計画研究
MD-SAXS法による天然変性タンパク質の動的構造解析では、本年度新規に購入した2次元複合型ピクセルアレー検出器を既存のSAXS装置に組み込んで測定システムの最良化・効率化を図るとともに、X線結晶構造解析やNMRによって得られた原子モデルから水和構造を正しく考慮して理論的にSAXS強度を計算する方法を開発した。この方法については世界的に幾つかの方法が提案されているが、実験的に得られたSAXS強度との一致度はよくないので、本研究では、タンパク質溶液と緩衝溶液それぞれに対して、MDシミュレーションによってSAXS強度を計算して両者を差し引く方法を開発した。この方法は、これまでに提案されている方法とはまったく異なる発想に基づいてタンパク質分子表面の水和水からの散乱を取り扱っており、モデルタンパク質を用いての動的構造解析で良好な結果が得られた。一方、高速原子間力顕微鏡(高速AFM)による天然変性領域の動態解析の研究では、新しい振幅計測法を導入して装置のノイズ低減化を図るとともに、IDPを含む種々のタンパク質の観察に適した基板や溶液条件を検討した。IDタンパク質FACTについては、ID領域のリン酸化に伴うフォールディングを見出し、ID領域とDNAの結合がこのフォールディングを通して調節されていることが示唆された。IDを多く含むと予測されるPQBP-1の高速AFM撮影を試み、WWドメインと推定される球状ドメインにID領域と思われる長い紐状の構造が続き、その先に小さい球状のドメインがあるように観察された。IDの存在が確認されていない種々のタンパク質のダイナミクスについても高速AFM撮影を行った。
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J Biol Chem 285
ページ: 12299-307
J.Biol.Chem. 285
ページ: 6648-6657
Biochim.Biophys.Acta.-Biomembranes 1978
ページ: 703-718
Nature Nanotechnology 5
ページ: 208-212
顕微鏡 45
ページ: 22-30
Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 65
ページ: 1302-5
ページ: 1435-45
ページ: 959-61
Biophys J 97
ページ: 1354-1361
Biophys.J. 97
ページ: 2358-2367
J.Struct.Biol. 167
ページ: 153-158
Chem Lett. 38
ページ: 690-691
真空 51
ページ: 783-788
バイオインダストリー 26
ページ: 21-30
http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/xtal/index.html
http://www.s.kanazawa-u.ac.jp/phys/biophys/index.htm
