大規模シーケンスとコンピューティングによるがんの進化と多様性の解明

2019 年度 実績報告書

• 研究領域: がんシステムの新次元俯瞰と攻略
• 研究課題/領域番号: 15H05909
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 小川 誠司 京都大学, 医学研究科, 教授 (60292900)
• 研究分担者: 佐藤 悠佑 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (20372378) ; 牧島 秀樹 京都大学, 医学研究科, 准教授 (40402127) ; 南谷 泰仁 京都大学, 医学研究科, 特定准教授 (60451811)
• 研究期間 (年度): 2015-06-29 – 2020-03-31
• キーワード: RNAシーケンス / 総合生物 / ゲノム科学 / システムゲノム科学 / 腫瘍学

研究実績の概要

癌の起源と進化に関する解析では、潰瘍性大腸炎による上皮再構築メカニズムと発がんとの関係を解明した(Kakiuchiら、Nature 2019)。長期間の炎症に暴露された大腸粘膜と、これを背景として発症する大腸がんの大規模なゲノム解析を通じて、潰瘍性大腸炎の長期罹患患者の大腸上皮では、炎症に関わるIL-17シグナル経路の遺伝子変異を獲得した細胞が増加し、直腸の半分以上の領域を置き換えていることを明らかにした。興味深いことに、IL-17シグナル経路の遺伝子変異のうち、いくつかの変異は大腸がんではほとんど認められず、これらの遺伝子変異を獲得した上皮細胞は発がんし難かったため、有望な治療標的となり得ることが示唆された。癌のシーケンスだけでは発がんし難い変異の解析は難しく、癌の起源と進化に関する非常に重要な知見を得ることができた。胚細胞変異の解析では、引き続きDDX41の胚細胞変異の解析を継続した。MDSの解析症例を多数追加し、合計2000例の解析を行い、リスクアリルの種類や頻度等の評価を進めた。また、同DDX41遺伝子の遺伝子改変マウスを用いた解析ではDDX41の欠失で造血不全を認め、RNAシーケンス等でDDX41の造血器における標的パスウェイを同定した。臨床シーケンスに関する検討では、前年度までにStageII/IIIの大腸癌検体2000例について既知のドライバー変異に関するターゲットシーケンスを行い遺伝子変異の同定およびコピー数異常を解析したが、今年度は同2000検体についてRNAシーケンスを行い、遺伝子発現プロファイルや融合遺伝子の解析を行った。これらのゲノムおよびトランスクリプトームを臨床情報と統合的に解析することにより、病型分類やバイオマーカーについて重要な知見を得ることができた。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [国際共同研究] Dana-Farber Cancer Institute/MD Anderson Cancer Center/Massachusetts General Hospital Center(米国)
  • 国名: 米国
  • 外国機関名: Dana-Farber Cancer Institute/MD Anderson Cancer Center/Massachusetts General Hospital Center
• [国際共同研究] Munich Leukemia Laboratory/Georg- August-University/Hannover Medical School(ドイツ)
  • 国名: ドイツ
  • 外国機関名: Munich Leukemia Laboratory/Georg- August-University/Hannover Medical School
• [国際共同研究] Wellcome Trust Sanger Institute/Leeds Teaching Hospitals(英国)
  • 国名: 英国
  • 外国機関名: Wellcome Trust Sanger Institute/Leeds Teaching Hospitals
• [国際共同研究] Paris Diderot University(フランス)
  • 国名: フランス
  • 外国機関名: Paris Diderot University
• [国際共同研究] Karolinska Institute(スウェーデン)
  • 国名: スウェーデン
  • 外国機関名: Karolinska Institute
• [国際共同研究]
  • 他の国数: 5
• [雑誌論文] Persistent clonal cytogenetic abnormality with del(20q) from an initial diagnosis of acute promyelocytic leukemia. (2020)
  • 著者名/発表者名: Fujioka M, Itonaga H, Kato T, Nannya Y, Hashimoto M, Kasai S, Toriyama E, Kamijo R, Taguchi M, Taniguchi H, Sato S, Atogami S, Imaizumi Y, Hata T, Moriuchi Y, Ogawa S, Miyazaki Y.
  • 雑誌名: Int J Hematol. 巻: 111(2): ページ: 311-316
  • DOI: 10.1007/s12185-019-02731-w.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Molecular pathogenesis of progression to myeloid leukemia from TET-insufficient status. (2020)
  • 著者名/発表者名: Shrestha R, Sakata-Yanagimoto M, Maie K, Oshima M, Ishihara M, Suehara Y, Fukumoto K, Nakajima-Takagi Y, Matsui H, Kato T, Muto H, Sakamoto T, Kusakabe M, Nannya Y, Makishima H, Ueno H, Saiki R, Ogawa S, Chiba K, Shiraishi Y, Miyano S, Mouly E, Bernard OA, Inaba T, Koseki H, Iwama A, Chiba S.
  • 雑誌名: Blood Adv 巻: 4(5) ページ: 845-854
  • DOI: 10.1182/bloodadvances.2019001324.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Combined Cohesin-Runx1 Deficiency Synergistically Perturbs Chromatin Looping and Causes Myelodysplastic Syndromes (2020)
  • 著者名/発表者名: Ochi Y, Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Cancer Discov 巻: - ページ: -
  • DOI: 10.1158/2159-8290.CD-19-0982.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genetic basis of myelodysplastic syndromes (2020)
  • 著者名/発表者名: OGAWA Seishi
  • 雑誌名: Proceedings of the Japan Academy, Series B 巻: 96 ページ: 107～121
  • DOI: 10.2183/pjab.96.009
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genome analysis of myelodysplastic syndromes among atomic bomb survivors in Nagasaki. (2020)
  • 著者名/発表者名: Taguchi M, Mishima H, Shiozawa Y, Hayashida C, Kinoshita A, Nannya Y, Makishima H, Horai M, Matsuo M, Sato S, Itonaga H, Kato T, Taniguchi H, Imanishi D, Imaizumi Y, Hata T, Takenaka M, Moriuchi Y, Shiraishi Y, Miyano S, Ogawa S, Yoshiura KI, Miyazaki Y.
  • 雑誌名: Haematologica 巻: 105(2) ページ: 358-365.
  • DOI: 10.3324/haematol.2019.219386.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] , Rojnuckarin P. Novel DDX41 variants in Thai patients with myeloid neoplasms. I (2020)
  • 著者名/発表者名: Polprasert C, Takeda J, Niparuck P, Rattanathammethee T, Pirunsarn A, Suksusut A, Kobbuaklee S, Wudhikarn K, Lawasut P, Kongkiatkamon S, Chuncharunee S, Songserm K, Phowthongkum P, Bunworasate U, Nannya Y, Yoshida K, Makishima H, Ogawa S,
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 111(2) ページ: 241-246
  • DOI: 10.1007/s12185-019-02770-3.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Distinct and convergent consequences of splice factor mutations in myelodysplastic syndromes (2020)
  • 著者名/発表者名: Madan V, Li J, Zhou S, Teoh WW, Han L, Meggendorfer M, Malcovati L, Cazzola M, Ogawa S, Haferlach T, Yang H, Koeffler HP.
  • 雑誌名: Am J Hematol. 巻: 95(2) ページ: 133-143
  • DOI: 10.1002/ajh.25673. Epub 2019 Nov 18.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] TET2 haploinsufficiency alters reprogramming into induced pluripotent stem cells (2020)
  • 著者名/発表者名: Secardin Lise、Limia Cintia Elisabeth Gomez、di Stefano Antonio、Bonamino Martin Hernan、Saliba Joseph、Kataoka Keisuke、Rehen Stevens K.、Raslova Hana、Marty Caroline、Ogawa Seishi、Vainchenker William、Monte-Mor Barbara da Costa Reis、Plo Isabelle
  • 雑誌名: Stem Cell Research 巻: 44 ページ: 101755～101755
  • DOI: 10.1016/j.scr.2020.101755
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Dasatinib is an effective treatment for angioimmunoblastic T-cell lymphoma. (2020)
  • 著者名/発表者名: Nguyen TB, Sakata-Yanagimoto M, Fujisawa M, Tanzima Nuhat S, Miyoshi H, Nannya Y, Hashimoto K, Fukumoto K, Bernard OA, Kiyoki Y, Ishitsuka K, Momose H, Sukegawa S, Shinagawa A, Suyama T, Sato Y, Nishikii H, Obara N, Kusakabe M, Yanagimoto S, Ogawa S, Ohshima K, Chiba S.
  • 雑誌名: Cancer Res. 2020. 巻: - ページ: -
  • DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-19-2787.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Prominence of nestin-expressing Schwann cells in bone marrow of patients with myelodysplastic syndromes with severe fibrosis (2019)
  • 著者名/発表者名: Cao-Sy Luan、Obara Naoshi、Sakamoto Tatsuhiro、Kato Takayasu、Hattori Keiichiro、Sakashita Shingo、Nannya Yasuhito、Ogawa Seishi、Harada Hironori、Sakata-Yanagimoto Mamiko、Nishikii Hidekazu、Chiba Shigeru
  • 雑誌名: International Journal of Hematology 巻: 109 ページ: 309～318
  • DOI: 10.1007/s12185-018-02576-9
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genome analysis of myelodysplastic syndromes among atomic bomb survivors in Nagasaki (2019)
  • 著者名/発表者名: Taguchi Masataka、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Haematologica 巻: 105 ページ: 358～365
  • DOI: 10.3324/haematol.2019.219386
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] RNAmut: robust identification of somatic mutations in acute myeloid leukemia using RNA-seq. (2019)
  • 著者名/発表者名: Gu M, Zwiebel M, Ong SH, Boughton N, Nomdedeu J, Basheer F, Nannya Y, Quiros PM, Ogawa S, Cazzola M, Rad R, Butler AP, Vijayabaskar MS, Vassiliou G.
  • 雑誌名: Haematologica 巻: - ページ: -
  • DOI: 10.3324/haematol.2019
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Molecular heterogeneity in peripheral T-cell lymphoma, not otherwise specified revealed by comprehensive genetic profiling (2019)
  • 著者名/発表者名: Watatani Yosaku,Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 33 ページ: 2867～2883
  • DOI: 10.1038/s41375-019-0473-1
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• [雑誌論文] Acute myeloid leukemia with a cryptic NUP98/PRRX2 rearrangement developing after low-dose methotrexate therapy for rheumatoid arthritis (2019)
  • 著者名/発表者名: Chonabayashi Kazuhisa、Yoshida Yoshinori、Kitawaki Toshio、Nannya Yasuhito、Nakamura Momoko、Oshima Shinichiro、Hishizawa Masakatsu、Yamashita Kouhei、Ogawa Seishi、Takaori-Kondo Akifumi
  • 雑誌名: Annals of Hematology 巻: 98 ページ: 2841～2843
  • DOI: 10.1007/s00277-019-03838-0
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Frequent mutations that converge on the NFKBIZ pathway in ulcerative colitis (2019)
  • 著者名/発表者名: Kakiuchi Nobuyuki、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Nature 巻: 577 ページ: 260～265
  • DOI: 10.1038/s41586-019-1856-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] DNA methylation-based classification reveals difference between pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia and normal thymocytes (2019)
  • 著者名/発表者名: Kimura Shunsuke、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 34 ページ: 1163～1168
  • DOI: 10.1038/s41375-019-0626-2
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Novel DDX41 variants in Thai patients with myeloid neoplasms (2019)
  • 著者名/発表者名: Polprasert Chantana、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: International Journal of Hematology 巻: 111 ページ: 241～246
  • DOI: 10.1007/s12185-019-02770-3
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• [雑誌論文] Ring sideroblasts in AML are associated with adverse risk characteristics and have a distinct gene expression pattern (2019)
  • 著者名/発表者名: Berger Gerbrig、Gerritsen Mylene、Yi Guoqiang、Koorenhof-Scheele Theresia N.、Kroeze Leonie I.、Stevens-Kroef Marian、Yoshida Kenichi、Shiraishi Yuichi、van den Berg Eva、Schepers Hein、Huls Geert、Mulder Andr? B.、Ogawa Seishi、Martens Joost H. A.、Jansen Joop H.、Vellenga Edo
  • 雑誌名: Blood Advances 巻: 3 ページ: 3111～3122
  • DOI: 10.1182/bloodadvances.2019000518
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Transcriptome analysis offers a comprehensive illustration of the genetic background of pediatric acute myeloid leukemia (2019)
  • 著者名/発表者名: Shiba Norio、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Blood Advances 巻: 3 ページ: 3157～3169
  • DOI: 10.1182/bloodadvances.2019000404
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Age-related remodelling of oesophageal epithelia by mutated cancer drivers (2019)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama Akira、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Nature 巻: 565 ページ: 312～317
  • DOI: 10.1038/s41586-018-0811-x
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• [雑誌論文] Associations of complementation group, ALDH2 genotype, and clonal abnormalities with hematological outcome in Japanese patients with Fanconi anemia (2019)
  • 著者名/発表者名: Yabe Miharu、Koike Takashi、Ohtsubo Keisuke、Imai Eri、Morimoto Tsuyoshi、Takakura Hiromitsu、Koh Katsuyoshi、Yoshida Kenichi、Ogawa Seishi、Ito Etsuro、Okuno Yusuke、Muramatsu Hideki、Kojima Seiji、Matsuo Keitaro、Mori Minako、Hira Asuka、Takata Minoru、Yabe Hiromasa
  • 雑誌名: Annals of Hematology 巻: 98 ページ: 271～280
  • DOI: 10.1007/s00277-018-3517-0
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Differential expression of individual transcript variants of PD-1 and PD-L2 genes on Th-1/Th-2 status is guaranteed for prognosis prediction in PCNSL (2019)
  • 著者名/発表者名: Takashima Yasuo、Kawaguchi Atsushi、Sato Ryuichi、Yoshida Kenichi、Hayano Azusa、Homma Jumpei、Fukai Junya、Iwadate Yasuo、Kajiwara Koji、Ishizawa Shin、Hondoh Hiroaki、Nakano Masakazu、Ogawa Seishi、Tashiro Kei、Yamanaka Ryuya
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 9 ページ: -
  • DOI: 10.1038/s41598-019-46473-5
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• [雑誌論文] Decreased RORC expression and downstream signaling in HTLV‐1‐associated adult T‐cell lymphoma/leukemia uncovers an antiproliferative IL17 link: A potential target for immunotherapy? (2019)
  • 著者名/発表者名: Subramanian Kritika、Dierckx Tim、Khouri Ricardo、Menezes Soraya Maria、Kagdi Huseini、Taylor Graham P.、Farre Lourdes、Bittencourt Achilea、Kataoka Keisuke、Ogawa Seishi、Van Weyenbergh Johan
  • 雑誌名: International Journal of Cancer 巻: 144 ページ: 1664～1675
  • DOI: 10.1002/ijc.31922
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Frequent germline mutations of HAVCR2 in sporadic subcutaneous panniculitis-like T-cell lymphoma (2019)
  • 著者名/発表者名: Polprasert Chantana、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Blood Advances 巻: 3 ページ: 588～595
  • DOI: 10.1182/bloodadvances.2018028340
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Novel neuroblastoma amplified sequence (NBAS) mutations in a Japanese boy with fever-triggered recurrent acute liver failure. (2019)
  • 著者名/発表者名: Ono S, Matsuda J, Watanabe E, Akaike H, Teranishi H, Miyata I, Otomo T, Sadahira Y, Mizuochi T, Kusano H, Kage M, Ueno H, Yoshida K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Ogawa S, Hayashi Y, Kanegane H, Ouchi K.
  • 雑誌名: Hum Genome Var 巻: 6:2. ページ: -
  • DOI: 10.1038/s41439-018-0035-5.
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• [雑誌論文] Defective Epstein-Barr virus in chronic active infection and haematological malignancy. (2019)
  • 著者名/発表者名: Okuno Y, Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Nat Microbiol. 巻: 4(3 ページ: 404-413
  • DOI: 10.1038/s41564-018-0334-0.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Hematopoietic stem cell transplantation for progressive combined immunodeficiency and lymphoproliferation in patients with activated phosphatidylinositol-3-OH kinase δ syndrome type 1 (2019)
  • 著者名/発表者名: Okano Tsubasa、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Journal of Allergy and Clinical Immunology 巻: 143 ページ: 266～275
  • DOI: 10.1016/j.jaci.2018.04.032
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Invariant patterns of clonal succession determine specific clinical features of myelodysplastic syndromes (2019)
  • 著者名/発表者名: Nagata Yasunobu、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 10 ページ: -
  • DOI: 10.1038/s41467-019-13001-y
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genetic and transcriptional landscape of plasma cells in POEMS syndrome (2019)
  • 著者名/発表者名: Nagao Yuhei、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 33 ページ: 1723～1735
  • DOI: 10.1038/s41375-018-0348-x
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Pathogenic mutations identified by a multimodality approach in 117 Japanese Fanconi anemia patients (2019)
  • 著者名/発表者名: Mori Minako、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Haematologica 巻: 104 ページ: 1962～1973
  • DOI: 10.3324/haematol.2018.207241
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Myelodysplastic Syndrome-Associated SRSF2 Mutations Cause Splicing Changes by Altering Binding Motif Sequences (2019)
  • 著者名/発表者名: Masaki So、Ikeda Shun、Hata Asuka、Shiozawa Yusuke、Kon Ayana、Ogawa Seishi、Suzuki Kenji、Hakuno Fumihiko、Takahashi Shin-Ichiro、Kataoka Naoyuki
  • 雑誌名: Frontiers in Genetics 巻: 10 ページ: -
  • DOI: 10.3389/fgene.2019.00338
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mechanisms of Progression of Myeloid Preleukemia to Transformed Myeloid Leukemia in Children with Down Syndrome (2019)
  • 著者名/発表者名: Labuhn Maurice、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Cancer Cell 巻: 36 ページ: 123～138.e10
  • DOI: 10.1016/j.ccell.2019.06.007
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Integrated genetic and epigenetic analysis revealed heterogeneity of acute lymphoblastic leukemia in Down syndrome (2019)
  • 著者名/発表者名: Kubota Yasuo、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Cancer Science 巻: 110 ページ: 3358～3367
  • DOI: 10.1111/cas.14160
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Molecular pathogenesis of disease progression in MLL-rearranged AML (2019)
  • 著者名/発表者名: Kotani Shinichi、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 33 ページ: 612～624
  • DOI: 10.1038/s41375-018-0253-3
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Modification of cellular and humoral immunity by somatically reverted T cells in X-linked lymphoproliferative syndrome type 1. (2019)
  • 著者名/発表者名: Hoshino A, Yang X, Tanita K, Yoshida K, Ono T, Nishida N, Okuno Y, Kanzaki T, Goi K, Fujino H, Ohshima K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Ogawa S, Kojima S, Morio T, Kanegane H.
  • 雑誌名: J Allergy Clin Immunol. 巻: 143(1) ページ: 421-424
  • DOI: 10.1016/j.jaci.2018.07.044.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] TP53 mutation status divides myelodysplastic syndromes with complex karyotypes into distinct prognostic subgroups (2019)
  • 著者名/発表者名: Haase Detlef、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 33 ページ: 1747～1758
  • DOI: 10.1038/s41375-018-0351-2
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genetic analysis of a case of Helicobacter pylori-uninfected intramucosal gastric cancer in a family with hereditary diffuse gastric cancer. (2019)
  • 著者名/発表者名: Funakoshi T, Miyamoto S, Kakiuchi N, Nikaido M, Setoyama T, Yokoyama A, Horimatsu T, Yamada A, Torishima M, Kosugi S, Yamada H, Sugimura H, Haga H, Sakai Y, Ogawa S, Seno H, Muto M, Chiba T.
  • 雑誌名: Gastric Cancer. 巻: 22(4) ページ: 892-898.
  • DOI: 10.1007/s10120-018-00912-w.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Role of Donor Clonal Hematopoiesis in Allogeneic Hematopoietic Stem-Cell Transplantation (2019)
  • 著者名/発表者名: Frick Mareike、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Journal of Clinical Oncology 巻: 37 ページ: 375～385
  • DOI: 10.1200/JCO.2018.79.2184
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Escape hematopoiesis by HLA-B5401-lacking hematopoietic stem progenitor cells in men with acquired aplastic anemia. (2019)
  • 著者名/発表者名: Elbadry MI, Mizumaki H, Hosokawa K, Espinoza JL, Nakagawa N, Chonabayashi K, Yoshida Y, Katagiri T, Hosomichi K, Zaimoku Y, Imi T, Nguyen MAT, Fujii Y, Tajima A, Ogawa S, Takenaka K, Akashi K, Nakao S
  • 雑誌名: Haematologica. 巻: - ページ: -
  • DOI: 10.3324/haematol.2018.210856.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] PAK Kinase Inhibition Has Therapeutic Activity in Novel Preclinical Models of Adult T-Cell Leukemia/Lymphoma (2019)
  • 著者名/発表者名: Chung Elaine Y.、Mai Yun、Shah Urvi A.、Wei Yongqiang、Ishida Elise、Kataoka Keisuke、Ren Xiaoxin、Pradhan Kith、Bartholdy Boris、Wei Xiaolei、Zou Yiyu、Zhang Jinghang、Ogawa Seishi、Steidl Ulrich、Zang Xingxing、Verma Amit、Janakiram Murali、Ye B. Hilda
  • 雑誌名: Clinical Cancer Research 巻: 25 ページ: 3589～3601
  • DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-18-3033
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genomic landscape and clonal evolution of acute myeloid leukemia with t(8;21): an international study on 331 patients (2019)
  • 著者名/発表者名: Christen Friederike、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Blood 巻: 133 ページ: 1140～1151
  • DOI: 10.1182/blood-2018-05-852822
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of enhancer of mRNA decapping 4 as a novel fusion partner of MLL in acute myeloid leukemia. (2019)
  • 著者名/発表者名: Becker H, Greve G, Kataoka K, Mallm JP, Duque-Afonso J, Ma T, Niemoller C, Pantic M, Duyster J, Cleary ML, Schuler J, Rippe K, Ogawa S, Lubbert M.
  • 雑誌名: Blood Adv. 2019 巻: 3(5) ページ: 761-765.
  • DOI: 10.1182/bloodadvances.2018023879.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Remission clone in acute myeloid leukemia shows growth advantage after chemotherapy but is distinct from leukemic clone. (2019)
  • 著者名/発表者名: Ahn JS, Kim T, Kim YK, Cho YC, Cho S, Jung SH, Ahn SY, Jung SY, Yang DH, Lee JJ, Choi S, Lee JY, Shin MG, Yoshida K, Ogawa S, Kim IC, Zhang Z, Kim HJ, Kim DDH
  • 雑誌名: Exp Hematol. 巻: 75 ページ: 26-30
  • DOI: 10.1016/j.exphem.2019.06.001.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Essential thrombocythemia correctly diagnosed through the guidance of comprehensive genomic profilin (2019)
  • 著者名/発表者名: Shibata S, Kitano T, Okamoto Y, Takiuchi Y, Yamamoto K, Tabata S, Aiba A, Yoshida Y, Nannya Y, Ogawa S, Arima N
  • 雑誌名: Rinsho Ketsueki 巻: 60(12) ページ: 1630-1634
  • DOI: 10.11406/rinketsu.60.1630.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Predisposed genomic instability in pre-treatment bone marrow evolves to therapy-related myeloid neoplasms in malignant lymphoma (2019)
  • 著者名/発表者名: Katagiri Seiichiro、Makishima Hideki、Azuma Kenko、Nannya Yasuhito、Saitoh Yuu、Yoshizawa Seiichiro、Akahane Daigo、Fujimoto Hiroaki、Ito Yoshikazu、Velaga Ravi、Umezu Tomohiro、Ohyashiki Junko H.、Ogawa Seishi、Ohyashiki Kazuma
  • 雑誌名: Haematologica 巻: - ページ: 229856
  • DOI: 10.3324/haematol.2019.229856
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] [Successful treatment of pure red cell aplasia with cyclosporin in a patient with T-cell large granular lymphocytic leukemia harboring the STAT3 D661V mutation]. (2019)
  • 著者名/発表者名: Adachi M, Yoshida K, Shiraishi Y, Chiba K, Miyano S, Ogawa S.
  • 雑誌名: Rinsho Ketsueki. 巻: 60(1) ページ: 39-45
  • DOI: 10.11406/rinketsu.60.39.
• [雑誌論文] Genetics of MDS (2019)
  • 著者名/発表者名: Ogawa Seishi
  • 雑誌名: Blood 巻: 133 ページ: 1049～1059
  • DOI: 10.1182/blood-2018-10-844621
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Mutational landscape of colorectal cancer with POLE gene mutation・ポスター (2019)
  • 著者名/発表者名: Yoshikage Inoue, Nobuyuki Kakiuchi, Kenichi Yoshida, Yusuke Shiozawa, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Tetsuichi Yoshizato, Hiroko Tanaka, Ai Okada, Satoshi Nagayama, Satoru Miyano, Yoshiharu Sakai and Seishi Ogawa
  • 学会等名: American Associationツfor Cancer ResearchツAnnual Meeting 2019.Atlanta, USA
  • 国際学会
• [学会発表] Myxofibrosarcoma is characterized by frequent abnormalities in TP53 and increased genetic instability (2019)
  • 著者名/発表者名: Yasuhide Takeuchi, Annegret Kunitz, Hiromichi Suzuki, Kenichi Yoshida, Yuichi Shiraishi, Teppei Shimamura, Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka, Nobuyuki Kakiuchi, Yusuke Shiozawa, Akira Yokoyama, Tetsuichi Yoshizato, Kosuke Aoki, Yoichi Fujii, Hideki Makishima, Hironori Haga, Satoru Miyano, Frederik Damm, Seishi Ogawa
  • 学会等名: American Association for Cancer Research Annual Meeting 2019
  • 国際学会
• [学会発表] Clonal evolution of non-malignant proliferative lesions into breast cancers（ポスター） (2019)
  • 著者名/発表者名: Tomomi Nishimura, Kenichi Yoshida, Yukiko Kawata, Yasuhide Takeuchi, Nobuyuki Kakiuchi, Yusuke Shiozawa, Kosuke Aoki, Masahiro Hirata, Tatsuki R. Kataoka, Takaki Sakurai, Satoko Baba, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Kengo Takeuchi, Hironori Haga, Satoru Miyano, Masakazu Toi, Seishi Ogawa
  • 学会等名: AACR Annual meeting 2019 (Atlanta, USA)
  • 国際学会
• [学会発表] Genetic analysis of pheochromocytoma (2019)
  • 著者名/発表者名: Tatsuki Ogasawara, Yoichi Fujii, Masanori Fujimoto, Yusuke Shiozawa, Hiromichi Suzuki, Tetsuichi Yoshizato, Kenichi Yoshida, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka, Hideki Makishima, Satoru Miyano, Tomoaki Tanaka, Seishi Ogawa
  • 学会等名: American Association for Cancer Research Annual Meeting 2019, Atlanta, USA
  • 国際学会
• [学会発表] Genetic analysis of pancreatic neuroendocrine neoplasms grade 3 (2019)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Kakiuchi, Ogawa Seishi., et al.
  • 学会等名: AACR Annual Metting 2019
  • 国際学会
• [学会発表] 「がんの起源について」 (2019)
  • 著者名/発表者名: Seishi Ogawa
  • 学会等名: 第56回日本臨床分子医学会学術集会
  • 招待講演
• [学会発表] がんの起源について (2019)
  • 著者名/発表者名: Seishi Ogawa
  • 学会等名: 第30回日本医学会総会 2019 中部
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Distinct ethnic, clinical, and genetic characteristics of der(1;7) in myelodysplastic syndromes.(Poster) (2019)
  • 著者名/発表者名: Rurika Okuda,,Ogawa Seishi., et al.
  • 学会等名: 15th MDS Symposium
  • 国際学会
• [学会発表] Molecular characteristics that predict response to azacitidine therapy (2019)
  • 著者名/発表者名: Yasuhito Nannya, Ogawa Seishi., et al.
  • 学会等名: Th 15th International Symposium on Myelodysplastic Syndromes, Copenhagen, Denmark
  • 国際学会
• [学会発表] 孤発例の皮下脂肪織炎様T細胞リンパ腫でも高頻度でTIM3の胚細胞変異を認める (2019)
  • 著者名/発表者名: 竹内 康英, Chantana Polprasert, 垣内 伸之, 吉田 健一, 真田 昌, 秋田 直洋, 竹田 淳恵, 藤井 陽一, 鈴木 啓道, 南谷 泰仁, 白石 友一, 千葉 健一, 田中 洋子, 宮野 悟, Ponlapat Rojnuckarin, 小川 誠司, 牧島 秀樹
  • 学会等名: 第108回病理学会総会
• [学会発表] Germline DDX41 mutations in the Japanese populations（口頭） (2019)
  • 著者名/発表者名: Seishi Ogawa
  • 学会等名: The 10th JSH International
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] NGS-based Copy Number Analysis in 1,966 Patients with Myeloid Neoplasms (2019)
  • 著者名/発表者名: Ryunosuke Saiki, Yusuke Shiozawa, Tetsuichi Yoshizato, Yasuhito Nanya, June Takeda, Yoichi Hujii, Kenichi Yoshida, Yuichi Shiraishi, Hiroko Tanaka, Kenichi Chiba, Yoshiko Atsuta, Makoto Onizuka, Hidehiro Itonaga, Masashi Sanada, Yoshinobu Kanda, Bartlomiej Przychodzen, Mikkael A. Sekeres,
  • 学会等名: 24th EHA Anniversary Congress, Amsterdam,
  • 国際学会
• [学会発表] Clonal hematopoiesis in Aplastic anemia (2019)
  • 著者名/発表者名: Seishi Ogawa
  • 学会等名: 24th Congress of European Hematology Association
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Biological characterization of the U2af1 S34F mutation in the pathogenesis of myelodysplasia (2019)
  • 著者名/発表者名: Ayana Kon Yasuhito Nannya, Keisuke Kataoka, Manabu Nakayama, Haruhiko Koseki, Masashi Sanada, Hideki Makishima, Marshall Masahiro Nakagawa, Seishi Ogawa
  • 学会等名: 24th Congress of European Hematology Association
  • 国際学会
• [学会発表] NOVEL MOLECULAR PATHOGENESIS AND THERAPEUTIC TARGET IN ACUTE ERYTHROID LEUKEMIA(Poster) (2019)
  • 著者名/発表者名: June Takeda , Ogawa Seishi., et al.
  • 学会等名: 24th EHA Congress, Amsterdam,
  • 国際学会
• [学会発表] Clonal evolution of non-malignant proliferative lesions into breast cancers (2019)
  • 著者名/発表者名: Tomomi Nishimura, Kenichi Yoshida, Yukiko Kawata, Yasuhide Takeuchi, Nobuyuki Kakiuchi, Yusuke Shiozawa, Kosuke Aoki, Masahiro Hirata, Tatsuki R. Kataoka, Takaki Sakurai, Satoko Baba, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Kengo Takeuchi, Hironori Haga, Satoru Miyano, Masakazu Toi, Seishi Ogawa
  • 学会等名: 第78回日本癌学会学術総会
• [学会発表] Clonal expansion in non-cancer (2019)
  • 著者名/発表者名: Seishi Ogawa
  • 学会等名: The XVIIIth KICancer-StratCan Retreat
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Molecular profiles in Myelodysplastic Syndromes (2019)
  • 著者名/発表者名: Seishi Ogawa
  • 学会等名: QOL-ONE IV Annual Conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Clinical and Genetic Characteristics of Colorectal Cancer with POLE Gene Mutation (2019)
  • 著者名/発表者名: Yoshikage Inoue, Nobuyuki Kakiuchi, Kenichi Yoshida, Yusuke Shiozawa, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Tetsuichi Yoshizato, Hiroko Tanaka, Ai Okada, Satoshi Nagayama, Satoru Miyano, Yoshiharu Sakai and Seishi Ogawa
  • 学会等名: The 78thAnnualツMeeting of the JapanツCancer Association,Kyoto
  • 国際学会
• [学会発表] 粘液線維肉腫にみられるTP53の異常と著明な遺伝的不安定性 (2019)
  • 著者名/発表者名: 竹内 康英, 鈴木 啓道, 吉田 健一, 白石 友一, 垣内 伸之, 塩澤 裕介, 井上 善景, 千葉 健一, 牧島 秀樹, 宮野 悟, 羽賀 博典, Damm Frederik, 小川 誠司
  • 学会等名: The 78th JCA conference
• [学会発表] 急性赤白血病のゲノム解析と治療標的 (2019)
  • 著者名/発表者名: June Takeda , Ogawa Seishi., et al.
  • 学会等名: The 78th JCA conference
• [学会発表] Clonal evolution of proliferative lesions into breast cancers (2019)
  • 著者名/発表者名: Tomomi Nishimura, Kenichi Yoshida, Yasuhide Takeuchi, Nobuyuki Kakiuchi, Yusuke Shiozawa, Tatsuki R. Kataoka, Takaki Sakurai, Kengo Takeuchi, Hironori Haga, Satoru Miyano, Masakazu Toi, Seishi Ogawa
  • 学会等名: The 78th JCA conference
• [学会発表] Analysis of mechanisms underlying clonal evolution in MDS to sAML transformation by single-cell sequencing (2019)
  • 著者名/発表者名: Ryosaku Inagaki, Masahiro M Nakagawa, Yasuhito Nannya, Xingxing Qi, June Takeda, Akinori Yoda, Ayana Kon, Hideki Makishima, Seishi Ogawa
  • 学会等名: The 78th JCA conference
• [学会発表] 骨髄系腫瘍におけるコピー数異常と遺伝子変異の統合解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 佐伯 龍之介、塩澤 裕介、吉里 哲一、南谷 泰仁、竹田 淳恵、吉田 健一、白石 友一、千葉 滋、石川 隆之、宮野 悟、牧島 秀樹、小川 誠司
  • 学会等名: 78th Japanese Cancer Association
• [学会発表] Distinct ethnic, clinical, and genetic characteristics of der(1;7) in myelodysplastic syndromes.(Poster) (2019)
  • 著者名/発表者名: Rurika Okuda, Ogawa Seishi., et al.
  • 学会等名: 78th Japanese Cancer Association
• [学会発表] Distinct ethnic, clinical, and genetic characteristics of der(1;7) in myelodysplastic syndromes.(PlenarySessioin) (2019)
  • 著者名/発表者名: Rurika Okuda, Ogawa Seishi., et al.
  • 学会等名: 81st Japanese Society of Haematology
• [学会発表] Novel combinations of genetic events and subtypes in myeloid tumors revealed by Integrated analysis (2019)
  • 著者名/発表者名: Yasuhito Nannya, June Takeda, Hiroko Tanaka, Kenichi Chiba, Yuichi Shiraishi, Masahiro Nakagawa, Hideki Makishima, Kenichi Yoshida, Shigeru Chiba, Yasushi Miyazaki, Kazuma Ohyashiki, Satoru Miyano, and Seishi Ogawa
  • 学会等名: The 81st Annual Meeting of the Japanese Society of Hematology, Kyoto
• [学会発表] 骨髄系腫瘍におけるコピー数異常と遺伝子変異の統合解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 佐伯 龍之介, 小川誠司他
  • 学会等名: The 81th Annual Meeting of the JapaneseツCancerツAssociation, Tokyo, Japan
• [学会発表] 孤発例の皮下脂肪織炎様T細胞リンパ腫でも高頻度でTIM3の胚細胞変異を認める (2019)
  • 著者名/発表者名: 竹内 康英, Chantana Polprasert, 垣内 伸之, 吉田 健一, 真田 昌, 秋田 直洋, 竹田 淳恵, 藤井 陽一, 鈴木 啓道, 南谷 泰仁, 白石 友一, 千葉 健一, 田中 洋子, 宮野 悟, Ponlapat Rojnuckarin, 小川 誠司, 牧島 秀樹
  • 学会等名: The 81th Annual Meeting of the JapaneseツCancerツAssociation, Tokyo, Japan
• [学会発表] NOVEL MOLECULAR PATHOGENESIS AND THERAPEUTIC TARGET IN ACUTE ERYTHROID LEUKEMIA (Oral) (2019)
  • 著者名/発表者名: June Takeda , Ogawa Seishi., et al.
  • 学会等名: The 81th Annual Meeting of the JapaneseツCancerツAssociation, Tokyo, Japan
• [学会発表] Clinical significance of TP53 mutations in pediatric B cell acute lymphoblastic leukemia (2019)
  • 著者名/発表者名: Hiroo Ueno, Ogawa Seishi., et al.
  • 学会等名: The 81st JCA conference 2019, Tokyo, Japan
• [学会発表] Analysis of mechanisms underlying clonal evolution of AML by a new single-cell sequencing platform (2019)
  • 著者名/発表者名: Ryosaku Inagaki, Masahiro M Nakagawa, Yasuhito Nannya, Xingxing Qi, Zhao Lanying, June Takeda, Akinori Yoda, Ayana Kon, Hisashi Tsurumi, Hideki Makishima, Seishi Ogawa
  • 学会等名: The 81st JCA conference 2019, Tokyo, Japan
• [学会発表] On the Origin of Cancer (2019)
  • 著者名/発表者名: Seishi Ogawa
  • 学会等名: The 7th Mcgill-Kyoto Training course & Symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Clonal Origin of Cancer (2019)
  • 著者名/発表者名: Seishi Ogawa
  • 学会等名: XXIX IACRLRD SYMPOSIUM 2019
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 潰瘍性大腸炎における上皮細胞の陽性選択 (2019)
  • 著者名/発表者名: 垣内 伸之, 内野 基, 木原 多佳子, 赤木 宏太朗, 井上 善景, 長山 聡, 横山 顕礼, 平野 智紀, 竹内 康英, 越智 陽太郎, 塩澤 裕介, 片岡 圭亮, 中川 正宏, 依田 成玄, 南谷 泰仁, 牧島 秀樹, 白石 友一, 千葉 健一, 真田 昌, 三好 弘之, 坂井 義治, 桜井 孝規, 羽賀 博典, 廣田 誠一, 池内 浩基, 竹内 理, 宮野 悟, 妹尾 浩, 小川 誠司
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会 (日本分子生物学会)
• [学会発表] A Unique Mechanism of Cancer Immune Evasion via the Disruption of PD-L1 3’-UTR (2019)
  • 著者名/発表者名: Seishi Ogawa
  • 学会等名: 第50回記念高松宮妃癌研究基金国際シンポジウム
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] CTX-712, a novel CLK inhibitor targeting myeloid neoplasms with splicing factor mutations (Oral) (2019)
  • 著者名/発表者名: Akinori Yoda, Daisuke Morishita, Akio Mizutani, Hirokazu Tozaki, Yotaro Ochi, Yoshihiko Satoh, Yasuhito Nannya, Hideki Makishima, Hiroshi Miyake and Seishi Ogawa
  • 学会等名: The 61st Annual Meeting and Exposition of American Society of Hematology, Orlando, USA
  • 国際学会
• [学会発表] Molecular characteristics that predict response to azacitidine therapy (Poster) (2019)
  • 著者名/発表者名: Yasuhito Nannya,Ogawa Seishi., et al.
  • 学会等名: 61st ASH Annual Meeting & Exposition, Orland, FL
  • 国際学会
• [学会発表] Novel molecular pathogenesis and therapeutic targets in acute erythroid leukemia (Oral) (2019)
  • 著者名/発表者名: June Takeda ,Ogawa Seishi., et al.
  • 学会等名: The 61st Annual Meeting and Exposition of American Society of Hematology, Orlando, USA
  • 国際学会
• [学会発表] Integrated Analysis of Copy-Number Alterations and Gene Mutations in 2,000 Patients with Myeloid Neoplasms (2019)
  • 著者名/発表者名: Ryunosuke Saiki, Ogawa Seishi., et al.
  • 学会等名: The 61st Annual Meeting and Exposition of American Society of Hematology, Orlando, USA
  • 国際学会
• [学会発表] Analysis of mechanisms underlying clonal evolution of AML by a new single-cell sequencing platform (2019)
  • 著者名/発表者名: Ryosaku Inagaki, Masahiro M Nakagawa, Yasuhito Nannya, Xingxing Qi, Lanying Zhao, June Takeda, Akinori Yoda, Ayana Kon, Hisashi Tsurumi, Hideki Makishima, Seishi Ogawa
  • 学会等名: 62nd American Society of Hematology Annual Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Clonal evolution of proliferative lesions into breast cancers (2019)
  • 著者名/発表者名: Tomomi Nishimura, Kenichi Yoshida, Nobuyuki Kakiuchi, Yasuhide Takeuchi, Yukiko Kawata, Hirona Maeda, Yusuke Shiozawa, Kosuke Aoki, Masahiro Hirata, Tatsuki R. Kataoka, Takaki Sakurai, Satoko Baba, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Kengo Takeuchi, Hironori Haga, Satoru Miyano, Masakazu Toi, and Seishi Ogawa
  • 学会等名: San Antonio Breast Cancer Symposium 2019シSan Antonio, USA
  • 国際学会
• [備考] https://researchmap.jp/7000009356/
• [備考]
  • URL: https://www.med.kyoto-u.ac.jp/organization-staff/research/doctoral_course/r-006/
• [備考]
  • URL: http://plaza.umin.ac.jp/kyoto_tumorpatho/