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2007 年度 実績報告書

メリステムにおける遺伝子産物の発現と細胞内動態の高感度解析

計画研究

研究領域植物メリステムと器官の発生を支える情報統御系
研究課題/領域番号 19060016
研究機関京都大学

研究代表者

荒木 崇  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (00273433)

研究分担者 福田 裕穂  東京大学, 理学系研究科, 教授 (10165293)
町田 泰則  名古屋大学, 理学研究科, 教授 (80175596)
深城 英弘  神戸大学, 理学研究科, 准教授 (80324979)
山本 興太朗  北海道大学, 理学研究科, 教授 (80142008)
島本 功  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (10263427)
キーワード植物 / 生体分子 / 発現制御 / 分子間相互作用 / イメージング / マイクロアレイ / タイリングアレイ / エピジェネティクス
研究概要

本年度は初年度に当たるため、来年度からの支援実施のための基盤整備を中心に進めた。
本支援班のひとつの目的は、植物の発生研究にとって必須となってきた、全ゲノムに渡る網羅的遺伝子発現解析とタイリングアレイを利用した低分子RNAの発現、およびchip-on-chipによるゲノムのメチル化、アセチル化を網羅的に解析する方法を確立し、この技術を計画研究・公募研究の班員に提供することにある。このために、本年度は、購入したDNA解析装置の調整と、網羅的遺伝子解析技術の習得及び開発を行った。その結果、シロイヌナズナ及びヒャクニチソウ遺伝子の網羅的発現解析が可能となった。また、ゲノム修飾の実験系の立ち上げを行い、培養細胞を用いての解析が可能となった。
もう一つの目的は、タンパク質の組織内・細胞内局在の解析の技術情報や、植物細胞内におけるタンパク質間相互作用解析のためのベクター、茎頂メリステムの細胞動態を解析するための材料などを整備し、計画研究・公募研究の班員に提供することである。このために、本年度は、バージョンアップした共焦点レーザー走査顕微鏡の利用環境の整備とこれを用いた植物細胞内におけるタンパク質間相互作用の試験的解析をおこなった。また、解析技術のひとつである、Bi-molecular fluorescent complementation (BiFC)法に用いるベクターの構築を進め、平成20年度から配布できる準備を整えた。これと合わせて、このBiFC法について紹介した和文総説を公表した。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] TERE; a novel cis-element responsible for a coordinated expression of genesrelated to programmed cell death and secondary wall formation during tracheary element differentiation.2007

    • 著者名/発表者名
      Pyo, H., Demura, T., and Fukuda, H.
    • 雑誌名

      Plant Journal 51

      ページ: 955-965

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gain-of-function phenotypes of chemically synthetic CLAVATA3/ESR-related(CLE) peptides in Arabidopsis thaliana and Oryza sativa.2007

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita, A., Nakamura, Y., Sasaki, E., Kyozuka, J., Fukuda, H. and Sawa, S.
    • 雑誌名

      Plant & Cell Physiology 48

      ページ: 1821-1825

    • 査読あり
  • [雑誌論文] BiFC (Bimolecular Fluorescence Complementation)法2007

    • 著者名/発表者名
      大門靖史, 荒木 崇
    • 雑誌名

      化学と生物 45

      ページ: 718-725

  • [学会発表] 管状要素分化転換過程における遺伝子発現に対するDNAメチル化・ヒストン説アセチル化阻害の影響2008

    • 著者名/発表者名
      貴舩永津子, 岩本訓知, 十時泰, 豊田敦, 持田恵一, 出村拓, 福田裕穂
    • 学会等名
      第49回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      20080320-22

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公開日: 2010-02-04   更新日: 2016-04-21  

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