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2016 年度 実績報告書

環境刺激による細胞リプログラミング制御

計画研究

研究領域植物の成長可塑性を支える環境認識と記憶の自律分散型統御システム
研究課題/領域番号 15H05961
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

杉本 慶子  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, チームリーダー (30455349)

研究期間 (年度) 2015-06-29 – 2020-03-31
キーワードエピジェネティックス / ヒストン修飾 / 細胞リプログラミング / 傷害ストレス / シロイヌナズナ
研究実績の概要

植物細胞は一般的に動物細胞に比べて分化全能性を発揮しやすく、一旦分化した細胞が傷害ストレスなどの過酷な環境刺激に応答して脱分化、再分化するが、その分子機構はほとんど解明されていない。本研究では、環境ストレスがクロマチン状態によって規定される細胞記憶をリセットすることにより細胞リプログラミングを誘導するという仮説を検証し、その分子機構を解明する。具体的には植物のエピジェネティックな細胞記憶の分子実体の解明、細胞リプログラミングを誘導する環境シグナル伝達機構の解明、環境ストレスによる細胞リプログラミングの分子機構の解明を目指している。先行研究から、シロイヌナズナでは傷害及び高温ストレスがWIND1-4を初めとするリプログラミング遺伝子の発現を誘導することを見いだしている。今年度はこれらの環境ストレスによって発生する初期シグナル分子の探索を進め、これらのシグナルがリプログラミング遺伝子の発現を誘導する転写制御ネットワークの解析を進めた。今年度は特に高温ストレス応答のシグナル伝達に関与することが知られる転写因子群が細胞リプログラミングを制御することを見いだし、その分子機構の解明を進めた。またWIND1遺伝子の発現が幹細胞維持に関与する転写因子ERF115とその相互作用因子PAT1によって制御されること、またWIND1が茎葉再生を促進するENHANCER OF SHOOT REGENERATION 1 (ESR1) 遺伝子の発現を直接誘導することで傷口からの再生を促進することを明らかにした。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

これまでに細胞リプログラミングを誘導する環境シグナル伝達機構の一部の解明に成功し、今年度はWIND1-ESR1経路に関する論文をPlant Cell誌に発表することができた。またヒストン修飾を介した植物のエピジェネティックな細胞記憶の分子実体の解明にも着手し、ChIP-seq, RNA-seqの実験系を順調に立ち上げることができた。

今後の研究の推進方策

これまでに同定したリプログラミング遺伝子の多くは非ストレス条件下ではPRC2によるH3K27me3を受け発現抑制されるが、ストレス条件下で発現が誘導される。今後はこうしたエピジェネティックな発現抑制が解除される仕組みの解明を進める。ストレス条件下におけるリプログラミング遺伝子近傍のクロマチン修飾の変化を解析し、ヒストンの脱メチル化やアセチル化の変化と遺伝子発現制御との関係を解析する。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 5件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 2件、 招待講演 3件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Sainsbury Lab Cambridge University(United Kingdom)

    • 国名
      英国
    • 外国機関名
      Sainsbury Lab Cambridge University
  • [国際共同研究] IISER(India)

    • 国名
      インド
    • 外国機関名
      IISER
  • [雑誌論文] Molecular networks orchestrating plant cell growth2017

    • 著者名/発表者名
      Franciosini Anna、Rymen Bart、Shibata Michitaro、Favero David S、Sugimoto Keiko
    • 雑誌名

      Current Opinion in Plant Biology

      巻: 35 ページ: 98~104

    • DOI

      10.1016/j.pbi.2016.11.010

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] WIND1 Promotes Shoot Regeneration through Transcriptional Activation of ENHANCER OF SHOOT REGENERATION1 in Arabidopsis2016

    • 著者名/発表者名
      Iwase Akira、Harashima Hirofumi、Ikeuchi Momoko、Rymen Bart、Ohnuma Mariko、Komaki Shinichiro、Morohashi Kengo、Kurata Tetsuya、Nakata Masaru、Ohme-Takagi Masaru、Grotewold Erich、Sugimoto Keiko
    • 雑誌名

      The Plant Cell

      巻: 29 ページ: 54~69

    • DOI

      10.1105/tpc.16.00623

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The heterodimeric transcription factor complex ERF115?PAT1 grants regeneration competence2016

    • 著者名/発表者名
      Heyman Jefri、Cools Toon、Canher Balkan、Shavialenka Sviatlana、Traas Jan、Vercauteren Ilse、Van den Daele Hilde、Persiau Geert、De Jaeger Geert、Sugimoto Keiko、De Veylder Lieven
    • 雑誌名

      Nature Plants

      巻: 2 ページ: 16165~16165

    • DOI

      10.1038/nplants.2016.165

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Transcriptional Regulation of Arabidopsis Polycomb Repressive Complex 2 Coordinates Cell-Type Proliferation and Differentiation2016

    • 著者名/発表者名
      de Lucas Miguel、Pu Li、Turco Gina、Gaudinier Allison、Morao Ana Karina、Harashima Hirofumi、Kim Dahae、Ron Mily、Sugimoto Keiko、Roudier Francois、Brady Siobhan M.
    • 雑誌名

      The Plant Cell

      巻: 28 ページ: 2616~2631

    • DOI

      https://doi.org/10.1105/tpc.15.00744

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Plant regeneration: cellular origins and molecular mechanisms2016

    • 著者名/発表者名
      Ikeuchi Momoko、Ogawa Yoichi、Iwase Akira、Sugimoto Keiko
    • 雑誌名

      Development

      巻: 143 ページ: 1442~1451

    • DOI

      10.1242/dev.134668

    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Epigenetic control of plant cellular reprogramming2017

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto K
    • 学会等名
      Joint Meeting for German and Japanese Societies of Developmental Biologists
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Epigenetic control of plant cellular reprogramming2016

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto K
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Asia Conference
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Totipotency: the plant’s view2016

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto K
    • 学会等名
      Lausanne Genomics Days
    • 招待講演
  • [備考] Cell Function Research Team

    • URL

      http://cellfunction.riken.jp/index.html

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公開日: 2018-12-17  

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