and hyperkinetic and stereotyped movement disorders (2015)
  • 著者名/発表者名: Ohba C, Shiina M, Tohyama J, Haginoya K, Lerman-Sagie T, Okamoto N, Blumkin L, Lev D, Mukaida S, Nozaki F, Uematsu M, Onuma A, Kodera H, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Tanaka F, Kato M, Ogata K, Saitsu H, Matsumoto N
  • 雑誌名: Epilepsia 巻: 印刷中 ページ: 印刷中
  • DOI: 10.1111/epi.12987
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification of diphtheria toxin R domain mutants with enhanced inhibitory activity against HB-EGF (2015)
  • 著者名/発表者名: Keisuke Suzuki, Hiroto Mizushima, Hiroyyki Abe, Ryo Iwamoto, Haruki Nakamura, Eisuke Mekada
  • 雑誌名: Journal of Biochemistry 巻: 157 ページ: 331-343
  • DOI: 10.1093/jb/mvu079
  • 査読あり
• [雑誌論文] SV40 VP1 major capsid protein in its self-assembled form allows VP1 pentamers to coat various types of artificial beads in vitro regardless of their sizes and shapes (2014)
  • 著者名/発表者名: Kawano, M., Doi, K., Fukuda, H., Kita, Y., Imai, K., Inoue, T., Enomoto, T., Matsui, M., Hatakeyama, M., Yamaguchi, Y., and Handa, H.
  • 雑誌名: Biotechnol. Rep. 巻: 5 ページ: 105-111
  • DOI: 10.1016/j.btre.2014.12.008
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] DSIF and NELF interact with Integrator to specify the correct post-transcriptional fate of snRNA genes (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, J., Hagiwara, Y., Chiba, K., Isobe, T., Narita, T., Handa, H., and Yamaguchi, Y.
  • 雑誌名: Nat. Commun. 巻: 5 ページ: 4263
  • DOI: 10.1038/ncomms5263
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Inhibition of protein SUMOylation by davidiin, an ellagitannin from Davidia involucrata (2014)
  • 著者名/発表者名: Takemoto, M., Kawamura, Y., Hirohama, M., Yamaguchi, Y., Handa, H., Saitoh, H., Nakao, Y., Kawada, M., Khalid, K., Koshino, H., Kimura, K., Ito, A., and Yoshida, M.
  • 雑誌名: J. Antibiot. 巻: 67 ページ: 335-338
  • DOI: 10.1038/ja.2013.142
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Magnetically-promoted rapid immunoreactions using functionalized fluorescent magnetic beads (2014)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto, S., Omagari, K., Kita, Y., Mochizuki, Y., Naito, Y., Kawata, S., Matsuda, S., Itano, O., Jinno, H., Takeuchi, H., Yamaguchi, Y., Kitagawa, Y., and Handa, H.
  • 雑誌名: Clin. Chem. 巻: 60 ページ: 610-620
  • DOI: 10.1373/clinchem.2013.211433
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Scaffold function of Ca2+-dependent protein kinase: NtCDPK1 transfers 14-3-3 to the substrate RSG after phosphorylation (2014)
  • 著者名/発表者名: Ito T, Nakata M, Fukazawa J, Ishida S, Takahashi Y.
  • 雑誌名: Plant Physiol. 巻: 165 ページ: 1737-1750
  • DOI: 10.1104/pp.114.236448
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] DELLAs function as coactivators of GAI ASSOCIATED FACTOR1 in regulation of GA homeostasis and signaling in Arabidopsis (2014)
  • 著者名/発表者名: Fukazawa J, Teramura H, Murakoshi S, Nasuno K, Nishida N, Ito T, Yoshida M, Kamiya Y, Yamaguchi S, Takahashi Y.
  • 雑誌名: Plant Cell 巻: 26 ページ: 2920-2938
  • DOI: 10.1105/tpc.114.125690
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Phosphorylation-independent binding of 14-3-3 to NtCDPK1 by a new mode (2014)
  • 著者名/発表者名: Ito T, Nakata M, Fukazawa J, Ishida S, Takahashi Y.
  • 雑誌名: Plant Signal Behav. 巻: 9 ページ: e977721
  • DOI: 10.4161/15592324.2014.977721
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Crystallization of the Ets1-Runx1-CBFβ-DNA complex formed on the TCRα gene enhancer (2014)
  • 著者名/発表者名: Shiina M, Hamada K, Inoue-Bungo T, Shimamura M, Baba S, Sato K, Ogata K
  • 雑誌名: Acta Crystallogr F Struct Biol Commun 巻: 70 ページ: 1380-1384
  • DOI: 10.1107/S2053230X14018470
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A hemizygous GYG2 mutation and Leigh syndrome: a possible link? (2014)
  • 著者名/発表者名: Imagawa E, Osaka H, Yamashita A, Shiina M, Takahashi E, Sugie H, Nakashima M, Tsurusaki Y, Saitsu H, Ogata K, Matsumoto N, Miyake N
  • 雑誌名: Hum Genet 巻: 133 ページ: 225-234
  • DOI: 10.1007/s00439-013-1372-6
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Regulation of RNA polymerase II activation by histone acetylation in single living cells (2014)
  • 著者名/発表者名: Stasevich TJ, Hayashi-Takanaka Y, Sato Y, Maehara K, Ohkawa Y, Sakata-Sogawa K, Tokunaga M, Nagase T, Nozaki N, McNally JG, Kimura H
  • 雑誌名: Nature 巻: 516 ページ: 272-275
  • DOI: 10.1038/nature13714
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Facile Preparation of Glass-supported Lipid Bilayers for Analyzing Molecular Dynamics (2014)
  • 著者名/発表者名: Ito Y, Sakata-Sogawa K, Tokunaga M
  • 雑誌名: Anal Sci 巻: 30 ページ: 1103-1106
  • DOI: 10.2116/analsci.30.1103
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Nuclear actin activates human transcription factor genes including the OCT4 gene (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki S., Yamamoto K., Tokunaga M., Sakata-Sogawa K., Harata M.
  • 雑誌名: Biosci Biotechnol Biochem 巻: 79 ページ: 242-246
  • DOI: 10.1080/09168451
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Clinical exome sequencing in neurology practice (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyatake S,Matsumoto N.
  • 雑誌名: Nat Rev Neurol 巻: 10（12） ページ: 676-678
  • DOI: 10.1038/nrneurol.2014.213
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] De novo SOX11 mutations cause Coffin-Siris syndrome (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsurusaki Y, Ohashi H, Phadke S, Koshimizu E, Kou I, Shiina M, Suzuki T, Okamoto N, Imamura S, Yamashita M, Watanabe S, Yoshiura K-i, Kodera H, Miyatake S, Nakashima N, Saitsu H, Ogata K, Ikegawa S, Miyake N, and Matsumoto N.
  • 雑誌名: Nat Commun 巻: 5 ページ: 4011
  • DOI: 10.1038/ncomms5011
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Expanding the phenotypic spectrum of TUBB4A-associated hypomyelinating leukoencephalopathies (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyatake S, Osaka H, Shiina M, Sasaki M, Takanashi J, Haginoya K, Wada T, Morimoto M, Ando N, Ikuta Y, Nakashima N, Tsurusaki Y, Miyake N, Ogata K, Matsumoto N, Saitsu H .
  • 雑誌名: Neurology 巻: 82(24) ページ: 2230-2237
  • DOI: 10.1212/WNL.0000000000000535
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] PIGA mutations cause early-onset epileptic encephalopathies and distinctive features (2014)
  • 著者名/発表者名: Kato M, Saitsu H, Murakami Y , Kikuchi K, Watanabe S, Iai M, Miya K, Matsuura R, Takayama R, Ohba C, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Hamano S, Osaka H, Hayasaka K, Kinoshita T, Matsumoto N.
  • 雑誌名: Neurology 巻: 82（18） ページ: 1587-1596
  • DOI: 10.1212/WNL.0000000000000389
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] AKT3 and PIK3R2 mutations in two patients with megalencephaly-related syndromes (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakamura K, Kato M, Tohyama J, Shiohama T, Hayasaka K, Nishiyama K, Kodera H, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Matsumoto N, Saitsu H.
  • 雑誌名: Clin Genet 巻: 85（4） ページ: 396-398
  • DOI: 10.1111/cge.12188
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] PIGN mutations cause congenital anomalies, developmental delay, hypotonia, epilepsy, and progressive cerebellar atrophy (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohba C, Okamoto N, Murakami Y, Kawato K, Suzuki Y, Ikeda T, Tsurusaki Y, Nakashima M, Miyake N, Tanaka F, Kinoshita T, Matsumoto N, Saitsu H .
  • 雑誌名: Neurogenet 巻: 15（2） ページ: 85-92
  • DOI: 10.1007/s10048-013-0384-7
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Early onset epileptic encephalopathy caused by de novo SCN8A mutations (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohba C, MD, Kato M, Takahashi S, Lerman-Sagie T, Lev D, Terashima H, Kubota M, Kawawaki H, Matsufuji M, Kojima Y, Tateno A, Goldberg-Stern H, Straussberg R, MD, Marom D, Leshinsky-Silver E, Nakashima M, Nishiyama K, Tsurusaki T, Miyake N, Tanaka F, Matsumoto N, Saitsu H .
  • 雑誌名: Epilepsia 巻: 55（7） ページ: 994-1000
  • DOI: 10.1111/epi.12668
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] De novo WDR45 mutation in a patient showing clinically Rett syndrome with childhood iron deposition in brain (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohba C, Nabatame S, Iijima Y, Nishiyama K, Tsurusaki Y, Nakashima M, Miyake N, Tanaka F, Ozono K, Saitsu H, Matsumoto N.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 59（5） ページ: 292-295
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.18
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Deep sequencing detects very low-grade somatic mosaicism in the unaffected mother of siblings with nemaline myopathy (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyatake S, Koshimizu E, Hayashi YK, Miya K, Shiina M, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Ogata K, Nishino I, Matsumoto N.
  • 雑誌名: Neuromuscul Disord 巻: 24（7） ページ: 642-647
  • DOI: 10.1016/j.nmd.2014.04.002
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Novel compound heterozygous PIGT mutations caused multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 3 (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakashima M, Kashii H, Murakami Y, Kato M, Tsurusaki Y, Miyake N, Kubota M, Kinoshita T, Saitsu H, Matsumoto N.
  • 雑誌名: Neurogenet 巻: 15（3） ページ: 193-200
  • DOI: 10.1007/s10048-014-0408-y
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Numerous BAF complex genes are mutated in Coffin-Siris syndrome (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyake N, Tsurusaki Y, Matsumoto N.
  • 雑誌名: Am J Med Genet Part C 巻: 166c（3） ページ: 257-261
  • DOI: 10.1002/ajmg.c.31406
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Causative novel PNKP mutations and concomitant PCDH15 mutations in a patient with microcephaly with early-onset seizures and developmental delay syndrome and hearing loss (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakashima M, Takano K, Osaka H, Aida N, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Matsumoto N.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 59（8） ページ: 471-474
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.51
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Whole exome analysis identifies frequent CNGA1 mutations in Japanese population with autosomal recessive retinitis pigmentosa (2014)
  • 著者名/発表者名: Katagiri S, Akahori M, Sergeev Y, Yoshitake K, Ikeo K, Furuno M, Hayashi T, Kondo M, Ueno S, Tsunoda K, Shinoda K, Kuniyoshi K, Tsurusaki Y, Matsumoto N, Tsuneoka H, Iwata T.
  • 雑誌名: Plos One 巻: 9（9） ページ: e108721
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0108721
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Whole exome sequencing revealed causative biallelic IFT122 mutations in a family with CED1 and recurrent pregnancy loss (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsurusaki Y, Yonezawa R, Furuya M, Nishimura G, Pooh RK, Nakashima M, Saitsu H, Miyake N, Saito S, *Matsumoto N.
  • 雑誌名: Clin Genet 巻: 85（6） ページ: 592-594
  • DOI: 10.1111/cge.12215
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Coffin-Siris syndrome is a SWI/SNF complex disorder (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsurusaki Y, Okamoto N, Ohashi H, Mizuno S, Matsumoto N, Makita Y, Fukuda M, Isidor B, Perrier J, Aggarwal S, Al-Kindy A, Liebelt J, Mowat D, Nakashima M, Saitsu H, Miyake N, Matsumoto N.
  • 雑誌名: Clin Genet 巻: 85（6） ページ: 548-554
  • DOI: 10.1111/cge.12225
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] De novo EEF1A2 mutations in patients with characteristic facial features, intellectual disability and, autistic behaviors and epilepsy (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakajima J, Okamoto N, Tohyama J, Kato M, Arai H, Funahashi O, Tsurusakia Y, Nakashima M, Kawashima H, Saitsu H, Matsumoto N, Miyake N.
  • 雑誌名: Clin Genet 巻: 87(4) ページ: 356-361
  • DOI: 10.1111/cge.12394
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Dominant mutations in ORAI1 cause tubular-aggregate-myopathy with hypocalcemia by constitutive activation of store-operated Ca2+ channel (2014)
  • 著者名/発表者名: Endo Y, Noguchi S, Hara Y, Hayashi YK, Motomura K, Murakami N, Tanaka S, Yamashita S, Kizu R, Bamba M, Goto Y, Matsumoto N, Nonaka I, Nishino I.
  • 雑誌名: Hum Mol Genet 巻: 24（3） ページ: 637-648
  • DOI: 10.1093/hmg/ddu477
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Late-onset spastic ataxia phenotype in a patient with a homozygous DDHD2 mutation (2014)
  • 著者名/発表者名: Doi H, Ushiyama M, Baba T, Tani K, Shiina M, Ogata K, Miyatake S, Fukuda-Yuzawa Y, Tsuji S, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Ikeda S, Tanaka F, Matsumoto N, Yoshida K.
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 24（4） ページ: 7132
  • DOI: 10.1038/srep07132
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Atypical giant axonal neuropathy arising from a homozygous mutation by uniparental isodisomy (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyatake S, Koshimizu E, Tada H, Satoshi Moriya S, Takanashi J, Hirano Y, Hayashi M, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Matsumoto N, Saitsu H.
  • 雑誌名: Clin Genet 巻: 87（4） ページ: 395-397
  • DOI: 10.1111/cge.12455
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] High-resolution modeling of antibody structures by a combination of bioinformatics, expert knowledge, and molecular simulations (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Shirai, Kazuyoshi Ikeda, Kazuo Yamashita, Yuko Tsuchiya, Jamica Sarmiento, Shide Liang, Tatsuaki Morokata, Kenji Mizuguchi, Junichi Higo, Daron M. Standley, Haruki Nakamura
  • 雑誌名: Proteins 巻: 82 (8) ページ: 1624-1635
  • DOI: 10.1002/prot.24591
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Zero-multipole summation method for estimating electrostatic interactions in molecular dynamics: analysis of the accuracy and application to liquid systems (2014)
  • 著者名/発表者名: Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 巻: 140 ページ: 194307
  • DOI: 10.1063/1.4875693
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 3D flexible alignment using 2D maximum common substructure: dependence of prediction accuracy on target-reference chemical similarity (2014)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Kawabata, Haruki Nakamura
  • 雑誌名: Journal of Chemical Information and Modeling 巻: 54 (7) ページ: 1850-1863
  • DOI: 10.1021/ci500006d
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure of the entire stalk region of the dynein motor domain (2014)
  • 著者名/発表者名: Yosuke Nishikawa, Takuji Oyama, Narutoshi Kamiya, Takahide Kon, Yoko Y. Toyoshima, Haruki Nakamura, Genji Kurisu
  • 雑誌名: Journal of Molecular Biology 巻: 426 ページ: 3232-3245
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2014.06.023
  • 査読あり
• [雑誌論文] Kotai Antibody Builder: Automated, high-resolution structural modeling of antibodies (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuo Yamashita, Kazuyoshi Ikeda, Karlou Amada, Shide Liang, Yuko Tsuchiya,Haruki Nakamura, Hiroki Shirai, Daron M Standley
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 30 (22) ページ: 3279-3280
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/510
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Novel Approach of Dynamic Cross Correlation Analysis on Molecular Dynamics Simulations and its Application to Ets1 dimer–DNA Complex (2014)
  • 著者名/発表者名: Kota Kasahara, Ikuo Fukuda, Haruki Nakamura
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9 (11) ページ: e112419
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0112419
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The specification and global reprogramming of histone epigenetic marks during gamete formation and early embryo development in C. elegans (2014)
  • 著者名/発表者名: Samson M, Jow MM, Wong CC, Fitzpatrick C, Aslanian A, Saucedo I, Estrada R, Ito T, Park SK, Yates JR, Chu, DS
  • 雑誌名: PLoS Genet 巻: 10 ページ: e1004588
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1004588
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [学会発表] アフィニティビーズを利用した生物活性物質標的タンパク質の単離・同定・評価 (2015)
  • 著者名/発表者名: 坂本 聡、山口 雄輝、半田 宏
  • 学会等名: 日本薬学会第135年会
  • 発表場所: 神戸学院大学（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-03-28
• [学会発表] DELLA-GAF1/IDD2複合体によるGA信号伝達とフィードバック制御機構 (2015)
  • 著者名/発表者名: 深澤壽太郎、高橋陽介
  • 学会等名: 第56回日本植物生理学会
  • 発表場所: 東京農業大学（東京都世田谷区）
  • 年月日: 2015-03-18
• [学会発表] EPR1の新奇転写抑制モチーフの機能解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 伊藤岳、高橋陽介
  • 学会等名: 第56回日本植物生理学会
  • 発表場所: 東京農業大学（東京都世田谷区）
  • 年月日: 2015-03-17
• [学会発表] 転写因子Ets1の天然変性領域によるDNA認識調節メカニズムに関する計算化学的検討 (2015)
  • 著者名/発表者名: 笠原浩太
  • 学会等名: 第3回天然変性蛋白質計算科学セミナー
  • 発表場所: 御殿場高原時之栖（静岡県御殿場市）
  • 年月日: 2015-03-11
• [学会発表] DSIF and NELF interact with Integrator to specify the correct post-transcriptional fate of snRNA genes (2015)
  • 著者名/発表者名: 山本 淳一、半田 宏、山口 雄輝
  • 学会等名: 冬の若手ワークショップ2015
  • 発表場所: ホテル松本楼（群馬県渋川市）
  • 年月日: 2015-02-06
• [学会発表] 転写伸長因子DSIFのリン酸化の転写伸長反応への寄与の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 磯部 智康、千葉 国俊、山口 雄輝
  • 学会等名: 冬の若手ワークショップ2015
  • 発表場所: ホテル松本楼（群馬県渋川市）
  • 年月日: 2015-02-06
• [学会発表] 核内アクチンフィラメントの転写制御への関与とその分子機構の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 山崎 祥他, 山本 浩二、十川 久美子, 徳永 万喜洋, 原田 昌彦
  • 学会等名: 第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 安芸グランドホテル(広島県廿日市市)
  • 年月日: 2014-12-15 – 2014-12-17
• [学会発表] 個別化医療を進めるために (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 日本遺伝子診療学会：遺伝子診断・検査技術推進フォーラム公開シンポジウム2014）
  • 発表場所: コクヨホール（東京都港区）
  • 年月日: 2014-12-12
• [学会発表] Coffin-Siris症候群の新規遺伝子探索 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: NCNP（精神・神経疾患研究開発費（後藤班）平成26年度報告会
  • 発表場所: ＮＣＮＰ（東京都小平市）
  • 年月日: 2014-12-09
  • 招待講演
• [学会発表] TUBB4A変異による先天性白質形成不全症 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: NCNP（精神・神経疾患研究開発費（佐々木班）平成26年度報告会
  • 発表場所: ＮＣＮＰ（東京都小平市）
  • 年月日: 2014-11-30
  • 招待講演
• [学会発表] “Congenital intellectual disability syndromes arising from mutations of epigenetic regulators”in the symposium for epigenetic dysregulation and disease (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: The 37th annual meeting of the molecular biology society of Japan
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-27
• [学会発表] 発癌誘導に関与するヒストンH2A変異体の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 相原 仁, 水崎 博文, 中川 武弥, 伊藤 敬
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-27
• [学会発表] ジベレリン信号伝達に関与するカルシウム依存性タンパク質リン酸化酵素NtCDPK1の自己リン酸化による機能制御の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 伊藤岳、高橋陽介
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Kinetic characterization of a DNA binding activity of the transcription factor Ets1 and its regulation by phosphorylation at an intrinsically disordered region (2014)
  • 著者名/発表者名: Shiina M, Hamada K, Bungo-Inoue T, Shimamura M, Uchiyama A, Baba S, Sato K, Suzuki K, Yamamoto M, Ogata K
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Orientation of Ets1 and Runx1 binding sites on enhancers and their cooperative regulation (2014)
  • 著者名/発表者名: Uchiyama A, Shiina M, Hamada K, Bungo T, Shimamura M, Ogata K
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Structure-based analysis for DNA recognition mechanism of the Nrf2-containing transcription factor heterodimer (2014)
  • 著者名/発表者名: Suzuki K, Shiina M, Hamada K, Bungo T, Okada C, Baba S, Ohta T, Ogata K
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Microtubules Instability and Dynamics Mediated by CLIP-170 in T Cells (2014)
  • 著者名/発表者名: Wei Ming Lim,伊藤 由馬, 十川 久美子, 徳永 万喜洋
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Live cell single-molecule imaging of T cell receptor and microcluster with planar lipid bilayers (2014)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 由馬, 十川 久美子, 徳永 万喜洋
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] E3ユビキチンリガーゼの基質認識レセプター CRBNとポマリドマイド依存的な基質Aiolosの生化学的解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 片山 美樹,伊藤 拓水,安藤 秀樹,山口 雄輝,半田 宏
  • 学会等名: 第３７回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] Histone H2A Thr 120 phosphorylation results in cancer via up regulation of Cyclin D1 (2014)
  • 著者名/発表者名: Hirofumi Mizusaki, Hitoshi Aihara, Takashi Ito
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] Dzip3はマウスES細胞において分化に関与する様々な遺伝子を調節する (2014)
  • 著者名/発表者名: 井上 大嗣, 相原 仁, 水崎 博文, 土井口 真康, 中山 敏幸, 中川 武弥, 伊藤 敬
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] Regulatory Mechanisms for Pol II Termination Sites and 3' Processing Pathways in Higher Eukaryotes (2014)
  • 著者名/発表者名: 山口雄輝、山本淳一
  • 学会等名: 転写サイクル国際シンポジウム2014
  • 発表場所: 東工大蔵前会館（東京都目黒区）
  • 年月日: 2014-11-24
• [学会発表] 人類遺伝学研究におけるデータベースの重要性 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第59回大会・松本直通・NPGランチョンセミナー
  • 発表場所: タワーホール船堀・東京（東京都江戸川区）
  • 年月日: 2014-11-22
• [学会発表] 次世代シーケンサーを用いた染色体・ゲノム構造異常解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第59回大会
  • 発表場所: タワーホール船堀・東京（東京都江戸川区）
  • 年月日: 2014-11-21
  • 招待講演
• [学会発表] 次世代シーケンサーによる遺伝子解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 第56回日本先天代謝異常学会総会
  • 発表場所: 江陽グランドホテル・仙台（宮城県仙台市）
  • 年月日: 2014-11-14
• [学会発表] 次世代シーケンサーの活用法 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 第17回胎児遺伝子診断研究会
  • 発表場所: 長崎ハウステンボス（長崎県佐世保市）
  • 年月日: 2014-11-07
• [学会発表] Zero-dipole summation法を用いたエンハンソソーム制御メカニズムの分子動力学的解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 笠原浩太、福田育夫
  • 学会等名: 第1回「京」を中核とするHPCIシステム利用研究課題成果報告会
  • 発表場所: コクヨホール（東京都港区）
  • 年月日: 2014-10-31
• [学会発表] DELLA-GAF1複合体によるGA信号伝達とフィードバック制御機構の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 深澤壽太郎、高橋陽介
  • 学会等名: 第49回植物化学調節学会
  • 発表場所: 京都大学（京都府京都市）
  • 年月日: 2014-10-19
• [学会発表] ヒストンシャペロンNap1の構造解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 浜田恵輔，椎名政昭，中島理沙，斎藤 誠，伊藤 敬，緒方一博
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館（京都府京都市）
  • 年月日: 2014-10-15 – 2014-10-18
• [学会発表] Analysis of the function of nuclear actin in cell differentiation (2014)
  • 著者名/発表者名: 山本 浩志, 山崎 祥他, 十川 久美子, 徳永 万喜洋, 原田 昌彦
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館・グランドプリンスホテル京都(京都府京都市）
  • 年月日: 2014-10-15 – 2014-10-18
• [学会発表] Functional regulation of the dynamics of actin in the nucleus (2014)
  • 著者名/発表者名: 山崎 祥他, 十川 久美子, 徳永 万喜洋, 原田 昌彦
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館・グランドプリンスホテル京都(京都府京都市）
  • 年月日: 2014-10-15 – 2014-10-18
• [学会発表] 分子動力学シミュレーション解析のためのMulti-modal Dynamic Cross Correlation法の開発と応用 (2014)
  • 著者名/発表者名: 笠原浩太、福田育夫、中村春木
  • 学会等名: 第3回生命医薬情報学連合大会
  • 発表場所: 仙台国際センター（宮城県仙台市）
  • 年月日: 2014-10-02
• [学会発表] Segmentation & fitting algorithm for multiple submit fitting into a low resolution density map (2014)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Kawabata, Hirofumi Suzuki, Haruki Nakamura
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-27
• [学会発表] Theoretical analysis of molecular interactions in secondary structures of proteins (2014)
  • 著者名/発表者名: Yu Takano, Ayumi Kusaka, Haruki Nakamura
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-27
• [学会発表] Contact number diffusion model for the normal mode analysis of protein structure (2014)
  • 著者名/発表者名: Bhaskar Dasgupta, Kota Kasahara, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura, Akira Kinjo
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-26
• [学会発表] Formation of microclusters of receptor molecules improves signal/noise ratio in cellular signal transduction (2014)
  • 著者名/発表者名: 深川 暁宏, 十川 久美子, 徳永 万喜洋
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Single molecule imaging and quantitative analysis of dynamics of negative elongation factor NELF (2014)
  • 著者名/発表者名: 池田 大地, 伊藤 由馬, 徳永 万喜洋, 十川 久美子
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Studies of dynamic chromatin structure and function to understand fundamentals of life (2014)
  • 著者名/発表者名: 十川 久美子, 伊藤 由馬, 深川 暁宏, 原田 昌彦, 木村 宏, 徳永 万喜洋
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
  • 招待講演
• [学会発表] The elucidation of the molecular mechanism of PDLIM2 activation (2014)
  • 著者名/発表者名: 鳥山 悟, 伊藤 由馬, 田中 貴志, 徳永 万喜洋, 十川 久美子
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] A series of GECO mutants suitable for calcium imaging in a wide range of calcium concentration (2014)
  • 著者名/発表者名: 大木 杜生, 伊藤 由馬, 徳永 万喜洋, 十川 久美子
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] T cell receptor on the surface of living cells changes in the dynamics inside microclusters revealed by single-molecule imaging analysis (2014)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 由馬, 十川 久美子, 徳永 万喜洋
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Free-energy landscape of C-terminal negative regulatory domain of p53 (2014)
  • 著者名/発表者名: Shinji Iida, Haruki Nakamura, Junini Higo
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25
• [学会発表] Computational study of the electronic structures of hemes in cytochrome c3 (2014)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiro Imada, Haruki Nakamura, Yu Takano
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25
• [学会発表] Elastic properties of dynein motor domain obatined from all-atom molecular dynamics simulations in explicit water (2014)
  • 著者名/発表者名: Narutoshi Kamiya, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Takahide Kon, Genji Kurisu, Haruki Nakamura
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25
• [学会発表] Molecular dynamics study on cooperative binding of Ets1 and partner transcription factors on regulatory elements (2014)
  • 著者名/発表者名: Kota Kasahara, Ikuo Fukuda, Haruki Nakamura
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25
• [学会発表] Histone H2A Thr 120 phosphorylation results in cancer via up regulation of Cyclin D1 (2014)
  • 著者名/発表者名: Hirofumi Mizusaki, Hitoshi Aihara, Takashi Ito
  • 学会等名: Cold Spring Harbor Laboratory Meeting & Courses Epigenetics & Chromatin
  • 発表場所: コールドスプリングハーバー（アメリカ）
  • 年月日: 2014-09-10
• [学会発表] Histone H2A Mutation Might Play Roles in Carcinogenesis (2014)
  • 著者名/発表者名: Hitoshi Aihara, Hirofumi Mizusaki, Takeya Nakagawa, Takashi Ito
  • 学会等名: Cold Spring Harbor Laboratory Meeting & Courses Epigenetics & Chromatin
  • 発表場所: コールドスプリングハーバー（アメリカ）
  • 年月日: 2014-09-10
• [学会発表] ゲノム解析と医療--1000ドルゲノム時代を迎えて-- (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: KOBE内分泌・代謝スキルアップセミナー特別講演
  • 発表場所: ホテルクラウンパレス神戸（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2014-08-23
• [学会発表] A new non-Ewald scheme for molecular dynamics simulation and its application to a free energy landscape for protein-protein interaction (2014)
  • 著者名/発表者名: Haruki Nakamura
  • 学会等名: 2nd International Conference on Computational Science and Engineering (ICCSE 2014)
  • 発表場所: ホーチミン（ベトナム）
  • 年月日: 2014-08-23
  • 招待講演
• [学会発表] ヒト発生・発達異常の分子探索と診断法の開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 文部科学省イノベーションシステム整備事業先端融合領域イノベーション創出拠点形成プログラム「翻訳後修飾プロテオミクス医療研究拠点の形成」第5回公開シンポジウム
  • 発表場所: 県民共済みなとみらいホール（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-08-19
  • 招待講演
• [学会発表] 難病を解き明かすヒト全遺伝子・全ゲノム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 横浜市立大学先端医科学研究センター市民講座
  • 発表場所: ウイング横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-08-07
  • 招待講演
• [学会発表] 転写伸長因子DSIFにリン酸化依存的に相互作用する因子の機能解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 磯部 智康、千葉 国俊、山口 雄輝
  • 学会等名: 転写サイクル班会議2014
  • 発表場所: 慶山（山梨県笛吹市）
  • 年月日: 2014-08-05
• [学会発表] DSIF and NELF interact with Integrator to specify the correct post-transcriptional fate of snRNA genes (2014)
  • 著者名/発表者名: 山本淳一、半田宏、山口雄輝
  • 学会等名: 転写サイクル班会議2014
  • 発表場所: 慶山（山梨県笛吹市）
  • 年月日: 2014-08-05
• [学会発表] 転写伸長因子DSIFおよびNELFがES細胞の多分化能維持に果たす役割 (2014)
  • 著者名/発表者名: 柴田 紘孝、半田 宏、山口 雄輝
  • 学会等名: 転写サイクル班会議2014
  • 発表場所: 慶山（山梨県笛吹市）
  • 年月日: 2014-08-05
• [学会発表] 新規転写伸長因子ヒトRtf1が関与する転写制御の分子機構 (2014)
  • 著者名/発表者名: 曹 青福、陳 業熹、半田 宏、山口 雄輝
  • 学会等名: 転写サイクル班会議2014
  • 発表場所: 慶山（山梨県笛吹市）
  • 年月日: 2014-08-05
• [学会発表] ヒトRNA ポリメラーゼII 転写産物のプロセシング経路の選択機構 (2014)
  • 著者名/発表者名: 山口 雄輝、山本 淳一、半田 宏
  • 学会等名: 転写サイクル班会議2014
  • 発表場所: 慶山（山梨県笛吹市）
  • 年月日: 2014-08-04
• [学会発表] GAF1, A DELLA INTERACTING PROTEIN, REGULATES GIBBERELLIN HOMEOSTASIS AND SIGNALING (2014)
  • 著者名/発表者名: Fukazawa, J., Takahasi, Y.
  • 学会等名: 25th International Conference on Arabidopsis Research
  • 発表場所: バンクーバー（カナダ）
  • 年月日: 2014-07-28 – 2014-08-01
• [学会発表] 共用スパコンを用いた分子動力学シミュレーション研究 (2014)
  • 著者名/発表者名: 笠原浩太
  • 学会等名: 国立遺伝学研究所スーパーコンピュータユーザ会
  • 発表場所: 国立遺伝学研究所（静岡県三島市）
  • 年月日: 2014-07-22
• [学会発表] Scaffold function of Ca2+-dependent protein kinase: NtCDPK1 transfers 14-3-3 to the substrate RSG after phosphorylation (2014)
  • 著者名/発表者名: Ito, T., Takahashi, Y.
  • 学会等名: Plant Biology 2014
  • 発表場所: ポートランド（アメリカ）
  • 年月日: 2014-07-12 – 2014-07-16
• [学会発表] 遺伝性疾患のゲノム解析---1000ドルゲノム時代を迎えて--- (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: がん研臨床試験・研究センター 第12回臨床研究セミナー
  • 発表場所: がん研究会（東京都江東区）
  • 年月日: 2014-07-03
• [学会発表] 発達障害のゲノム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 第110回日本精神神経学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-06-27
• [学会発表] fkcombu：2D-MCSを用いた鋳型ベースの低分子化合物ドッキング法の開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 川端猛、中村春木
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-06-27
• [学会発表] 抗原抗体ドッキングのデコイセット評価法 (2014)
  • 著者名/発表者名: 榛葉教子、神谷成敏、中村春木
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-06-26
• [学会発表] Cytochrome c3中のヘムの電子構造制御に関する計算科学的研究 (2014)
  • 著者名/発表者名: 今田康博、中村春木、鷹野優
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-06-26
• [学会発表] Regulation of DNA binding of Ets1 by phosphorylation in an intrinsic disordered region (2014)
  • 著者名/発表者名: 椎名政昭，浜田恵輔，井上－豊後泰子，嶋村麻利子，馬場しほ，内山晃子，鈴木香絵，タヒロフ タヒール，緒方一博
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-06-25 – 2014-06-27
  • 招待講演
• [学会発表] 蛋白質の二次構造形成に関わる相互作用に関する理論的研究 (2014)
  • 著者名/発表者名: 鷹野優、中村春木
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-06-25
  • 招待講演
• [学会発表] Free-energy landscape of the C-terminal negative regulatory domain of p53 (2014)
  • 著者名/発表者名: Sinji Iida, Haruki Nakamura, Junichi Higo
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-06-25
• [学会発表] 分子動力学法に基づいた新しい動的相関解析手法の開発と転写因子Ets-1-DNA結合機構解析への応用 (2014)
  • 著者名/発表者名: 笠原浩太、福田育夫、中村春木
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-06-25
• [学会発表] ゲノム解析と医療：1000ドルゲノム時代を迎えて (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 藤田保健衛生大学遺伝子網羅的解析センター開所記念セミナー・特別講演
  • 発表場所: 藤田保健衛生大学（愛知県豊明市）
  • 年月日: 2014-06-21
• [学会発表] New Non-Ewald Scheme for Molecular Dynamics Simulation and Application to Free Energy Calculation (2014)
  • 著者名/発表者名: Haruki Nakamura
  • 学会等名: Bioinformatics in Torun 2014 (BIT14)
  • 発表場所: Torun(Poland)
  • 年月日: 2014-06-12
  • 招待講演
• [学会発表] 抗炎症薬サリチル酸の生体内作用機構の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 坂本 聡、Vipul Gupta、劉 舒捷、安藤 秀樹、舘野 峻平、金子 裕生、湯上 真人、石井 亮平、濡木 理、山口 雄輝、半田 宏
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー学会第９回年会
  • 発表場所: 大阪大学（大阪府豊中市）
  • 年月日: 2014-06-11
• [学会発表] Neurodegeneration with Brain Iron Accumulation (NBIA): 急速に広がる疾患概念 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 第55回日本神経病理学会総会学術集会
  • 発表場所: 学術総合センター（東京都千代田区）
  • 年月日: 2014-06-07
• [学会発表] ゲノム解析と医療：1000ドルゲノムシーケンス時代を迎えて (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 信州大学先鋭領域融合研究群バイオメディカル研究所設立記念講演会・記念講演会
  • 発表場所: 信州大学医学部（長野県松本市）
  • 年月日: 2014-05-25
• [学会発表] ゲノム解析と医療：1000ドルゲノム時代を迎えて (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 九州大学産婦人科セミナー
  • 発表場所: 第二博多偕成ビルアイクレオ（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2014-05-21
• [学会発表] New Approach to Electrostatic Properties of Proteins and Protein-Protein Interactions (2014)
  • 著者名/発表者名: Haruki Nakamura
  • 学会等名: The 4th Asia Pacific Protein Association (APPA 2014)
  • 発表場所: 済州島（韓国）
  • 年月日: 2014-05-18
  • 招待講演
• [学会発表] Molecular dynamics study on enhancer recognitions by cooperative binding of Ets1 and partner transcription factors (2014)
  • 著者名/発表者名: 笠原浩太、福田育夫、中村春木
  • 学会等名: The 4th Asia Pacific Protein Association (APPA 2014)
  • 発表場所: 済州島（韓国）
  • 年月日: 2014-05-18
• [学会発表] 植物の新奇転写抑制モチーフ –真核生物に保存された転写抑制機構の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 岡村僚太、高橋陽介
  • 学会等名: 第71回中国四国植物学会
  • 発表場所: 岡山理科大学（岡山県岡山市）
  • 年月日: 2014-05-10
• [学会発表] 翻訳後修飾によるジベレリン信号伝達制御の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 三島由佳、高橋陽介
  • 学会等名: 第71回中国四国植物学会
  • 発表場所: 岡山理科大学（岡山県岡山市）
  • 年月日: 2014-05-10
• [学会発表] 遺伝性疾患におけるエクソーム解析の有用性 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: 第382回医学研究の基礎を語り合う集い
  • 発表場所: 東京慈恵医科大学（東京都港区）
  • 年月日: 2014-04-21
• [学会発表] Next generation sequencing dissecting human genetic diseases (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直道
  • 学会等名: The 9th Cherry Blossom Symposium
  • 発表場所: 横浜赤レンガ倉庫（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-04-19
• [学会発表] 次世代シーケンサー解析のポテンシャルと小児医療 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松本 直通
  • 学会等名: 第37回日本小児遺伝学会学術集会・シンポジウム
  • 発表場所: 名古屋市立大学桜山キャンパス(愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2014-04-10
• [図書] 生命のメカニズム - 美しいイメージで学ぶ構造生命科学入門 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中村春木（監訳）、工藤高裕、西川建、中村春木（訳）
  • 総ページ数: 168
  • 出版者: シナジー
• [図書] １分子生物学 (2014)
  • 著者名/発表者名: 原田 慶恵、石渡 信一、宝谷 紘一、船津 高志、城口 克之、吉田 賢右、上村 想太郎、井出 徹、佐甲 靖志、上田 昌宏、十川 久美子、樋口 秀男、多田隈 尚史、渡邉 朋信、徳永 万喜洋、石島 秋彦、安藤 敏夫、岡田 康志、他
  • 総ページ数: 7
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 見てわかる構造生命科学 - 生命科学研究へのタンパク質構造の利用 - (2014)
  • 著者名/発表者名: 椎名政昭，緒方一博
  • 総ページ数: 28
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 見てわかる構造生命科学 - 生命科学研究へのタンパク質構造の利用 - (2014)
  • 著者名/発表者名: 中村春木（編）、中村春木他9名
  • 総ページ数: 326
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 生命科学から創薬へのイノベーション (2014)
  • 著者名/発表者名: 米田悦啓、堤康央、石井健（編）、中村春木他45名
  • 総ページ数: 202
  • 出版者: 南山堂
• [図書] 基礎からしっかり学ぶ生化学 (2014)
  • 著者名/発表者名: 山口雄輝、成田央
  • 総ページ数: 245
  • 出版者: 羊土社
• [備考] 新学術領域研究「転写サイクル」
  • URL: http://transcriptioncycle.org/
• [産業財産権] 重度の知的障害及び運動発達遅滞を伴う難治性てんかんの検出方法 (2014)
  • 発明者名: 松本直通・才津浩智
  • 権利者名: 横浜市立大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: PCT/JP2014/065217
  • 出願年月日: 2014-06-09
  • 外国
• [産業財産権] コフィン－シリス症候群の検出方法 (2014)
  • 発明者名: 松本直通・三宅紀子・鶴崎美徳
  • 権利者名: 横浜市立大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2013-552406
  • 出願年月日: 2014-07-14
• [産業財産権] 孔脳症又は脳出血のリスクを予測する方法 (2014)
  • 発明者名: 松本直通・才津浩智
  • 権利者名: 横浜市立大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 14/357,373
  • 出願年月日: 2014-05-09
  • 外国