各種環境から多数の未知系統の微生物を分離培養して、14の新属、66の新種を記載・発表し、生理性状やゲノム解読、機能の解析も行なった。培養株の乏しい系統群の代表的なものの一つであるDPANNグループのアーキア2種について、それぞれ別種アーキアと共生状態で培養することにも成功し、宿主に寄生する生活様式を明らかにした。また、共生状態で培養したヒト腸内細菌では有機酸を介した共生関係も解明した。安価簡便かつ効率良いシングルセルゲノム解析技術の開発にも取り組み、整備バイオリソースや培養技術等により領域の他研究者との連携・支援も実施した。
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