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2020 年度 実績報告書

高機能性生体分子の創成をめざした生合成マシナリーの基盤解明

計画研究

研究領域生物合成系の再設計による複雑骨格機能分子の革新的創成科学
研究課題/領域番号 16H06452
研究機関北海道大学

研究代表者

大利 徹  北海道大学, 工学研究院, 教授 (70264679)

研究期間 (年度) 2016-06-30 – 2021-03-31
キーワード多価不飽和脂肪酸 / 生合成酵素 / 炭素鎖長制御機構 / ポリケチド合成酵素 / シス不飽和結合導入機構
研究実績の概要

昨年度、海洋原核微生物由来のドコサヘキサエン酸(DHA; C22,ω3)合成酵素、エイコサペンタエン酸(EPA; C20,ω3)合成酵素、アラキドン酸(ARA; C20, ω6)合成酵素を用いた精密解析により、炭素鎖長制御機構とω3/ω6導入制御機構を明らかにした。これら合成酵素はω3かω6の何れか一方のみを生合成するのに対し、原核酵素と相同性を有さない真核微細藻類のDHA合成酵素は、ω3のDHAとω6のドコサペンタエン酸(DPA; C22)を併産する。したがって、真核微細藻類のDHA合成酵素は、原核微生物由来酵素とは異なるω3/ω6導入制御機構を持つと予想されるため、これまで用いてきた手法で解明を試みた。真核微細藻類のDHA合成酵素は、OrfA, B, Cの3つの酵素からなり、OrfAとOrfBにケトシンターゼドメイン(KS)が存在する、また、デヒドラターゼドメインに関しては、OrfAにポリケチドタイプ(DH-PKS)が1つ、OrfCに脂肪酸合成酵素タイプ(DH-FabA)が2つ存在する。そこで最初に、これら全てがDHA/DPAの合成に必須であるか大腸菌を宿主に用いたin vivo 発現実験で検証した。ドメインの各活性アミノ酸残基をアラニン置換で不活化したところ、DH-PKS不活化株では生産性が低下したもののDHA生産性を保持していたのに対し、KSドメインのいずれか一方を不活化した酵素とDH-FabAのいずれか一方を不活化した酵素はDHA生産性を消失した。そこで、2つのDH-FabAドメインの機能の違いをin vitroで明らかにすることを試みた。アシル鎖合成が比較的容易な炭素鎖長4,6,8,12,18の各種アシルキャリアタンパク(ACP)結合アシル基質を調製し、2つのDH-FabAドメインを部分発現させた組換え酵素を用いて解析した結果、主に2つのうちの1つが殆どの基質に対して高活性を示した。今後、炭素鎖長10,16,20のACP結合アシル基質を調製し、もう一方のDH-FabAドメインが活性を持つかの確認実験が必要である。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (17件)

すべて 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (10件) (うち招待講演 1件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Flavonoids from Woodfordia fruticosa as potential SmltD inhibitors in the alternative biosynthetic pathway of peptidoglycan2021

    • 著者名/発表者名
      Lee Yuan-E、Kodama Takeshi、Win Nwet Nwet、Ki Dae-Won、Hoang Nhat Nam、Wong Chin Piow、Lae Khine Zar Wynn、Ngwe Hla、Dairi Tohru、Morita Hiroyuki
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      巻: 36 ページ: 127787~127787

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2021.127787

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Identification of the peptide epimerase MslH responsible for d-amino acid introduction at the C-terminus of ribosomal peptides2021

    • 著者名/発表者名
      Feng Zhi、Ogasawara Yasushi、Dairi Tohru
    • 雑誌名

      Chemical Science

      巻: 12 ページ: 2567~2574

    • DOI

      10.1039/D0SC06308H

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Recent advances in functional analysis of polyunsaturated fatty acid synthases2020

    • 著者名/発表者名
      Hayashi Shohei、Satoh Yasuharu、Ogasawara Yasushi、Dairi Tohru
    • 雑誌名

      Current Opinion in Chemical Biology

      巻: 59 ページ: 30~36

    • DOI

      10.1016/j.cbpa.2020.04.015

    • 査読あり
  • [雑誌論文] High Production of Ergothioneine in Escherichia coli using the Sulfoxide Synthase from Methylobacterium strains2020

    • 著者名/発表者名
      Kamide Tomoyuki、Takusagawa Shun、Tanaka Naoyuki、Ogasawara Yasushi、Kawano Yusuke、Ohtsu Iwao、Satoh Yasuharu、Dairi Tohru
    • 雑誌名

      Journal of Agricultural and Food Chemistry

      巻: 68 ページ: 6390~6394

    • DOI

      10.1021/acs.jafc.0c01846

    • 査読あり
  • [学会発表] 抗腫瘍抗生物質マイトマイシンの生合成解析2021

    • 著者名/発表者名
      中川 陽、小笠原泰志、大利 徹
    • 学会等名
      2021年度日本農芸化学会大会
  • [学会発表] 新規ATP依存ペプチドエピメラーゼMurLの反応機構解析2021

    • 著者名/発表者名
      中尾優文、小笠原泰志、佐藤康治、大利 徹
    • 学会等名
      2021年度日本農芸化学会大会
  • [学会発表] Identification and Characterization of the Novel Peptide Epimerase Responsible for the C-terminal D-Tryptophan Introduction in the Biosynthesis of Lasso Peptide, MS-2712021

    • 著者名/発表者名
      Zhi Feng, Yasushi Ogasawara, and Tohru Dairi
    • 学会等名
      2021年度日本農芸化学会大会
  • [学会発表] ポリグルタミン酸生合成におけるエピメリ化酵素の同定2021

    • 著者名/発表者名
      加藤陽菜多、小笠原泰志、大利 徹
    • 学会等名
      2021年度日本農芸化学会大会
  • [学会発表] メナキノン新規生合成経路の最終段階の解明2020

    • 著者名/発表者名
      青木風花、清水庸平、小笠原泰志、大利 徹
    • 学会等名
      第30回イソプレノイド研究会
  • [学会発表] エルゴチオネインの組換え微生物による発酵生産2020

    • 著者名/発表者名
      佐藤康治、田草川隼、小笠原泰志、大津厳生、大利徹
    • 学会等名
      第1回エルゴチオネイン・セレノネイン研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] 抗腫瘍抗生物質マイトマイシンの生合成解析2020

    • 著者名/発表者名
      中川 陽、小笠原 泰志、大利 徹
    • 学会等名
      2020年度 日本農芸化学会北海道支部/日本栄養・食糧学会北海道支部 合同学術講演会
  • [学会発表] 新規ATP依存ペプチドエピメラーゼMurLの反応機構解析2020

    • 著者名/発表者名
      中尾 優文、小笠原 泰志、佐藤 康治、大利 徹
    • 学会等名
      2020年度 日本農芸化学会北海道支部/日本栄養・食糧学会北海道支部 合同学術講演会
  • [学会発表] ポリグルタミン酸生合成におけるエピメリ化酵素の同定2020

    • 著者名/発表者名
      加藤 陽菜多、小笠原 泰志、大利 徹
    • 学会等名
      2020年度 日本農芸化学会北海道支部/日本栄養・食糧学会北海道支部 合同学術講演会
  • [学会発表] Identification and Characterization of the Peptide Epimerase Catalyzing Isomerization of the C-terminal L-Tryptophan Residue in the Biosynthesis of Lasso Peptide, MS-2712020

    • 著者名/発表者名
      Zhi Feng, Yasushi Ogasawara, and Tohru Dairi
    • 学会等名
      2020年度 日本農芸化学会北海道支部/日本栄養・食糧学会北海道支部 合同学術講演会
  • [図書] 脂質・脂肪酸関連物質の使いこなし方 -素材開発・機能創生・応用技術-2020

    • 著者名/発表者名
      相川 達郎、大利 徹(分担執筆)
    • 総ページ数
      618
    • 出版者
      テクノシステム
    • ISBN
      978-4-924728-86-8
  • [備考] ヒトの必須脂肪酸EPA,DHAを作り分けるしくみを解明

    • URL

      https://www.hokudai.ac.jp/news/2019/04/epadhadhaepaepa.html

  • [備考] 微細藻類がヒトの必須脂肪酸を作り分けるしくみを解明

    • URL

      https://www.hokudai.ac.jp/news/190308_pr.pdf

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公開日: 2021-12-27  

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