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2010 年度 自己評価報告書

エネルギー・構造揺らぎの時間分解検出法開発と反応機構の研究

計画研究

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研究領域揺らぎが機能を決める生命分子の科学
研究課題/領域番号 20107003
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関京都大学

研究代表者

寺嶋 正秀  京都大学, 大学院・理学研究科, 教授 (00188674)

研究期間 (年度) 2008 – 2012
キーワード揺らぎ / 生体分子 / 反応 / 機能
研究概要

本研究では、分子の持つ揺らぎやすさやエネルギー揺らぎ変化を時間分解し、過渡種の揺らぎとダイナミクスを結び付ける手法の開発と、実際に光受容タンパク質への適用を行う。こうした揺らぎの時間分解計測法を確立し、反応の進行に構造揺らぎがどのような役割を果たしているかを明らかにする。これらの手法を、動物・植物・細菌が持つ種々の光センサーに適用し、共通因子を明らかにすることにより、揺らぎがいかに機能と結びついているかという一般則を見出す。また、他グループとの共同研究を通して、揺らぎを制御するために必須の要因をアミノ酸残基単位で明らかにし、それがそのタンパク質の機能とどう関係しているかを明らかにする。その背景にある分子論的な要因を探る。
また、情報伝達過程と揺らぎとの関係を明らかにするために、拡散を用いて分子間相互作用ダイナミクスを検出し、ここで開発する時間分解揺らぎ検出法を組み合わることで、いかにして生体タンパク質は揺らぎを使ってタンパク質-タンパク質相互作用を制御しているかを明らかにする。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (5件) 図書 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Kinetics of conformational changes of the FKF1-LOV domain upon photoexcitation2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Nakasone, K.Zikihara, S.Tokutomi, M.Terazima
    • 雑誌名

      Biophys.J. 99

      ページ: 3831-3839

    • 査読あり
  • [雑誌論文] When is the helix conformation restored after the reverse reaction of Phototropin2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Kawaguchi, Y.Nakasone, K.Zikihara, S.Tokutomi, M.Terazima
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 132

      ページ: 8838-8839

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Oligomeric State-Dependent Conformational Change of a BLUF Protein TePixD (Tll0078)2009

    • 著者名/発表者名
      K.Tanaka, Y.Nakasone, K.Okajima, M.Ikeuchi, S.Tokutomi, M.Terazima
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 386

      ページ: 1290-1300

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reaction dynamics of halorhodopsin studied by time-resolved diffusion2009

    • 著者名/発表者名
      K.Inoue, M.Kubo, M.Demura, N.Kamo, M.Terazima
    • 雑誌名

      Biophys.J. 96

      ページ: 3724-3734

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Stability of dimer and domain-domain interaction of Arabidopsis phototropin 1 LOV22008

    • 著者名/発表者名
      Y.Nakasone, T.Eitoku, K.Zikihara, D.Matsuoka, S.Tokutomi, M.Terazima
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 383

      ページ: 904-913

    • 査読あり
  • [学会発表] Role of water-protein interaction for the function of biological proteins2010

    • 著者名/発表者名
      M.Terazima
    • 発表場所
      Pacifichem, Honolulu, USA
    • 年月日
      20101215-20101220
  • [学会発表] タンパク質反応における時間分解揺らぎ検出の試み2010

    • 著者名/発表者名
      寺嶋正秀
    • 学会等名
      日本物理学会年会
    • 発表場所
      大阪府立大学
    • 年月日
      20100923-20100926
  • [学会発表] Time-resolved observation of protein-protein interaction between blue-light receptor PixD and response regulator PixE2010

    • 著者名/発表者名
      K.Tanaka, Y.Nakasone, K.Okajima, M.Ikeuchi, S.Tokutomi, M.Terazima
    • 学会等名
      生物物理学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      20100920-20100922
  • [学会発表] 青色光センサータンパク質PixDの光誘起反応ダイナミクス2010

    • 著者名/発表者名
      田中啓介、岡島公司、池内昌彦、徳富哲、寺嶋正秀
    • 学会等名
      第4回分子科学討論会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      20100914-20100917
  • [学会発表] 分子拡散の時間分解検出による光回復酵素のDNA光修復反応機構の解明2010

    • 著者名/発表者名
      近藤正人、人見研一、山元淳平、藤堂剛、岩井成憲、E.D.Getzoff, 寺嶋正秀
    • 学会等名
      第90回日本化学会年会
    • 発表場所
      近畿大学
    • 年月日
      20100326-20100329
  • [図書] 揺らぎと生体機能(生体分子の反応中の揺らぎをとらえる分子科学手法)(寺嶋正秀監修)メディカルバイオ別冊2010

    • 著者名/発表者名
      寺嶋正秀
    • 総ページ数
      10-16
    • 出版者
      オーム社
  • [図書] 可視・紫外分光法2009

    • 著者名/発表者名
      寺嶋正秀・馬場正昭・冨宅喜代一・星野幹雄・松本剛昭・宮崎芳雄・西澤潔 共著
    • 出版者
      講談社サイエンティフィック
  • [図書] Water and Biomolecules(Time-resolved detection of intermolecular interaction of photosensor proteins)(M.Terazima, Physical Chemistry of Life Phenomena, Eds.)2009

    • 著者名/発表者名
      K.Kuwajima, Y.Goto, F.Hirata, M.kataoka, M.Terazima
    • 総ページ数
      149-172
    • 出版者
      Springer
  • [備考] ホームページ

    • URL

      http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/hikari/index.html

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公開日: 2012-03-09   更新日: 2016-04-21  

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