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2018 年度 実績報告書

糸状菌ウイルスのネオ・ライフスタイル

計画研究

研究領域ネオウイルス学:生命源流から超個体、そしてエコ・スフィアーへ
研究課題/領域番号 16H06436
研究機関岡山大学

研究代表者

鈴木 信弘  岡山大学, 資源植物科学研究所, 教授 (70206514)

研究分担者 近藤 秀樹  岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (40263628)
研究期間 (年度) 2016-06-30 – 2021-03-31
キーワードヤドヌシウイルス / ヤドカリウイルス / 菌類ウイルス / dsRNA / 白紋羽病菌 / ネオライフスタイル / 共生
研究実績の概要

昨年度同様に以下の項目を進めた。
柱1「ハダカウイルスの 3 者生態系における役割の解析」(鈴木)7) 新規ハダカウイルス2種(ポリマイコウイルスプロトタイプと配列類似性を示すHadV2, 3)感染したパキスタン産糸状菌2株からそれぞれウイルス非感染株を単胞子分離法により得た。感染、非感染菌株でフェノーム(培地での菌糸生育、色素形成、酵素産生等)解析を行なった結果、ウイルス感染の糸状菌宿主への影響がないことが示された。また、Fusarium oxysporumから分離されたハダカウイルス(HadV2)は、分画遠心法により通常のウイルス粒子を作成可能性が強く示唆された。 8) HadV1 感染、非感染菌株をクリ胴枯病菌の実験宿主であるリンゴでの植物上での生存適応能の差は認められなかった。 柱2「ヤドカリ・ヤドヌシウイルスの4者生態系での役割の解析」(鈴木)9) YkV1とYnV1混合感染とYnV1単独感染を比較すると、混合感染が日本産白紋羽病菌W567の生育をより低下させる傾向にあった。
柱3「ネオ・ライフスタイルを持つウイルスの探索と生態学的役割の考察」(鈴木・近藤)
13)バングラデシュ産植物感染性糸状菌(約500株)、パキスタン産植物感染性 糸状菌(約10株)、スペイン産植物感染性糸状菌(約80株)、英国産植物感染性糸状菌(約30株)から網羅的にウイルス探索を行った。新たに見つかったヤドカリウイルス、ネオ・ライフスタイルの解明を行うため、YkV4の2系統に対する感染性クローンの作成に成功した。 一方、上記パキスタン産ハダカウイルスのネオ・ライフスタイルは現在解析中である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

昨年度の実績報告書、あるいは中間報告書に記載した通り、HadV1が裸性(dsRNAで感染性を示す)を持っていない可能性が高まった。そこで、パキスタン産の菌類から検出された裸性を持つ可能性が高い新規ウイルス(HadV2, HadV3)の性格づけにシフト(する)した。また、スペイン産白紋羽病菌から非常に興味深いYkV2, YkV3, YkV4を発見した。これらのウイルスの解析も、「糸状菌ウイルスのネオライフスタイル」の確立に大いに資すると考えた。実績の概要に記したように、HadV2については、通常のウイルス粒子を作成しないことを示唆するデータを得、それらが不顕性感染することを示した。。また、YkV4の2系統に対し、感染性クローンの作成に成功し、現在それらのパートナーの同定を進めている。以上のように、当初の研究計画に従って、研究が進んでいる。

今後の研究の推進方策

昨年度に引き続き下記の計画を実施する。
柱1「裸性を持つデあろうポリマイコウイルスの3者生態系における役割の解析」
7)パキスタン産ポリマイコウイルス(HadV2, HadV3)感染、非感染菌株でフェノーム(培地での菌糸生育、色素形成、酵素産生等)、トランスクリプトーム、small RNAnome 解析を行い、ウイルス感染の糸状菌宿主への影響を調べる。 また、それらウイルスの感染性の実体を明らかにする。
柱2「ヤドカリ・ヤドヌシウイルスの4者生態系dえの役割の解析」 9)YnV1、YkV1が織りなす相利共生関係について、YkV1感染性クローンを利用した逆遺伝学とYnV1トランスフェクション法を用いて詳細に解析す る。 10)7)同様にYnV1、YkV1単独感染、混合感染、非感染菌株でフェノーム(菌糸生育、色素形成、酵素産生、ウイルス蓄積量等)、トランスクリプトーム、small RNAnome解析を人工培地上で行い、ウイルス感染の糸状菌宿主への影響を調べる。
柱3「ネオ・ライフスタイルを持つウイルスの探索と生態学的役割の考察」 13)スペイン産、フィリピン産およびバングラデシュ産植物感染性糸状菌の提供受け(1,000株を予定)、網羅的にウイルス探索を行う。一部は次世代シークエンサーでバイローム解析を進め、ネオ・ライフスタイルの生物界を跨いだ普遍性を明らかにする。また、YnV1、YkV1様ウイルスの単独感染株、 混合感染株の検出頻度を比較し、ウイルス相利共生の生態学的役割をよりグローバルなレベルで考察可能とする。

  • 研究成果

    (25件)

すべて 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (12件) (うち国際共著 11件、 査読あり 12件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 9件、 招待講演 7件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Integration of viral sequences into eukaryotic host genomes: legacy of ancient infections2019

    • 著者名/発表者名
      Tomonaga, K., Suzuki, N., and Berkhout, B.
    • 雑誌名

      Virus Research.

      巻: 262 ページ: 1.

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2018.12.012

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Hijacking a host scaffold protein, RACK1, for replication of a plant RNA virus.2019

    • 著者名/発表者名
      Hyodo, K., Suzuki, N., and Okuno, T.
    • 雑誌名

      New Phytologist

      巻: 221 ページ: 935-945

    • DOI

      https://doi.org/10.1111/nph.15412.

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Investigation of host range of and host defense against a mitochondrially replicating mitovirus.2019

    • 著者名/発表者名
      Shahi, S., Eusebio-Cope, A., I. B., Hillman, B. I., and Suzuki, N.
    • 雑誌名

      J. Virol.

      巻: 93 ページ: e01503-18

    • DOI

      10.1128/JVI.01503-18

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Dicer functions transcriptionally and post-transcriptionally in a multilayer antiviral defense.2019

    • 著者名/発表者名
      Andika, I. B., Kondo, H., and Suzuki, N.
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Science, U S A

      巻: 116 ページ: 2274-2281

    • DOI

      10.1073/pnas.1812407116

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] A novel insect-infecting virga/nege-like virus group and its pervasive endogenization into insect genomes2019

    • 著者名/発表者名
      Kondo, H., Hirota, K., Maruyama, K., Andika, I. B., and Suzuki, N.
    • 雑誌名

      Virus Res.

      巻: 262 ページ: 37-47

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2017.11.020

    • 査読あり
  • [雑誌論文] ICTV Virus Taxonomy Profile: Hypoviridae.2018

    • 著者名/発表者名
      Suzuki N., Ghabrial, S. A., Kim, K-H., Pearson, M., Marzano, S-Y., Yaegashi, H., Xie, J., Guo, L., Kondo, H., Koloniuk, I., Hillman, B. I., and ICTV Report Consortium (2018).
    • 雑誌名

      Journal of General Virology

      巻: 99 ページ: 615-616

    • DOI

      10.1099/jgv.0.001055

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] First evidence for internal ribosomal entry sites in diverse fungal virus genomes.2018

    • 著者名/発表者名
      Chiba, S., Jamal, A., and Suzuki. N.
    • 雑誌名

      mBio

      巻: 9 ページ: e02350-17

    • DOI

      10.1128/mBio.02350-17

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Novel, diverse RNA viruses from Mediterranean isolates of the phytopathogenic fungus, Rosellinia necatrix: insights into evolutionary biology of fungal viruses.2018

    • 著者名/発表者名
      Arjona-Lopez, J. M., Telengech, P., Jamal, A., Hisano, S., Kondo, H., Yelin, M. D., Arjona-Girona, I., Kanematsu, S., Lopez-Herrera, C., and Suzuki, N.
    • 雑誌名

      Environ Microbiol.

      巻: 20 ページ: 1464-1483

    • DOI

      10.1111/1462-2920.14065

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] ICTV Virus Taxonomy Profile: Quadriviridae.2018

    • 著者名/発表者名
      Chiba, S., Caston J. R., Ghabrial, S. A., Suzuki, N., and ICTV Report Consortium
    • 雑誌名

      Journal of General Virology

      巻: 99 ページ: 1480-1481

    • DOI

      10.1099/jgv.0.001152

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Novel mitoviruses and a unique tymo-like virus in hypovirulent and virulent strains of the Fusarium Head Blight fungus, Fusarium boothii.2018

    • 著者名/発表者名
      Mizutani, Y., Abraham, A., Uesaka, K., Kondo, H., Suga, H., Suzuki, N., Chiba, S.
    • 雑誌名

      Viruses-Basel

      巻: 10 ページ: pii: E584

    • DOI

      10.3390/v10110584

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The biological attributes, genome architecture and packaging of diverse multi-component fungal viruses.2018

    • 著者名/発表者名
      Sato, Y., Caston, J., and Suzuki, N.
    • 雑誌名

      Current Opinion in Virology

      巻: 33, ページ: 55-65

    • DOI

      doi.org/10.1016/j.coviro.2018.07.009.

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Capsid structure of dsRNA fungal viruses.2018

    • 著者名/発表者名
      Luque, D., Mata, C. P., Ghabrial, S. A., Suzuki, N., and Caston, J. R.
    • 雑誌名

      Viruses

      巻: 10 ページ: pii: E481

    • DOI

      10.3390/v10090481

    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 今だから聞けるウイルス学講座「菌類ウイルスに魅せられて」2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木信弘
    • 学会等名
      湯河原ウイルスキャンプ
    • 招待講演
  • [学会発表] 白紋羽病菌で繰り広げられるRNAウイルスのネオ・ライフスタイル2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木信弘
    • 学会等名
      第 53 回植物感染生理談話会
    • 招待講演
  • [学会発表] Synergism in the chestnut blight fungus Cryphonectria parasitica between two RNA viruses, Cryphonectria hypoviruses 1 and 4.2018

    • 著者名/発表者名
      Aulia, A., Andika, I. B., Hillman, B. I., and Suzuki, N.
    • 学会等名
      The 17th Awaji International Forum on Infection and Immunity.
    • 国際学会
  • [学会発表] A neo-virus lifestyle exhibited by a (+)ssRNA virus hosted in an unrelated dsRNA virus: taxonomic and evolutionary considerations2018

    • 著者名/発表者名
      Hisano, H., Zhang, R., Faruk, M. I., Kondo, H., and Suzuki, N.
    • 学会等名
      American Society for Virology 2018.
    • 国際学会
  • [学会発表] Detection and identification of new mycoviruses in Rosellinia necatrix isolates from avocado crops.2018

    • 著者名/発表者名
      Arjona-Lopez, J.M., Suzuki N., Lopez-Herrera, C.J.
    • 学会等名
      National Congress of the Spanish Society of Phytopathology
    • 国際学会
  • [学会発表] Virocontrol and RNA silencing.2018

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, N.
    • 学会等名
      KSPP 2018 Satellite Meeting on Fungal Genetics.
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A neo-virus-lifestyle exhibited by a (+)RNA virus hosted by an unrelated dsRNA virus in a phytopathogenic fungus.2018

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, N.
    • 学会等名
      The Spring Meeting of the Korean Society of Plant Pathology (KSPP 2018).
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Another nude virus: a capsidless ssRNA virus hosted by an unrelated dsRNA virus.2018

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, N.
    • 学会等名
      Post ICBC Satellite Meeting.
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Viruses as biological control (virocontrol) agents of plant fungal pathogens.2018

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, N., and Kanematsu, S.
    • 学会等名
      The First International Congress of Biological Control.
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Another nude virus: a capsidless ssRNA virus hosted by an unrelated dsRNA virus.2018

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, N.
    • 学会等名
      13th International dsRNA Virus Symposium.
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structures of replicative cores of dsRNA viruses.2018

    • 著者名/発表者名
      Caston, J. R., Mata, C. P., Luque, D., Suzuki, N., and Ghabrial, S. A.
    • 学会等名
      13th International dsRNA Virus Symposium.
    • 国際学会
  • [備考] 植物・微生物相互作用グループ

    • URL

      http://www.rib.okayama-u.ac.jp/pmi/publication.html

  • [備考] ネオウイルス学

    • URL

      http://neo-virology.org/

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公開日: 2021-12-27  

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