mRNA制御システムによる生殖細胞形成機構

2012 年度 研究成果報告書

• 研究領域: 多様性と非対称性を獲得するＲＮＡプログラム
• 研究課題/領域番号: 20112003
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 神戸大学
• 研究代表者: 井上 邦夫 神戸大学, 大学院・理学研究科, 教授 (40252415)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2012
• キーワード: 生殖細胞 / 生殖顆粒 / mRNA 制御 / miRNA / RNA 結合蛋白質 / TALEN 法

研究概要

ゼブラフィッシュ始原生殖細胞形成をモデル系とした解析を行い、数種の生殖質mRNA が体細胞でmiRNA による抑制制御を受けるのに対し、始原生殖細胞ではRNA 結合タンパク質DAZL がその抑制解除に働くことを示した。また、miRNA によるサイレンシング機構として、PABP に依存しない翻訳抑制機構の役割を示した。一方、生殖顆粒構成因子Gra タンパク質が翻訳開始因子eIF4E との結合を介して翻訳抑制を行う可能性を見出した。さらに、TALEN 法によって、いくつかのmRNA 制御因子の変異体系統を樹立した。

研究成果

• [雑誌論文] Characterization of the compact bicistronic microRNA precursor, miR-1/miR-133, expressed specifically in Ciona muscle tissues (2013)
  • 著者名/発表者名: Kusakabe, R., Tani, S., Nishitsuji, K., Shindo, M., Okamura, K., Miyamoto, Y., Nakai, K., Suzuki, Y., Kusakabe, T. G., and Inoue, K
  • 雑誌名: Gene Exp. Patterns 巻: 13 ページ: 43-50
  • 査読あり
• [雑誌論文] A specific set of exon junction complex subunits is required for the nuclear retention of unspliced RNAs in Caenorhabditis elegans (2013)
  • 著者名/発表者名: Shiimori, M., Inoue, K., and Sakamoto, H
  • 雑誌名: Mol. Cell. Biol 巻: 33 ページ: 444-456
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of MIWI-associated poly(A) RNAs by immunoprecipitation with an anti-MIWI monoclonal antibody (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishibu, T., Hayashida, Y., Tani, S., Kurono, S., Ukekawa, R., Kojima-Kita, K., Kurokawa, T., Kuramochi-Miyagawa, S., Nakano, T., Inoue, K., and Honda, S
  • 雑誌名: BioScience Trends 巻: 6 ページ: 248-261
  • 査読あり
• [雑誌論文] Translational inhibition by deadenylation-independent mechanisms is central to microRNA-mediated silencing in zebrafish (2012)
  • 著者名/発表者名: Mishima, Y., Fukao, A., Kishimoto, T., Sakamoto, H., Fujiwara, T., and Inoue, K
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 109 ページ: 1104-1109
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional and direct interaction between the RNA binding protein HuD and active Akt1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, T., Fukao, A., Sasano, Y., Matsuzaki, H., Kikkawa, U., Imataka, A., Inoue, K., Endo, S., Sonenberg, N. Thoma, C., and Sakamoto, H
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 40 ページ: 1944-1953
  • 査読あり
• [雑誌論文] Microtubule association of a neuronal RNA-binding protein HuD through its binding to the light chain of MAP1B (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, Y., Kasashima, K., Saito, K., Fukuda, M., Fukao, A., Sasano, Y., Inoue, K., Fujiwara, T., and Sakamoto, H
  • 雑誌名: Biochimie 巻: 93 ページ: 817-822
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic organization and embryonic expression of miR-430 in medaka (Oryzias latipes): insights into the post-transcriptional gene regulation in early development (2010)
  • 著者名/発表者名: Tani, S., Kusakabe, R., Naruse, K., Sakamoto, H., and Inoue, K
  • 雑誌名: Gene 巻: 449 ページ: 41-49
  • 査読あり
• [雑誌論文] DAZL relieves miRNA-mediated repression of germline mRNAs by controlling poly(A) tail length in zebrafish (2009)
  • 著者名/発表者名: Takeda, Y., Mishima, Y., Fujiwara, T., Sakamoto, H., and Inoue, K
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 4 ページ: e7513
  • 査読あり
• [雑誌論文] The ELAV protein HuD stimulates cap-dependent translation in a poly(A)- and eIF4A-dependent manner (2009)
  • 著者名/発表者名: Fukao, A., Sasano, Y., Imataka, H., Inoue, K., Sakamoto, H., Sonenberg, N., Thoma, C. and Fujiwara, T
  • 雑誌名: Mol. Cell 巻: 36 ページ: 1007-1017
  • 査読あり
• [雑誌論文] A useful approach to total analysis of RISC-associated RNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Hayashida, Y., Nishibu, T., Inoue, K., and Kurokawa, T
  • 雑誌名: BMC Research Notes 巻: 2 ページ: 169
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role and mechanism of U1-independent pre-mRNA splicing in the regulation of alternative splicing (2009)
  • 著者名/発表者名: Fukumura, K. and Inoue, K
  • 雑誌名: RNA Biol 巻: 6 ページ: 395-398
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel application of metabolomics in vertebrate development (2009)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, S., Akiyama, S., Tamaru, Y., Takeda, Y., Fujiwara, T., Inoue, K., Kobayashi, A., Maegawa, S., and Fukusaki, E
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 386 ページ: 268-272
  • 査読あり
• [雑誌論文] Localization of c-mos mRNA around the animal pole in the zebrafish oocyte with Zor-1/Zorba (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, H., Tsukahara, T., and Inoue, K
  • 雑誌名: BioScience Trends 巻: 3 ページ: 96-104
  • 査読あり
• [雑誌論文] U1-independent pre-mRNA splicing contributes to the regulation of alternative splicing (2009)
  • 著者名/発表者名: Fukumura, K., Taniguchi, I., Sakamoto, H., Ohno, M., and Inoue, K
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 37 ページ: 1907-1914
  • 査読あり
• [雑誌論文] R. Developmental expression and evolution of muscle-specific microRNAs conserved in vertebrates
  • 著者名/発表者名: Tani, S., Kuraku, S., Sakamoto, H., Inoue, K., and Kusakabe, R
  • 雑誌名: Evolution & Development 巻: (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] RNA regulation in zebrafish germ cell formation (2012)
  • 著者名/発表者名: Inoue, K
  • 学会等名: 2012 Taiwan-Japan Joint Symposium on cell signaling and gene regulation
  • 発表場所: 台南・台湾
  • 年月日: 20121100
• [学会発表] Molecular mechanisms and regulations of microRNA-mediated gene silencing inzebrafish (2011)
  • 著者名/発表者名: Mishima, Y., and Inoue, K
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会・ワークショップ
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 20111200
• [学会発表] Control of germline/somatic cell distinction by miRNA function in zebrafish (2010)
  • 著者名/発表者名: Inoue, K
  • 学会等名: A satellite symposium on Germ Cells in SDB-JSDB Joint Meeting 2010
  • 発表場所: New Mexico.America
  • 年月日: 20100800
• [学会発表] U1-independent splicing and the splicing regulation (2009)
  • 著者名/発表者名: Inoue, K
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会 ワークショップ「多様性を生むRNAプログラム」
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-09
• [学会発表] Control of germline/somatic cell distinctions by miRNA function (2009)
  • 著者名/発表者名: Inoue, K
  • 学会等名: The NIBB International Practical course "Developmental Genetics of zebrafish and medaka"
  • 発表場所: 基生研
  • 年月日: 2009-01-29
• [学会発表] U1-independent pre-mRNA splicing contributes to the regulationof alternative splicing (2008)
  • 著者名/発表者名: Inoue, K
  • 学会等名: 国際シンポジウム "The expanding world of post-transcriptional regulation of gene expression"
  • 発表場所: 東京医科歯科大学
  • 年月日: 2008-12-13
• [備考]
  • URL: http://www.research.kobe-u.ac.jp/fsci-r na/
• [備考]
  • URL: http://www.org.kobe-u.ac.jp/rna/