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2019 年度 実績報告書

高機能性生体分子の創成をめざした生合成マシナリーの基盤解明

計画研究

研究領域生物合成系の再設計による複雑骨格機能分子の革新的創成科学
研究課題/領域番号 16H06452
研究機関北海道大学

研究代表者

大利 徹  北海道大学, 工学研究院, 教授 (70264679)

研究期間 (年度) 2016-06-30 – 2021-03-31
キーワード多価不飽和脂肪酸 / 生合成酵素 / 炭素鎖長制御 / チオエステラーゼ / ペプチドグリカン / アクチノマイシンD
研究実績の概要

①多価不飽和脂肪酸(PUFA)生合成酵素の精密機能解析;昨年度、海洋原核微生物由来のエイコサペンタエン酸(EPA; C20,ω3)とドコサヘキサエン酸(DHA; C22,ω3)生合成酵素内に存在するketo-synthase (KS)/chain length factor (CLF)ドメインが、生産物の炭素鎖長制御に関与することを明らかにした。両酵素のKS/CLFドメインのアミノ酸配列は高い相同性を有するが、両酵素間で互いに異なり、かつ各々の酵素群で高度に保存されているアミノ酸残基が存在する。そこで今年度は、これらが炭素鎖長制御に関与するか検討するため、DHAのアミノ酸残基を対応するEPAの残基に置換した改変酵素を20作成した。その結果、2つの改変酵素がEPAのみを生産したことから、極限られた残基が鎖長制御に関与することが明らかになった。
昨年度、得られた知見を基に真核藻類由来のDHA生合成酵素のKSドメインに変異導入した結果、EPAをDHAと等量生合成する改変酵素を得た。今年度はCLF領域に変異導入した結果、よりEPAを多く生産する改変酵素(EPA/DHA比が1.7)を得た。
さらに、生合成の最終反応であるACP (acyl carrier protein)からのDHA/EPAの切り離しに関与する新規なacyltransferase-likeドメインを同定した。
②新規アミド結合形成酵素(MurNAc-L-Ala-L-Glu synthetase);本生合成機構は、イネ白葉枯病菌が利用している。したがって、本酵素の阻害剤は特異的農薬になると考えられることから放線菌と糸状菌の培養液に候補化合物を探索した。その結果、アクチノマイシンDが本酵素を阻害することがわかった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

昨年度までに多価不飽和脂肪酸(PUFA)生合成酵素に存在し、ω3位の二重結合の生成に関与するドメインと炭素鎖長の制御に関与するドメインを同定した。今年度、鎖長制御ドメイン内の関与アミノ酸残基も同定した。また藻類のDHA生合成酵素に変異導入し、EPA/DHA比が1.7となる酵素も取得した。さらに生成物のACPからの切りだし機構も明らかとし、当初の計画以上に進展している。
イネ白葉枯病菌が利用している新規アミド結合形成酵素(MurNAc-L-Ala-L-Glu synthetase)に関しても阻害剤を探索し、アクチノマイシンDを得たことから、本経路が農薬のターゲット酵素になり得ることを示すことができ順調に進展している。

今後の研究の推進方策

今年度に引き続き真核微細藻類由来のDHA合成酵素の解析を行う。これまでに解析した原核微生物由来のDHA、EPA、ARA合成酵素はω3かω6の何れか一方のみを生合成するのに対し、真核微細藻類のDHA合成酵素は、ω3のDHAとω6のDPA(ドコサペンタエン酸)を併産する。したがって、原核微生物由来の酵素とは異なる制御機構の存在が示唆されるため、これまで用いてきた手法で解明する。今年度は基質の化学合成を試みルートを確立できたので、次年度は大量調製しin vitro反応で詳細な解析を行う。
また、今年度同様に、新規アミド結合形成酵素(MurNAc-L-Ala-L-Glu synthetase)の特異的阻害剤を放線菌と糸状菌の培養液に探索する。

  • 研究成果

    (24件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (18件) (うち国際学会 7件、 招待講演 3件)

  • [雑誌論文] Off-Loading Mechanism of Products in Polyunsaturated Fatty Acid Synthases2020

    • 著者名/発表者名
      Hayashi Shohei、Ogasawara Yasushi、Satoh Yasuharu、Maruyama Chitose、Hamano Yoshimitsu、Dairi Tohru
    • 雑誌名

      ACS Chemical Biology

      巻: 15 ページ: 651~656

    • DOI

      https://doi.org/10.1021/acschembio.0c00075

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 抗酸化物質エルゴチオネインの組換え微生物による発酵生産2020

    • 著者名/発表者名
      佐藤康治, 大津巌生, 大利 徹
    • 雑誌名

      科学と工業

      巻: 94 ページ: 40~45

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Amino Acid Residues Recognizing Isomeric Glutamate Substrates in UDP-N-acetylmuramic acid-l-alanine-glutamate Synthetases2019

    • 著者名/発表者名
      Feng Ruoyin、Satoh Yasuharu、Morita Hiroyuki、Ogasawara Yasushi、Dairi Tohru
    • 雑誌名

      ACS Chemical Biology

      巻: 14 ページ: 975~978

    • DOI

      https://doi.org/10.1021/acschembio.9b00159

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Subtle Control of Carbon Chain Length in Polyunsaturated Fatty Acid Synthases2019

    • 著者名/発表者名
      Naka Mai、Ikeuchi Kenshin、Hayashi Shohei、Satoh Yasuharu、Ogasawara Yasushi、Dairi Tohru
    • 雑誌名

      ACS Chemical Biology

      巻: 14 ページ: 2553~2556

    • DOI

      https://doi.org/10.1021/acschembio.9b00803

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of actinomycin D as a specific inhibitor of the alternative pathway of peptidoglycan biosynthesis2019

    • 著者名/発表者名
      Ogasawara Yasushi、Shimizu Yohei、Sato Yohei、Yoneda Tomoki、Inokuma Yasuhide、Dairi Tohru
    • 雑誌名

      The Journal of Antibiotics

      巻: 73 ページ: 125~127

    • DOI

      https://doi.org/10.1038/s41429-019-0252-2

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 海洋微生物における多価不飽和脂肪酸生合成酵素の解析と応用2019

    • 著者名/発表者名
      林 祥平, 小笠原泰志, 佐藤康治, 大利 徹
    • 雑誌名

      B & I

      巻: 77 ページ: 448~452

  • [学会発表] Dissecting polyunsaturated fatty acid synthases for product control2020

    • 著者名/発表者名
      S. Hayashi, Y. Satoh, Y. Ogasawara, and T. Dairi
    • 学会等名
      3rd International Conference on Natural Product Discovery and Development in the Genomic Era
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 多価不飽和脂肪酸合成酵素の生産物リリース機構の解明2020

    • 著者名/発表者名
      林 祥平、小笠原 泰志、佐藤 康治、丸山 千登勢、濱野 吉十、大利 徹
    • 学会等名
      2020年度日本農芸化学会大会
  • [学会発表] 新規ペプチドグリカン生合成経路阻害剤の探索2020

    • 著者名/発表者名
      清水 庸平、佐藤 洋平、小笠原 泰志、米田 友貴、猪熊 泰英、大利 徹
    • 学会等名
      2020年度日本農芸化学会大会
  • [学会発表] 精密解析に基づく多価不飽和脂肪酸生合成酵素の論理的機能改変2019

    • 著者名/発表者名
      大利 徹
    • 学会等名
      科研費新学術領域研究「生合成リデザイン」第6回公開シンポジウム
    • 招待講演
  • [学会発表] Exploration of futalosine pathway specific inhibitors2019

    • 著者名/発表者名
      Y. Shimizu, K. Kondo, Y. Sato, Y. Ogasawara, and T. Dairi
    • 学会等名
      International Symposium on Biopolymer Synthesis and Degradation
    • 国際学会
  • [学会発表] Engineering of polyunsaturated fatty acid synthase to alter the product specificity2019

    • 著者名/発表者名
      M. Ohtsuka, K. Ikeuchi, S. Hayashi, M. Naka, K. Kobayashi, Y. Satoh, Y. Ogasawara, and T. Dairi
    • 学会等名
      International Symposium on Biopolymer Synthesis and Degradation
    • 国際学会
  • [学会発表] Dissecting polyunsaturated fatty acid synthases for product control2019

    • 著者名/発表者名
      S. Hayashi, Y. Satoh, Y. Ogasawara, and T. Dairi
    • 学会等名
      Annual Meeting of the Society for Industrial Microbiology and Biotechnology
    • 国際学会
  • [学会発表] Involvement of peptide epimerization in poly-glutamic acid biosynthesis2019

    • 著者名/発表者名
      Y. Ogasawara, M. Shigematsu, S. Sato, H. Kato, and T. Dairi
    • 学会等名
      Annual Meeting of the Society for Industrial Microbiology and Biotechnology
    • 国際学会
  • [学会発表] 多価不飽和脂肪酸合成酵素の機能改変2019

    • 著者名/発表者名
      大塚 慎、池内 健心、林 祥平、中 真以、小林 洸太、小笠原 泰志、佐藤 康治、氏原 哲朗、大利 徹
    • 学会等名
      第3回 新学術領域研究「生合成リデザイン」若手シンポジウム
  • [学会発表] 多価不飽和脂肪酸生合成酵素の精密解析2019

    • 著者名/発表者名
      林 祥平、佐藤 康治、丸山 千登勢、濱野 吉十、小笠原 泰志、大利 徹
    • 学会等名
      第61回天然有機化合物討論会
  • [学会発表] 精密解析に基づく多価不飽和脂肪酸生合成酵素の機能改変2019

    • 著者名/発表者名
      林 祥平、佐藤 康治、小笠原 泰志、大利 徹
    • 学会等名
      第71回日本生物工学会大会シンポジウム
  • [学会発表] ペプチドグリカン新規生合成経路阻害剤の探索2019

    • 著者名/発表者名
      清水 庸平、佐藤 洋平、小笠原 泰志、米田 友貴、猪熊 泰英、大利 徹
    • 学会等名
      2019年度(第34回)日本放線菌学会大会
  • [学会発表] ペプチドリガーゼ相同遺伝子の探索と機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      成冨 駿、小笠原 泰志、大利 徹
    • 学会等名
      2019年度(第34回)日本放線菌学会大会
  • [学会発表] メナキノン新規生合成経路阻害剤の探索2019

    • 著者名/発表者名
      青木 風花、小笠原 泰志、松本 厚子、大利 徹
    • 学会等名
      2019年度(第34回)日本放線菌学会大会
  • [学会発表] Dissecting polyunsaturated fatty acid synthases for product control2019

    • 著者名/発表者名
      T. Dairi
    • 学会等名
      Enzyme Engineering XXV
    • 国際学会
  • [学会発表] ペプチドリガーゼ相同遺伝子の探索と機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      成冨 駿,小笠原 泰志,大利 徹
    • 学会等名
      2019年度日本生物工学会北日本支部大会
  • [学会発表] ペプチドグリカン新規生合成経路阻害剤の探索2019

    • 著者名/発表者名
      清水 庸平, 佐藤 洋平, 小笠原 泰志, 米田 友貴, 猪熊 泰英, 大利 徹
    • 学会等名
      2019年度日本生物工学会北日本支部大会
  • [学会発表] Unique enzymes involved in biosynthesis of natural products produced by actinomycetes2019

    • 著者名/発表者名
      T. Dairi
    • 学会等名
      International Workshop on Biology and Applications of Actinomycetes
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2021-01-27  

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