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2023 年度 実績報告書

マルチセルラコンピューティングシステムの実細胞再構成

計画研究

研究領域脳神経マルチセルラバイオコンピューティング
研究課題/領域番号 21H05164
研究機関東北大学

研究代表者

山本 英明  東北大学, 電気通信研究所, 准教授 (10552036)

研究分担者 谷井 孝至  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (20339708)
平野 愛弓  東北大学, 電気通信研究所, 教授 (80339241)
研究期間 (年度) 2021-08-23 – 2024-03-31
キーワード多細胞バイオ計算 / 培養神経回路 / リザバーコンピューティング / 数理モデル / スパイキングニューラルネットワーク / マイクロ流体デバイス / カルシウムイメージング
研究実績の概要

本計画班では,微細加工基板表面に形成した人工神経細胞回路とその摂動解析系を基盤として,実神経細胞が構成するマルチセルラネットワークの大自由度システムとしての動的特性と自己組織性をボトムアップに解析した.課題の最終年度であるR5年度には,以下の2つのテーマに関する研究を実施し,それぞれ原著論文として国際誌に発表した.
(1)リザバーコンピューティングによる人工神経細胞回路の刺激応答特性の解析
A01班代表の香取と共同で,リザバーコンピューティングと呼ばれる機械学習の新しい枠組みを用いて,ラットの大脳皮質神経細胞で構成した人工神経細胞回路の刺激応答特性を解析した.本実験では,培養された神経細胞ネットワークの刺激応答を光遺伝学と蛍光カルシウムイメージングを用いて記録し,リザバーコンピューティングを使用して刺激応答をデコーディングした.実験の結果,人工神経細胞回路は数百ミリ秒程度の短期記憶を持ち,これを利用して時系列データの分類が可能であることが示された.
(2) モジュール構造型人工神経細胞回路の摂動応答特性の解析
哺乳類の大脳皮質では,複数の神経細胞が同期して活動する状態と細胞がそれぞれ個別に発火する状態の均衡が保たれている.本研究では,人工神経細胞回路を用いて,このような均衡が実現されるメカニズムを調べた.そして,哺乳類の大脳皮質で見られる「モジュール性」という特徴を強く持った培養神経回路ほど外部入力に対する感受性が強くなり,培養神経回路特有の過剰な同期が崩されやすくなることを明らかにした.さらに,一連の実験結果を説明するシミュレーションモデルを構築し,入力を常時受けることによってシナプス伝達で放出される神経伝達物質が減少することが鍵になっていることを突き止めた.本研究は,領域の海外アドバイザーであるJordi Soriano准教授(バルセロナ大学)らとの国際共同研究として推進した.

現在までの達成度 (段落)

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (35件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (25件) (うち国際学会 14件、 招待講演 5件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] バルセロナ大学/グラナダ大学(スペイン)

    • 国名
      スペイン
    • 外国機関名
      バルセロナ大学/グラナダ大学
  • [国際共同研究] マックスプランク研究所(ドイツ)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      マックスプランク研究所
  • [雑誌論文] Enhanced responses to inflammatory cytokine interleukin-6 in micropatterned networks of cultured cortical neurons2024

    • 著者名/発表者名
      M. Sakaibara, H. Yamamoto, H. Murota, N. Monma, S. Sato, A. Hirano-Iwata
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 695 ページ: 149379

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2023.149379

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Numerical Study on Physical Reservoir Computing With Josephson Junctions2024

    • 著者名/発表者名
      K. Watanabe, Y. Mizugaki, S. Moriya, H. Yamamoto, T. Yamashita, S. Sato
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Applied Superconductivity

      巻: 1700204 ページ: 1700294

    • DOI

      10.1109/TASC.2024.3350576

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biological neurons act as generalization filters in reservoir computing2023

    • 著者名/発表者名
      T. Sumi, H. Yamamoto, Y. Katori, K. Ito, S. Moriya, T. Konno, S. Sato, A. Hirano-Iwata
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences, U.S.A.

      巻: 120 ページ: e2217008120

    • DOI

      10.1073/pnas.2217008120

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] マイクロ流体デバイスを用いた神経回路機能の実細胞再構成2023

    • 著者名/発表者名
      山本英明, 平野愛弓, 佐藤茂雄
    • 雑誌名

      応用物理

      巻: 92 ページ: 278-282

    • DOI

      10.11470/oubutsu.92.5_278

  • [雑誌論文] Microfluidic technologies for reconstituting neuronal network functions in vitro2023

    • 著者名/発表者名
      H. Yamamoto, A. Hirano-Iwata, S. Sato
    • 雑誌名

      JSAP Review

      巻: 2023 ページ: 230420

    • DOI

      10.11470/jsaprev.230420

    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Modular architecture facilitates noise-driven control of synchrony in neuronal networks2023

    • 著者名/発表者名
      H. Yamamoto, F.P. Spitzner, T. Takemuro, V. Buend_a, H. Murota, C. Morante, T. Konno, S. Sato, A. Hirano-Iwata, A. Levina, V. Priesemann, M.A. Mu_oz, J. Zierenberg, J. Soriano
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 9 ページ: eade1755

    • DOI

      10.1126/sciadv.ade1755

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Model-free idealization: Adaptive integrated approach for idealization of ion-channel currents2023

    • 著者名/発表者名
      M. Sato, M. Hariyama, M. Komiya, K. Suzuki, Y. Tozawa, H. Yamamoto, A. Hirano-Iwata
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 122 ページ: 3959-3975

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2023.08.019

    • 査読あり
  • [学会発表] シナプススケーリング則の最適化:モジュラスパイキングニューラルネットワークへの適用とその影響の解析2024

    • 著者名/発表者名
      新川拓海, 加藤秀行, 石川慶孝, 住 拓磨, 山本英明, 香取勇一
    • 学会等名
      電子情報通信学会 非線形問題(NLP)研究会
  • [学会発表] Generation of Lorenz attractor by reservoir-based predictive coding in cultured neurons with spiking neural network model2024

    • 著者名/発表者名
      Y. Ishikawa, T. Shinkawa, T. Sumi, H. Kato, H. Yamamoto, Y. Katori
    • 学会等名
      The 12th RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer
    • 国際学会
  • [学会発表] Parameter analysis for biologically plausible learning algorithms for recurrent SNNs: impact of dynamical and anatomical network properties2024

    • 著者名/発表者名
      D. Noe, H. Yamamoto, S. Sato
    • 学会等名
      The 12th RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer
    • 国際学会
  • [学会発表] Analog circuit design of multiplicative spike-timing-dependent plasticity in 65-nm CMOS2024

    • 著者名/発表者名
      S. Moriya, Y. Iida, H. Yamamoto, S. Sato
    • 学会等名
      The 12th RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer
    • 国際学会
  • [学会発表] Designing modular neuronal networks with directional connections to enhance dynamical complexity2024

    • 著者名/発表者名
      N. Monma, H. Yamamoto, H. Murota, S. Moriya, N. Fujiwara, A.Hirano-Iwata, S. Sato
    • 学会等名
      The 12th RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer
    • 国際学会
  • [学会発表] Modulation of neuronal ensembles by optogenetic stimulation in biological neuronal networks2024

    • 著者名/発表者名
      H. Murota, H. Yamamoto, N. Monma, S. Sato, A. Hirano-Iwata
    • 学会等名
      The 12th RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer
    • 国際学会
  • [学会発表] Recovery of neuronal activity in culture and numerical models through functional connectivity reorganization2024

    • 著者名/発表者名
      T. Sumi, A. M. Houben, A.-C. H?b, H. Yamamoto, H. Kato, Y. Katori, H. Chiba, J. Soriano, A. Hirano-Iwata
    • 学会等名
      The 12th RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer
    • 国際学会
  • [学会発表] 神経細胞ネットワークの機能を理解し応用するための神経工学技術2024

    • 著者名/発表者名
      山本英明
    • 学会等名
      Beyond AIワークショップ「培養ニューロンの機能と未来」
    • 招待講演
  • [学会発表] 脳領域間結合のin vitro再構成に向けたマイクロ流体デバイスの開発2024

    • 著者名/発表者名
      遠藤壮太, 山本英明, 西村周泰, 酒井原一守, 門間信明, 正水芳人, 平野愛弓, 佐藤茂雄
    • 学会等名
      第71回応用物理学会春季学術講演会
  • [学会発表] In vitro neuroengineering technologies for reconstituting and decoding neuronal network dynamics2023

    • 著者名/発表者名
      H. Yamamoto, A. Hirano-Iwata, S. Sato
    • 学会等名
      Tohoku NeuroTech Symposium (TNS) 2023
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Physical reservoir computing using dynamics of biological neuronal network with modular structure2023

    • 著者名/発表者名
      T. Sumi, H. Yamamoto, Y. Katori, K. Ito, S. Sato, A. Hirano-Iwata
    • 学会等名
      10th International Congress on Industrial and Applied Mathematics (ICIAM 2023)
    • 国際学会
  • [学会発表] マイクロパターン培養神経ネットワークのダイナミクスを用いたリザバーコンピューティング2023

    • 著者名/発表者名
      住 拓磨, 山本英明, 伊藤亘輝, 香取勇一, 佐藤茂雄, 平野愛弓
    • 学会等名
      第33回日本神経回路学会全国大会
  • [学会発表] 人工神経細胞回路における摂動応答特性のモジュール構造依存性の解析2023

    • 著者名/発表者名
      室田白馬, 山本英明, 竹室汰貴, 佐藤茂雄, J. Soriano, 平野愛弓
    • 学会等名
      第33回日本神経回路学会全国大会
  • [学会発表] 結合指向性を有する神経細胞ネットワークの in vitro-in silico モデリング2023

    • 著者名/発表者名
      門間信明, 山本英明, 室田白馬, 守谷 哲, 藤原直哉, 平野愛弓, 佐藤茂雄
    • 学会等名
      第84回応用物理学会秋季学術講演会
  • [学会発表] 大規模モジュール構造型培養神経回路のリザバー特性の解析2023

    • 著者名/発表者名
      伊藤亘輝, 山本英明, 住 拓磨, 香取勇一, 佐藤茂雄, 平野愛弓
    • 学会等名
      第84回応用物理学会秋季学術講演会
  • [学会発表] 人工神経細胞回路における光刺激前後での神経アンサンブルの解析2023

    • 著者名/発表者名
      室田白馬, 山本英明, 門間信明, 佐藤茂雄, 平野愛弓
    • 学会等名
      第84回応用物理学会秋季学術講演会
  • [学会発表] 高密度多点電極アレイ上にパターニングしたモジュール構造型大規模培養神経回路の活動解析2023

    • 著者名/発表者名
      薗 勇輝, 山本英明, 佐藤有弥, 香取勇一, 平野愛弓, 佐藤茂雄
    • 学会等名
      第84回応用物理学会秋季学術講演会
  • [学会発表] Bottom-Up Investigation of Multicellular Computing Within Biological Neuronal Networks2023

    • 著者名/発表者名
      H. Yamamoto, T. Sumi, Y. Sato, S. Sato, A. Hirano-Iwata
    • 学会等名
      2023 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2023)
    • 国際学会
  • [学会発表] Spiking and Bursting Properties of Spontaneous Activities in Modular Spiking Neuronal Networks2023

    • 著者名/発表者名
      H. Kato, T. Shinkawa, Y. Ishikawa, T. Sumi, H. Yamamoto, Y. Katori
    • 学会等名
      2023 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2023)
    • 国際学会
  • [学会発表] Modular Topology Enhances Reservoir Computing Performance in Biological Neuronal Networks2023

    • 著者名/発表者名
      T. Sumi, H. Yamamoto, Y. Katori, K. Ito, S. Sato, A. Hirano-Iwata
    • 学会等名
      2023 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2023)
    • 国際学会
  • [学会発表] Evaluation of Reservoir-Based Predictive Coding in Cultured Neurons with Spiking Neural Network Model2023

    • 著者名/発表者名
      Y. Ishikawa, T. Shinkawa, T. Sumi, H. Kato, H. Yamamoto, Y. Katori
    • 学会等名
      2023 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2023)
    • 国際学会
  • [学会発表] 人工神経細胞回路を用いた物理リザバーコンピューティング2023

    • 著者名/発表者名
      山本英明, 住 拓磨, 平野愛弓, 佐藤茂雄
    • 学会等名
      化学とマイクロ・ナノシステム学会第48回研究会 (CHEMINAS48)
    • 招待講演
  • [学会発表] 生体工学と機械学習による神経回路機能の探求2023

    • 著者名/発表者名
      山本英明
    • 学会等名
      計測自動制御学会 システム・情報部門 学術講演会 2023 (SSI2023)
    • 招待講演
  • [学会発表] Optogenetic perturbation of engineered neuronal networks grown in vitro2023

    • 著者名/発表者名
      H. Yamamoto, S. Sato, A. Hirano-Iwata
    • 学会等名
      16th International Symposium on Nanomedicine (ISNM2023)
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Enhanced modulation of spontaneous neural activity by interleukin-6 in micropatterned neuronal networks2023

    • 著者名/発表者名
      M. Sakaibara, H. Yamamoto, H. Murota, N. Monma, S. Sato, A. Hirano-Iwata
    • 学会等名
      16th International Symposium on Nanomedicine (ISNM2023)
    • 国際学会
  • [備考] 領域ホームページ

    • URL

      https://www.mnbc.riec.tohoku.ac.jp/

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公開日: 2024-12-25  

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