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2015 年度 実績報告書

バイオイメージプロセッシング

計画研究

研究領域共鳴誘導で革新するバイオイメージング
研究課題/領域番号 15H05954
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

横田 秀夫  国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究領域, チームリーダー (00261206)

研究分担者 吉澤 信  国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究領域, 上級研究員 (10455371)
竹本 智子  国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究領域, 研究員 (00450403)
森田 正彦  国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究領域, 特別研究員 (40449038)
世良 俊博  九州大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (40373526)
研究期間 (年度) 2015-06-29 – 2020-03-31
キーワードデジタル画像情報 / 画像認識 / 画像処理 / 画像データベース / 画像計測 / 生体画像処理 / 細胞内画像処理 / バイオイメージインフォマティクス
研究実績の概要

現状の画像情報処理技術では、本新学術領域での新規的・独創的技術から得られ
る新しい画像データの適切な管理・処理が困難である。それゆえ、本計画研究班では、共鳴誘導で革新するバイオイメージングのための新しい画像情報処理技術の研究・開発を目的としている。具体的には、新規イメージング技術から得られた画像データを統一的に管理・処理するクラウド型データベース、画像処理基盤システム、及び画像処理アルゴリズムの研究を実施し、領域内外に公開する。これは、日本発の先端画像処理技術と革新的アルゴリズムに基づき、量的・質的に従来とは大きく異なる画像を一括して管理・処理・解析しようとする独創的な試みである。また、他の各計画研究との密な連携により、生物学・光学・化学・情報学との本格的融合研究の先駆けとなり、新学術領域の構築を目指している。
本年度の具体的な研究実績は、以下にまとめられる。画像処理アルゴリズム:特徴保存画像平滑化フィルタの高速かつ高精度な近似アルゴリズムの考案とその周波数分解・画像合成への応用。画像処理基盤システム:我々独自の画像処理ソフトウェアであるVCATの拡張及び、そのレゾナンスバイオ用プラグイン(パターン認識・領域/特徴抽出・超解像)とその設計をGUIにて行えるプラグインCADの開発。クラウド型データベース:領域内拠点を結ぶプロトタイプの構築。さらに、これらの技術を生物学・医学の分野へ応用した融合研究を実施した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本年度は、各計画研究が対象としている異なるイメージング技術のデータ及び画像処理における共通情報の抽象化を行い、主に下記3つの項目に関して当初の計画通り進めた。
1:画像処理基礎アルゴリズムの研究:抽象化した共通情報に基づき、大容量の画像データに対する客観的なパターン解析ソフトウェアのために、特徴空間生成及び機械学習に基づく領域抽出、及び超解像フィルタのプロトタイプを開発した。
2:情報処理基盤システム・データベースの研究: 注釈・注目領域・装置情報付き画像データベースの構築と基盤となるVCATの拡張、及びそのネットワーク利用(クラウドシステム)のプロトタイプを開発した。
3:画像処理ソフトウェア作成コンテスト: 新しい学術領域としての普及推進を図るため、画像処理コンテストの企画・推進を行い、本領域の画像データが精密工学会主催第16回外観検査アルゴリズムコンテストの課題に採択された。

今後の研究の推進方策

今後の研究は、前年度に開発したプロトタイプの検証と改善を各計画研究が対象としている異なるイメージング技術のデータへ適応することで実施する予定である。特に、各計画研究拠点と共同で基盤システムに個別のアルゴリズムを適応し、ソフトウェア化を実施する。このように、抽象化を経て個別対象への特化を行う情報学のアプローチにより、領域内の画像データに対する統一的な管理・解析法の確立を目指す。さらに、採択された画像処理コンテストの実行及び関連学協会とのシンポジウム・研究会の共催を通じて、生物学・光学・化学・情報学の融合を促進することで、本新学術領域の構築を目指す予定である。

  • 研究成果

    (32件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (12件) (うち国際共著 2件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (15件) 備考 (4件)

  • [国際共同研究] 中原大学(台湾)

    • 国名
      その他の国・地域
    • 外国機関名
      中原大学
  • [雑誌論文] Visual Simulation of Cardiac Beating Motion with Shape Matching Dynamics2015

    • 著者名/発表者名
      T. Ijiri, T. Ashihara, N. Umetani, Y. Koyama, T. Igarashi, R. Haraguchi, H. Yokota, and K. Nakazawa,
    • 雑誌名

      Transactions of Japanese Society for Medical and Biological Engineering

      巻: 53(3) ページ: 130-137

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of the equine ovarian structure during the first twelve months of life by three-dimensional internal structure microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      N. Yamashita, M. Morita, W. R. Legant, B.-C. Chen, E. Betzig, H. Yokota, and Y. Mimori-Kiyosue
    • 雑誌名

      Journal of Biomedical Optics

      巻: 20(10) ページ: 1-18

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 細部を復元するシームレス画像合成法2015

    • 著者名/発表者名
      吉澤 信、横田 秀夫
    • 雑誌名

      情報処理学会論文誌

      巻: 56(6) ページ: 1517-1527

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-Dimensional Image of Cleavage Bodies in Nuclei Is Configured Using Gas Cluster Ion Beam with Time-of-Flight Secondary Ion Mass Spectrometry2015

    • 著者名/発表者名
      N. Masaki, I. Ishizaki, T. Hayasaka, G. Fisher, N. Sanada, H. Yokota, and M. Setou
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 5:10000 ページ: -

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 生物画像処理のためのクラウド型システム2015

    • 著者名/発表者名
      森田 正彦, 吉澤 信, 井尻 敬, 俵 丈展, 西村 将臣, 趙 武魁, 黒木 一平, 舛本 現, 辻村 有紀, 姫野 龍太郎, 横田 秀夫
    • 雑誌名

      日本医用画像工学会誌

      巻: 33(3) ページ: 112-117

    • DOI

      http://doi.org/10.11409/mit.33.112

  • [雑誌論文] 特集/バイオイメージング 序 文2015

    • 著者名/発表者名
      横田秀夫
    • 雑誌名

      日本医用画像工学会誌

      巻: 33(3) ページ: 75-76

    • DOI

      http://doi.org/10.11409/mit.33.75

  • [雑誌論文] Analysis of the equine ovarian structure during the first twelve months of life by three-dimensional internal structure microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      M. Ono, H. Akuzawa, Y. Nambo, Y. Hirano, J. Kimura, S. Takemoto, S. Nakamura, H.Yokota, R. Himeno, T Higuchi, T. Ohtaki, and S. Tsumagari
    • 雑誌名

      Journal of Veterinary Medical Science

      巻: 77(12) ページ: 1599-1603

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Numerical simulation of airflow and microparticle deposition in a synchrotron micro-CT-based pulmonary acinus model2015

    • 著者名/発表者名
      T. Sera, K. Uesugi, N. Yagi, and H. Yokota
    • 雑誌名

      Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering

      巻: 18(13) ページ: 1427-1435

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effectiveness of Two-dimensional Medical Image Interpolation in the Transverse Plane in the Voxel Analysis of Nasal Air Flow and Temperature2015

    • 著者名/発表者名
      K. Isobe, Y. Kimura, S. Kimura, T. Sera, H. Yokota, K. Ono, and G. Tanaka
    • 雑誌名

      Transactions of Japanese Society for Medical and Biological Engineering

      巻: 53(3) ページ: 160-167

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Simulation Model of Insulin Granule Dynamics in Pancreatic Beta Cell2015

    • 著者名/発表者名
      T. Matsumoto, N. Tabata, H. Tamaki, T. Shibasaki, S. Seino, Y. Sunaga, H. Yokota, and M. Fukushima
    • 雑誌名

      IEEJ Transactions on Electronics Information and Systems

      巻: 135(8) ページ: 963-970

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Artificial oxygen carriers rescue placental hypoxia and improve fetal development in the rat pre-eclampsia model2015

    • 著者名/発表者名
      H. Li, H. Ohta, Y. Tahara, S. Nakamura, K. Taguchi, M. Nakagawa, Y. Oishi, Y. Goto, K. Wada, M. Kaga, M. Inagaki, M. Otagiri, H. Yokota, S. Shibata, H. Sakai, K. Okamura, and N. Yaegashi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 5 ページ: 15271

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Anatomical Geometry and Thickness of Aponeuroses in Human Cadaver Triceps Surae Muscles2015

    • 著者名/発表者名
      T. Oda, T. Hisano, D. Hay, R. Kinugasa, N. Yamamura, T. Komatsu, H. Yokota, and S. Takagi
    • 雑誌名

      Advanced Biomedical Engineering

      巻: 4 ページ: 12-15

    • 査読あり
  • [学会発表] 高速線形 Ridge 回帰画像フィルタ2016

    • 著者名/発表者名
      吉澤 信, 横田 秀夫
    • 学会等名
      2016年度 精密工学会春季大会学術講演会
    • 発表場所
      東京理科大学・野田市
    • 年月日
      2016-03-15 – 2016-03-17
  • [学会発表] 逐次断面精密切削 -観察システムを利用した皮質骨組織の微小硬さ分布測定2016

    • 著者名/発表者名
      藤崎 和弘, 山下 典理男, 横田 秀夫
    • 学会等名
      2016年度 精密工学会春季大会学術講演会
    • 発表場所
      東京理科大学・
    • 年月日
      2016-03-15 – 2016-03-17
  • [学会発表] マイクロサージャリーにおける近赤外線イメージサポートの可能性2015

    • 著者名/発表者名
      大山 慎太郎, 横田 秀夫
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所・和光市
    • 年月日
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [学会発表] OCT画像から網膜内の層厚を検出するためのロバストなエッジ検出アルゴリズムの開発2015

    • 著者名/発表者名
      工藤 重樹, 横田 秀夫, 秋葉 正博
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所・和光市
    • 年月日
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [学会発表] 粉末積層造形法による人工骨の成形2015

    • 著者名/発表者名
      山澤 建二, 横田 秀夫, 山形 豊, 安齋 正博
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所・和光市
    • 年月日
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [学会発表] 高速エッジ保存画像平滑化フィルタにおける畳み込み核の解析2015

    • 著者名/発表者名
      吉澤 信, 横田 秀夫
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所・和光市
    • 年月日
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [学会発表] 体計測画像に基づく三次元形状解2015

    • 著者名/発表者名
      山下 典理男, 吉澤 信, 辻村 有紀, 横田 秀夫
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所・和光市
    • 年月日
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [学会発表] 3次元内部構造顕微鏡を用いた生体高分子発現解析2015

    • 著者名/発表者名
      中村 佐紀子, 於保 祐子, 阿部 訓也, 横田 秀夫
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所・和光市
    • 年月日
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [学会発表] NIR live cell imaging2015

    • 著者名/発表者名
      辻村 有紀, 福島 理人, 曽我 公平, 横田 秀夫
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所・和光市
    • 年月日
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [学会発表] 迅速な生物画像解析を支援する画像処理法の性能評価システム2015

    • 著者名/発表者名
      竹本 智子, 高橋 美和, 横田 秀夫
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所・和光市
    • 年月日
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [学会発表] 生物・医用画像のための処理・通信システム「4DICP」2015

    • 著者名/発表者名
      森田 正彦, 俵 丈展, 西村 将臣, 井尻 敬, 吉澤 信, 趙 武魁, 舛本 現, 辻村 有紀, 姫野 龍太郎, 横田 秀夫
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所・和光市
    • 年月日
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [学会発表] VCAT5 による 4D 画像処理2015

    • 著者名/発表者名
      西村 将臣, 横田 秀夫
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所・和光市
    • 年月日
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [学会発表] モン テカルロ光線追跡法による黒体放射シミュレーション2015

    • 著者名/発表者名
      俵 丈展, 牛島 一朗, 髙本 将男, DAS Manoj, 香取 秀俊, 横田 秀夫
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所・和光市
    • 年月日
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [学会発表] 3次元OCT 画像からの緑内障関連因子の抽出と評価2015

    • 著者名/発表者名
      松本 朗子, 前川 重人, 面高 宗子, 中澤 徹, 横田 秀夫, 秋葉 正博
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所・和光市
    • 年月日
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [学会発表] 生物・医用画像処理・解析のためのクラウド・コンピューティング 4DICP: 4D Image Communication Platform2015

    • 著者名/発表者名
      森田 正彦, 俵 丈展, 西村 将臣, 井尻 敬, 吉澤 信, 趙 武魁, 舛本 現, 辻村 有紀, 姫野 龍太郎, 横田 秀夫
    • 学会等名
      日本バイオイメージング学会学術集会
    • 発表場所
      東京理科大学・葛飾区
    • 年月日
      2015-09-25 – 2015-09-26
  • [備考] 細胞まるごと3次元画像データの自動解析法を開発

    • URL

      http://www.riken.jp/pr/press/2015/20151105_1/

  • [備考] 画像情報処理研究チーム研究紹介

    • URL

      http://www.riken.jp/brict/research.html

  • [備考] 画像情報処理研究チーム

    • URL

      http://www.rap.riken.jp/jp/labs/eprg/iprt/index.html

  • [備考] 画像情報処理研究チーム

    • URL

      http://www.riken.jp/research/labs/rap/extr_photonics/img_process/

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公開日: 2017-01-06   更新日: 2022-08-26  

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