• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2012 年度 実績報告書

プロテオミクスによる遺伝情報発現の場の理解

計画研究

研究領域遺伝情報収納・発現・継承の時空間場
研究課題/領域番号 20114006
研究機関北海道大学

研究代表者

小布施 力史  北海道大学, 先端生命科学研究科(研究院), 教授 (00273855)

研究分担者 長尾 恒治  北海道大学, 先端生命科学研究科(研究院), 講師 (60426575)
研究期間 (年度) 2008-11-13 – 2013-03-31
キーワード染色体 / 細胞核 / 発現制御 / 発生分化 / プロテオーム
研究概要

昨年度までに、HP1結合タンパク質として見いだした未知タンパク質HBiX1はSMCHD1と複合体を形成して、ヒト不活性化X染色体上で、HP1の結合するH3K9me3領域と、XISTに富むH3K27me3領域とを繋ぐことで、凝縮したヘテロクロマチン構造を作り出していることを明らかにした。当該研究により、ヒト細胞において不活性X染色体以外での局在、男性細胞での局在、マウス細胞においての局在を、クロマチン免疫沈降法と次世代シーケンサーを組み合わせたChIP-seq法により解析を行った。具体的には、HBiX1、SMCHD1、XIST、H3K9me3、H3K27me3について、ヒト女性細胞(hTERT-RPE1)、ヒト男性細胞(hTERT-BJ5)、マウス細胞(13.5d, MEF mixture)における、常染色体上での分布を解析した。その結果、HBiX1-SMCHD1は主にH3K9me3ドメインに局在し、まれにH3K27me3領域に局在することが明らかとなった。このことから、不活性X染色体上でのヘテロクロマチン形成の仕組みが常染色体上でも使われていると考えられる。また、マウスの局在解析により、XIST RNAの分布がSMCHD1と極めて強く一致することから、HBiX1-SMCHD1を基盤とした高次構造がXIST RNAの局在に寄与していることが示唆され興味深い。本課題により、プロテオミクスにより明らかにしたHP1を基点にした分子ネットワークから、不活性X染色体の遺伝情報発現制御に関わるヘテロクロマチン高次構造の分子構築が明らかとなった。また、常染色体上でもこのシステムが働きうることが明らかとなり、ジェネラルな遺伝情報発現場の理解が著しく進めることができた。

現在までの達成度 (区分)
理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (26件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (12件) (うち招待講演 3件) 図書 (2件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] Human inactive X chromosome is compacted through a polycomb-independent SMCHD1-HBiX1 pathway2013

    • 著者名/発表者名
      Nozawa R.S.
    • 雑誌名

      Nature Structure and Molecular Biology

      巻: 20 ページ: 566-573

    • DOI

      10.1038/nsmb.2532.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Vertebrate Spt2 is a novel nucleolar histone chaperone that assists in ribosomal DNA transcription.2013

    • 著者名/発表者名
      Osakabe A
    • 雑誌名

      Journal of cell science

      巻: 126 ページ: 1323-1332

    • DOI

      10.1242/jcs.112623.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A co-localization model of paired ChIP-seq data using a large ENCODE data set enables comparison of multiple samples.2013

    • 著者名/発表者名
      Maehara K
    • 雑誌名

      Nucleic acids research

      巻: 41 ページ: 54-62

    • DOI

      10.1093/nar/gks1010.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Simultaneous inhibition of Src and Aurora kinases by SU6656 induces therapeutic synergy in human synovial sarcoma growth, invasion and angiogenesis in vivo.2012

    • 著者名/発表者名
      Arai R
    • 雑誌名

      European journal of cancer(Oxford,England:1990)

      巻: 48 ページ: 2417-2430

    • DOI

      10.1016/j.ejca.2011.12.028.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Histone chaperone activity of Fanconi anemia proteins,FANCD2 and FANCI,is required for DNA crosslink repair.2012

    • 著者名/発表者名
      Sato K
    • 雑誌名

      The EMBO journal

      巻: 31 ページ: 3524-3536

    • DOI

      10.1038/emboj.2012.197.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Epstein-Barr nuclear antigen 1 (EBNA1)-dependent recruitment of origin recognition complex(Orc) on oriP of Epstein-Barr virus with purified proteins:stimulation by Cdc6 through its direct interaction with EBNA1.2012

    • 著者名/発表者名
      Moriyama K
    • 雑誌名

      The Journal of biological chemistry

      巻: 287 ページ: 23977-23994

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.368456.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] An inducible RNA interference system in Physcomitrella patens reveals a dominant role of augmin in phragmoplast microtubule generation.2012

    • 著者名/発表者名
      Nakaoka Y
    • 雑誌名

      The Plant cell

      巻: 24 ページ: 1478-1493

    • DOI

      10.1105/tpc.112.098509.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A mutation of the fission yeast EB1 overcomes negative regulation by phosphorylation and stabilizes microtubules.2012

    • 著者名/発表者名
      Iimori M
    • 雑誌名

      Experimental cell research

      巻: 318 ページ: 262-275

    • DOI

      10.1016/j.yexcr.2011.11.006.

    • 査読あり
  • [学会発表] 新規HP1相互作用タンパク質は、53BP1のDNA損傷への集積を促進する2012

    • 著者名/発表者名
      磯部真也
    • 学会等名
      第30回染色体ワークショップ・第11回核ダイナミクス研究会合同開催
    • 発表場所
      淡路夢舞台(兵庫県)
    • 年月日
      20121221-20121221
  • [学会発表] 不活性 X 染色体における構成的ヘテロクロマチンと条件的ヘテロクロマチンとのクロストーク2012

    • 著者名/発表者名
      野澤竜介
    • 学会等名
      第30回染色体ワークショップ・第11回核ダイナミクス研究会合同開催
    • 発表場所
      淡路夢舞台(兵庫県)
    • 年月日
      20121221-20121221
  • [学会発表] 不活性 X 染色体におけるヘテロクロマチン形成機構2012

    • 著者名/発表者名
      野澤竜介
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県)
    • 年月日
      20121214-20121214
  • [学会発表] 新規HP1相互作用タンパク質は、53BP1のDNA損傷への集積を促進する2012

    • 著者名/発表者名
      磯部真也
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県)
    • 年月日
      20121214-20121214
  • [学会発表] SENP7-SETDB2 複合体はヒストン修飾とメチル化DNAを認識してSatII-SatIII領域へのHP1の局所化を促進する2012

    • 著者名/発表者名
      野澤竜介
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県)
    • 年月日
      20121214-20121214
  • [学会発表] 機成因子の使いわけによるヒトPolycomb Repressive Complex2(PRC2)の多様性2012

    • 著者名/発表者名
      長尾恒治
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県)
    • 年月日
      20121214-20121214
  • [学会発表] SETDB2-SENP7 complex recognizes histone mark and methylated DNA to maintain H3K9me3 and HP1 on specific loci.2012

    • 著者名/発表者名
      Nozawa R.S.
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory 2012 Meeting Epigenetics and Chromatin
    • 発表場所
      コールドスプリングハーバー研究所(アメリカ)
    • 年月日
      20120915-20120915
  • [学会発表] HP1 binding proteins facilitate 53BP1 recruitment to damages DNA in human cells2012

    • 著者名/発表者名
      Isobe S.Y.
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory 2012 Meeting Epigenetics and Chromatin
    • 発表場所
      コールドスプリングハーバー研究所(アメリカ)
    • 年月日
      20120915-20120915
  • [学会発表] Human inactive X chromosome is compacted through a polycomb-independent SMCHD1-HBIX1 pathway governed by XIST RNA2012

    • 著者名/発表者名
      Obuse C.
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory 2012 Meeting Epigenetics and Chromatin
    • 発表場所
      コールドスプリングハーバー研究所(アメリカ)
    • 年月日
      20120915-20120915
  • [学会発表] 不活性 X 染色体における非コードRNA XISTを介したヘテロクロマチン形成機構2012

    • 著者名/発表者名
      小布施力史
    • 学会等名
      第14回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東北大学(仙台市)
    • 年月日
      20120718-20120718
    • 招待講演
  • [学会発表] タンパク質複合体の構成因子を同定するための試料調整法2012

    • 著者名/発表者名
      小布施力史
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会2012年大会
    • 発表場所
      未来科学館(東京都)
    • 年月日
      20120716-20120716
    • 招待講演
  • [学会発表] 不活性 X 染色体における構成的ヘテロクロマチンと条件的ヘテロクロマチンとのクロストーク2012

    • 著者名/発表者名
      小布施力史
    • 学会等名
      第6回エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京一ツ橋学術総合センター(東京都)
    • 年月日
      20120514-20120514
    • 招待講演
  • [図書] 実験医学 vol. 31 No.11 (p1771 - 1775):バー小体の正体ーHBiX1-SMCHD1複合体によるヒト不活性化X染色体の凝縮2013

    • 著者名/発表者名
      長尾恒治
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      羊土社
  • [図書] ヘテロクロマチンタンパク質によるAurora B キナーゼ複合体の局在と活性化のメカニズム2012

    • 著者名/発表者名
      野澤竜介
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      生化學会
  • [備考] 北海道大学 大学院先端生命科学研究院 分子細胞生物学研究室

    • URL

      http://altair.sci.hokudai.ac.jp/infgen/

  • [備考] researchmap

    • URL

      http://researchmap.jp/obuse/

  • [備考] 研究紹介

    • URL

      http://www.lfsci.hokudai.ac.jp/labs/infgen/nsmb2013/

  • [備考] 論文プレリリース

    • URL

      http://www.hokudai.ac.jp/news/130401_pr_sci.pdf

URL: 

公開日: 2015-05-28  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi