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2023 年度 実績報告書

複合的な不均一環境における根粒共生を介した窒素栄養獲得の統御機構

計画研究

研究領域不均一環境変動に対する植物のレジリエンスを支える多層的情報統御の分子機構
研究課題/領域番号 20H05908
研究機関筑波大学

研究代表者

壽崎 拓哉  筑波大学, 生命環境系, 准教授 (40575825)

研究期間 (年度) 2020-11-19 – 2025-03-31
キーワード窒素栄養 / 環境適応 / 根粒共生
研究実績の概要

土壌中に窒素栄養が豊富に存在する環境では根粒形成が抑制されることが知られている。これまでこの制御に異常を示すnrsymと名付けたミヤコグサのEMS変異体を単離し、それらを用いた分子遺伝学的な解析を行ってきた。その結果、2つのNLP転写因子NRSYM1/LjNLP4およびNRSYM2/LjNLP1が硝酸態窒素に応答した根粒形成遺伝子の発現制御に関わることや硝酸イオン輸送体NRSYM3/LjNRT2.1がNLP依存的な遺伝子発現制御を仲介する機能をもつことを明らかにしてきた。これまでの研究では順遺伝学的なアプローチは有効に作用してきたが、この手法では特定することのできる遺伝子の数は飽和状態に近いことが考えられた。そこで、ミヤコグサの国内野生系統に着目し、自然変異を利用して新規因子を同定することを試みた。まず、硝酸存在下における根粒形成を調べたところ、系統間で表現型に大きなバリエーションがあることが分かった。硝酸応答の表現型を指標にしてGWASを行い、新規因子をいくつか同定した。
NLPとNINは同一の転写因子ファミリーに属しているが、それぞれ硝酸シグナリング、根粒形成シグナリングにおいてマスターレギュレーターとして機能する。NLPとNINはDNA結合ドメインが高度に保存されており、共通した標的遺伝子をもつ一方で、根粒形成の正の制御遺伝子のプロモーター上に存在するシス配列にはNINのみが結合することが分かっている。これまでの研究により、このNLPとNINのDNA結合特異性の違いを生み出している新規モチーフを同定している。今年度はCRISPR-Cas9システムにより、このモチーフを特異的に欠失させた植物を作出した。その表現型を解析したところ、根粒形成に著しい影響が出ることが分かり、根粒形成の制御におけるこのモチーフの重要性が示された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

並行して進めている複数の研究項目について着実に研究成果が蓄積しており、一部については論文発表につながっているため。

今後の研究の推進方策

並行して進めている複数の研究項目について、詰めの実験を行い論文発表に必要なデータを取得する。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] IMA peptides regulate root nodulation and nitrogen homeostasis by providing iron according to internal nitrogen status2024

    • 著者名/発表者名
      Ito Momoyo、Tajima Yuri、Ogawa-Ohnishi Mari、Nishida Hanna、Nosaki Shohei、Noda Momona、Sotta Naoyuki、Kawade Kensuke、Kamiya Takehiro、Fujiwara Toru、Matsubayashi Yoshikatsu、Suzaki Takuya
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 15 ページ: 733

    • DOI

      10.1038/s41467-024-44865-4

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Developing for nutrient uptake: Induced organogenesis in parasitic plants and root nodule symbiosis2023

    • 著者名/発表者名
      Cui Songkui、Inaba Shoko、Suzaki Takuya、Yoshida Satoko
    • 雑誌名

      Current Opinion in Plant Biology

      巻: 76 ページ: 102473

    • DOI

      10.1016/j.pbi.2023.102473

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] An improved method for the highly specific detection of transcription start sites2023

    • 著者名/発表者名
      Seki Masahide、Kuze Yuta、Zhang Xiang、Kurotani Ken-ichi、Notaguchi Michitaka、Nishio Haruki、Kudoh Hiroshi、Suzaki Takuya、Yoshida Satoko、Sugano Sumio、Matsushita Tomonao、Suzuki Yutaka
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 52 ページ: e7

    • DOI

      10.1093/nar/gkad1116

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Staying hungry: a roadmap to harnessing central regulators of symbiotic nitrogen fixation under fluctuating nitrogen availability2023

    • 著者名/発表者名
      Qiao Lijin、Lin Jieshun、Suzaki Takuya、Liang Pengbo
    • 雑誌名

      aBIOTECH

      巻: 5 ページ: 107~113

    • DOI

      10.1007/s42994-023-00123-7

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 細菌と植物のコミュニケーションー根粒共生を例にしてー2023

    • 著者名/発表者名
      野田桃菜、落合美智、深谷夢夏、壽崎拓哉
    • 雑誌名

      生物の科学 遺伝

      巻: 77 ページ: 436-443

  • [学会発表] NIN転写因子のPB1ドメインの役割2024

    • 著者名/発表者名
      野田桃菜; 伊藤百代; 壽崎 拓哉
    • 学会等名
      第65回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] ミヤコグサの硝酸応答におけるNRT3.1の機能2024

    • 著者名/発表者名
      落合美智; 野田桃菜; 伊藤百代; 壽崎 拓哉
    • 学会等名
      第65回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] 根粒共生および窒素恒常性を制御するペプチドシグナル2024

    • 著者名/発表者名
      壽崎 拓哉
    • 学会等名
      第65回日本植物生理学会年会
    • 招待講演
  • [学会発表] 転写因子ファミリー内での比較解析から根粒共生獲得の軌跡を探る2024

    • 著者名/発表者名
      野﨑 翔平; 野田 桃菜; 小野田 浩宜; 三浦謙治; 壽崎 拓哉
    • 学会等名
      日本農芸化学会2024年度大会
  • [学会発表] 根粒形成に必要不可欠な鍵転写因子の生化学的研究2023

    • 著者名/発表者名
      野﨑 翔平; 野田 桃菜; 三浦 謙治; 壽崎 拓哉
    • 学会等名
      日本農芸化学会関東支部2023年度大会
  • [学会発表] A novel motif of NIN determines its different DNA-binding specificity from NLPs2023

    • 著者名/発表者名
      Nosaki Shohei; Noda Momona; Miura Kenji; Suzaki Takuya
    • 学会等名
      15th European Nitrogen Fixation Conference
    • 国際学会
  • [学会発表] A nitrogen-induced peptide mediates nutrient-dependent regulation of root nodule symbiosis2023

    • 著者名/発表者名
      Suzaki Takuya
    • 学会等名
      15th European Nitrogen Fixation Conference
    • 国際学会
  • [学会発表] NIN 転写因子の特異的配列に基づく遺伝子発現制御機構2023

    • 著者名/発表者名
      野﨑 翔平; 野田 桃菜; 三浦 謙治; 壽崎 拓哉
    • 学会等名
      植物微生物研究会 第32回研究交流会
  • [備考] 植物が共生菌への鉄供給によって窒素を得る仕組みを解明

    • URL

      https://www.tsukuba.ac.jp/journal/biology-environment/20240129190000.html

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公開日: 2024-12-25  

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