核と細胞質間のRNA分配制御

2012 年度 研究成果報告書

• 研究領域: 多様性と非対称性を獲得するＲＮＡプログラム
• 研究課題/領域番号: 20112007
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 大野 睦人 京都大学, ウイルス研究所, 教授 (80201979)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2012
• キーワード: RNA / 輸送 / 核 / 細胞質 / 識別

研究概要

我々は、hnRNP Cの四量体が"分子ものさし"となってRNAの長さを測り、RNAポリメラーゼIIの転写産物をその長さに応じてmRNAとU snRNAに分類することを明らかにした。また、哺乳類のmRNA前駆体の核内保持に関わる因子を複数同定した。他に、RNA核外輸送についてのいくつかの新規知見を得た。

研究成果

• [雑誌論文] hDbr1 is a nucleocytoplasmic shuttling protein with a protein phosphatase-like motif essential for debranching activity (2013)
  • 著者名/発表者名: Kataoka, N. Hagiwara, M. and Ohno, M
  • 雑誌名: Sci. Rep 巻: 3-1090 ページ: 1090(オンライン番号)
  • DOI: doi:10.1038/srep01090
  • 査読あり
• [雑誌論文] Size matters in RNA export (2012)
  • 著者名/発表者名: Ohno, M
  • 雑誌名: RNA Biology 巻: 9(12) ページ: 1-5
  • DOI: doi:10.4161/rna.22569
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mechanistic insights into human pre-mRNA splicing of human ultra-short introns: potential unusual mechanism identifies G-rich introns (2012)
  • 著者名/発表者名: Sasaki-Haraguchi N, Shimada MK, Taniguchi I, Ohno M, Mayeda A
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 423(2) ページ: 289-94
  • DOI: doi:10.1016/j.bbrc.2012.05.112
  • 査読あり
• [雑誌論文] 40S subunit dissociation and proteasome-dependent RNA degradation in nonfunctional 25S rRNA decay (2012)
  • 著者名/発表者名: Fujii,K., Sakata,T., Kitabatake,M. and Ohno, M
  • 雑誌名: The EMBO Journa 巻: 31 ページ: 2579-2589
  • DOI: doi:10.1038/emboj.2012.85
  • 査読あり
• [雑誌論文] HnRNP C tetramer measures RNA length to classify RNA polymerase II transcripts for export (2012)
  • 著者名/発表者名: McCloskey,A. Taniguchi,I,. Shinmyozu, K, and Ohno, M
  • 雑誌名: Science 巻: 30 ページ: 1643-1646
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multiple factors in the early splicing complex are involved in the nuclear retention of pre-mRNAs in mammalian cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Takemura,R., Takeiwa,T,. McCloskey, A.,Taniguchi,I. and Ohno, M
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 16(10) ページ: 1035-49
  • DOI: DOI:10.1111/j.1365-2443.2011.01548
  • 査読あり
• [雑誌論文] Specific Y14 domains mediate its nucleo- cytoplasmic shuttling and association with spliced mRNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Kataoka, N., Diem, M. D., Yoshida, M., Hatai, C., Dobashi, I., Dreyfuss, G., Hagiwara, M. and Ohno, M
  • 雑誌名: Sci. Rep 巻: 1 ページ: 92
  • DOI: DOI:10.1038/srep00092
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cajal body surveillance of U snRNA export complex assembly (2010)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., Izumi, H. and Ohno, M
  • 雑誌名: J. Cell Biol 巻: 190 ページ: 603-612
  • DOI: doi:10.1083/jcb.201004109
  • 査読あり
• [雑誌論文] A role for ubiquitin in the clearance of nonfunctional rRNAs (2009)
  • 著者名/発表者名: Fujii, K., Sakata, T.,Kitabatake, M. and Ohno, M
  • 雑誌名: Genes Dev 巻: 23 ページ: 963-74
  • DOI: doi:10.1101/gad.1775609
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional association of the microprocessor complex with the spliceosome (2009)
  • 著者名/発表者名: Kataoka, N., Fujita, M. and Ohno, M
  • 雑誌名: Mol. Cell. Biol 巻: 29 ページ: 3243-54
  • DOI: doi:10.1128/MCB.00360-09
  • 査読あり
• [雑誌論文] U1-independent pre-mRNA splicing contributes to the regulation of alternative Splicing (2009)
  • 著者名/発表者名: Fukumura,K,. Taniguchi, I,. Sakamoto, H,. Ohno, M and Inoue,I
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: Vol.37, No.6 ページ: 1907-1914
  • DOI: doi:10.1093/nar/gkp050
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterization of postsplicing lariat-intron complexes (2009)
  • 著者名/発表者名: Yoshimoto, R., Kataoka, N., Okawa, K. and Ohno,M
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 37 ページ: 891-902
  • DOI: doi:10.1093/nar/gkn1002
  • 査読あり
• [雑誌論文] Immunoprecipitation analysis to study RNA-protein interactions in Xenopus oocytes (2008)
  • 著者名/発表者名: Mabuchi, N., Masuyama, K. and Ohno, M
  • 雑誌名: Methods Mol. Biol 巻: 488 ページ: 257-65
  • DOI: doi:10.1007/978-1-60327-475-3_18
  • 査読あり
• [雑誌論文] ATP- dependent recruitment of export factor Aly/REF onto intronless mRNAs by RNA helicase UAP56 (2008)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi,I. and Ohno,M
  • 雑誌名: Mol. Cell. Biol 巻: 28 ページ: 601-8
  • DOI: PMID:17984224
  • 査読あり
• [雑誌論文] A compartmentalized phosphorylation/ dephosphorylation system that regulates U snRNA export from the nucleu (2008)
  • 著者名/発表者名: Kitao, S., Segref, A., Kast, J., Wilm, M., Mattaj, I, W. and Ohno, M
  • 雑誌名: Mol. Cell. Biol 巻: 28 ページ: 487-97
  • DOI: PMID:17967890
  • 査読あり
• [学会発表] Classical low-throughput analyses on RNA export from the nucleus (2013)
  • 著者名/発表者名: Ohno,M
  • 学会等名: 第2回 RNA and Biofunctions- ASIA Study
  • 発表場所: Hotel Leopalace Hakata. Japan
  • 年月日: 2013-01-10
• [学会発表] Nuclear RNA Binding Protein hnRNP C Measures the Length of RNA Polymerase II Transcripts and Sorts them into two RNA Categories for Nuclear Export (2012)
  • 著者名/発表者名: Ohno,M
  • 学会等名: 第19回東アジアシンポジウム
  • 発表場所: Hoam Faculty House. Seoul. South Korea
  • 年月日: 20120822-24
• [学会発表] 40S subunit dissociation and proteasome-dependent RNA degradation in nonfunctional 25S rRNA decay (2012)
  • 著者名/発表者名: Kitabatake,M
  • 学会等名: The 22nd CDB Meeting
  • 発表場所: RIKEN Center for Developmental biology. Kobe. Japan
  • 年月日: 20120611-13
• [学会発表] 40S subunit dissociation and proteasome-dependent RNA degradation in nonfunctional 25S rRNA decay (2012)
  • 著者名/発表者名: Kitabatake,M
  • 学会等名: RNA 2012 Sixteenth Annual Meeting of the RNA Society
  • 発表場所: University of Michigan. Detroit. USA
  • 年月日: 20120329-0603
• [学会発表] HnRNP C tetramer measures RNA length to classify RNA polymerase II transcripts for export (2012)
  • 著者名/発表者名: McCloskey,A
  • 学会等名: The 10th International Student
  • 発表場所: Shiran Kaikan, Inamori Hall. Kyoto. Japan
  • 年月日: 20120329-0603
• [学会発表] A novel activity of HIV-1 Rev protein to remodel export RNPs in directing virus-specific RNA export. Cerevisiae (2011)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi,I
  • 学会等名: 2011 RNA meeting
  • 発表場所: kyoto International Coference Cente. kyoto Japan
  • 年月日: 20110614-19
• [学会発表] In vivo reversal of a UV-induced lesion on mouse 28S rRNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyata,A
  • 学会等名: 2011 RNA meeting
  • 発表場所: kyoto International Coference Cente. kyoto Japan
  • 年月日: 20110614-19
• [学会発表] HnRNPC1/C2 tetramer measures RNA length to ensure the proper nuclear export of messenger RNAs (2011)
  • 著者名/発表者名: McCloskey,A
  • 学会等名: 2011 RNA meeting
  • 発表場所: kyoto International Coference Cente. kyoto Japan
  • 年月日: 20110614-19
• [学会発表] Functional Decay of Nonfunctional 25S rRNA Requires Proteasome Activity (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujii,K
  • 学会等名: The 9th International Student Seminar.Kyoto
  • 発表場所: Shiran Kaikan, Inamori Hall. kyoto Japan
  • 年月日: 20110307-09
• [学会発表] HnRNPC1/C2 tetramer measures RNA length prior to RNA export from the nucleus (2010)
  • 著者名/発表者名: McCloskey,A
  • 学会等名: 15th annual Meeting of the RNA Society
  • 発表場所: University of Washington. Seattle USA
  • 年月日: 20100622-26
• [学会発表] A mechanism to measure RNA length prior to RNA export from the nucleus (2010)
  • 著者名/発表者名: Ohno,M
  • 学会等名: 19th CDB Meeting.May 10-12, 2010
  • 発表場所: RIKEN Center for Developmental biology. kobe Japan
  • 年月日: 20100510-12
• [学会発表] Selective Degradation of Nonfunctional Ribosomal RNAs Mediated by the Ubiquitin-proteasome System (2010)
  • 著者名/発表者名: Kitabatake,M
  • 学会等名: 19th CDB Meeting
  • 発表場所: RIKEN Center for Developmental biology. kobe Japan
  • 年月日: 20100510-12
• [学会発表] Analysis of cis- and trans- acting Elements for Nuclear Pre-mRNA Retention (2010)
  • 著者名/発表者名: Takeiwa,T
  • 学会等名: The 8th International Student Seminar
  • 発表場所: kyoto, Shiran Kaikan, Inamori Hall. kyoto Japan
  • 年月日: 20100303-06
• [学会発表] Functional Decay of Nonfunctional 25S rRNA Requires Proteasome Activity (2009)
  • 著者名/発表者名: Fujii,K
  • 学会等名: The 16th East Asia Joint Conference on Biomedical Research
  • 発表場所: Shiran Kaikai. Kyoto Japan
  • 年月日: 20090913-14
• [学会発表] A role for ubiquitin in the clearance of nonfunctional rRNAs (2009)
  • 著者名/発表者名: Kitabatake,M
  • 学会等名: 14th annual Meeting of the RNA Society
  • 発表場所: University of Wisconsin campus. USA
  • 年月日: 20090526-31
• [学会発表] Regulations of nucleo- cytoplasmic RNA distribution (2008)
  • 著者名/発表者名: Ohno,M
  • 学会等名: NAIST Global COE Symposium on Cell Signaling
  • 発表場所: Nara Institute of Science and Technology. Nara Japan
  • 年月日: 20081113-14