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2010 年度 実績報告書

mRNA3'末端プロセシングを標的とした遺伝子発現調節・RNA品質管理機構の解明

計画研究

研究領域多様性と非対称性を獲得するRNAプログラム
研究課題/領域番号 20112005
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

星野 真一  名古屋市立大学, 大学院・薬学研究科, 教授 (40219168)

研究分担者 廣瀬 哲郎  独立行政法人産業技術総合研究所, バイオメディシナル情報研究センター, 研究チーム長 (30273220)
キーワード脊髄小脳変性症 / デアデニレーション / mRNA分解 / ストレス顆粒 / U7 snRNA / ヒストン / ノンコーディングRNA
研究概要

mRNA 3'末端プロセシングを標的とした遺伝子発現調節とRNA品質管理機構の解明を目的として、本研究においては特に次の5つの課題、(1)mRNA3'非翻訳領域に存在するシス因子による遺伝子特異的なポリ(A)鎖分解調節、(2)miRNAをはじめとする機能性RNAによるポリ(A)鎖分解のトランス活性化調節、(3)細胞質ポリ(A)鎖伸長による選択的遺伝子発現調節、(4)ストレスによるグローバルなポリ(A)鎖分解調節、および(5)非標準的ポリA鎖付加酵素によるRNA品質管理・遺伝子発現制御、を研究対象としているか、そのなかで本年度はとくに(1)、(2)、(4)について解析を行った。(1)についてはシス因子UREをもつクルタミン酸受容体GluR2 mRNAの発現調節について解析し、CPEB3がCaflをmRNA上にリクルートすることでポリA鎖分解を促進し遺伝子発現を負に制御することを明らかにした(EMBO J in Press)。また、昨年度よりCPEBについても解析を行い、癌遺伝子c-mycのmRNAの3'UTRに存在するCPEに対し、やはりCPEBがCaf1をリクルートすることでc-mycの発現を負に制御していることを見出した。また、(2)については、本領域の公募班員(脇山班員)との共同研究によりTNRC6とCaf1 deadenylaseおよび癌抑制遺伝子産物Tobとの相互作用について検計をおこたったが、予測された結合は観察されなかった。一方、(4)のストレス時におけるmRNA代謝制御の課題においては、mRMAの安定化保持に関わると考えられるストレス顆粒の形成が、Ataxin-2とUsp10という2つのPAM2モチーフ含有因子によって制御されていることを明らかにし、PAM2の結合相手であるPABPもまたストレス顆粒の形成にかかわることを見出した。また、両者は同じPAM2モチーフ含有因子であろが、Ataxin-2かmRNAの不溶化凝集を促進することでストレス顆粒の形成にかかわるのに対して、Usp10の作用点は異なることも明らかにした。
研究分担者は、U7 snRNPの新規構成因子としてhnRNP UL1を同定し、この因子が前年度までに発見していたU7 snRNPの新規機能であるヒストン遺伝子転写抑制能を担う因子であることを示した。また核内ncRNA依存的なパラスペックル構造体の形成が、長鎖ncRNAの選択的3'末端形成機構によって支配されていることを見出し、その一部の機構を解明した。

  • 研究成果

    (46件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (11件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (33件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Anti-proliferative protein Tob negatively regulates CPEB3 target by recruiting Cafl deadenylase.2011

    • 著者名/発表者名
      Hosoda, N., Funakoshi, Y., Hirasawa, M., Yamagishi, R., Asano, Y., Miyagawa, R., Ogami, K., Tsujimoto, M., Hoshino, S.
    • 雑誌名

      EMBO J

      巻: 30 ページ: 1311-1323

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Paraspeckles are subpopulation-specific nuclear bodies that are not essential in mice.2011

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa, S., Naganuma, T., Shioi, G., Hirose, T.
    • 雑誌名

      Journal of Cell Biology

      巻: 193 ページ: 31-39

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Architectural roles of long noncoding RNAs in the intranuclear formation of functional paraspeckles.2011

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, T., Hirose, T.
    • 雑誌名

      Frontier in Bioscience

      巻: (印刷中)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gas5 gene.version 2.2011

    • 著者名/発表者名
      Hirose, T.
    • 雑誌名

      Encyclopedia on Human Genome.

      ページ: e1-e5

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 核内構造体形成を司る長鎖ncRNA2011

    • 著者名/発表者名
      長沼孝雄、廣瀬哲郎
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: (印刷中)

  • [雑誌論文] Quantitative characterization of TOB interactions provides the thermodynamic basis for translation termination-coupled deadenylase regulation.2010

    • 著者名/発表者名
      Ruan, L., Osawa, M., Hosoda, N., Imai, S., Machiyama, A., Katada, T., Hoshino, S., Shimada I.
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 285 ページ: 27624-27631

    • 査読あり
  • [雑誌論文] mRNA分解研究と創薬2010

    • 著者名/発表者名
      尾上耕一、星野真一
    • 雑誌名

      日本薬理学雑誌(Folia Pharmacol.Jpn.)

      巻: 136 ページ: 150-154

  • [雑誌論文] Thymus-specific noncoding RNA, Thy-ncR1, is a cytoplasmic riboregulator that facilitates hUPF1-dependent degradation of MFAP4 mRNA in specific T-cell leukemia cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Aoki, K., Harashima, A., Sano, M.Yokoi, T., Nakamura, S., Kibata, M.Hirose, T.
    • 雑誌名

      BMC Molecular Biology

      巻: 11 ページ: 99

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 明らかになってきたエピゲノム制御におけるRNAの役割2010

    • 著者名/発表者名
      廣瀬哲郎
    • 雑誌名

      医学のあゆみ

      巻: 235 ページ: 1013-1018

  • [雑誌論文] non-coding RNAから機能性RNAへ:医療応用への新たな展開2010

    • 著者名/発表者名
      廣瀬哲郎
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 28 ページ: 164-170

  • [雑誌論文] ノンコーディングRNAの機能単位2010

    • 著者名/発表者名
      長沼孝雄、廣瀬哲郎
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 28 ページ: 30-36

  • [学会発表] 癌抑制遺伝子産物Tobは癌原遺伝子c-mycの発現を負に制御する2011

    • 著者名/発表者名
      尾上耕一、細田直、船越祐司、星野真一
    • 学会等名
      第131回薬学会年会
    • 発表場所
      静岡
    • 年月日
      2011-03-31
  • [学会発表] カスパーゼによる翻訳終結因子eRF3の分解と翻訳抑制2011

    • 著者名/発表者名
      橋本芳史、細田直、星野真一
    • 学会等名
      第131回薬学会年会
    • 発表場所
      静岡
    • 年月日
      2011-03-30
  • [学会発表] Noncoding RNAとタンパク質の特異的相互作用による核内構造体形成過程2010

    • 著者名/発表者名
      廣瀬哲郎
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会 ワークショップ
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2010-12-08
  • [学会発表] Rapid protein production of immunomodulatory chemokine, RANTES, in a multifunctional T cell subset, Tchreg, is coupled with 3'-UTR-mediated mRNA stabilization.2010

    • 著者名/発表者名
      原島哲、虎谷輝政、鈴木元幸、山本真由子、廣瀬哲郎、山崎文之、中村修二、木畑正義
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] 核内構造構築に必要なnoncoding RNAの選択的3'末端プロセシングの分子機構2010

    • 著者名/発表者名
      長沼孝雄、中川真一、青木一真、五島直樹、佐々木保典、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] 核内パラスペックルに局在するクロマチン再構築因子の解析2010

    • 著者名/発表者名
      川口哲哉、長沼孝雄、佐々木保典、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] パラスペックル構造体を介して制御される核内繋留mRNAの解析2010

    • 著者名/発表者名
      谷川明恵、横井崇秀、佐々木保典、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] エクソソームによって分解される二次構造保存ゲノムシンテニー領域由来非コードRNA群の解析2010

    • 著者名/発表者名
      迫田絵里、光山統泰、浅井潔、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] U7 snRNP新規構成タンパク質によるヒストン遺伝子の転写抑制機構2010

    • 著者名/発表者名
      井手上賢、足達俊吾、夏目徹、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] Emerging functions of "modern" and "classical" noncoding RNAs in mammalian cells2010

    • 著者名/発表者名
      Tetsuro Hirose
    • 学会等名
      4th International Symposium on Nanomedicine (ISNM2010)
    • 発表場所
      岡崎コンフェレンスセンター
    • 年月日
      2010-12-01
  • [学会発表] 癌抑制遺伝子産物TobにおよるmRNA分解開始調節の分子メカニズム2010

    • 著者名/発表者名
      星野真一
    • 学会等名
      GCOE特別セミナー
    • 発表場所
      東京大学医科学研究所
    • 年月日
      2010-11-16
  • [学会発表] 核内パラスペックルに局在するクロマチン再構築因子の解析2010

    • 著者名/発表者名
      川口哲哉、長沼孝雄、佐々木保典、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      RNAフロンティアミーティング2010
    • 発表場所
      裾野市
    • 年月日
      2010-09-27
  • [学会発表] How do "Architectural" Noncoding RNAs act in nuclear body construction?2010

    • 著者名/発表者名
      Tetsuro Hirose
    • 学会等名
      RiboClub Annual Meeting 2010
    • 発表場所
      Sherbrooke, Canada
    • 年月日
      2010-09-21
  • [学会発表] Anti-proliferative protein Tob negatively regulates CPEB3 target by recruiting Cafl deadenylase.2010

    • 著者名/発表者名
      Hosoda N, Funakoshi Y, Yamagishi R, Ogami K, Hoshino S
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Meeting "Translational control"
    • 発表場所
      New York, USA
    • 年月日
      2010-09-14
  • [学会発表] ゲノムから生み出される非コードRNA群の機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      廣瀬哲郎
    • 学会等名
      第22回高遠シンポジウム
    • 発表場所
      高遠市
    • 年月日
      2010-08-20
  • [学会発表] Emerging roles of noncoding RNAs that diversify genomic functions2010

    • 著者名/発表者名
      Tetsuro Hirose
    • 学会等名
      International symposium on biodiversity sciences 2010
    • 発表場所
      名古屋市
    • 年月日
      2010-08-02
  • [学会発表] Emerging roles of long noncoding RNAs in gene expression and intracellular organization2010

    • 著者名/発表者名
      Tetsuro Hirose
    • 学会等名
      CBRC2010
    • 発表場所
      東京都
    • 年月日
      2010-07-30
  • [学会発表] RNAのプロセシングと品質管理(オーバービュー)2010

    • 著者名/発表者名
      星野真一
    • 学会等名
      第12回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-07-28
  • [学会発表] アポトーシス時における翻訳終結因子eRF3を標的とした翻訳制御2010

    • 著者名/発表者名
      橋本芳史、細田直、星野真一
    • 学会等名
      第12回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-07-28
  • [学会発表] 癌癌抑制遺伝子産物TobはRas-MAPKシグナルの下流でc-myc mRNAの安定性を直接制御する2010

    • 著者名/発表者名
      尾上耕一、細田直、船越祐司、星野真一
    • 学会等名
      第12回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-07-28
  • [学会発表] 脊髄小脳変性症の原因遺伝子Ataxin-2がストレス顆粒形成に果たす役割2010

    • 著者名/発表者名
      成瀬 貴文、的場 洋子、細田 直、星野真一
    • 学会等名
      第12回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-07-27
  • [学会発表] U7 snRNP新規構成タンパク質によるDNA複製阻害に応答したヒストン遺伝子転写抑制機構2010

    • 著者名/発表者名
      井手上賢、足達俊吾、夏目徹、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東京都
    • 年月日
      2010-07-27
  • [学会発表] 核内構造体noncoding RNAの選択的プロセシング制御機構2010

    • 著者名/発表者名
      長沼孝雄、中川真一、青木一真、五島直樹、佐々木保典、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東京都
    • 年月日
      2010-07-27
  • [学会発表] パラスペックル構造体によって制御される核内繋留mRNAの解析2010

    • 著者名/発表者名
      谷川明恵、横井崇秀、佐々木保典、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東京都
    • 年月日
      2010-07-27
  • [学会発表] 核内パラスペックルに局在するクロマチンリモデリング因子の解析2010

    • 著者名/発表者名
      川口哲哉、佐々木保典、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東京都
    • 年月日
      2010-07-27
  • [学会発表] 胸腺特異的ncRNA Thy-ncR1によるMFAP4 mRNAの新規安定化制御2010

    • 著者名/発表者名
      青木一真、佐野美穂、原島哲、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東京都
    • 年月日
      2010-07-27
  • [学会発表] 酵母プリオン[Psi+]の表現型解析から見出した翻訳終結因子eRF3の新規機能2010

    • 著者名/発表者名
      岡本淳志、細田直、星野真一
    • 学会等名
      第56回日本薬学会東海支部大会
    • 発表場所
      岐阜
    • 年月日
      2010-07-03
  • [学会発表] No go decay(NGD(によるmRNA品質管理機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      成瀬貴文、的場洋子、細田直、星野真一
    • 学会等名
      第56回日本薬学会東海支部大会
    • 発表場所
      岐阜
    • 年月日
      2010-07-03
  • [学会発表] Alternative 3' end processing of long noncoding RNAs is the underlyingregulatory mechanism of nuclear paraspeckle organization.2010

    • 著者名/発表者名
      Takao Naganuma, Shinichi Nakagawa, Naoki Goshima, Yasnori Sasaki, Tetsuro Hirose
    • 学会等名
      15th annual meeting of the RNA society
    • 発表場所
      Seattle, USA
    • 年月日
      2010-05-26
  • [学会発表] Novel function of U7 snRNA in transcriptional repression of histone gene upon DNA replication arrest2010

    • 著者名/発表者名
      Takashi Ideue, Tetsuro Hirose
    • 学会等名
      第19回CDBミーティング
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2010-05-12
  • [学会発表] Roles of Noncoding RNAs in Formation and Function of Nuclear Paraspeckles2010

    • 著者名/発表者名
      Takao Naganuma, Shinichi Nakagawa, Naoki Goshima, Yasnori Sasaki, Tetsuro Hirose
    • 学会等名
      第19回CDBミーティング
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2010-05-12
  • [学会発表] 機能性RNAの生体機能を利用した新しい創薬基盤の開拓2010

    • 著者名/発表者名
      廣瀬哲郎
    • 学会等名
      産総研ライフサイエンス分野シンポジウム
    • 発表場所
      東京都
    • 年月日
      2010-04-16
  • [学会発表] 長鎖noncoding RNAの新機能と疾患との接点の探索2010

    • 著者名/発表者名
      廣瀬哲郎
    • 学会等名
      第307回CBI学会研究講演会
    • 発表場所
      東京都
    • 年月日
      2010-04-12
  • [図書] 目的別で選べる基本の核酸実験法2011

    • 著者名/発表者名
      井手上賢、廣瀬哲郎
    • 出版者
      培養細胞からの核酸抽出法(印刷中)
  • [図書] RNA technologies & Their applicatios2010

    • 著者名/発表者名
      Hirose, T.
    • 総ページ数
      23
    • 出版者
      Emerging roles of noncoding RNAs in subcellular architecture and gene expression.

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公開日: 2012-07-19  

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