高分子非コードＲＮＡ作用マシナリー構成要素の探索と解析

2013 年度 研究成果報告書

• 研究領域: 非コードＲＮＡ作用マシナリー
• 研究課題/領域番号: 21115003
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 鈴木 健夫 東京大学, 工学(系)研究科(研究院), 講師 (90533125)
• 研究期間 (年度): 2009-07-23 – 2014-03-31
• キーワード: RNA / 転写後修飾 / プロセシング / 修飾酵素

研究概要

Xistの5'末構造解析によりmRNAのcapとは異なる修飾の状態が見出された。Malat1の3'末保存エレメント由来RNAの解析から1ヶ所のAがメチル化されていた。メチル化レベルをに影響する遺伝子の探索からメチル化酵素の同定とメチル化構造の実体を特定した。メチル化Aの検出手法とqRT-PCR法の組み合わせにより、微量サンプルからのRNA修飾定量法を開発した。2型糖尿病リスクとなるCDKAL1によるメチルチオ化修飾に適応し、リスクアレル保持者末梢血RNAサンプルでメチルチオ化修飾率が低下傾向にあることを示した。特徴的なRNA構造変化および修飾因子の発見への寄与があった。

研究成果

• [雑誌論文] A complete landscape of post-transcriptional modifications in mammalian mitochondrial tRNAs (2014)
  • 著者名/発表者名: Suzuki T. and Suzuki T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: (in press)
  • DOI: 10.1093/nar/gku390
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biochemical and mass spectrometric analysis of 3'-end methylation of piRNAs (2014)
  • 著者名/発表者名: Suzuki T, Miyauchi K, Sakaguchi Y, Suzuki T
  • 雑誌名: Methods Mol. Biol 巻: 1093 ページ: 59-72
  • DOI: 10.1007/978-1-62703-694-8_6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Quantitative PCR measurement of tRNA 2-methylthio modification for assessing type 2 diabetes risk (2013)
  • 著者名/発表者名: Xie, P., Wei, H.-Y., Hirata, S., Kaitsuka, T., Suzuki, T., Suzuki, T. and Tomizawa, K.
  • 雑誌名: Clin. Chem 巻: 59 ページ: 1604-1612
  • DOI: 10.1373/clinchem.2013.210401
  • 査読あり
• [雑誌論文] Decoding mechanism of non-universal genetic codes in Loligo bleekeri mitochondria (2013)
  • 著者名/発表者名: Ohira T, Suzuki T (第2著者), 他5名
  • 雑誌名: J . Biol. Chem 巻: 288 ページ: 7645-7652
  • DOI: 10.1074/jbc.M112.439554
  • 査読あり
• [雑誌論文] Base methylations in the double-stranded RNA by a fused methyltransferase bearing unwinding activity (2012)
  • 著者名/発表者名: Kimura S, Ikeuchi Y, Kitahara K, Sakaguchi Y, Suzuki T and Suzuki T
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 40 ページ: 4071-4085
  • DOI: 10.1093/nar/gkr1287
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular basis of dihydrouridine formation on tRNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Yu F, Tanaka Y, Yamashita K, Suzuki T (第4著者), 他4名
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 巻: 108 ページ: 19593-19598
  • DOI: 10.1073/pnas.1112352108
  • 査読あり
• [雑誌論文] Taurine-containing uridine modifications in tRNA anticodons are required to decipher non-universal genetic codes in ascidian mitochondria (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki T (第1著者), 他8名
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 286 ページ: 35494-35498
  • DOI: 10.1074/jbc.M111.279810
  • 査読あり
• [雑誌論文] Loss of ribosomal RNA modification causes developmental defects in zebrafish (2011)
  • 著者名/発表者名: Higa-Nakamine S, Suzuki T (第2著者) 他7名
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 40 ページ: 391-398
  • DOI: 10.1093/nar/gkr700
  • 査読あり
• [雑誌論文] Human Mitochondrial tRNAs : Biogenesis, Function, Structural Aspects, and Diseases (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki T, Nagao A and Suzuki T
  • 雑誌名: Annu. Rev. Genet 巻: 45 ページ: 299-329
  • DOI: 10.1146/annurev-genet-110410-132531
  • 査読あり
• [雑誌論文] Deficit of Lys-tRNA Modification by Cdkal1 Causes the Development of Type 2 Diabetes in Mice (2011)
  • 著者名/発表者名: Wei FY, Suzuki T (第2著者), 他11名
  • 雑誌名: J. Clin. Invest 巻: 121 ページ: 3598-3608
  • DOI: 10.1172/JCI58056
  • 査読あり
• [雑誌論文] Actin-binding protein ABP140 is a methyltransferase for 3-methylcytidine at position 32 of tRNAs in Saccharomyces cerevisiae (2011)
  • 著者名/発表者名: Noma A, Yi S, Katoh T, Takai Y, Suzuki T and Suzuki T
  • 雑誌名: RNA 巻: 17 ページ: 1111-1119
  • DOI: 10.1261/rna.2653411
  • 査読あり
• [雑誌論文] Human mitochondrial diseases caused by lack of taurine-modification in mitochondrial tRNAs (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki T, Nagao A and Suzuki T
  • 雑誌名: Wiley Interdiscip Rev RNA 巻: 2 ページ: 376-386
  • DOI: 10.1002/wrna.65
  • 査読あり
• [雑誌論文] Agmatine-conjugated cytidine in tRNA anticodon essential for AUA decoding in archaea (2010)
  • 著者名/発表者名: Ikeuchi Y, Kimura S, Numata T, Nakamura D, Yokogawa T, Ogata T, Wada T, Suzuki T and Suzuki T
  • 雑誌名: Nat. Chem. Biol 巻: 6 ページ: 277-282
  • DOI: 10.1038/nchembio.323
  • 査読あり
• [学会発表] Novel modified nucleoside found in 16S rRNA from halophilic archaea (2013)
  • 著者名/発表者名: Takeo Suzuki, Hajime Takeda, Tomoyuki Watanabe, Naoki Uchiyama, Takeshi Wada, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: MBSJ2013
  • 発表場所: Kobe, Japan
  • 年月日: 20131200
• [産業財産権] RNA 修飾の簡易検出法、及び該検出法を用いた2型糖尿病の検査方法 (2013)
  • 発明者名: 富澤 一仁、魏 范研、鈴木 健夫、鈴木 勉
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 特願2013-047278
  • 出願年月日: 2013-03-08