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2008 年度 実績報告書

π電子系の関与する生体エネルギー変換過程の理論とシミュレーション

計画研究

研究領域高次π空間の創発と機能開発
研究課題/領域番号 20108017
研究機関京都大学

研究代表者

安藤 耕司  京都大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (90281641)

キーワード電子移動 / プロトンポンプ / エネルギー変換 / 量子動力学 / 生体分子
研究概要

波束の中心と幅の自由度が可変であるようなガウス型電子波束を用いて化学結合を記述する新理論を開発した。これにより、電子と原子核をコンシステントに扱った大規模分子動力学シミュレーションを実現することを目標とする。プロトン移動反応や水素結合構造を記述するために近年開発してきた準量子的時間依存ハートリー法を拡張し、多電子波動関数の反対称性を取り入れるために、非直交原子価結合法のアイデアを活用した。非直交軌道に由来する計算コストの問題、すなわち、行列要素数が電子数の階乗で増大する問題を回避するために、新たに分離電子対近似と有効内殻擬ポテンシャルの開発を行った。分離電子対近似の検討の結果、核物理やプラズマ物理の分野で従来利用されてきたフェルミオン分子動力学法におけるパウリポテンシャルについて、より正確な理論的基礎付け及び改良の指針を得た。最初の応用として、水素化リチウムのポテンシャルエネルギー曲線に関する数値計算では、一電子当り浮動ガウス波束一個の最小基底であるにも関らず、電子相関効果を取り入れた高精度の非経験的分子軌道計算に遜色ない結果が得られた。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2009

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Semiquantal valence-bond wavepacket description of chemical bonding2009

    • 著者名/発表者名
      K. Ando
    • 雑誌名

      Bull. Chem. Soc. Jpn

      巻: Vol.823 ページ: 975-983

    • DOI

      DOI:10.1246/bcsj.82.975

    • 査読あり
  • [学会発表] Semiquantal Time-dependent Hartree Theory for Hydrogen Bonding and Transfers2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      The Horiba International Symposium on Simulations and Dynamics for Nanoscale and Biological Systems
    • 発表場所
      Semiquantal Time-dependent Hartree
    • 年月日
      2009-03-04
  • [学会発表] π電子系の関与する生体エネルギー変換過程の理論とシミュレーション2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      新学術領域研究「高次π空間の創発と機能開発」第1回公開シンポジウム
    • 発表場所
      東京国際交流館プラザ平成メディアホール
    • 年月日
      2009-02-01
  • [学会発表] 水素結合構造とプロトン移動反応の準量子的解析2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      計算科学研究センター・ワークショップ「次世代理論化学の新展開と超並列計算への挑戦」
    • 発表場所
      分子科学研究所岡崎コンファレンスセ
    • 年月日
      2009-01-09

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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