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2010 年度 実績報告書

細胞核の機能的複合体の構造と動作メカニズム

計画研究

研究領域遺伝情報収納・発現・継承の時空間場
研究課題/領域番号 20114005
研究機関早稲田大学

研究代表者

胡桃坂 仁志  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (80300870)

キーワードゲノム再編・発現・維持 / 遺伝子及び染色体 / タンパク質と酵素 / 生体分子立体構造解析及び予測 / 構造生物学 / X線結晶解析
研究概要

クロマチンは染色体の基盤構造であり、遺伝子発現、DNA複製、DNA組換え、DNA修復などにおいて重要な働きを担っている。特に、染色体の特定領域の核内配置や、局所的・過渡的な構造の変動などが、DNA代謝の調節に重要な役割を果たしていることが近年明らかになってきた。本研究では、遺伝情報収納・発現・継承のための「場」の実体として、局所的・過渡的な染色体の核内配置やダイナミクスを考え、それらを制御する核内の"機能的複合体"の動作メカニズムを生化学的および構造生物学的手法により解明することを目的とする。このような研究を通して、遺伝子の収納・発現・継承の分子基盤を明らかにする。本年度では、クロマチンの最小構造ユニットであるヌクレオソームを、リコンビナントヒストンによって再構成することに成功した。本ヌクレオソーム再構成系を用いて、種々のヒストンバリアントやヒストンの化学修飾をミミックした変異体を含んだヌクレオソームを再構成し、ヌクレオソームの結晶化を蒸気拡散法によって行った。その際、本年度に購入した、タンパク質結晶化用液体ハンドリングシステムおよび光散乱分光光度計を使用した。そして、種々のヒストンバリアントやヒストンの化学修飾をミミックした変異体を含むヌクレオソームの単結晶を得ることができた。これらのヌクレオソーム結晶を用いて、X線回折データを得た。高分解能でのデータは、SPring8放射光施設を利用して収集した。そして、ヒト精巣特異的に存在するヒストンH3バリアントである、H3Tを含むヌクレオソームの立体構造決定に成功した。加えて、H3Tヌクレオソームが、通常のヌクレオソームと比較して非常に壊れやすい性質であることを明らかにした。これらの解析によって、精巣での染色体基盤構造の形成および機能発現機構の解明に重要な知見を与えることができた。

  • 研究成果

    (51件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (41件)

  • [雑誌論文] Structural and biochemical analyses of the human PAD4 variant encoded by a functional haplotype gene2011

    • 著者名/発表者名
      Naoki Horikoshi, et al.
    • 雑誌名

      Acta Cryst.D

      巻: 67 ページ: 112-118

    • 査読あり
  • [雑誌論文] KIAA1018/FAN1 nuclease protects cells against genomic instability induced by interstrand cross-linking agents2010

    • 著者名/発表者名
      Kazunori Yoshikiyo, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA

      巻: 107 ページ: 21553-21557

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of instability of the nucleosome containing a testis-specific histone variant, human H3T2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Tachiwana, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA

      巻: 107 ページ: 10454-10459

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deimination stabilizes histone H2A/H2B dimers as revealed by electrospray ionization mass spectrometry2010

    • 著者名/発表者名
      Shingo Shimoyama, et al.
    • 雑誌名

      J.Mass Spectrom.

      巻: 45 ページ: 900-908

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nucleosome formation activity of human sNASP2010

    • 著者名/発表者名
      Akihisa Osakabe, et al.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 285 ページ: 11913-11921

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Single-stranded DNA catenation mediated by human EVL and a type I topoisomerase2010

    • 著者名/発表者名
      Motoki Takaku, et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 38 ページ: 7579-7586

    • 査読あり
  • [雑誌論文] GEMIN2 promotes accumulation of RAD51 at double-strand breaks in homologous recombination2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshimasa Takizawa, et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 38 ページ: 5059-5074

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The putative nuclear localization signal of the human RAD52 protein is a potential sumoylation site2010

    • 著者名/発表者名
      Kengo Saito, et al.
    • 雑誌名

      J.Biochem.

      巻: 147 ページ: 833-842

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Holliday junction binding activity of human SPF452010

    • 著者名/発表者名
      Naoki Horikoshi, et al.
    • 雑誌名

      Genes Cells

      巻: 5 ページ: 373-383

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 発がん防御に重要な相同組換えの分子機構2010

    • 著者名/発表者名
      齋藤健吾, 他
    • 雑誌名

      最新医学

      巻: 65 ページ: 1318-1330

    • 査読あり
  • [学会発表] Atomic Resolution Structures of the Human Nucleosomes Containing Histone Variants2011

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Kurumizaka
    • 学会等名
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      Awaji, Japan(招待講演)
    • 年月日
      2011-01-25
  • [学会発表] Roles of the N-terminal and C-terminal domains of the Rad52 protein in homologous recombination repair2011

    • 著者名/発表者名
      Wataru Kagawa, et al.
    • 学会等名
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      Awaji, Japan
    • 年月日
      2011-01-25
  • [学会発表] Biochemical and cell biological analyses of a novel histone interacting factor, SPT22011

    • 著者名/発表者名
      Akihisa Osakabe, et al.
    • 学会等名
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      Awaji, Japan
    • 年月日
      2011-01-24
  • [学会発表] Functional analyses of the Fanconi anemia protein, FANCD22011

    • 著者名/発表者名
      Koichi Sato, et al.
    • 学会等名
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      Awaji, Japan
    • 年月日
      2011-01-24
  • [学会発表] The Crystal STructure of Centromere Specific Nucleosome2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Tachiwana, et al.
    • 学会等名
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      Awaji, Japan
    • 年月日
      2011-01-24
  • [学会発表] A novel homologous recomination factor, human EVL forms single-stranded DNA catemers with a type I topoisomerase2011

    • 著者名/発表者名
      Motoki Takaku, et al.
    • 学会等名
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      Awaji, Japan
    • 年月日
      2011-01-24
  • [学会発表] Regulation of Radiation-induced focus formation by SUMOylation2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Shima, et al.
    • 学会等名
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      Awaji, Japan
    • 年月日
      2011-01-24
  • [学会発表] C-terminal Tail of Histone H2AX Reduces Intra-nucleosome Array Interaction2011

    • 著者名/発表者名
      Noriyuki Suka, et al.
    • 学会等名
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      Awaji, Japan
    • 年月日
      2011-01-24
  • [学会発表] Monitoring Histone Modifications in Single Cells using FabLEM (Fab-based Live Endogenous Modification Labeling)2011

    • 著者名/発表者名
      Yoko Hayashi-Takanaka, et al.
    • 学会等名
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      Awaji, Japan
    • 年月日
      2011-01-24
  • [学会発表] SLX4 links the Fanconi anemia pathway to structure-specific endonucleases, SLX1, XPF and MUS81 in interstrand crosslink repair2011

    • 著者名/発表者名
      Kimiyo N.Yamamoto, et al.
    • 学会等名
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      Awaji, Japan
    • 年月日
      2011-01-24
  • [学会発表] H2A.Bbdを含むヌクレオソームの生化学的解析2011

    • 著者名/発表者名
      有村泰宏, 他
    • 学会等名
      第28回染色体ワークショップ
    • 発表場所
      加賀
    • 年月日
      2011-01-12
  • [学会発表] ヒストンH3バリアントCENP-Aを含むヌクレオソームのX線結晶構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      立和名博昭, 他
    • 学会等名
      第28回染色体ワークショップ
    • 発表場所
      加賀
    • 年月日
      2011-01-12
  • [学会発表] 出芽酵母Rad51によるD-loop形成促進のためのRad52第二DNA結合部位の機能2011

    • 著者名/発表者名
      新井直人, 他
    • 学会等名
      第28回染色体ワークショップ
    • 発表場所
      加賀
    • 年月日
      2011-01-12
  • [学会発表] 新規ヒストン結合因子ヒトSPT2のDNA損傷修復における機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      越坂部晃永, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-10
  • [学会発表] セントロメア領域に特異的なヌクレオソームのX線結晶構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      立和名博昭, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-10
  • [学会発表] NMRによるヒストンヌクレオソームコアの立体構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      森脇義仁, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-09
  • [学会発表] 質量分析を用いたヒストンH2A-H2Bのシトルリン化の解析2010

    • 著者名/発表者名
      浅野裕輝, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-09
  • [学会発表] CENP-Aターゲッティングドメインを含むH3変異体が形成するヌクレオソームのX線結晶構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      志賀達也, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-09
  • [学会発表] ファンコニ貧血原因遺伝子産物FANCD2およびFANCIの複合体形成と機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      佐藤浩一, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-09
  • [学会発表] Chd2 interacts with H3.3 to determine cell fate in myogenesis2010

    • 著者名/発表者名
      Akihito Harada, et al.
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-09
  • [学会発表] DNA結合活性を有するCCANタンパク質群の機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      竹内康造, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-09
  • [学会発表] 酵母とヒトDNA修復タンパク質Rad52の機能ドメイン解析2010

    • 著者名/発表者名
      香川亘, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-08
  • [学会発表] ヒストンバリアントを含むヌクレオソームの構造多様性と機能2010

    • 著者名/発表者名
      胡桃坂仁志, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸(招待講演)
    • 年月日
      2010-12-08
  • [学会発表] 生細胞におけるメチル化およびアセチル化修飾ヒストンの可視化2010

    • 著者名/発表者名
      林陽子, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] RAD51によるparanemic joint molecule形成過程へのtopoisomerase III αの役割2010

    • 著者名/発表者名
      高久誉大, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] 新規RAD51組換え活性制御化合物の同定とその作用機序2010

    • 著者名/発表者名
      石田恭子, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] PSFによるDNA組換え酵素DMC1の活性化2010

    • 著者名/発表者名
      両角佑一, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] 出芽酵母Rad52の第二DNA結合部位も相同組換えに必要である2010

    • 著者名/発表者名
      新井直人, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] DNA修復タンパク質RAD52の翻訳後修飾による機能制御機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      齋藤健吾, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] ヌクレオソームの立体構造からみたエピジェネティクスの分子機構2010

    • 著者名/発表者名
      胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第21回フォーラム・イン・ドージン エピジェネティクスによる細胞のメタモルフォーゼ
    • 発表場所
      熊本(招待講演)
    • 年月日
      2010-11-26
  • [学会発表] Structual and biochemical studies of DMC1 polymorphisms in the human population2010

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Kurumizaka
    • 学会等名
      European Genomics Meeting & European Neurodegenerative Diseases-2010-Meeting
    • 発表場所
      Oxford, United Kingdom(招待講演)
    • 年月日
      2010-09-20
  • [学会発表] ヒトと酵母のDNA修復タンパク質Rad52の機能比較2010

    • 著者名/発表者名
      齋藤健吾, 他
    • 学会等名
      第9回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      伊豆
    • 年月日
      2010-05-28
  • [学会発表] ブーケ配向形成因子S.japonicas Bqt1-Bqt2複合体の生化学的解析2010

    • 著者名/発表者名
      市川雄一, 他
    • 学会等名
      第9回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      伊豆
    • 年月日
      2010-05-28
  • [学会発表] シトルリン化タンパク質PAD4のSNP変異体の解析2010

    • 著者名/発表者名
      堀越直樹, 他
    • 学会等名
      第9回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      伊豆
    • 年月日
      2010-05-28
  • [学会発表] 低分子化合物によるRAD51依存的相同組換え反応の制御2010

    • 著者名/発表者名
      石田恭子, 他
    • 学会等名
      第9回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      伊豆
    • 年月日
      2010-05-28
  • [学会発表] Fanconi貧血原因遺伝子FANCD2及びFANCIの機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      佐藤浩一, 他
    • 学会等名
      第9回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      伊豆
    • 年月日
      2010-05-28
  • [学会発表] ヒストンシャペロンsNASPの生化学的解析2010

    • 著者名/発表者名
      越坂部晃永, 他
    • 学会等名
      第9回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      伊豆
    • 年月日
      2010-05-28
  • [学会発表] SUMO修飾システムによるRAD51核内ドメイン形成の制御2010

    • 著者名/発表者名
      島弘季, 他
    • 学会等名
      第9回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      伊豆
    • 年月日
      2010-05-28
  • [学会発表] 新規RAD51活性化因子GEMIN2の相同組換え修復における機能2010

    • 著者名/発表者名
      高久誉大, 他
    • 学会等名
      第9回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      伊豆
    • 年月日
      2010-05-27
  • [学会発表] ヒストンバリアントH3Tを含むヌクレオソームの構造解析および生化学的解析2010

    • 著者名/発表者名
      立和名博昭, 他
    • 学会等名
      第9回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      伊豆
    • 年月日
      2010-05-27
  • [学会発表] Rad52タンパク質のDNA positive supercoiling活性の役割2010

    • 著者名/発表者名
      香川亘, 他
    • 学会等名
      第9回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      伊豆
    • 年月日
      2010-05-27

URL: 

公開日: 2012-07-19  

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