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2015 年度 実績報告書

リポクオリティが演出する膜の形態と性質

計画研究

研究領域脂質クオリティが解き明かす生命現象
研究課題/領域番号 15H05902
研究機関名古屋大学

研究代表者

藤本 豊士  名古屋大学, 医学系研究科, 教授 (50115929)

研究分担者 末次 志郎  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (70345031)
研究期間 (年度) 2015-06-29 – 2020-03-31
キーワード膜脂質 / 電子顕微鏡 / 膜ドメイン / 脂質結合ドメイン
研究実績の概要

1)細胞内物質輸送など多様な現象に関与するホスファチジルイノシトール3,5-二燐酸(PtdIns(3,5)P2)の局在を急速凍結・凍結割断レプリカ標識電子顕微鏡法で解析するための方法を新たに開発した。プローブとして出芽酵母ATG18にGST, 4xFLAGのタグを付加したリコンビナント蛋白質を精製し、抗FLAG抗体、プロテインA標識金コロイドを用いて可視化した。上記プローブはホスファチジルイノシトール3燐酸(PtdIns3P)にも結合を示すが、過剰量のp40phoxのPXドメインを共存させてPtdIns3Pとの反応を抑制した。この方法を用いることにより、出芽酵母では高浸透圧処理した際に形成される液胞膜のラフト様ドメインにPtdIns(3,5)P2が集中すること、一方、哺乳類細胞ではにPtdIns(3,5)P2は管・小胞状構造を示すエンドソームの小胞部分に集まり、管状部分にはほとんど存在しないことなどを見出した。
2)BARタンパク質の中から、脂質膜への挿入部位を持つと推定されるタンパク質としてendophilinに注目した。BARドメインは、ダイマーとして機能するが、ほとんどのBARドメインと脂質膜の相互作用は、塩基性アミノ酸残基と酸性脂質の間の静電的な相互作用によっている。BARドメインの中でもendophilinは特に、その両端及び中央部に両親媒性部位を持つ。この両親媒性部位は、二重層からなる脂質膜の一層に挿入されることから、脂肪酸の多様性を認識できる可能性がある。本年度の研究では、様々な組織より抽出された脂質とendophilinの結合を調べたところ、脂質膜との結合や、結合の結果生じる脂質膜の形態の違いを見出した。また、ARDを含むタンパク質の中にも、脂質の組成により異なる結合を示すものを見出した。すなわち、endophilinやARDを含むタンパク質は、組織により異なるリポクオティの違いを認識できる可能性がある。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本年度は新たな膜脂質可視化法の開発に成功し、またリポクオリティの違いを認識できる可能性のある蛋白質を見出した。いずれも翌年度以降の研究の発展に直結する成果であると言える。

今後の研究の推進方策

昨年度の成果に基づいた研究の展開を目指すだけでなく、さらに新たな方向をめざす研究を開始し、リポクオリティの意義を明らかにする取り組みを展開する。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Higher-order assemblies of BAR domain proteins for shaping membranes2016

    • 著者名/発表者名
      Suetsugu S
    • 雑誌名

      Microscopy

      巻: - ページ: in press

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfw002

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phosphatidylinositol 3,5-bisphosphate-rich membrane domains in endosomes and lysosomes2016

    • 著者名/発表者名
      Takatori S, Tatematsu T, Cheng J, Matsumoto J, Akano T, Fujimoto T
    • 雑誌名

      Traffic

      巻: 17 ページ: 154-167

    • DOI

      10.1111/tra.12346

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A novel imaging method revealed phosphatidylinositol 3,5-bisphosphate-rich domains in the endosome/lysosome membrane2016

    • 著者名/発表者名
      Takatori S, Fujimoto T
    • 雑誌名

      Commun Integr Biol

      巻: 9 ページ: in press

    • DOI

      10.1080/19420889

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Possible regulation of caveolar endocytosis and flattening by phosphorylation of F-BAR domain protein PACSIN2/Syndapin II2015

    • 著者名/発表者名
      Senju Y, Suetsugu S
    • 雑誌名

      Bioarchitecture

      巻: 5 ページ: 70-77

    • DOI

      10.1080/19490992.2015.1128604

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phosphorylation of PACSIN2 by protein kinase C triggers the removal of caveolae from the plasma membrane2015

    • 著者名/発表者名
      Senju Y, Rosenbaum E, Shah C, Hamada-Nakahara S, Itoh Y, Yamamoto K, Hanawa-Suetsugu K, Daumke O, Suetsugu S
    • 雑誌名

      J Cell Sci

      巻: 128 ページ: 2766-2780

    • DOI

      10.1242/jcs.167775

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Yeast Ivy1p Is a Putative I-BAR-domain Protein with pH-sensitive Filament Forming Ability in vitro2015

    • 著者名/発表者名
      Itoh Y, Kida K, Hanawa-Suetsugu K, Suetsugu S
    • 雑誌名

      Cell Struct Funct

      巻: 41 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1247/csf.15014

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Electron Microscopy to observe the nano-scale distribution of membrane lipids2016

    • 著者名/発表者名
      Toyoshi Fujimoto
    • 学会等名
      The 7th Asia-Pacific Congress of Anatomy
    • 発表場所
      シンガポール国立大学,Singapore
    • 年月日
      2016-03-17 – 2016-03-20
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Looking at the nano-level membrane lipid distribution by electron microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      Toyoshi Fujimoto
    • 学会等名
      The 12th Multinational Congress on Microscopy (MCM2015)
    • 発表場所
      Eger, Hungary
    • 年月日
      2015-08-23 – 2015-08-28
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2017-01-06  

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