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2011 年度 実績報告書

非天然アミノ酸の部位特異的導入技術を用いたタンパク質の揺らぎ解析

計画研究

研究領域揺らぎが機能を決める生命分子の科学
研究課題/領域番号 20107005
研究機関北陸先端科学技術大学院大学

研究代表者

芳坂 貴弘  北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 教授 (30263619)

キーワードタンパク質 / 非天然アミノ酸 / 揺らぎ / 4塩基コドン / 無細胞翻訳系 / マルトース結合タンパク質 / 蛍光共鳴エネルギー移動 / 一分子測定
研究概要

蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)のドナーおよびアクセプターとなる非天然アミノ酸をタンパク質にそれぞれ導入して、FRET測定によってドナー・アクセプター間の距離およびその分布を調べ、タンパク質の特定部位における構造揺らぎを計測できる手法を確立することを目的として研究を行なった。モデルタンパク質としてマルトース結合タンパク質(MBP)を用いた場合、N末端にFRETのドナーとなる蛍光標識アミノ酸を導入しつつ、様々な内部部位にアクセプターとなる非天然アミノ酸を導入して、蛍光寿命測定からFRET効率とドナー・アクセプター間距離およびその分布の分析を行なった。また、一分子測定に適用可能なFRETアクセプターとなる新たな蛍光標識アミノ酸を設計・合成し、実際にタンパク質の様々な部位に導入できることを見い出した。この新規蛍光標識アミノ酸はMBPの溶液中での一分子測定に使用可能であること、及び、タンパク質の構造揺らぎの測定に応用できることを明らかにした。また、FRETのドナーの代わりにルシフェラーゼを用いることで、生物発光共鳴エネルギー移動(BRET)によって、同様の分析が可能となることも示した。一方、蛍光標識アミノ酸を抗体のN末端部分に導入した場合に、抗原非結合状態では抗体断片内部のトリプトファンによって消光されるが、抗原の結合によって消光が解消されて、抗原を蛍光変化によって検出できることを見い出した。これは、抗体断片の抗原結合部位の揺らぎを利用することで可能になったと考えられる。また、特定部位のアミノ酸を他の天然アミノ酸や様々な非天然アミノ酸に簡便に置換する手法の開発を行ない、タンパク質の構造やその揺らぎに対するアミノ酸置換の影響を効率良く解析できる手法を確立した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

非天然アミノ酸の導入技術を用いたFRETによるタンパク質構造揺らぎの測定方法の確立、および、タンパク質揺らぎの制御に向けた様々な非天然アミノ酸の導入ともに、おおむね順調に進展している。また、蛍光標識アミノ酸を導入した抗体断片の揺らぎに基づいた抗原検出法が新たに見い出され、本研究成果の診断薬等への実用的な応用の可能性も示された。

今後の研究の推進方策

今後も引き続き計画に沿って研究を推進する。また新たに得られた知見に基づいて、蛍光標識アミノ酸を導入した抗体断片の実用化についても検討し、その際に必要となる非天然アミノ酸導入タンパク質の大量合成法の開発も行なう。

  • 研究成果

    (30件)

すべて 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (22件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Synthesis of Novel BRET/FRET Protein Probes Containing Light-Emitting Proteins and Fluorescent Nonnatural Amino Acids2012

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Yamaguchi, Takahiro Hohsaka
    • 雑誌名

      Bull. Chem. Soc. Jpn.

      巻: 85 ページ: 576-583

    • DOI

      10.1246/bcsj.20110368

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Incorporation of Unnatural Non-α-Amino Acids into the N-Terminus of Proteins in a Cell-Free Translation System2012

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Hohsaka
    • 雑誌名

      Methods Mol. Biol.

      巻: 794 ページ: 229-239

    • DOI

      10.1007/978-1-61779-331-8_14

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Amber Codon-Mediated Expanded Saturation Mutagenesis of Proteins using a Cell-Free Translation System2012

    • 著者名/発表者名
      Naoki Shozen, Takayoshi Watanabe, Takahiro Hohsaka
    • 雑誌名

      J.Biosci.Bioeng.

      巻: (印刷中)

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2012.01.018

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biosynthesis of proteins containing modified lysines and fluorescent labels using non-natural amino acid mutagenesis2011

    • 著者名/発表者名
      Yasunori Tokuda, Takayoshi Watanabe, Kazushi Horiike, Kaori Shiraga, Ryoji Abe, Norihito Muranaka, Takahiro Hohsaka
    • 雑誌名

      J.Biosci.Bioeng.

      巻: 111 ページ: 402-407

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2010.12.012

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Farnesyl pyrophosphate regulates adipocyte functions as an endogenous PPARgamma agonist2011

    • 著者名/発表者名
      Tsuyoshi Goto, Hiroyuki Nagai, Kahori Egawa, Youg-Il Kim, Sota Kato, Aki Taimatsu, Tomoya Sakamoto, Shogo Ebisu, Takahiro Hohsaka, Hiroh Miyagawa, Shigeru Murakami, Nobuyuki Takahashi, Teruo Kawada
    • 雑誌名

      Biochem J

      巻: 438 ページ: 111-119

    • DOI

      10.1042/BJ20101939

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of a novel PPARgamma ligand screening system using pinpoint fluorescence-probed protein2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Nagai, Shogo Ebisu, Ryoji Abe, Tsuyoshi Goto, Nobuyuki Takahashi, Takahiro Hohsaka, Teruo Kawada
    • 雑誌名

      Biosci.Biotechnol.Biochem.

      巻: 75 ページ: 337-341

    • DOI

      10.1271/bbb.100810

    • 査読あり
  • [雑誌論文] "Quenchbodies" : quench-based antibody probes that show antigen-dependent fluorescence2011

    • 著者名/発表者名
      Ryoji Abe, Hiroyuki Ohashi, Issei Iijima, Masaki Ihara, Hiroaki Takagi, Takahiro Hohsaka, Hiroshi Ueda
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc.

      巻: 133 ページ: 17386-17394

    • DOI

      10.1021/ja205925j

    • 査読あり
  • [学会発表] Incorporation of Fluorescent Nonnatural Amino Acids into Proteins and its Application to FRET Analysis of Proteins2012

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Hohsaka, Yasunori Tokuda, Kaori Shiraga, Takayoshi Watanabe
    • 学会等名
      揺らぎが機能を決める生命分子の科学第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      東大寺総合文化センター(奈良)
    • 年月日
      20120107-20120108
  • [学会発表] Amber Codon-Mediated Expanded Saturation Mutagenesis of Proteins Using Cell-Free Translation System2012

    • 著者名/発表者名
      Naoki Shozen, Takayoshi Watanabe, Takahiro Hohsaka
    • 学会等名
      揺らぎが機能を決める生命分子の科学第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      東大寺総合文化センター(奈良)
    • 年月日
      20120107-20120108
  • [学会発表] Microsecond-Resolved Time Traces of Protein Conformational Changes by Single-Molecule Fluorescence Detection2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Oikawa, Kiyoto Kamagata, Issei Iijima, Takahiro Hohsaka, Satoshi Takahashi
    • 学会等名
      揺らぎが機能を決める生命分子の科学第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      東大寺総合文化センター(奈良)
    • 年月日
      20120107-20120108
  • [学会発表] Incorporation of Fluorescent Non-natural Amino Acids into Staphylococcal Nuclease for FRET Analyses of Induced Folding2012

    • 著者名/発表者名
      Takuya Muto, Emi Ohta, Yusuke Kishi, Mariko Yamaguchi, Kaori Shiraga, Yoichi Yamazaki, Hironari Kamikubo, Takahiro Hohsaka, Mikio Kataoka
    • 学会等名
      揺らぎが機能を決める生命分子の科学第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      東大寺総合文化センター(奈良)
    • 年月日
      20120107-20120108
  • [学会発表] アンバーサプレッションを用いたタンパク質の拡張飽和変異法の開発2012

    • 著者名/発表者名
      渡邉貴嘉・聖前直樹・峯浦稔也・芳坂貴弘
    • 学会等名
      日本化学会春季年会
    • 発表場所
      慶応義塾大学(神奈川)
    • 年月日
      2012-03-27
  • [学会発表] 蛍光標識アミノ酸導入と発光タンパク質融合発現によるBRET/FRETタンパク質プローブの合成2012

    • 著者名/発表者名
      山口純・芳坂貴弘
    • 学会等名
      日本化学会春季年会
    • 発表場所
      慶応義塾大学(神奈川)
    • 年月日
      2012-03-27
  • [学会発表] タンパク質への非天然アミノ酸の導入技術の開発と応用2012

    • 著者名/発表者名
      芳坂貴弘
    • 学会等名
      理研バイオものづくりシンポジウム
    • 発表場所
      理化学研究所(埼玉)(招待講演)
    • 年月日
      2012-03-08
  • [学会発表] Site-specific incorporation of fluorescent nonnatural amino acids into proteins and its application to fret analysis of protein structure2012

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Hohsaka
    • 学会等名
      4th Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences : Experiments and Simulations
    • 発表場所
      東大寺総合文化センター(奈良)(招待講演)
    • 年月日
      2012-01-09
  • [学会発表] 非天然アミノ酸の導入によるタンパク質の二重蛍光標識とFRET解析2011

    • 著者名/発表者名
      芳坂貴弘
    • 学会等名
      公開シンポジウム「蛋白質の機能を解き明かす多彩なアプローチ」
    • 発表場所
      横浜市立大学(神奈川)(招待講演)
    • 年月日
      2011-10-18
  • [学会発表] Application of nonnatural amino acid mutagenesis to proving protein fluctuations2011

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Hohsaka
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫)(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-19
  • [学会発表] Structural Analysis of Intrinsically Disordered Protein Model using FRET2011

    • 著者名/発表者名
      Takuya Muto, Yusuke Kishi, Mariko Yamaguchi, Kaori Shiraga, Issei Iijima, Yoichi Yamazaki, Haronari Kamikubo, Takahiro Hosaka, Mikio Kataoka
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫)
    • 年月日
      2011-09-18
  • [学会発表] Microsecond-resolved time traces of protein conformational change by single-molcule fluorescence detection2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Oikawa, Kiyoto Kamagata, Issei Iijima, Takahiro Hohsaka, Yoshihiro Sambongi, Satoshi Takahashi
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫)
    • 年月日
      2011-09-18
  • [学会発表] 翻訳開始過程の拡張による非天然アミノ酸誘導体のタンパク質への導入2011

    • 著者名/発表者名
      三浦将典・白神かおり・芳坂貴弘
    • 学会等名
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城)
    • 年月日
      2011-09-14
  • [学会発表] 蛍光標識非天然アミノ酸のタンパク質への導入とタンパク質解析への応用2011

    • 著者名/発表者名
      渡邊貴嘉・白神かおり・徳田安則・飯島一生・芳坂貴弘
    • 学会等名
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城)
    • 年月日
      2011-09-13
  • [学会発表] マイクロ秒分解一分子蛍光検出による蛋白質構造変化の追跡2011

    • 著者名/発表者名
      小井川浩之、鎌形清人、飯島一生、芳坂貴弘、高橋聡
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪)
    • 年月日
      2011-06-09
  • [学会発表] 抗原依存的蛍光を発する蛍光標識抗体Quenchbodyにおけるリンカー長の効果2011

    • 著者名/発表者名
      阿部亮二、伊原正喜、高木広明、芳坂貴弘、上田宏
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪)
    • 年月日
      2011-06-09
  • [学会発表] アンバーサプレッサーtRNAを用いた拡張飽和変異法の開発2011

    • 著者名/発表者名
      聖前直樹、渡邉貴嘉、峯浦稔也、芳坂貴弘
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪)
    • 年月日
      2011-06-09
  • [学会発表] 蛍光標識非天然アミノ酸を導入したレクチンの基質結合による蛍光変化2011

    • 著者名/発表者名
      伊藤康高、飯島一生、芳坂貴弘
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪)
    • 年月日
      2011-06-09
  • [学会発表] 長波長蛍光標識アミノ酸のタンパク質への部位特異的導入2011

    • 著者名/発表者名
      渡邉貴嘉、白神かおり、徳田安則、飯島一生、芳坂貴弘
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪)
    • 年月日
      2011-06-09
  • [学会発表] 開始コドンの拡張による非天然アミノ酸誘導体のタンパク質へのN末端特異的導入2011

    • 著者名/発表者名
      三浦将典、白神かおり、山口純、芳坂貴弘
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪)
    • 年月日
      2011-06-09
  • [学会発表] 蛍光標識非天然アミノ酸の導入によるマルトース結合タンパク質の基質結合に伴う蛍光変化2011

    • 著者名/発表者名
      飯島一生、芳坂貴弘
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪)
    • 年月日
      2011-06-09
  • [学会発表] 非天然アミノ酸のタンパク質への導入技術の開発とタンパク質の機能拡張への応用2011

    • 著者名/発表者名
      芳坂貴弘
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪)(招待講演)
    • 年月日
      2011-06-07
  • [備考]

    • URL

      http://www.jaist.ac.jp/ms/labs/hohsaka/

URL: 

公開日: 2013-06-26  

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