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2012 年度 実績報告書

メリステムにおける遺伝子産物の発現と細胞内動態の高感度解析

計画研究

研究領域植物メリステムと器官の発生を支える情報統御系
研究課題/領域番号 19060016
研究機関京都大学

研究代表者

荒木 崇  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (00273433)

研究分担者 福田 裕穂  東京大学, 理学系研究科, 教授 (10165293)
研究期間 (年度) 2007-07-25 – 2013-03-31
キーワード植物 / 生体分子 / 網羅的遺伝子解析 / 分子間相互作用 / イメージング / マイクロアレイ / タイリングアレイ / ジーンチップ
研究概要

最終年度に当たる本年度は、公募班員を含む班員に対する支援事業をおこなった。
本支援班の一つ目の目的は、シロイヌナズナ23K-DNAチップ、ヒャクニチソウDNAチップ、シロイヌナズナタイリングアレイを用いた網羅的な遺伝子発現解析を行い、そのデータを提供することである。本年度は、7研究室から延べ39件の遺伝子解析の依頼があった。これらの依頼に応えて解析を行い、その遺伝子発現データを班員に戻した。これらの解析から、新規オーキシン関連遺伝子の同定、膜交通関連遺伝子の発現プロファイルの取得、側根形成を支配する遺伝子の発現パターンの解明、維管束転写因子の下流遺伝子発現のプロファイル取得、感染におけるシグナル遺伝子の同定、ペプチド誘導性遺伝子の発見など、植物メリステム研究に寄与する多くの成果があがった。
また、本支援班では、蛍光標識したタンパク質の組織内・細胞内局在の解析の技術情報や、植物細胞内におけるタンパク質問相互作用解析のためのベクターなどを整備し班員に提供するとともに、必要な班員には共焦点レーザー顕微鏡の利用の便を図ることも目的としている。本年度は、分子量の小さい蛍光タグとして改良が加えられたphiLOVドメインの利用可能性の検討を進め、蛍光強度・退光しにくさ等の点で、以前のiLOVより大幅に改善していることを確認した。FTタンパク質の輸送・動態の解析に利用を始めた。以上に加え、BiFC法によるタンパク質問相互作用解析のためのベクターの配布2件と1件(1研究室)の共焦点レーザー顕微鏡観察の技術支援をおこなった。
2012年11月には、連携研究者である奈良先端大・島本功教授がオーガナイザーとなり、ワークショップ「明日の植物科学を探る-ゲノムから細胞機能の統合を目指して-」(奈良先端大・植物科学グローバルトップ教育推進プログラムとの共催)をおこない、多数の参加者を得て、技術交流を図った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

班員の支援は予定通り行うことにより、それぞれ所期の成果が挙げることができ、本特定領域研究における研究の進展に寄与することができたため。

  • 研究成果

    (28件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (18件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] The florigen genes FT and TSF modulate lateral shoot outgrowth in Arabidopsis thaliana.2013

    • 著者名/発表者名
      Hiraoka, K., Yamaguchi, A., Abe, M., Araki, T.
    • 雑誌名

      Plant & Cell Physiology

      巻: 54 ページ: 352-368

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs168

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Plant meristems and organogenesis : the new era of plant developmental research. (Editorial)2013

    • 著者名/発表者名
      Machida, Y., Fukaki, H., Araki, T.
    • 雑誌名

      Plant & Cell Physiology

      巻: 54 ページ: 295-301

    • DOI

      10.1093/pcp/pct034

  • [雑誌論文] BRANCHED1 interacts with FLOWERING LOCUS T to repress the floral transition of the axillary meristems in Arabidopsis.2013

    • 著者名/発表者名
      Niwa, M., Daimon, Y., Kurotani, K., Higo, A, Pruneda-Paz, J. L., Breton, G., Mitsuda, N., Kay, S. A., Ohme-Takagi, M., Endo, M., Araki, T.
    • 雑誌名

      Plant Cell

      巻: 25(印刷中)

    • DOI

      10.1105/tpc.112.109090

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phloem long-distance delivery of FLOWERING LOCUS T (FT) to the apex.2013

    • 著者名/発表者名
      Yoo, S. -C., Chen, C., Rojas, M., Daimon, Y., Ham, B.K., Araki, T., Lucas, W.
    • 雑誌名

      Plant Journal

      巻: 74(印刷中)

    • DOI

      10.1111/tpj.12213

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Auxin-associated initiation of vascular cell differentiation by LONESOME HIGHWAY.2013

    • 著者名/発表者名
      Ohashi-Ito, K, Obuchi, M., Kojima, M., Sakakibara, H., Fukuda, H.
    • 雑誌名

      Development

      巻: 140 ページ: 765-769

    • DOI

      10.1242/dev.087924

    • 査読あり
  • [雑誌論文] An atypical b HLH transcription factor regulate early xylem development downstream of auxin.2013

    • 著者名/発表者名
      Ohashi-Ito, K., Matsukawa, M., Fukuda, H.
    • 雑誌名

      Plant & Cell Physiology

      巻: 54 ページ: 398-405

    • DOI

      10.1093/pcp/pct013

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 植物固有の転写因子LEAFYとゼニゴケの有性生殖2012

    • 著者名/発表者名
      荒木崇
    • 雑誌名

      植物科学の最前線(BSJ-Review)

      巻: 3 ページ: 134-158

    • DOI

      http://bsj.or.jp/frontier/BSJreview2012B8.pdf)

  • [雑誌論文] Initiation of cell wall pattern by a Rho- and microtubule-driven symmetry breaking.2012

    • 著者名/発表者名
      Oda, Y., Fukuda, H.
    • 雑誌名

      Science

      巻: 337 ページ: 1333-1336

    • DOI

      10.1126/science.1222597

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The proteasome is responsible for caspase-3-like activity during xylem development.2012

    • 著者名/発表者名
      Han, J., Lin, W, Oda, Y., Cui, K. M., Fukuda, H., He, X. Q.
    • 雑誌名

      Plant Journal

      巻: 72 ページ: 129-141

    • DOI

      10.1111/j.1365-313X.2012.05070.x

    • 査読あり
  • [学会発表] シロイヌナズナBRC1はFT/TSFと相互作用して側芽の相転換を抑制する2013

    • 著者名/発表者名
      丹羽優喜, 遠藤求, 荒木崇
    • 学会等名
      日本植物生理学会2013年度年会
    • 発表場所
      岡山市・岡山大学津島キャンパス(ポスター発表)
    • 年月日
      2013-03-23
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケにおけるmiR156およびSBP型転写因子の解析2013

    • 著者名/発表者名
      山口礼子, 宮下結衣, 吉川学, 酒井友希, 石崎公庸, 河内孝之, 荒木崇
    • 学会等名
      日本植物生理学会2013年度年会
    • 発表場所
      岡山市・岡山大学津島キャンパス(ポスター発表)
    • 年月日
      2013-03-23
  • [学会発表] NIMA関連キナーゼは花成制御因子FT, TFL1と相互作用する2013

    • 著者名/発表者名
      高谷彰吾, 池田龍也, 川本望, 酒井達也, 平山隆志, 後藤弘爾, 荒木崇, 高橋卓, 本瀬宏康
    • 学会等名
      日本植物生理学会2013年度年会
    • 発表場所
      岡山市・岡山大学津島キャンパス(ポスター発表)
    • 年月日
      2013-03-23
  • [学会発表] phyB相互作用因子PHLによる花成制御2013

    • 著者名/発表者名
      遠藤求, 長谷あきら, 荒木崇
    • 学会等名
      日本植物生理学会2013年度年会
    • 発表場所
      岡山市・岡山大学津島キャンパス
    • 年月日
      2013-03-22
  • [学会発表] シロイヌナズナ14-3-3タンパク質の花成における役割の解析2013

    • 著者名/発表者名
      肥後あすか, 川本望, 丹羽優喜, 山口礼子, 遠藤求, 荒木崇
    • 学会等名
      日本植物生理学会2013年度年会
    • 発表場所
      岡山市・岡山大学津島キャンパス
    • 年月日
      2013-03-22
  • [学会発表] リン酸化によるbZIP型転写因子FDの機能制御機構とタンパク質キナーゼの探索2013

    • 著者名/発表者名
      川本望, 笹部美知子, 遠藤求, 町田泰則, 荒木崇
    • 学会等名
      日本植物生理学会2013年度年会
    • 発表場所
      岡山市・岡山大学津島キャンパス
    • 年月日
      2013-03-22
  • [学会発表] 原核生物型PEBPファミリータンパク質CORのシロイヌナズナとゼニゴケにおける機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      森花小百合, 竹本覚, 辻井由香, 有手友嗣, 竹村美保, 酒井友希, 山口礼子, 遠藤求, 石崎公庸, 大和和幸, 河内孝之, 荒木崇
    • 学会等名
      日本植物生理学会2013年度年会
    • 発表場所
      岡山市・岡山大学津島キャンパス
    • 年月日
      2013-03-21
  • [学会発表] Regulation of microtubule organization directing spatial patterning of wall assembly during xylem cell formation in Arabidopsis.2012

    • 著者名/発表者名
      福田裕穂, 小田祥久
    • 学会等名
      Gordon Conference "Plant & Microbial Cytoskeleton"
    • 発表場所
      Proctor Academy, Andover NH, USA(招待講演)
    • 年月日
      20120812-20120817
  • [学会発表] シロイヌナズナFTおよびTSFフロリゲンの側枝形成・伸長における役割2012

    • 著者名/発表者名
      荒木崇
    • 学会等名
      第85回日本生化学会年会
    • 発表場所
      福岡市・福岡国際会議場(招待講演)
    • 年月日
      2012-12-15
  • [学会発表] 転写因子の機能から迫る陸上植物の有性生殖メカニズムの進化-安定して次世代を残すために-2012

    • 著者名/発表者名
      酒井友希, 荒木崇
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡市・福岡国際会議場(招待講演)
    • 年月日
      2012-12-13
  • [学会発表] Flagella and related genes. in "Genome Session (omnibus)"2012

    • 著者名/発表者名
      荒木崇
    • 学会等名
      International Marchantia Workshop 2012
    • 発表場所
      熊本県阿蘇郡・ホテルグリーンピア南阿蘇
    • 年月日
      2012-11-16
  • [学会発表] Role of LEAFY in gametophyte development and function.2012

    • 著者名/発表者名
      酒井友希, 宮下結衣, 宇山和樹, 辻井由香, 山口礼子, 荒木崇
    • 学会等名
      International Marchantia Workshop 2012
    • 発表場所
      熊本県阿蘇郡・ホテルグリーンビア南阿蘇(招待講演)
    • 年月日
      2012-11-15
  • [学会発表] 二次細胞壁パターンの数理解析にむけて2012

    • 著者名/発表者名
      小田祥久, 福田裕穗
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス(招待講演)
    • 年月日
      2012-09-16
  • [学会発表] 花成と有性生殖を支える成長システムの統合的理解に向けて2012

    • 著者名/発表者名
      荒木崇
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス(招待講演)
    • 年月日
      2012-09-15
  • [学会発表] シロイヌナズナBRC1/TCP18はFTと相互作用して側芽分裂細織の相転換を抑制する2012

    • 著者名/発表者名
      丹羽優喜, 遠藤求, 荒木崇
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス
    • 年月日
      2012-09-15
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケにおけるSBP型転写因子の解析2012

    • 著者名/発表者名
      山口礼子, 宮下結衣, 酒井友希, 石崎公庸, 河内孝之, 荒木崇
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス(ポスター発表)
    • 年月日
      2012-09-15
  • [学会発表] 超解像イメージングで挑む木部細胞分化の分子ダイナミクス2012

    • 著者名/発表者名
      小田祥久, 福田裕穂
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス(招待講演)
    • 年月日
      2012-09-15
  • [学会発表] 開始から完了まで-維管束分化の統合的理解に向けて-2012

    • 著者名/発表者名
      伊藤(大橋)恭子, 福田裕穂
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス(招待講演)
    • 年月日
      2012-09-15
  • [図書] Plant Signaling Peptides. (ed. R, Irving and C. Gehring) (Peptide regulating vascular development.の章を分担執筆)2012

    • 著者名/発表者名
      Fukuda, H.
    • 総ページ数
      284
    • 出版者
      Springer

URL: 

公開日: 2014-07-16  

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