「転写サイクル」領域の総括

2015 年度 実績報告書

• 研究領域: 高精細アプローチで迫る転写サイクル機構の統一的理解
• 研究課題/領域番号: 24118001
• 研究機関: 東京工業大学
• 研究代表者: 山口 雄輝 東京工業大学, 生命理工学院, 教授 (50345360)
• 研究分担者: 十川 久美子 東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 (20291073) ; 中村 春木 大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (80134485) ; 松本 直通 横浜市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (80325638) ; 高橋 陽介 広島大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (90183855) ; 緒方 一博 横浜市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (90260330) ; 伊藤 敬 長崎大学, 医歯(薬)学総合研究科, 教授 (90306275)
• 研究期間 (年度): 2012-06-28 – 2017-03-31
• キーワード: 転写サイクル

研究実績の概要

本領域では、先端的な解析技術の開発・導入、および、ウェットとドライ（情報科学・計算科学）の融合、という2つをドラインビングフォースとして、転写制御の全体像を定量的に明らかにすることを目指している。総括班は、開発された技術を領域内外に普及させる活動や、ウェットとドライの融合を促進する場の醸成等を通じて、転写サイクル研究を推進する。研究支援の具体的な活動内容は以下のとおりである。
1．先端的技術の領域内共同システムの構築と運用。H25年度までに次世代シーケンサー、１分子蛍光顕微鏡、構造解析装置の領域内共同利用システムを確立し、H26年度はその利用率の向上を図るためチュートリアルの整備等を行った。H27年度には同システムの利用率向上を企図してトレーニングワークショップ（後述）を再度実施した。
2．トレーニングワークショップの開催。H25年度に2件のワークショップを実施したのに引き続いて、H27年11月に初級者向けインフォマティクス講習会を筑波大学で開催した。
3．領域内の研究交流ならびに若手支援。本領域では年1回の全体班会議のほか、年1回の若手主体のワークショップを開催している。H27年度は8月に静岡県伊東市のホテルで班会議を行ったほか、2月に山梨県山中湖畔のホテルにおいては転写研究会、新学術領域「転写代謝システム」との共催で「冬の若手ーワークショップ」を開催した。
4．広報活動。領域ウェブサイトを通じて、引き続き積極的な情報発信を行った。また、H27年12月にはニュースレターを発行した。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

以下のとおり、研究支援活動の各項目を計画どおりに進めることができた。
1．先端的技術の領域内共同システムの構築と運用。H25年度までに次世代シーケンサー、１分子蛍光顕微鏡、構造解析装置の領域内共同利用システムを確立し、H26年度はその利用率の向上を図るためチュートリアルの整備等を行った。H27年度には同システムの利用率向上を企図してトレーニングワークショップ（後述）を再度実施した。
2．トレーニングワークショップの開催。H25年度に2件のワークショップを実施したのに引き続いて、H27年11月に初級者向けインフォマティクス講習会を筑波大学で開催した。
3．領域内の研究交流ならびに若手支援。本領域では年1回の全体班会議のほか、年1回の若手主体のワークショップを開催している。H27年度は8月に静岡県伊東市のホテルで班会議を行ったほか、2月に山梨県山中湖畔のホテルにおいては転写研究会、新学術領域「転写代謝システム」との共催で「冬の若手ーワークショップ」を開催した。
4．広報活動。領域ウェブサイトを通じて、引き続き積極的な情報発信を行った。また、H27年12月にはニュースレターを発行した。

今後の研究の推進方策

今年度の研究支援活動として以下を計画している。
1．先端的技術の領域内共同利用システムの運用。本領域では、次世代シーケンサーや１分子顕微鏡、構造解析用の装置を総括班の経費で購入し、各分野に熟練した松本、十川、緒方がそれぞれの機器の管理・運用や技術支援を行ってきた。特に、第二期の公募班で新たに加わった班員を対象に同システムを周知するなどし、機器の利用率を一層高めるのが今年度の目標である。
2．若手研究者育成のための情報交換の機会の提供。通常の全体班会議を年１回開催するほか、若手主体のワークショップを開催して、若手に発表の機会を設ける。さらに、領域の若手研究者が海外で研究発表を行う際の旅費の支援も引き続いて行う。
3．領域の研究成果を国内外に知らしめるとともに、海外の先端的な研究成果を取り入れ、人的交流を促すために、国際シンポジウムを開催する。
4．広報活動。領域のウェブサイトを通じて研究者のみならず一般社会に向けて、領域の活動内容を発信してきた。今年度も引き続き、領域ウェブサイトを頻繁に更新して情報発信に務める。さらにニュースレターも発行して、領域の諸活動や研究成果の広報に務める。

研究成果

• [国際共同研究] システムバイオロジー研究所/UT Southwestern Medical Center at Dallas/カーネギー研究所(米国)
  • 国名: 米国
  • 外国機関名: システムバイオロジー研究所/UT Southwestern Medical Center at Dallas/カーネギー研究所
  • 他の機関数: 1
• [国際共同研究] オックスフォード大学(英国)
  • 国名: 英国
  • 外国機関名: オックスフォード大学
• [雑誌論文] Haem-dependent dimerization of PGRMC1/sigma-2 receptor facilitates cancer proliferation and chemoresistance. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kabe, Y., Nakane, T., Koike, I., Yamamoto, T., Sugiura, Y., Harada, E., Sugase, K., Shimamura, T., Ohmura, M., Muraoka, K., Yamamoto, A., Uchida, T., Iwata, S., Yamaguchi, Y., Krayukhina, E., Noda, M., Handa, H., Ishimori, K., Uchiyama, S., Kobayashi, T., and Suematsu, M.
  • 雑誌名: Nat. Commun. 巻: 7 ページ: 11030
  • DOI: 10.1038/ncomms11030
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] SMARCAD1 is an ATP-dependent stimulator of nucleosomal H2A acetylation via CBP, resulting in transcriptional regulation. (2016)
  • 著者名/発表者名: Doiguchi M, Nakagawa T, Imamura Y, Yoneda M, Higashi M, Kubota K, Yamashita S, Asahara H, Iida M, Fujii S, Ikura T, Liu Z, Nandu T, Kraus W. L., Ueda H, Ito T
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 6 ページ: 20179
  • DOI: 10.1038/srep20179
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Phenotypic spectrum of GNAO1 variants: epileptic encephalopathy to involuntary movements with severe developmental delay (2016)
  • 著者名/発表者名: Saitsu H, Fukai R, Ben-Zeev B, Sakai Y, Mimaki M, Okamoto N, Suzuki Y, Monden Y, Saito H, Tziperman B, Torio M, Akamine S, Takahashi N, Osaka H, Yamagata T, Nakamura K, Tsurusaki Y, Nakashima M, Miyake N, Shiina M, Ogata K, Matsumoto N
  • 雑誌名: Eur J Hum Genet 巻: 24(1) ページ: 129-134
  • DOI: 10.1038/ejhg.2015.92
  • 査読あり
• [雑誌論文] Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (3rd edition) (2016)
  • 著者名/発表者名: Klionsky DJ, et al., Matsumoto N, et al..
  • 雑誌名: Autophagy 巻: 12(1) ページ: 1-222
  • DOI: 10.1080/15548627.2015.1100356
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] FDG-PET study of patients with Leigh syndrome (2016)
  • 著者名/発表者名: Haginoya K, Kaneta T, Togashi N, Hino-Fukuyo N, Kobayashi T, Uematsu M, Kitamura T, Inui T, Okubo Y, Takezawa Y, Anzai M, Endo W, Miyake M, Saitsu H, Matsumoto N, Kure S
  • 雑誌名: Journal of the Neurological Sciences 巻: 362 ページ: 309-313
  • DOI: 10.1016/j.jns.2016.02.008
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] De novo DNM1 mutations in two cases of epileptic encephalopathy (2016)
  • 著者名/発表者名: Nakashima M, Kouga T, Lourenço CM, Shiina M, Goto T, Tsurusaki Y, Miyatake S, Miyake N, Saitsu H, Ogata K, Hitoshi Osaka H, Matsumoto N
  • 雑誌名: Epilepsia 巻: 57(1) ページ: e18-e23
  • DOI: 10.1111/epi.13257
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Detection of low-prevalence somatic TSC2 mutations in sporadic pulmonary lymphangioleiomyomatosis tissues by deep sequencing (2016)
  • 著者名/発表者名: Fujita A, Ando K, Kobayashi E, Mitani K, Okudera K, Nakashima N, Miyatake S, Tsurusaki Y, Saitsu H, Seyama K, Miyake N, Matsumoto N
  • 雑誌名: Human Genetics 巻: 135(1) ページ: 61-68
  • DOI: 10.1007/s00439-015-1611-0
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Development of Massive Multilevel Molecular Dynamics Simulation Program, Platypus (PLATform for dYnamic Protein Unified Simulation), for the Elucidation of Protein (2016)
  • 著者名/発表者名: Takano Y, Nakata K, Yonezawa Y, Nakamura H
  • 雑誌名: Journal of Computational Chemistry 巻: 37 ページ: 1125-1132
  • DOI: 10.1002/jcc.24318
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A critical appraisal of the zero-multipole method: Structural, thermodynamic, dielectrid, and dynamical properties of a water system (2016)
  • 著者名/発表者名: Wang H, Nakamura H, Fukuda I
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 巻: 144 ページ: 114503
  • DOI: 10.1063/1.4943956
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Density functional study of molecular interactions in secondary structures of proteins (2016)
  • 著者名/発表者名: Takano Y, Kusaka A, Nakamura H
  • 雑誌名: Biophysics and Physicobiology 巻: 13 ページ: 27-35
  • DOI: 10.2142/biophysico.13.0_27
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Characterization of the human transcription elongation factor Rtf1: evidence for non-overlapping functions of Rtf1 and the Paf1 complex (2015)
  • 著者名/発表者名: Cao, Q.-F., Yamamoto, J., Isobe, T., Tateno, S., Murase, Y., Chen, Y., Handa, H., and Yamaguchi, Y.
  • 雑誌名: Mol. Cell. Biol. 巻: 35 ページ: 3459-3470
  • DOI: 10.1128/MCB.00601-15
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] CTCF regulates NELF, DSIF and P-TEFb recruitment during transcription. (2015)
  • 著者名/発表者名: Laitem, C., Zaborowska, J., Tellier, M., Yamaguchi, Y., Cao. Q.-F., Egloff, S., Handa, H., and Murphy, S.
  • 雑誌名: Transcription 巻: 6 ページ: 79-90
  • DOI: 10.1080/21541264
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Enhancer of Acetyltransferase Chameau (EAChm) Is a Novel Transcriptional Co-Activator (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa T, Ikehara T, Doiguchi M, Imamura Y, Higashi M, Yoneda M, Ito T
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 ページ: e0142305
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0142305
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Dzip3 regulates developmental genes in mouse embryonic stem cells by reorganizing 3D chromatin conformation. (2015)
  • 著者名/発表者名: Inoue D, Aihara H, Sato T, Mizusaki H, Doiguchi M, Higashi M, Imamura Y, Yoneda M, Miyanishi T, Fujii S, Okuda A, Nakagawa T, Ito T
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 5 ページ: 16567
  • DOI: 10.1038/srep16567
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Binding of GID1 to DELLAs promotes dissociation of GAF1 from DELLA in GA dependent manner (2015)
  • 著者名/発表者名: Fukazawa, J., Ito, T., Kamiya, Y., Yamaguchi, S. and Takahashi, Y.
  • 雑誌名: Plant Signal Behav. 巻: 10 ページ: e1052923
  • DOI: 10.1080/15592324.2015.1052923
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Short-lasting unilateral neuralgiform headache attacks with ispilateral facial flushing is a new variant of paroxysmal extreme pain disorder (2015)
  • 著者名/発表者名: Imai N, Miyake N, Saito Y, Kobayashi E, Ikawa M, Manaka S, Shiina M, Ogata K, Matsumoto N
  • 雑誌名: J Headache Pain 巻: 16(1) ページ: 519
  • DOI: 10.1186/s10194-015-0519-3
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A novel allosteric mechanism on protein-DNA interactions underlying the phosphorylation-dependent regulation of Ets1 target gene expressions (2015)
  • 著者名/発表者名: Shiina M, Hamada K, Inoue-Bungo T, Shimamura M, Uchiyama A, Baba S, Sato K, Yamamoto M, Ogata K
  • 雑誌名: J Mol Biol 巻: 427(8) ページ: 1655-1669
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2014.07.020
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Novel compound heterozygous LIAS mutations cause glycine encephalopathy (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsurusaki Y, Tanaka R, Shimada S, Shimojima K, Shiina M, Nakashima M, Saitsu H, Miyake N, Ogata K, Yamamoto T, Matsumoto N
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 60(10) ページ: 631-635
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.72
  • 査読あり
• [雑誌論文] De novo SHANK3 mutation causes a female patient with Rett syndrome like phenotype. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hara M, Ohba C, Yamashita Y, Saitsu H, Matsumoto N, Matsuishi T.
  • 雑誌名: J Med Genet Part A 巻: 167(7) ページ: 1593-1596
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.36775
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Japanese familial case of myoclonus-dystonia syndrome with a splicing mutation in the SGCE gene (2015)
  • 著者名/発表者名: Wada T, Takano K, Tsurusaki Y, Miyake N, Nakashima M, Saitsu H, Matsumoto N, Osaka H
  • 雑誌名: Pediatr Int 巻: 57(2) ページ: 324-326
  • DOI: 10.1111/ped.12613
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A family of distal arthrogryposis type 5 due to a novel PIEZO2 mutation (2015)
  • 著者名/発表者名: Okubo M, Fujita A, Saito Y, Komaki H, Ishiyama A, Kojima E, Koichihara R, Saito T, Nakagawa E, Sugai K, Yamazaki H, Kusaka K, Tanaka H, Matsumoto N, Sasaki M
  • 雑誌名: Am J Med Genet Part A 巻: 167(5) ページ: 1100-1106
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.36881
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Mutations in the glutaminyl-tRNA synthetase gene cause early-onset epileptic encephalopathy (2015)
  • 著者名/発表者名: Kodera H, Osaka H, Iai M, Aida N, Yamashita A, Tsurusaki Y, Nakashima M, Miyake N, Saitsu H, Matsumoto N
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 60(2) ページ: 97-101
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.103
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Japanese girl with a severe form of vanishing white matter disease resembling Cree leukoencephalopathy (2015)
  • 著者名/発表者名: Takano K, Tsuyusaki Y, Sato M, Takagi M, Anzai R, Okuda M, Iai M, Yamashita S, Okabe T, Aida N, Tsurusaki Y, Saitsu H, Matsumoto N, Osaka H
  • 雑誌名: Brain Dev 巻: 37(6) ページ: 638-642
  • DOI: 10.1016/j.braindev.2014.10.002
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Detecting copy number variations in whole exome sequencing data using the eXome Hidden Markov Model: an “exome-first” approach (2015)
  • 著者名/発表者名: Miyatake S, Koshimizu E, Fujita A, Fukai R, Imagawa E, Ohba C, Kuki I, Nukui M, Araki A, Makita Y, Ogata T, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Matsumoto N
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 60(4) ページ: 175-182
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.124
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] SPTAN1 encephalopathy: distinct phenotypes and genotypes (2015)
  • 著者名/発表者名: Tohyama J, Nakashima M, Nabatame S, Gaik-Siew C, Miyata R, Rener-Primec Z, Kato M, Matsumoto N, Saitsu H
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 60(4) ページ: 167-173
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.5
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] GRIN1 mutations cause encephalopathy with infantile-onset epilepsy, hyperkinetic and stereotyped movement disorders (2015)
  • 著者名/発表者名: Ohba C, Takahashi N, Kato M, Osaka H, Takashi Shiihara T, Tohyama J, Nabatame S, Azuma J, MD, Fujii Y, MD, Hara M, Tsurusawa R, Ogata R, Watanabe Y, Togashi N, Kodera H, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Tanaka F, *Saitsu H, Matsumoto N
  • 雑誌名: Epilepsia 巻: 56(6) ページ: 841-848
  • DOI: 10.1111/epi.12987
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Sporadic infantile-onset spinocerebellar ataxia caused by missense mutations of the inositol 1,4,5-triphosphate receptor type 1 gene. (2015)
  • 著者名/発表者名: Sasaki M, Ohba C, Iai M, Hirabayashi S, Osaka H, Hiraide T, Saitsu H, Matsumoto N
  • 雑誌名: J Neurol 巻: 262(5) ページ: 1278-1284
  • DOI: 10.1007/s00415-015-7705-8
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Japanese case of cerebellar ataxia, spastic paraparesis, and deep sensory impairment associated with a novel homozygous TTC19 mutation (2015)
  • 著者名/発表者名: Kunii M, Doi H, Higashiyama Y, Kugimoto C, Ueda N, Hirata J, Tomita-Katsumoto A, Kashikura-Kojima M, Kubota S, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Matsumoto N, Tanaka F
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 60(4) ページ: 187-191
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.7
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A case of autism spectrum disorder arising from a de novo missense mutation in POGZ (2015)
  • 著者名/発表者名: Fukai R, Hiraki Y, Tsurusaki Y, Nakashima M, Saitsu H, Miyake N, Matsumoto N
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 60(5) ページ: 277-279
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.13
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] An Aberrant Splice Acceptor Site Due to a Novel Intronic Nucleotide Substitution in MSX1 Gene Is the Cause of Congenital Tooth Agenesis in a Japanese Family (2015)
  • 著者名/発表者名: Tatematsu T, Kimura M, Nakashima M, Machida J, Yamaguchi S, Shibata A, Goto H, Nakayama A, Higashi Y, Miyachi H, Shimozato K, Matsumoto N, Tokita Y
  • 雑誌名: Plos One 巻: 10(6) ページ: e0128227
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0128227
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Dominant mutations in ORAI1 cause tubular-aggregate- myopathy with hypocalcemia by constitutive activation of store-operated Ca2+ channel (2015)
  • 著者名/発表者名: Endo Y, Noguchi S, Hara Y, Hayashi YK, Motomura K, Murakami N, Tanaka S, Yamashita S, Kizu R, Bamba M, Goto Y, Matsumoto N, Nonaka I, Nishino I
  • 雑誌名: Hum Mol Genet. 巻: 24(3) ページ: 637-648
  • DOI: 10.1093/hmg/ddu477
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A novel mutation in ELOVL4 leading to spinocerebellar ataxia (SCA) with the hot cross bun sign but lacking erythrokeratodermia: A broadened spectrum of SCA34 (2015)
  • 著者名/発表者名: Ozaki K, Doi H, Mitsui J, Sato N, Iikuni Y, Majima T, Yamane K, Irioka T, Ishiura H, Doi K, Morishita S, Higashi M, Sekiguchi T, Koyama K, Ueda N, Miura Y, Miyatake S, Matsumoto N, Yokota T, Tanaka F, Tsuji S, Mizusawa H, Ishikawa K
  • 雑誌名: JAMA Neurol 巻: 72(7) ページ: 797-805
  • DOI: 10.1001/jamaneurol.2015.0610
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Novel rare variations of the oxytocin receptor (OXTR) gene in autism spectrum disorder individuals (2015)
  • 著者名/発表者名: Liu X, Kawashima M, Miyagawa T, Otowa T, Latt KZ, Thiri M, Nishida H, Sugiyama T, Tsurusaki Y, Matsumoto N, Mabuchi A, Tokunaga K, Sasaki T
  • 雑誌名: Human Genome Variation 巻: 2 ページ: 15024
  • DOI: 10.1038/hgv.2015.24
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification and in vivo functional characterization of novel compound heterozygous BMP1 variants in osteogenesis imperfecta (2015)
  • 著者名/発表者名: Cho SY, Asharani PV, Kim OH, Iida A, Miyake N, Matsumoto N, Nishimura G, Ki CS, Hong G, Kim SJ, Sohn YB, Park SW, Lee J, Kwun Y, Carney TJ, Huh R, Ikegawa S, Jin DK
  • 雑誌名: Human Mutation 巻: 36(2) ページ: 191-195
  • DOI: 10.1002/humu.22731
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Predominant cerebellar phenotype in spastic paraplegia 7 (SPG7) (2015)
  • 著者名/発表者名: Yahikozawa H, Yoshida K, Sato S, Hanyu N, Doi H, Miyatake S, Matsumoto N
  • 雑誌名: Human Genome Variation 巻: 2 ページ: 15012
  • DOI: 10.1038/hgv.2015.12
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Somatic Mutations in the MTOR Gene Cause Focal Cortical Dysplasia Type IIb (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakashima M, Saitsu H, Tohyama J, Kato M, Shiina M, Takei N, Kitaura H, Shirozu H, Masuda H, Watanabe K, Ohba C, Tsurusaki Y, Miyake N, Takebayashi H, Ogata K, Kameyama S, Kakita A, Matsumoto N
  • 雑誌名: Annals of Neurology 巻: 78(3) ページ: 375-386
  • DOI: 10.1002/ana.24444
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Two novel homozygous RAB3GAP1 mutations cause Warburg micro syndrome (2015)
  • 著者名/発表者名: Imagawa E, Fukai R, Behnam M, Goyal M , Nouri N, Nakashima M, Tsurusaki Y, Saitsu H, Salehi M, Kapoor S, Tanaka F, Miyake N, Matsumoto N
  • 雑誌名: Human Genome Variation 巻: 2 ページ: 15034
  • DOI: 10.1038/hgv.2015.34
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Electroclinical features of epileptic encephalopathy caused by SCN8A mutation (2015)
  • 著者名/発表者名: Takahashi S, Yamamoto S, Okayama A, Araki A, Saitsu H, Matsumoto N, Azuma H
  • 雑誌名: Pediatrics International 巻: 57(4) ページ: 758-762
  • DOI: 10.1111/ped.12622.
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] DNA methylation and gene expression dynamics during spermatogonial stem cell differentiation in the early postnatal testis (2015)
  • 著者名/発表者名: Kubo N, Toh H, Shirane K, Shirakawa T, Kobayashi H, Sato T, Sone H, Sato Y, Tomizawa S, Tsurusaki Y, Shibata H, Saitsu H, Suzuki Y, Matsumoto N, Suyama M, Kono T, Ohbo K, Sasak H
  • 雑誌名: Genomics 巻: 16(1) ページ: 624
  • DOI: 10.1186/s12864-015-1833-5
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] De Novo 17q24.2-q24.3 microdeletion presenting with generalized hypertrichosis terminalis, gingival fibromatous hyperplasia, and distinctive facial features (2015)
  • 著者名/発表者名: Afifi H, Fukai R, Miyake N, Gamal E, Din A, Eid M, Eid O, Thomas M, El-Badry T, Tosson A, Abdel-Salam G, Matsumoto N
  • 雑誌名: Am J Med Genet Part A 巻: 167(10) ページ: 2418-2424
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.37185
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Biallelic mutations in NUP107 encoding a nuclear pore complex subunit cause early childhood onset steroid-Resistance nephrotic syndrome (2015)
  • 著者名/発表者名: Miyake N, Tsukaguchi Y, Koshimizu E, Shono A, Matsunaga S, Shiina M, Mimura Y, Nozu K, Akioka Y, Hattori M, Yoshikawa N, Kitamura A, Imamura S, Yamashita M, Fijita A, Miyatake S, Tsurusaki Y, Nakashima M, Saitsu H, Imamoto N, Ryo A, Ogata K, Iijima K, Matsumoto N
  • 雑誌名: American Journal of Human Genetics 巻: 97(4) ページ: 555-566
  • DOI: 10.1016/j.ajhg.2015.08.013
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification of HOXD4 Mutations in Spinal Extradural Arachnoid Cyst (2015)
  • 著者名/発表者名: Ogura Y, Miyake N, Kou I, Iida A, Nakajima M, Takeda K, Fujibayashi S, Shiina M, Okada E, Toyama Y, Iwanami A, Ishii K, Ogata K, Asahara H, Matsumoto N, Nakamura M, Matsumoto M, Ikegawa S
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10(11) ページ: e0142126
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0142126
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] De novo KCNB1 mutations in infantile epilepsy inhibit repetitive neuronal firing (2015)
  • 著者名/発表者名: Saitsu H, Akita T,, Tohyama J, Goldberg-Stern H, Kobayashi Y, Cohen R, Kato M, Ohba C, Miyatake S, Tsurusaki Y, Nakashima M, Miyake N, Fukuda A, Matsumoto N
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 5 ページ: 15199
  • DOI: 10.1038/srep15199
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Virtual-system coupled adaptive umbrella sampling to compute free-energy landscape for flexible molecular docking (2015)
  • 著者名/発表者名: Higo J, Dasgupta B, Mashimo T, Kasahara K, Fukunishi Y, Nakamura H
  • 雑誌名: Journal of Computational Chemistry 巻: 36 ページ: 1489-1501
  • DOI: 10.1002/jcc.23948
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Computational Study of Drug Binding Affinity to Influenza A Neuraminidase Using Smooth Reaction Path Generation (SRPG) Method (2015)
  • 著者名/発表者名: Nguyen H, Tran T, Fukunishi Y, Higo J, Nakamura H, Le L
  • 雑誌名: Journal of Chemical Information and Modeling 巻: 55 ページ: 1936-1943
  • DOI: 10.1021/acs.jcim.5b00319
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Omokage search: shape similarity search service for biomolecular structures in both the PDB and EMDB (2015)
  • 著者名/発表者名: Suzuki H, Kawabata T, Nakamura H
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 32 ページ: 619-620
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btv614
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] DELLA-GAF1/IDD2 complex regulates gibberellin homeostasis and signaling (2016)
  • 著者名/発表者名: Fukazawa, J., Ito, T., Takahashi, Y.
  • 学会等名: 22nd International Plant Growth Substances Association Conference
  • 発表場所: トロント（カナダ）
  • 年月日: 2016-06-21 – 2016-06-25
  • 国際学会
• [学会発表] DELLA-GAF1複合体によるジベレリン信号伝達の制御機構 (2016)
  • 著者名/発表者名: 深澤 壽太郎、高橋 竜平、藤井 麻弥、高橋 陽介
  • 学会等名: 第73回中国四国植物学会
  • 発表場所: 米子コンベンションセンター（鳥取県米子市）
  • 年月日: 2016-05-15
• [学会発表] ジベレリンとオーキシンによる茎部の伸長制御機構の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 伊東 裕太, 伊藤 岳, 高橋 陽介
  • 学会等名: 第73回中国四国植物学会
  • 発表場所: 米子コンベンションセンター（鳥取県米子市）
  • 年月日: 2016-05-14
• [学会発表] GAF1複合体によるGA生合成酵素遺伝子の転写抑制機構の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 勝部 隆義, 伊藤 岳, 深澤 壽太郎, 高橋 陽介
  • 学会等名: 第73回中国四国植物学会
  • 発表場所: 米子コンベンションセンター（鳥取県米子市）
  • 年月日: 2016-05-14
• [学会発表] カルシウム依存性タンパク質リン酸化酵素NtCDPK1の自己リン酸化による機能制御の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 岳, 石田 さらみ, 高橋 陽介
  • 学会等名: 第57回日本植物生理学会
  • 発表場所: 岩手大学（岩手県岩手市）
  • 年月日: 2016-03-19
• [学会発表] ヒストンH2Aのリン酸化と癌化 (2016)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 敬
  • 学会等名: 生物多様性コロキウム
  • 発表場所: 京都大学（京都府京都市）
  • 年月日: 2016-03-14
• [学会発表] BigData to Knowledge to Wisdom (2016)
  • 著者名/発表者名: Haruki Nakamura
  • 学会等名: Data Sharing Symposium
  • 発表場所: 一橋大学一橋講堂（東京都千代田区）
  • 年月日: 2016-02-29
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ヒストン翻訳後修飾と癌化 (2016)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 敬
  • 学会等名: Science Medical Frontier Forum
  • 発表場所: 御茶ノ水ソラシティカンファレンスセンター（東京都千代田区）
  • 年月日: 2016-02-08
• [学会発表] 多発性骨髄腫におけるPomalidomide標的因子の網羅的探索 (2016)
  • 著者名/発表者名: 舘野 峻平、飯田 緑、藤井 聡、山口 雄輝
  • 学会等名: 冬の若手ワークショップ2016
  • 発表場所: ホテル清渓（山梨県南都留郡）
  • 年月日: 2016-02-05
• [学会発表] 新規抗がん剤の作用機構の解明 (2016)
  • 著者名/発表者名: 佐倉 絵里、舘野 峻平、山口 雄輝
  • 学会等名: 冬の若手ワークショップ2016
  • 発表場所: ホテル清渓（山梨県南都留郡）
  • 年月日: 2016-02-05
• [学会発表] PolⅡ複合体をモデルとしたタンパク質間相互作用の実験系の評価 (2016)
  • 著者名/発表者名: 新垣 貴之、徳山 遥香、山口 雄輝
  • 学会等名: 冬の若手ワークショップ2016
  • 発表場所: ホテル清渓（山梨県南都留郡）
  • 年月日: 2016-02-05
• [学会発表] NELFを中心としたRNAの品質管理のメカニズム (2016)
  • 著者名/発表者名: 瑞慶覧 安里、山本 淳一、磯部 智康、山口 雄輝
  • 学会等名: 冬の若手ワークショップ2016
  • 発表場所: ホテル清渓（山梨県南都留郡）
  • 年月日: 2016-02-05
• [学会発表] サリドマイド標的タンパク質CRBNの相互作用因子の探索 (2016)
  • 著者名/発表者名: 徳山 遥香、新垣 貴之、山口雄輝
  • 学会等名: 冬の若手ワークショップ2016
  • 発表場所: ホテル清渓（山梨県南都留郡）
  • 年月日: 2016-02-05
• [学会発表] マウスES細胞における2細胞期特異的な遺伝子の発現制御メカニズムの解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 翔子、柴田 紘孝、山口 雄輝
  • 学会等名: 冬の若手ワークショップ2016
  • 発表場所: ホテル清渓（山梨県南都留郡）
  • 年月日: 2016-02-05
• [学会発表] サリドマイドの多様な薬理作用の分子メカニズム (2016)
  • 著者名/発表者名: 山口 雄輝、伊藤 巧水、山本 淳一、半田 宏
  • 学会等名: 冬の若手ワークショップ2016
  • 発表場所: ホテル清渓（山梨県南都留郡）
  • 年月日: 2016-02-05
• [学会発表] snRNA3'末端プロセシング因子インテグレーターの構造・機能解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 外山 黛、荻原 裕里、Thiengtrong, Benjarat、山口 雄輝
  • 学会等名: 冬の若手ワークショップ2016
  • 発表場所: ホテル清渓（山梨県南都留郡）
  • 年月日: 2016-02-05
• [学会発表] Decapping exoribonuclease(DOX:Dom3z)の転写制御における機能解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 飯田緑、磯部智康、山口雄輝、藤井聡
  • 学会等名: 冬の若手ワークショップ2015
  • 発表場所: ホテル清渓（山梨県南都留郡）
  • 年月日: 2016-02-04 – 2016-02-06
• [学会発表] Computational approaches to analyze and predict protein-protein interactions (2016)
  • 著者名/発表者名: Haruki Nakamura
  • 学会等名: IPR International Workshop
  • 発表場所: 大阪大学蛋白質研究所 (大阪府吹田市)
  • 年月日: 2016-02-02
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 細胞核内アクチンフィラメントのゲノム機能への関与 (2016)
  • 著者名/発表者名: 山崎祥他，山本浩二，十川久美子，徳永万喜洋，原田昌彦
  • 学会等名: 第33回染色体ワークショップ・第14回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 一の坊（宮城県宮城郡）
  • 年月日: 2016-01-12 – 2016-01-14
• [学会発表] 細胞分化における核内アクチンの機能解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 山本浩二，山崎祥他，十川久美子，徳永万喜洋，原田昌彦
  • 学会等名: 第33回染色体ワークショップ・第14回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 一の坊（宮城県宮城郡）
  • 年月日: 2016-01-12 – 2016-01-14
• [学会発表] １分子顕微鏡で観る免疫細胞活性化の初期過程 (2015)
  • 著者名/発表者名: 十川久美子
  • 学会等名: 宇都宮大学 オプト－バイオシンポジウム
  • 発表場所: 宇都宮大学（栃木県宇都宮市）
  • 年月日: 2015-12-21
  • 招待講演
• [学会発表] 最先端テクノロジーによる疾患ゲノム解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本 直通
  • 学会等名: 第1回日本産婦人科遺伝診療学会学術講演会・教育講演
  • 発表場所: 長崎ブリックホール（長崎県長崎市）
  • 年月日: 2015-12-18
  • 招待講演
• [学会発表] Elucidation of the molecular mechanisms of action of bioactive natural products using high performance affinity beads (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Sakamoto, Yuki Yamaguchi, Takumi Ito, Hiroshi Handa
  • 学会等名: PACIFCHEM2015
  • 発表場所: ホノルル（アメリカ）
  • 年月日: 2015-12-17
  • 国際学会
• [学会発表] Biochemical analyses of CRBN, the target protein for immunomodulatory drugs (IMiDs) (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Sakamoto, Takumi Ito, Yuki Yamaguchi, Hideki Ando, Hiroshi Handa
  • 学会等名: PACIFCHEM2015
  • 発表場所: ホノルル（アメリカ）
  • 年月日: 2015-12-16
  • 国際学会
• [学会発表] ヒト疾患とrare variants (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本 直通
  • 学会等名: 第23回食細胞機能異常症研究会
  • 発表場所: 東京慈恵医科大学（東京都港区）
  • 年月日: 2015-12-12
  • 招待講演
• [学会発表] Computational approach to find a specific interaction among many IDR relating fuzzy complexes (2015)
  • 著者名/発表者名: Haruki Nakamura
  • 学会等名: International Symposium on Structure and Folding of Disease Related Proteins
  • 発表場所: ソウル（韓国）
  • 年月日: 2015-12-04
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 多発性骨髄腫に対するポマリドマイドの標的因子の網羅的探索 (2015)
  • 著者名/発表者名: 館野 俊平、飯田 緑、藤井 聡、山口 雄輝
  • 学会等名: 第３８回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-03
• [学会発表] EPR1の新規転写抑制モチーフの機能解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 岳, 岡村 僚太, 佐久間 哲史, 山本 卓, 高橋 陽介
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-03
• [学会発表] ATP依存的なクロマチンリモデリング因子でCBPによるヒストンアセチル化を刺激し転写を亢進する (2015)
  • 著者名/発表者名: 土井口 真康 、中川 武弥 、伊藤 敬
  • 学会等名: 第３８回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートピアホテル（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01 – 2015-12-04
• [学会発表] Dzip3はマウス胚性幹細胞において染色体の高次構造を調整することによって発生に関する遺伝子を制御する (2015)
  • 著者名/発表者名: 井上 大嗣、里 龍晴、相原 仁、水崎 博文、土井口 真康、東 美樹、宮西 隆幸、奥田 晶彦、中川武弥、伊藤 敬
  • 学会等名: 第３８回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: ポートピアホテル（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01 – 2015-12-04
• [学会発表] Ets1とRunx1のエンハンサー上での立体的な位置関係と協調性 (2015)
  • 著者名/発表者名: 内山 晃子，椎名 政昭，浜田 恵輔，豊後 泰子，嶋村 麻利子，緒方 一博
  • 学会等名: BMB2015（第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会）
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01 – 2015-12-04
• [学会発表] Kinetic characterization of a DNA binding activity of the transcription factor Ets1 and its regulation by phosphorylation in an intrinsically disordered region (2015)
  • 著者名/発表者名: Shiina M, Kasahara K, Higo J, Baba S, Hamada K, Uchiyama A, Suzuki K, Sato K, Nakamura H, Ogata K
  • 学会等名: BMB2015（第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会）
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01 – 2015-12-04
• [学会発表] 分子構造に基づく転写因子Nuclear factor (erythroid-derived2)-like2(Nrf2)の抗酸化剤応答配列認識機構の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 香絵，椎名 政昭，浜田 恵輔，石川 涼平，金井 達哉，豊後 泰子，岡田 千佳子，馬場 しほ，鈴木 隆史，太田 力，山本 雅之，緒方 一博
  • 学会等名: BMB2015（第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会）
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01 – 2015-12-04
• [学会発表] Somatic mutations in the MTOR gene cause focal cortical dysplasia type IIb (2015)
  • 著者名/発表者名: Naomichi Matsumoto
  • 学会等名: Biochemistry and Molecular Biology (BMB) 2015
  • 発表場所: 神戸ポートピアホテル（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 遺伝子解析におけるドロップレットディジタルPCRの活用 (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本直通
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会(第88回日本生化学会大会)BMB2015, ランチョンセミナー
  • 発表場所: 神戸ポートピアホテル（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
  • 招待講演
• [学会発表] A specific interaction among many fuzzy complexes regulated by phosphorylation: Molecular simulation approach (2015)
  • 著者名/発表者名: Haruki Nakamura
  • 学会等名: RSC/IPR Joint Symposium “Protein Structure and Function”
  • 発表場所: キャンベラ（オーストラリア）
  • 年月日: 2015-11-14
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Pol IIの転写伸長と運命決定制御のメカニズム (2015)
  • 著者名/発表者名: 山口 雄輝
  • 学会等名: 第２回北陸エピジェネティクス研究会
  • 発表場所: 富山大学（富山県富山市）
  • 年月日: 2015-11-10
  • 招待講演
• [学会発表] Rare variants in human diseases (2015)
  • 著者名/発表者名: Naomichi Matsumoto
  • 学会等名: University of Split Lecture
  • 発表場所: スプリット（クロアチア）
  • 年月日: 2015-11-09
  • 招待講演
• [学会発表] Next Generation Sequencing Dissecting Human “Genetic” Diseases (2015)
  • 著者名/発表者名: Naomichi Matsumoto
  • 学会等名: The VI Croatian Congress of Human Genetics
  • 発表場所: スプリット（クロアチア）
  • 年月日: 2015-11-06
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ジベレリン信号伝達におけるDELLA-GAF1複合体の標的遺伝子の探索 (2015)
  • 著者名/発表者名: 深澤 壽太郎、高橋 竜平、藤井 麻弥、三島 由佳、高橋 陽介
  • 学会等名: 第50回植物化学調節学会大会
  • 発表場所: 東京大学（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-10-25
• [学会発表] 低頻度体細胞モザイク変異が惹起するヒト疾患 (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本 直通
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第60回大会
  • 発表場所: 京王プラザホテル（東京都新宿区）
  • 年月日: 2015-10-16
• [学会発表] クロマチン動態制御におけるアクチン関連タンパク質Arp4の核内ダイナミクス (2015)
  • 著者名/発表者名: 伊藤由馬，木村宏，原田昌彦，十川久美子，徳永万喜洋
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Yeast two hybridおよび定量イメージング解析によるPDLIM2相互作用タンパク質の同定 (2015)
  • 著者名/発表者名: 申纂暎，伊藤由馬，十川久美子，田中貴志，徳永万喜洋
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] リポ多糖刺激における炎症抑制タンパク質PDLIM2活性化のイメージング定量解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 市川翔太，伊藤由馬，田中貴志，徳永万喜洋，十川久美子
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] CLIP170 phosphorylation mediates repositioning of microtubule-organizing center during T cell activation (2015)
  • 著者名/発表者名: 林偉銘，伊藤由馬，徳永万喜洋，十川久美子
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] 蛍光褪色回復法によるINO80クロマチンリモデリング複合体の核内動態解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 伊藤由馬，磯垣翼，木村宏，原田昌彦，十川久美子，徳永万喜洋
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] １分子イメージングによる転写伸長因子NELFとDSIFのダイナミクス定量解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 池田大地，伊藤由馬，徳永万喜洋，十川久美子
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] 転写因子Ets1天然変性領域のリン酸化によるDNA認識阻害メカニズムの検討 (2015)
  • 著者名/発表者名: 笠原浩太、肥後順一、椎名政昭、緒方一博、中村春木
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] EMDBとPDBデータの形状類似検索：Omokage検索 (2015)
  • 著者名/発表者名: 鈴木博文, 川端猛, 中村春木
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] ヘムの構造歪みが酸化還元電位に与える影響の計算科学的研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 今田康博, 中村春木, 鷹野優
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] 抗体CDR-H3ループ領域の立体構造予測 (2015)
  • 著者名/発表者名: 西上博士, Gert-Jan Bekker, 神谷成敏, 肥後順一, 中村春木
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] 天然変性領域であるp53C末端ドメインの構造と物性にアセチル化が及ぼす影響 (2015)
  • 著者名/発表者名: 飯田慎仁, 北條裕信, 中村春木, 肥後順一
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] On the convergence of binding free-energy landscape calculation by improved virtual-system coupled adaptive umbrella sampling (2015)
  • 著者名/発表者名: Bhaskar Dasgupta, 肥後順一, 中村春木
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] A novel method to determine the optimal unbinding path between receptor and ligand using advanced molecular dynamics simulation (2015)
  • 著者名/発表者名: Gert-Jan Bekker, 神谷成敏, 中村春木
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] 低解像度密度マップへの複数のサブユニットのあてはめ計算-実験情報による拘束の利用- (2015)
  • 著者名/発表者名: 川端猛, 鈴木博文, 中村春木
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Molecular Tailoring Approach法による蛋白質二次構造内に働く相互作用の量子化学的研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 草鹿あゆみ, 中村春木, 鷹野優
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] 分子シミュレーションにおける静電相互作用計算のための新規非エバルト法 (2015)
  • 著者名/発表者名: 福田育夫, 神谷成敏, Han Wang, 笠原浩太、中村春木
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Interaction of two subunits of D/L hetero dimer with catalytic subunits in archaeal RNA polymerase: Insights from MD simulations (2015)
  • 著者名/発表者名: Neetha Mohan, 笠原浩太、平田章、中村春木
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学角間キャンパス（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Regulatory Mechanisms for Pol II Termination Sites and 3' Processing Pathways in Higher Eukaryotes (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuki Yamaguchi and Junichi Yamamoto
  • 学会等名: MECHANISM OF EUKARYOTIC TRANSCRIPTION
  • 発表場所: Cold Spring Harbor（アメリカ）
  • 年月日: 2015-08-27
  • 国際学会
• [学会発表] 転写伸張因子DSIFのCTRを介した転写制御機構の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 磯部 智康、山口 雄輝
  • 学会等名: 転写サイクル班会議2015
  • 発表場所: ホテル暖香園（静岡県伊東市）ホテル暖香園
  • 年月日: 2015-08-05
• [学会発表] NELFを中心としたmRNAの品質管理のメカニズム (2015)
  • 著者名/発表者名: 瑞慶覧 安里、山本 淳一、磯部 智康、山口 雄輝
  • 学会等名: 転写サイクル班会議2015
  • 発表場所: ホテル暖香園（静岡県伊東市）
  • 年月日: 2015-08-05
• [学会発表] 転写伸長段階の制御メカニズム：新たな制御因子の探索 (2015)
  • 著者名/発表者名: 山口 雄輝、磯部 智康、曹 青福、山本 淳一
  • 学会等名: 転写サイクル班会議2015
  • 発表場所: ホテル暖香園（静岡県伊東市）
  • 年月日: 2015-08-04
• [学会発表] 分子シミュレーションから解き明かす転写因子Ets1のDNA結合調節機構 (2015)
  • 著者名/発表者名: 笠原浩太、Neetha Mohan、肥後順一、福田育夫、中村春木
  • 学会等名: 転写サイクル合同班会議2015
  • 発表場所: ホテル暖香園（静岡県伊東市）
  • 年月日: 2015-08-03 – 2015-08-05
• [学会発表] 転写制御に関係するヒストン修飾パターンの解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 藤井 聡、西山 晃、田村 智彦
  • 学会等名: 転写サイクル合同班会議2015
  • 発表場所: ホテル暖香園（静岡県伊東市）
  • 年月日: 2015-08-03 – 2015-08-05
• [学会発表] RNA polymerase IIのプロファイル解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 飯田 緑、磯部 智康、山口 雄輝、藤井 聡
  • 学会等名: 転写サイクル合同班会議2015
  • 発表場所: ホテル暖香園（静岡県伊東市）
  • 年月日: 2015-08-03 – 2015-08-05
• [学会発表] 遺伝性疾患における話題提供 (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本 直通
  • 学会等名: 第22回日本遺伝子診療学会大会・プレシジョン医療と診断情報の質保証
  • 発表場所: かながわ労働プラザ（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2015-07-19
  • 招待講演
• [学会発表] ヒト疾患とrare variants (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本 直通
  • 学会等名: 第33回内分泌代謝学サマーセミナー・続・内分泌至上主義・シンポジスト
  • 発表場所: 柳川藩主立花邸（福岡県柳川市）
  • 年月日: 2015-07-09
  • 招待講演
• [学会発表] Computational Approaches to Coupled Folding and Binding in Protein-Protein Interactions (2015)
  • 著者名/発表者名: Haruki Nakamura
  • 学会等名: 19th KPPS (Korean Peptide Protein Symposium) Symposium
  • 発表場所: 泰安郡（韓国）
  • 年月日: 2015-07-07
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ヘムの構造歪みが酸化還元電位に与える影響の計算科学的研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 今田康博, 中村春木, 鷹野優
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-24 – 2015-06-26
• [学会発表] p53蛋白質C末端天然変性領域の構造探索 (2015)
  • 著者名/発表者名: 飯田慎仁, 神谷成敏, 北條裕信, 中村春木, 肥後順一
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-24 – 2015-06-26
• [学会発表] 転写因子Ets1とパートナー転写因子の協調的結合によるDNA結合活性制御機構の計算科学的検討 (2015)
  • 著者名/発表者名: 笠原浩太, 福田育夫, 中村春木
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-24 – 2015-06-26
• [学会発表] FRET法とRAMD法を用いた核内受容体PPARγのリガンド結合に関する実験・理論的研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 神谷成敏, Gert-Jan Bekker, 白木琢磨, 中村春木
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-24 – 2015-06-26
• [学会発表] Molecular Tailoring Approachによるタンパク質の二次構造に働く相互作用の量子化学的解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 鷹野優, 草鹿あゆみ, 中村春木
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-24 – 2015-06-26
• [学会発表] HOMCOSサーバを用いた複合体立体構造の進化的保存性の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 川端猛, 中村春木
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-24 – 2015-06-26
• [学会発表] EMDBとPDBを対象とした形状類似性検索：Omokage検索 (2015)
  • 著者名/発表者名: 鈴木博文, 川端猛, 中村春木
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-24 – 2015-06-26
• [学会発表] 全エクソーム解析データの様々な活用法 (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本 直通
  • 学会等名: 2015アジレントゲノミクスフォーラム・招聘講演
  • 発表場所: ヒューリックホール浅草橋（東京都台東区）
  • 年月日: 2015-06-16
  • 招待講演
• [学会発表] IMiDs標的タンパク質CRBNの生化学的解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 坂本 聡、伊藤 拓水、安藤 秀樹、山口 雄輝、半田 宏
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー学会第10回年会
  • 発表場所: 東北大学（宮城県仙台市）
  • 年月日: 2015-06-10
• [学会発表] Deep sequencing detects very low-grade somatic mosaicism in the unaffected mother of siblings with nemaline myopathy (2015)
  • 著者名/発表者名: Naomichi Matsumoto, Eriko Koshimizu, Satoko Miyatake
  • 学会等名: European Human Genetics Conference 2015
  • 発表場所: グラスゴー（イギリス）
  • 年月日: 2015-06-06 – 2015-06-09
  • 国際学会
• [学会発表] Prediction of protein-protein and protein-ligand interactions, and application to drug discovery (2015)
  • 著者名/発表者名: Haruki Nakamura
  • 学会等名: The 9th Asian Biophysics Association Symposium (ABA2015)
  • 発表場所: 瀋陽（中国）
  • 年月日: 2015-05-10
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 遺伝性疾患の次世代シーケンス解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本 直通
  • 学会等名: 産総研Computational Biology Research Center (CBRC)セミナー
  • 発表場所: 産総研・臨海副都心センター別館（東京都江東区）
  • 年月日: 2015-04-23
  • 招待講演
• [学会発表] Computational analysis on electrostatic properties of proteins and their assembly (2015)
  • 著者名/発表者名: Haruki Nakamura
  • 学会等名: The first trilateral workshop for frontier protein studies
  • 発表場所: 北京（中国）
  • 年月日: 2015-04-23
  • 国際学会 / 招待講演
• [備考] 新学術領域研究「転写サイクル」
  • URL: http://transcriptioncycle.org/