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2009 年度 実績報告書

溶質分子が作り出す水の状態変化と水からの反作用

計画研究

研究領域水を主役としたATPエネルギー変換
研究課題/領域番号 20118007
研究機関九州大学

研究代表者

秋山 良  九州大学, 理学研究院, 准教授 (60363347)

研究分担者 吉森 明  九州大学, 理学研究院, 准教授 (90260588)
キーワード化学物理 / 生物物理 / 液体論 / 分子認識 / 多成分系の勢力学 / ATP / 共溶媒効果 / モータータンパク質
研究概要

画像情報には現れない為に軽視されがちな水分子等の小分子に関する情報に、熱力学、統計力学の観点から光を当ててきた。特にタンパク質の折れ畳みや分子認識の研究で認識されつつある、水分子の並進運動効果を重視した研究を行ってきた。ATP駆動タンパク質-ヌクレオチド間の分子認識、構造変化、及びATPエネルギー変換の機能発現を溶液内の分子の並進運動効果に着目しつつ、シンプルな描像で捉える事が本課題の目的である。分子シミュレーション等を行いながらも、モデル計算と統計力学理論を重視し、他の領域内研究との有機的連携を図ってきた。3年目に予定していた巨大分子の拡散係数を溶質溶媒動径分布関数から求める吉森との共同研究を開始し、結果を得つつある。計算結果は、共溶媒を添加した場合に巨大分子が感じる摩擦は予想以上に大きくなる事が予想された。この結果は同じ領域の岩城らの1分子測定における添加物効果と比較検討中である。また、MSA理論を用いて溶質が双極性分子溶媒の運動性に与える影響を研究中である。この結果は、高橋らの計算や鈴木らのハイパーモバイル水の実験と比較しうる。水のシミュレーションに基づく研究も準備中である。また、アクチンのみの会合でもモーターとして働きうるが、その会合のメカニズムに関してHNC-OZ理論を基にモデルをたてた。結果的に得られた描像は、実験との矛盾は無い。今後、詳細について検討してゆく。この結果は同じ領域の安永らの結果などとも比較できそうである。最近、非平衡状態に対する分子シミュレーションを行う事で化学反応を力学的仕事に変換できるモデル系を見つけた。本領域とのつながりはまだ十分に検討されていないが、興味深いモデル系になると思われる。

  • 研究成果

    (30件)

すべて 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (24件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Adsorption of xenon on a protein arising from the translational motion of solvent molecules2010

    • 著者名/発表者名
      R.Akiyama, et al
    • 雑誌名

      Physical Chemistry and Chemical Physics 12

      ページ: 3096-3101

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-Dimensional Density Profiles of Small and Medium Spheres near a Pair of Large Spheres : Relevance to Entropic Interaction Induced between Large Spheres2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Karino, et al
    • 雑誌名

      Journal of the Physical Society of Japan 78

      ページ: 044801-1-6

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of Solvent Granularity on the Activity Coefficient of Macromolecules2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Karino, et al
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letter 478

      ページ: 180-184

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Derivation of the nonlinear fluctuating hydrodynamic equation from underdamped Langevin equation2009

    • 著者名/発表者名
      T.Nakamura, et al
    • 雑誌名

      Journal of Physics A : Mathematical and Theoretical 42

      ページ: 065001-1-15

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Free Energy Landscape Theory of Glass Transition and Entropy2009

    • 著者名/発表者名
      T.Odagaki, et al
    • 雑誌名

      Journal of Non-Crystalline Solids 355

      ページ: 681-685

    • 査読あり
  • [学会発表] 粒子の選択的吸着と吸着サイトの形状依存性2010

    • 著者名/発表者名
      井手雄治, 他
    • 学会等名
      日本物理学会第65回年次大会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2010-03-23
  • [学会発表] 多成分溶媒系から受ける大きな粒子の抵抗2010

    • 著者名/発表者名
      茶円豊, 他
    • 学会等名
      日本物理学会第65回年次大会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2010-03-23
  • [学会発表] イオンまわりの溶媒の回転緩和2010

    • 著者名/発表者名
      植松勇一郎, 他
    • 学会等名
      日本物理学会第65回年次大会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2010-03-23
  • [学会発表] 電解質溶液中の同符号荷電コロイド粒子間相互作用にみられるリエントラントな挙動:HNC-OZ方程式の解2010

    • 著者名/発表者名
      秋山良
    • 学会等名
      日本物理学会第65回年次大会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2010-03-22
  • [学会発表] Counterion condensation and strong attraction between like-charged macroions immersed in an electrolyte solution2010

    • 著者名/発表者名
      R.Akiyama, et al
    • 学会等名
      International Symposium Fifty Years of Biophysics Research at Nagoya University
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2010-03-13
  • [学会発表] Strong attraction between like-charged macromolecules immersed in electrolyte solution and the behavior of counter charged ions2010

    • 著者名/発表者名
      R.Akiyama, et al
    • 学会等名
      International Symposium on Hydration and ATP Energy
    • 発表場所
      岩沼屋(仙台)
    • 年月日
      2010-03-09
  • [学会発表] Friction of a large particle arising from multi-component liquids2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Chaen, et al
    • 学会等名
      International Symposium on Hydration and ATP Energy
    • 発表場所
      岩沼屋(仙台)
    • 年月日
      2010-03-09
  • [学会発表] Rotational relaxation of solvents around an ion2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Uematsu, et al
    • 学会等名
      International Symposium on Hydration and ATP Energy
    • 発表場所
      岩沼屋(仙台)
    • 年月日
      2010-03-09
  • [学会発表] OZ-HNC方程式を用いた同符号荷電コロイド粒子間実効相互作用の理論的研究2010

    • 著者名/発表者名
      秋山良, 他
    • 学会等名
      次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発:第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2010-03-04
  • [学会発表] 生体分子間の相互作用 1:エントロピーの駆動する引力と分子認識 2:同符号マクロイオン問の引力相互作用2010

    • 著者名/発表者名
      秋山良
    • 学会等名
      物性基礎論コロキウム
    • 発表場所
      九州大学
    • 年月日
      2010-02-08
  • [学会発表] Strong attraction between two like-charged colloidal particles in electrolyte solution2010

    • 著者名/発表者名
      R.Akiyama
    • 学会等名
      The 2010 Berkeley Mini Statistical Mechanics Meeting
    • 発表場所
      Univ.of California Berkeley, CA, USA
    • 年月日
      2010-01-08
  • [学会発表] 対イオンがつくる同符号マクロイオン間の"共有結合"とアクチン分子間相互作用:HNC-OZ方程式の解2009

    • 著者名/発表者名
      秋山良
    • 学会等名
      九州工業大学 情報工学部生命情報工学科学科講演会
    • 発表場所
      九州工業大学(飯塚)
    • 年月日
      2009-12-10
  • [学会発表] 電解質中の同符号マクロイオン間の強い引力相互作用:クーロン相互作用が強い場合のHNC-OZ方程式の解2009

    • 著者名/発表者名
      秋山良
    • 学会等名
      第23回分子シミュレーション討論会
    • 発表場所
      名古屋市中小企業振興会館
    • 年月日
      2009-11-30
  • [学会発表] 対称な電解質中の同符号のマクロイオン問の強い引力相互作用2009

    • 著者名/発表者名
      秋山良
    • 学会等名
      第32回溶液化学シンポジウム
    • 発表場所
      朱鷺メッセ(新潟)
    • 年月日
      2009-11-18
  • [学会発表] 電解質中の同符号マクロイオン間の実効相互作用2009

    • 著者名/発表者名
      秋山良
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会
    • 発表場所
      アスティ徳島
    • 年月日
      2009-10-30
  • [学会発表] コロイド分散系のエネルギー散逸と揺動散逸定理の破れ2009

    • 著者名/発表者名
      吉森明, 他
    • 学会等名
      日本物理学会2009年秋季大会
    • 発表場所
      熊本大学
    • 年月日
      2009-09-26
  • [学会発表] 粒子間ポテンシャルに極小が2つある系の固液相転移の研究2009

    • 著者名/発表者名
      末松安由美, 他
    • 学会等名
      日本物理学会2009年秋季大会
    • 発表場所
      熊本大学
    • 年月日
      2009-09-25
  • [学会発表] Strong Attractive interaction between like-charged colloidal particles in electrolyte solution2009

    • 著者名/発表者名
      R.Akiyama
    • 学会等名
      信定グループ グループ・セミナー
    • 発表場所
      分子科学研究所
    • 年月日
      2009-09-11
  • [学会発表] ATPのエネルギー論2009

    • 著者名/発表者名
      R.Akiyama
    • 学会等名
      信定グループ グループ・セミナー
    • 発表場所
      分子科学研究所
    • 年月日
      2009-09-11
  • [学会発表] 溶質分子が作り出す水の状態変化と水からの反作用2009

    • 著者名/発表者名
      秋山良
    • 学会等名
      水を主役としたATPエネルギー変換 平成21年度全体会議
    • 発表場所
      大阪ガーデンパレス
    • 年月日
      2009-09-09
  • [学会発表] van der Waals描像と溶液内での生体分子間相互作用2009

    • 著者名/発表者名
      秋山良
    • 学会等名
      新潟大学 理学部 自然環境科学科 コロキウム
    • 発表場所
      新潟大学
    • 年月日
      2009-06-26
  • [学会発表] Attractive Interaction between like-charged colloidal particles in electrolyte solution2009

    • 著者名/発表者名
      R.Akiyama
    • 学会等名
      The 3rd Mini-Symposium on Liquids (MSL2009)
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2009-06-20
  • [学会発表] An analysis of Kirkwood superposition approximation in multicomponent hard sphere mixture2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Karino, et al
    • 学会等名
      The 3rd Mini-Symposium on Liquids (MSL2009)
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2009-06-20
  • [学会発表] Theoretical Study of Solvent Effects on Crowding Problem in Cytoplasm2009

    • 著者名/発表者名
      R.Akiyama, et al
    • 学会等名
      The 19th Joint Seminar of Busan Branch of the Korean Chemical Society and the Kyushu Branch of the Chemical Society of Japan
    • 発表場所
      BEXCO(釜山)
    • 年月日
      2009-05-29
  • [備考]

    • URL

      http://hyoka.ofc.kyushu-u.ac.jp/search/faculty2_j.cgi?ID=K000808

URL: 

公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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