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2019 年度 実績報告書

糸状菌ウイルスのネオ・ライフスタイル

計画研究

研究領域ネオウイルス学:生命源流から超個体、そしてエコ・スフィアーへ
研究課題/領域番号 16H06436
研究機関岡山大学

研究代表者

鈴木 信弘  岡山大学, 資源植物科学研究所, 教授 (70206514)

研究分担者 近藤 秀樹  岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (40263628)
研究期間 (年度) 2016-06-30 – 2021-03-31
キーワードヤドヌシウイルス / ヤドカリウイルス / 菌類ウイルス / dsRNA / 白紋羽病菌 / ネオライフスタイル / 共生
研究実績の概要

柱1「裸性を持つであろうポリマイコウイルスの3者生態系における役割の解析」パキスタン産ポリマイコ様ウイルス(HadV1)感染、非感染菌株でフェノーム解析を行った。まず、極めてユニークなHadV1のゲノム配列を決定した。11本の(+)RNA分節を持つことが示され、ポリマイコウイルスに保存されている富PAS(プロリンーアラニンーセリン)タンパク質がHadV1には保存されていないことが判明した。次にHadV1感染Fusarium oxysporumから単胞子分離により、非感染株を複数得た。ウイルス感染株、非感染株を比較したが、ウイルスによる生物学的な性状への影響を観察することができなかった。また、ウイルス実態を調べるた結果、HadV1は、既報のポリマイコウイルスあるいはハイポウイルスとは分画パターンを示し、通常それらのウイルスが沈降する条件での超遠心では沈降しないことが明らかとなり、新規のライフスタイルを持つキャプシドレスウイルスと示唆された。
柱2「ヤドカリ・ヤドヌシウイルスの4者生態系での役割の解析」 では、YkV1感染性クローンを利用した逆遺伝学とYnV1トランスフェクション法を用いて詳細に解析した。その結果、YkV1の複製にはYkV1 RdRpが必須でそれがポリプロテインから切断されることが必須であることが示された。
柱3「ネオ・ライフスタイルを持つウイルスの探索と生態学的役割の考察」 では、スペイン産、フィリピン産およびバングラデシュ産植物感染性糸状菌の提供受け、網羅的にウイルス探索を行った。その結果、スペイン産からYkV1と配列類似性を示す複数のウイルス、YkV2, YkV3, YkV4a, YkV4bが見つかったが、YnV1と配列類似性を示すウイルスは見つからなかった。YkV4のパートナーはメガトティウイルスであるこが、示唆された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

新たにパキスタン産糸状菌から見出されたキャプシドレスRNAウイルスHadV1, Penicillium janthinellum polymycovirus 1の実態解明、生物学的影響の有無の解析も順調に進展した。日本産白紋羽病菌から見つかっていたYkV1/YnV1については、YkV1感染性クローンを用いた実験から「YkV1がYnV1キャプシドを利用して自律複製する」というコンセプトの証明につながった。すなわち、YkV1がコードするRNA依存RNA合成酵素 RdRpがYkV1の複製に必須であるということが示されたのである。スペイン産白紋羽病菌から分離されたYkV2, YkV3, YkV4は遺伝子構造もそれぞれ、またYkV1とも異なり、それらのパートナーシップの決定機構は興味深い課題である。パートナーの候補となるdsRNAウイルス、フザグラウイルス(RnFGV1)、メガトティウイルス(RnMTV1)、メガビルナウイルス(RnMBV3)の単独感染株を得た。YkV4のパートナーがメガトティウイルスであること、YkV3のパートナーがメガビルナウイルスらしいことを示す結果を得た。今後、これらパートナーシップ解析に用いられる。以上のように、当初の研究計画に従って、研究が進んでいる。

今後の研究の推進方策

柱1「裸性を持つポリマイコウイルスの3者生態系における役割の解析」では、通常の他のウイルスで認められる粒子を作らないポリマイコ様ウイルス2種(HadV1, Penicillium janthinellum polymycovirus 1)パキスタン産糸状菌から分離された。これらの菌宿主での感染様式(水平伝搬、垂直伝搬)培養性状、菌の植物上での生存適応能(ヤドカリ・ヤドヌシウイルスの4者生態系での役割の解析」では、スペイン産白紋羽病菌から発見されたYkV2-4のパートナーを同定し、それらの4者生態系の役割を解明する。パートナーを同定した後には、日本産YkV1を含めスワッピング試験を行い、パートナーシップを明らかにする。
柱3「ネオ・ライフスタイルを持つピン産およびパキスタン産植物感染性糸状菌の提供受け(500株を予定)、網羅的にウイルス探索を行う。一部 は次世代シークエンサーでヴァイローム解析を進め、ネオ・ライフスタイルの生物界を跨いだ普遍性を明らかにする。また、YnV1、YkV1様ウイルスの単独感染株、混合感染株の検出頻度を比較し、ウイルス相利共生の生態学的役割をよりグローバルなレベルで考察可能とする。

  • 研究成果

    (31件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (15件) (うち国際共著 13件、 査読あり 13件、 オープンアクセス 13件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 10件、 招待講演 3件) 図書 (2件) 学会・シンポジウム開催 (1件)

  • [国際共同研究] Muhammad Faraz Bhatti/National University of Sci & Tech(パキスタン)

    • 国名
      パキスタン
    • 外国機関名
      Muhammad Faraz Bhatti/National University of Sci & Tech
  • [国際共同研究] Bradley I. Hillman/Rutgers University(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      Bradley I. Hillman/Rutgers University
  • [国際共同研究] Ana Eusebio-Cope/IRRI(フィリピン)

    • 国名
      フィリピン
    • 外国機関名
      Ana Eusebio-Cope/IRRI
  • [雑誌論文] Virome analysis of aphid populations that infest the barley field: the discovery of two novel groups of nege/kita-like viruses and other novel RNA viruses.2020

    • 著者名/発表者名
      Kondo, H., Fujita, M., Hisano, H., Hyodo, K., Andika I. B., and Suzuki, N.
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 11 ページ: 509

    • DOI

      10.3389/fmicb.2020.00509

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Diverse partitiviruses from the phytopathogenic fungus, Rosellinia necatrix.2020

    • 著者名/発表者名
      Telengech, P., Hisano, S., Micheni, C. M., Hyodo, K., Arjona-Lopez, J.M., Lopez-Herrera, C., Kanematsu, S., Kondo, H., and Suzuki, N.
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 11 ページ: 1064

    • DOI

      10.3389/fmicb.2020.01064

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Hadaka virus 1: A capsidless 11-segmented (+)RNA virus from a phytopathogenic fungus Fusarium oxysporum.2020

    • 著者名/発表者名
      Sato, Y., Shamsi, W., Jamal, A., Bhatti, M. F., Kondo, H., and Suzuki, N.
    • 雑誌名

      mBIo

      巻: 11 ページ: e0045-20

    • DOI

      10.1128/mBio.00450-20

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] ICTV Virus Taxonomy Profile: Chrysoviridae.2020

    • 著者名/発表者名
      Kotta-Loizou, I., Caston J. R., Coutts, R. H. A., Hillman, B. I., Jiang, D., Kim, D.-H., Moriyama, H., Suzuki, N., and ICTV Report Consortium
    • 雑誌名

      Journal of General Virology

      巻: 101 ページ: 143-144

    • DOI

      10.1099/jgv.0.001383

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Frontiers in fungal virus research2020

    • 著者名/発表者名
      Sun, L., Suzuki, N., Jiang, D., Turina, M., and Xie, J.
    • 雑誌名

      Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

      巻: 9 ページ: 456

    • DOI

      10.3389/fcimb.2019.00456. 9:456

  • [雑誌論文] Molecular and biological characterization of a novel botybirnavirus identified from a Pakistani isolate of Alternaria alternata.2019

    • 著者名/発表者名
      Shamsi, W., Sato, Y., Atif, J., Shahi, S., Kondo, H., Suzuki, N., and Bhatti, F. M.
    • 雑誌名

      Virus Res

      巻: 263 ページ: 19-128

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2019.01.006

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A novel insect-infecting virga/nege-like virus group and its pervasive endogenization into insect genomes.2019

    • 著者名/発表者名
      ondo, H., Hirota, K., Maruyama, K., Andika, I. B., and Suzuki, N.
    • 雑誌名

      Virus Res

      巻: 262 ページ: 37-47

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2017.11.020

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A symptomless hypovirus, CHV4, facilitates stable infection of the chestnut blight fungus by a coinfecting reovirus likely through suppression of antiviral RNA silencing.2019

    • 著者名/発表者名
      Aulia, A., Eusebio-Cope, A., I. B., Hillman, B. I., and Suzuki, N.
    • 雑誌名

      Virology

      巻: 533 ページ: 99-107

    • DOI

      10.1016/j.virol.2019.05.004

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Two novel negative-strand RNA mycoviruses related to mymonaviruses and phenuiviruses in the Shiitake mushroom, Lentinula edodes.2019

    • 著者名/発表者名
      Lin, Y.-H., Fujita, M., Chiba, S., Hyodo, K., Andika I. B., Suzuki, N., and Kondo, H.
    • 雑誌名

      Virology

      巻: 533 ページ: 125-136

    • DOI

      10.1016/j.virol.2019.05.008

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of a novel mycovirus infecting an edible mushroom, Grifola frondosa.2019

    • 著者名/発表者名
      Komatsu, A., Kondo, H., Sato, M., Kurahashi, A., Nishibori, K., Suzuki, Fujimori, F.
    • 雑誌名

      Mycoscience

      巻: 60 ページ: 211-220

    • DOI

      10.1016/j.myc.2019.01.005

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Three ourmia-like viruses and their associated RNAs in Pyricularia oryzae2019

    • 著者名/発表者名
      Ohkita, S., Lee, Y., Nguyen, Q., Ikeda, K., Suzuki, N., and Nakayashiki, H.
    • 雑誌名

      Virology

      巻: 534 ページ: 25-35

    • DOI

      10.1016/j.virol.2019.05.015

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Novel Victorivirus from a Pakistani isolate of Alternaria alternata lacking a typical translational stop/restart sequence signature.2019

    • 著者名/発表者名
      Jamal, A., Sato, Y., Shahi, S. Shamsi, W., Kondo, H., and Suzuki, N.
    • 雑誌名

      Viruses-Basel

      巻: 11 ページ: E577

    • DOI

      10.3390/v11060577

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] ICTV Virus Taxonomy Profile: Megabirnavirus.2019

    • 著者名/発表者名
      Sato, Y., Miyazaki, N., Kanematsu, S., Ghabrial, S. A., Hillman, B. I., Suzuki, N., and ICTV Report Consortium
    • 雑誌名

      Journal of General Virology

      巻: 100 ページ: 1269-1270

    • DOI

      10.1099/jgv.0.001297

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Integration of viral sequences into eukaryotic host genomes: legacy of ancient infections2019

    • 著者名/発表者名
      Tomonaga, K., Suzuki, N., and Berkhout, B.
    • 雑誌名

      Virus Research.

      巻: 262 ページ: 1.

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2018.12.012

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Neo-virology: The raison d’etre of viruses.2019

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, T., Suzuki, N., Tomonaga, K., Sawa, H., Matsuura, Y., Kwaguchi, Y., Takahashi, H., Nagasaki, K., Kawaoka, Y.
    • 雑誌名

      Virus Research.

      巻: 262 ページ: 197751

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2019.197751

  • [学会発表] Mycoviruses in C. parasitica and their biological control potential.2019

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, N.
    • 学会等名
      International Symposium on Cryphonectria and Mycoviruses
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Dual functionality of fungal Dicer in multilayer antiviral defense.2019

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, N.
    • 学会等名
      International Symposium on Virus Diseases of Important Crops.
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Dicer functions transcriptionally and post-transcriptionally in a multilayer antiviral defense.2019

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, N.
    • 学会等名
      European Congress of Virology 2019. April 29-May 1, 2019.
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Reporter system for antiviral RNA silencing in a model filamentous fungus host.2019

    • 著者名/発表者名
      Aulia, A
    • 学会等名
      Asian Mycological Congress 2019
    • 国際学会
  • [学会発表] 2A-like protease activity is essential for replication and viability of yado-kari virus 1 hosted by yado-nushi virus 1.2019

    • 著者名/発表者名
      Das, S.
    • 学会等名
      Asian Mycological Congress 2019
    • 国際学会
  • [学会発表] A symptomless hypovirus, CHV4, facilitates stable infection of the chestnut blight fungus by a coinfecting reovirus likely through suppression of antiviral RNA silencing.2019

    • 著者名/発表者名
      Aulia, A.
    • 学会等名
      Asian Mycological Congress 2019
    • 国際学会
  • [学会発表] Investigation of host range of and host defense against a mitochondrially replicating mitovirus.2019

    • 著者名/発表者名
      Shahi, S
    • 学会等名
      The Annual Meeting of the American Society for Virology 2019
    • 国際学会
  • [学会発表] Characterization of a novel fungal polymycovirus with a potential neo-virus lifestyle.2019

    • 著者名/発表者名
      Sato, Y.
    • 学会等名
      The Annual Meeting of the American Society for Virology 2019
    • 国際学会
  • [学会発表] Dicer-mediated transcriptional and post-transcriptional antiviral defense.2019

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, N.,
    • 学会等名
      The Annual Meeting of the American Society for Virology 2019
    • 国際学会
  • [学会発表] Detection of mycoviruses in phytopathogenic fungi causing disease of rice2019

    • 著者名/発表者名
      Eusebio-Cope, A
    • 学会等名
      Philippine Phytopathological Society Pest Management Council of the Philippines, Inc. PMCP 2019
    • 国際学会
  • [図書] 植物病理学第2版2020

    • 著者名/発表者名
      鈴木信弘・大木理・上田一郎(眞山滋志・土佐幸雄編)
    • 総ページ数
      14
    • 出版者
      文永堂
    • ISBN
      9784830041389
  • [図書] Integration of viral sequences into eukaryotic host genomes: legacy of ancient infections2019

    • 著者名/発表者名
      Tomonaga, K., Suzuki, N., and Berkhout, B
    • 総ページ数
      61
    • 出版者
      Elsevier
    • ISBN
      0168-1702
  • [学会・シンポジウム開催] Asian Mycological Congress 20192019

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公開日: 2021-01-27  

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