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2017 年度 実績報告書

実用的物質生産系構築にむけたゲノム情報に基づく新規生合成システムのリデザイン

計画研究

研究領域生物合成系の再設計による複雑骨格機能分子の革新的創成科学
研究課題/領域番号 16H06449
研究機関静岡県立大学

研究代表者

渡辺 賢二  静岡県立大学, 薬学部, 教授 (50360938)

研究分担者 植木 尚子  岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (50622023)
研究期間 (年度) 2016-06-30 – 2021-03-31
キーワード生合成 / リデザイン / 天然物化学 / キノコ / 酵素 / 遺伝子
研究実績の概要

担子菌類は他の生物種には無いユニークな天然物を生産することが知られている。しかしながら、担子菌は種によっては研究室内での栽培や培養が困難であることや、菌糸体や子実体(キノコ)といった形態により生合成産物が変化することから、未知生合成産物がいまだ多く残されていると考えられている。また、担子菌は実験室での培養条件では二次代謝産物の生合成に関与する遺伝子の多くが休眠型であり、多くの二次代謝産物が生合成されていないと予測されている。これら遺伝子を強制的に発現させることができれば、多くの二次代謝産物を獲得することができると考えられる。そこで、本研究では担子菌二次代謝産物の生合成遺伝子の高発現系の確立を目的として、キノコのモデル生物であるウシグソヒトヨタケ (Coprinopsis cinerea) に導入する天然物生合成遺伝子と、それに付与するプロモータ配列の検討を行った。
ウシグソヒトヨタケのゲノムに存在するCC1G_05377はorsellinic acidを生合成するポリケチド合成酵素をコードし、CC1G_03563はlagopodin Aを生合成するテルペン環化酵素をコードすることがすでにわかっている。そこで、ウシグソヒトヨタケの強発現遺伝子のプロモータ領域をこの生合成遺伝子に連結したベクターを作製し、ウシグソヒトヨタケを形質転換した。得られた形質転換株のorsellinic acidやlagopodin Aの生産量を調べた結果、orsellinic acidの生産量は大きく上昇することはなかったが、lagopodin Aの生産量は大きく増加した。この結果は、本手法を用いることで、キノコ由来の休眠型生合成遺伝子を強制発現することにより新規天然物の獲得に道を拓く大きな一歩となった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

C. cinerea Ku3-24株を用い遺伝子破壊法を樹立することを目指した。その標的としてcop6遺伝子を選択した。まずcop6遺伝子の5´-および3´-flanking regionそれぞれ1.5 kbの間に薬剤耐性マーカーであるhphを配置した遺伝子破壊カセットを設計した。出芽酵母を用いたGap-repair cloning法にて本カセットを作成し、プロトプラスト-PEG法にてKu3-24株へと導入した。遺伝子破壊の成否についてはPCR法によって確認し、目的のcop6遺伝子破壊株を取得することに成功した。取得したcop6の代謝産物解析を行ったところ、lagopodin類およびhytoyol類の生産が完全に消失していることが確認された。なおcop6株に対して、前項目にて述べたcop6強制発現カセットを導入した株cop6+pDED1_cop6についても作成し、本株においてlagopodinとhytoyol生産能が復帰することを確認した。以上のことはlagopodinおよびhytoyolの生合成にcop6遺伝子が必要であることを示しており、Cop6の産物であるcupreneneがこれら化合物の生合成中間体であることが初めて実験的に確かめられたため。

今後の研究の推進方策

本年度において担子菌ウシグソヒトヨタケC. cinereaを異種遺伝子発現の宿主として用いるための基礎的な検討を行った。まず、機能既知酵素遺伝子であるCC1G_05377 (PKS遺伝子)を用いて強制発現プロモーターの検討を行い、DED1、EF3等のプロモーターが有用であることを確認した。これを別の内在遺伝子cop6の強制発現へと適応し、その産物であるlagopodin類、hytoyol類の生産量を有意に増大させることに成功した。一方でC. cinereaの遺伝子破壊法が行えることを確認した。実際にcop6遺伝子の破壊を通じて、lagopodin類、hytoyol類生合成にcop6が必須であることが実証された。次年度は今年度に得られた知見をもとに、C. cinereaを宿主として別種の担子菌由来機能未知生合成遺伝子を異種発現させることを検討する。他方では、より天然物産生を志向したC. cinerea株を創出する。具体的には継続的基質供給や分解経路抑制が行われるような菌株をメタボリックエンジニアリングにより作成する。以上により、担子菌生合成遺伝子を用いた新規な天然物獲得手法の技術基盤を樹立することを目標として研究を展開する予定である。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 4件、 査読あり 4件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 5件、 招待講演 5件) 図書 (3件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] カリフォルニア大ロサンゼルス校(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      カリフォルニア大ロサンゼルス校
  • [雑誌論文] Integration of Chemical, Genetic, and Bioinformatic Approaches Delineates Fungal Polyketide-Peptide Hybrid Biosynthesis2017

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama M, Hirayama Y, Yamamoto T, Kishimoto S, Tsunematsu Y, Watanabe K
    • 雑誌名

      Org Lett

      巻: 19 ページ: 2002-2005

    • DOI

      0.1021/acs.orglett.7b00559

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] SAM-dependent enzyme-catalysed pericyclic reactions in natural product biosynthesis2017

    • 著者名/発表者名
      1.Ohashi, M., Liu, F., Hai, Y., Chen, M., Tang, M.-C., Yang, Z., Sato, M., Watanabe, K., Houk, K. N., Tang, Y.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 549 ページ: 502-506

    • DOI

      10.1038/nature23882

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Oxidative Cyclization in Natural Product Biosynthesis2017

    • 著者名/発表者名
      Tang Man-Cheng、Zou Yi、Watanabe Kenji、Walsh Christopher T.、Tang Yi
    • 雑誌名

      Chemical Reviews

      巻: 117 ページ: 5226~5333

    • DOI

      10.1021/acs.chemrev.6b00478

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Elucidation of Biosynthetic Pathways of Natural Products2017

    • 著者名/発表者名
      Kishimoto Shinji、Tsunematsu Yuta、Sato Michio、Watanabe Kenji
    • 雑誌名

      The Chemical Record

      巻: 17 ページ: 1095~1108

    • DOI

      10.1002/tcr.201700015

    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Disfavored exo-adduct formation by a modified octalin-forming Diels-Alderase2017

    • 著者名/発表者名
      渡辺賢二
    • 学会等名
      China/Japan Symposium on Natural Product Biosynthesis
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Disfavored exo-adduct generation by a modified octalin-forming Diels-Alderase2017

    • 著者名/発表者名
      渡辺賢二
    • 学会等名
      Society for Industrial Microbiology
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Pseurotin biosynthesis in fungus2017

    • 著者名/発表者名
      渡辺賢二
    • 学会等名
      9th US-Japan Seminar: The international Conference of Natural Product Biosynthesis
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Novel Genotoxins “Colibactin” Produced by E.coli and colon carcinogenesis (In Vitro, In Vivo Experiments)2017

    • 著者名/発表者名
      渡辺賢二
    • 学会等名
      The 12th international conference and 5th Asian congress on environmental mutagens with the 33rd annual meeting of KSOT/KEMS
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Genetic indoctrination of Escherichia coli for finding genotoxins colibactin facilitating inflammation-induced colorectal cancer2017

    • 著者名/発表者名
      渡辺賢二
    • 学会等名
      US-Japan Cooperative Medical Sciences Program Cancer Panel Meeting
    • 国際学会 / 招待講演
  • [図書] Polyketide synthase and nonribosomal peptide synthetase hybrid enzymes of fungi. The Mycota XV: Physiology and Genetics2018

    • 著者名/発表者名
      Kishimoto, S., Hirayama, Y., Watanabe, K.
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      Springer
  • [図書] 現代化学2017

    • 著者名/発表者名
      大橋雅生, 渡辺賢二
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      東京化学同人
  • [図書] BIO Clinica2017

    • 著者名/発表者名
      渡辺賢二
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      北隆館/ニュー・サイエンス社
  • [備考] 研究内容

    • URL

      http://sweb.u-shizuoka-ken.ac.jp/~kenji55-lab/

URL: 

公開日: 2018-12-17  

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