シミュレーションによる生命情報の場の再現

2010 年度 自己評価報告書

• 研究領域: 遺伝情報収納・発現・継承の時空間場
• 研究課題/領域番号: 20114008
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 国立遺伝学研究所
• 研究代表者: 木村 暁 国立遺伝学研究所, 新分野創造センター, 准教授 (10365447)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2012
• キーワード: シミュレーション / 細胞核 / 染色体 / 線虫

研究概要

本研究課題では、空間(場)のパラメータが遺伝情報の収納にどのような影響を及ぼし、細胞周期・個体発生においてどのような役割を果たしているかについてコンピュータシミュレーションを活用して再現・理解することを目指す。線虫C.elegans初期胚をモデル系に用いている。

研究成果

• [雑誌論文] A novel mechanism of microtubule length-dependent force to pull centrosomes toward the cell center. (2011)
  • 著者名/発表者名: Kimura K, Kimura A.
  • 雑誌名: BioArchitecture 巻: 1 ページ: 74-79
  • DOI: 10.4161/bioa.1.2.15549
• [雑誌論文] Intracellular organelles mediate cytoplasmic pulling force for centrosome centration in the Caenorhabditis elegans early embryo. (2011)
  • 著者名/発表者名: Kimura K., Kimura A.
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci.USA 108 ページ: 137-142
  • 査読あり
• [雑誌論文] Modeling microtubule-mediated forces and centrosome positioning in Caenorhabditis elegans embryos. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kimura A., Onami S.
  • 雑誌名: Methods in Cell Biol. 97 ページ: 437-453
  • 査読あり
• [雑誌論文] New look inside the spindle : microtubule-dependent microtubule generation within the spindle. (2009)
  • 著者名/発表者名: Goshima G, Kimura A.
  • 雑誌名: Curr.Opin.Cell Biol. 22 ページ: 44-49
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cell-size-dependent spindle elongation in the Caenorhabditis elegans early embryo. (2009)
  • 著者名/発表者名: Hara Y, Kimura A.
  • 雑誌名: Curr Biol. 19 ページ: 1549-1554
  • 査読あり
• [学会発表] Size-dependency/ independency in the spatial organization of the cell : nuclear positioning and chromosome dynamics in C.elegans embryos. (2011)
  • 著者名/発表者名: Kimura, A.
  • 学会等名: International Symposium Physicochemical Field for Genetic Activities.
  • 発表場所: Awaji Yumebutai International Conference Center, Awaji, Japan
  • 年月日: 2011-01-24
• [学会発表] Quantitative modeling of mitotic spindle in C.elegans embryos. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kimura, A.
  • 学会等名: 43rd Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 2010-06-22
• [学会発表] Quantitative Measurement and Modeling reveal Cell Size dependent Mechanisms to Elongate Mitotic Spindles in the C.elegans embryo. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kimura, A.
  • 学会等名: 2nd Joint Meeting of the French and Japanease Societies for Developmental Biology
  • 発表場所: Institut Pasteur, France
  • 年月日: 2010-05-26
• [学会発表] Force balance models of centrosome centering and apindle elongation in C.elegans embryos. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kimura, A.
  • 学会等名: The 101st Boehringer Ingelheim Fonds International Titisee Conferences, Schwarzwaldhotel Titisee
  • 発表場所: Germany
  • 年月日: 2010-03-19
• [学会発表] Construction of cell architecture models focusing on centrosome positioning in C.elegans. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kimura, A.
  • 学会等名: Japanese Molecular Biology Pre-meeting Symposium 2009
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 2009-12-08
• [図書] Cell Cycle in Development(Kubiak JZ Ed.)(Springer Series - Results and Problems in Cell Differentiation -) (2011)
  • 著者名/発表者名: Hara Y., Kimura A.
  • 出版者: Cell-size-dependent control of organelle sizes during development. in press
• [備考] 国立遺伝学研究所プレスリリース
  • URL: http://www.nig.ac.jp/katudounews/j/09.html
• [備考] 国立遺伝学研究所特集記事
  • URL: http://www.nig.ac.jp/tokusyu/intt.html
• [備考] 国立遺伝学研究所細胞建築研究室
  • URL: http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/cell_archi_home.html