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2019 年度 実績報告書

人工生合成マシナリーの合理的再構築による次世代天然物化学

計画研究

研究領域生物合成系の再設計による複雑骨格機能分子の革新的創成科学
研究課題/領域番号 16H06443
研究機関東京大学

研究代表者

阿部 郁朗  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授 (40305496)

研究期間 (年度) 2016-06-30 – 2021-03-31
キーワード生合成リデザイン / 合成生物学 / 生合成工学 / 天然物化学 / 生物分子科学
研究実績の概要

糸状菌由来メロテルペノイド等など、複雑骨格天然物の生合成をとりあげる。メロテルペノイドの生合成は、比較的短工程で複雑な分子骨格を構築する点が特徴的であり、これは多段階の劇的な骨格変換反応を触媒する多機能型酸化酵素等の存在によるところが大きい。本研究では、人為的な機能制御と分子多様性創出の格好の材料ともいえる、これら特異な反応を触媒する修飾酵素について、X線結晶構造解析などにより、酵素反応の立体構造基盤を解明し、さらに立体構造情報に基づき酵素機能を合理的な改変をめざした。
酵素の結晶構造解析と構造機能相関の解明。昨年に引き続き、アンジトミン、ノボフミガトニン、アスコフラノン、アスコクロリン、オーシノールなどの生合成において、多段階の劇的な骨格変換反応を触媒し、その構造複雑化に決定的な役割を演じる、多機能型非ヘム鉄要求性ジオキシゲナーゼについて、X線結晶構造解析を行い、酵素反応の立体構造基盤を解明、さらに、結晶構造に基づき、合理的な酵素機能の改変と生合成リデザインに成功した。結果を印刷公表した。加えて、メロテルペノイド構造複雑化に重要な役割を演じる酸素添加酵素、プレニル転移酵素、新規異性化酵素など、一連の修飾酵素についても、同様に、酵素の精密機能解析と立体構造基盤の解明に成功した。さらに、これらに加えて、インドールアルカロイド、スルホンアミドなど、関連する一連の複雑骨格天然物の新規生合成マシナリーの構造機能解析、生合成リデザインにも成功し、研究成果を印刷公表した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

計画を上回るペースで研究成果を挙げることができている。中間評価でA判定を得た。

今後の研究の推進方策

今年度がさし周年度。研究の取りまとめに専念する。昨年度に引き続き、複雑骨格の生合成酵素の結晶構造解析と構造機能相関の解明に取り組む。メロテルペノイドの生合成において、多段階の劇的な骨格変換反応を触媒し、その構造複雑化に決定的な役割を演じる、多機能型非ヘム鉄要求性ジオキシゲナーゼについて、さらに類縁酵素のX線結晶構造解析を行い、酵素反応の立体構造基盤を明らかにする。メロテルペノイド構造複雑化に重要な役割を演じる他の一連の酸素添加酵素、修飾酵素等についても、同様に、酵素の精密機能解析と結晶構造解析を進め、酵素反応の立体構造基盤と構造機能相関を明らかにする。
その他、セスタテルペン、ポリケタイド、インドールアルカロイドなど、複雑骨格天然物の生合成マシナリーの構造機能解析を進める。これら新奇な反応を触媒する酵素(生体触媒)の立体構造基盤の解明は、有機化学的にもきわめて興味深く、新たな触媒概念の確立、生体触媒の創製などにも道を拓く。

  • 研究成果

    (37件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (16件) (うち国際共著 7件、 査読あり 16件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 9件、 招待講演 13件) 図書 (4件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] 中国科学院/浙江大学/武漢大学(中国)

    • 国名
      中国
    • 外国機関名
      中国科学院/浙江大学/武漢大学
    • 他の機関数
      3
  • [国際共同研究] ボストン大学/テキサス大学/スクリプス研究所(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      ボストン大学/テキサス大学/スクリプス研究所
  • [国際共同研究] ボン大学(ドイツ)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      ボン大学
  • [雑誌論文] Exploiting a C-N Bond Forming Cytochrome P450 Monooxygenase for C-S Bond Formation2020

    • 著者名/発表者名
      Morita Iori、Mori Takahiro、Mitsuhashi Takaaki、Hoshino Shotaro、Taniguchi Yoshimasa、Kikuchi Takashi、Nagae Kei、Nasu Norihiro、Fujita Makoto、Ohwada Tomohiko、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 59 ページ: 3988~3993

    • DOI

      10.1002/anie.201916269

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Heterochiral coupling in non-ribosomal peptide macrolactamization2020

    • 著者名/発表者名
      Matsuda Kenichi、Zhai Rui、Mori Takahiro、Kobayashi Masakazu、Sano Ayae、Abe Ikuro、Wakimoto Toshiyuki
    • 雑誌名

      Nature Catalysis

      巻: 3 ページ: 507~515

    • DOI

      10.1038/s41929-020-0456-7

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification and characterization of N9-methyltransferase involved in converting caffeine into non-stimulatory theacrine in tea2020

    • 著者名/発表者名
      Zhang Yue-Hong、Li Yi-Fang、Wang Yongjin、Tan Li、Cao Zhi-Qin、Xie Chao、Xie Guo、Gong Hai-Biao、Sun Wan-Yang、Ouyang Shu-Hua、Duan Wen-Jun、Lu Xiaoyun、Ding Ke、Kurihara Hiroshi、Hu Dan、Zhang Zhi-Min、Abe Ikuro、He Rong-Rong
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 ページ: 1473-1473

    • DOI

      10.1038/s41467-020-15324-7

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural Diversification of Andiconin-Derived Natural Products by α-Ketoglutarate-Dependent Dioxygenases2020

    • 著者名/発表者名
      Bai Tongxuan、Matsuda Yudai、Tao Hui、Mori Takahiro、Zhang Yonghui、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Organic Letters

      巻: 22 ページ: 4311~4315

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.0c01358

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Sporormielones A?E, bioactive novel C?C coupled orsellinic acid derivative dimers, and their biosynthetic origin2020

    • 著者名/発表者名
      Chen Guo-Dong、Hu Dan、Huang Mei-Juan、Tang Jia、Wang Xiao-Xia、Zou Jian、Xie Jun、Zhang Wei-Guang、Guo Liang-Dong、Yao Xin-Sheng、Abe Ikuro、Gao Hao
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 56 ページ: 4607~4610

    • DOI

      10.1039/D0CC00855A

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular Basis for Sesterterpene Diversity Produced by Plant Terpene Synthases2020

    • 著者名/発表者名
      Chen Qingwen、Li Jianxu、Liu Zhixi、Mitsuhashi Takaaki、Zhang Yuting、Liu Haili、Ma Yihua、He Juan、Shinada Tetsuro、Sato Tsutomu、Wang Yong、Liu Hongwei、Abe Ikuro、Zhang Peng、Wang Guodong
    • 雑誌名

      Plant Communications

      巻: 1 ページ: 100051~100051

    • DOI

      10.1016/j.xplc.2020.100051

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Biosynthesis of biscognienyne B involving an unprecedented cytochrome P450‐dependent alkynylation2020

    • 著者名/発表者名
      Abe Ikuro、Lv Jian-Ming、Gao Yao-Hui、Zhao Huan、Awakawa Takayoshi、Liu Ling、Chen Guo-Dong、Yao Xin-Sheng、Hu Dan、Gao Hao
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 59 ページ: 印刷中

    • DOI

      https://doi.org/10.1002/anie.202004364

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular basis for the P450-catalyzed C-N bond formation in indolactam biosynthesis2019

    • 著者名/発表者名
      He Fei、Mori Takahiro、Morita Iori、Nakamura Hitomi、Alblova Miroslava、Hoshino Shotaro、Awakawa Takayoshi、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Nature Chemical Biology

      巻: 15 ページ: 1206~1213

    • DOI

      https://doi.org/10.1038/s41589-019-0380-9

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biomimetic Synthesis of Meroterpenoids by Dearomatization‐Driven Polycyclization2019

    • 著者名/発表者名
      Powers Zachary、Scharf Adam、Cheng Andrea、Yang Feng、Himmelbauer Martin、Mitsuhashi Takaaki、Barra Lena、Taniguchi Yoshimasa、Kikuchi Takashi、Fujita Makoto、Abe Ikuro、Porco John A.
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 58 ページ: 16141~16146

    • DOI

      https://doi.org/10.1002/anie.201910710

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural Elucidation of Tenebrathin: Cytotoxic C-5-Substituted γ-Pyrone with a Nitroaryl Side Chain from Streptoalloteichus tenebrarius2019

    • 著者名/発表者名
      Hoshino Shotaro、Mitsuhashi Takaaki、Kikuchi Takashi、Wong Chin Piow、Morita Hiroyuki、Awakawa Takayoshi、Fujita Makoto、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Organic Letters

      巻: 21 ページ: 6519~6522

    • DOI

      https://doi.org/10.1021/acs.orglett.9b02443

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multidomain P450 Epoxidase and a Terpene Cyclase from the Ascochlorin Biosynthetic Pathway in Fusarium sp.2019

    • 著者名/発表者名
      Quan Zhiyang、Awakawa Takayoshi、Wang Dongmei、Hu Yue、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Organic Letters

      巻: 21 ページ: 2330~2334

    • DOI

      https://doi.org/10.1021/acs.orglett.9b00616

    • 査読あり
  • [雑誌論文] (+)- and (-)-Preuisolactone A: A Pair of Caged Norsesquiterpenoidal Enantiomers with a Tricyclo[4.4.01,6.02,8]decane Carbon Skeleton from the Endophytic Fungus Preussia isomera2019

    • 著者名/発表者名
      Xu Lu-Lin、Chen Hai-Li、Hai Ping、Gao Yuan、Xie Chuan-Dong、Yang Xiao-Long、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Organic Letters

      巻: 21 ページ: 1078~1081

    • DOI

      https://doi.org/10.1021/acs.orglett.8b04123

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] How structural subtleties lead to molecular diversity for the type III polyketide synthases2019

    • 著者名/発表者名
      Morita Hiroyuki、Wong Chin Piow、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 294 ページ: 15121~15136

    • DOI

      doi: 10.1074/jbc.REV119.006129

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Inherent atomic mobility changes in carbocation intermediates during the sesterterpene cyclization cascade2019

    • 著者名/発表者名
      Sato Hajime、Mitsuhashi Takaaki、Yamazaki Mami、Abe Ikuro、Uchiyama Masanobu
    • 雑誌名

      Beilstein Journal of Organic Chemistry

      巻: 15 ページ: 1890~1897

    • DOI

      doi:10.3762/bjoc.15.184

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular basis for the plasticity of aromatic prenyltransferases in hapalindole biosynthesis2019

    • 著者名/発表者名
      Awakawa Takayoshi、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Beilstein Journal of Organic Chemistry

      巻: 15 ページ: 1545~1551

    • DOI

      doi:10.3762/bjoc.15.157

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Activation of silent biosynthetic pathways and discovery of novel secondary metabolites in actinomycetes by co‐culture with mycolic acid‐containing bacteria2019

    • 著者名/発表者名
      Shotaro Hoshino, Hiroyasu Onaka, Ikuro Abe
    • 雑誌名

      Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology

      巻: 46 ページ: 363-374

    • DOI

      https://doi.org/10.1007/s10295-018-2100-y

    • 査読あり
  • [学会発表] Unusual Enzyme Reactions in Fungal Meroterpenoid Biosynthesis2020

    • 著者名/発表者名
      Ikuro Abe
    • 学会等名
      3rd International Conference on Natural Product Discovery and Development in the Genomic Era
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Engineered Biosynthesis of Medicinal Natural Products2019

    • 著者名/発表者名
      Ikuro Abe
    • 学会等名
      2019 International Conference on Metabolic Sciences
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Unusual Enzyme Reactions in Natural Product Biosynthesis2019

    • 著者名/発表者名
      Ikuro Abe
    • 学会等名
      Design, Evolution and Application of Enzymes, Academia Sinica
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Engineered Biosynthesis of Medicinal Natural Products2019

    • 著者名/発表者名
      Ikuro Abe
    • 学会等名
      5th Sino-Italian Symposium on Bioactive Natural Products
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Engineered Biosynthesis of Medicinal Natural Products2019

    • 著者名/発表者名
      Ikuro Abe
    • 学会等名
      International Plant Cell Technology Industry Summit 2019
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Engineered Biosynthesis of Medicinal Natural Products2019

    • 著者名/発表者名
      Ikuro Abe
    • 学会等名
      9th International Conference on Biotechnology and Bioengineering
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 放線菌由来生物活性二次代謝産物の生合成研究2019

    • 著者名/発表者名
      阿部郁朗
    • 学会等名
      第34回日本放線菌学会大会
    • 招待講演
  • [学会発表] Engineered Biosynthesis of Fungal Meroterpenoids2019

    • 著者名/発表者名
      Ikuro Abe
    • 学会等名
      14th International Meeting on Biosynthesis, Function and Synthetic Biology of Isoprenoids (TERPNET 2019)
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 微生物由来薬用天然物の生合成リデザイン2019

    • 著者名/発表者名
      阿部郁朗
    • 学会等名
      東京大学微生物科学イノベーション連携研究機構、微生物ウイーク2019、オープニングシンポジウム
    • 招待講演
  • [学会発表] 希少有用二次代謝産物の合成生物学2019

    • 著者名/発表者名
      阿部郁朗
    • 学会等名
      第40回糸状菌遺伝子研究会例会
    • 招待講演
  • [学会発表] Engineered Biosynthesis of Medicinal Natural Products2019

    • 著者名/発表者名
      Ikuro Abe
    • 学会等名
      Fusion Conference, 2nd Synthetic Biology for Natural Products Conference
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 人工生合成マシナリーの合理的再構築による次世代天然物化学2019

    • 著者名/発表者名
      阿部郁朗
    • 学会等名
      科学研究費補助金 新学術領域研究(研究領域提案型)生物合成系の再設計による複雑骨格機能分子の革新的創成科学、第6回公開シンポジウム
    • 招待講演
  • [学会発表] Engineered Biosynthesis of Medicinal Natural Products2019

    • 著者名/発表者名
      Ikuro Abe
    • 学会等名
      Biosystems Design 5.0 Symposium
    • 国際学会 / 招待講演
  • [図書] Comprehensive Natural Products III: Chemistry and Biology, Vol. 12020

    • 著者名/発表者名
      Yudai Matsuda, Ikuro Abe
    • 総ページ数
      33
    • 出版者
      Elsevier
    • ISBN
      10.1016/B978-0-12-40954
  • [図書] Progress in the Chemistry of Organic Natural Products2020

    • 著者名/発表者名
      Takaaki Mitsuhashi, Ikuro Abe
    • 総ページ数
      79
    • 出版者
      Springer
    • ISBN
      10.1016/B978-0-12-409547
  • [図書] Encyclopedia of Inorganic and Bioinorganic Chemistry2020

    • 著者名/発表者名
      Yu Nakashima, Takahiro Mori, and Ikuro Abe
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      John Wiley & Sons, Ltd.
    • ISBN
      10.1002/9781119951438.eibc2735
  • [図書] Encyclopedia of Inorganic and Bioinorganic Chemistry2019

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Mori, and Ikuro Abe
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      John Wiley & Sons, Ltd.
    • ISBN
      10.1002/9781119951438.eibc2695
  • [備考] 東京大学大学院薬学系研究科天然物化学教室

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~tennen/head.htm

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公開日: 2021-01-27  

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