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2010 年度 実績報告書

細胞運動の自発的なゆらぎを利用した柔軟な環境応答の分子メカニズム

計画研究

研究領域動く細胞と場のクロストークによる秩序の生成
研究課題/領域番号 22111002
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

研究機関大阪大学

研究代表者

上田 昌宏  大阪大学, 生命機能研究科, 特任教授 (40444517)

キーワードシグナル伝達 / 1分子計測(SMD) / 自己組織化 / 細胞運動 / 自発性 / 細胞性粘菌 / イノシトールリン脂質 / ゆらぎ
研究概要

本研究では、細胞の自発運動に関与するイノシトールリン脂質代謝経路の自己組織化反応に着目し、多階層イメージング解析により自己組織化反応の時空間ダイナミクスを実験的に捉え、数理モデル化を通して、確率的にはたらく分子から細胞の運動機能がゆらぎを内包しつつ自律的に形成されるメカニズムを明らかにすることを目指す。
イノシトールリン脂質代謝経路の自己組織化メカニズムと自発運動ゆらぎを利用した環境適応メカニズムを解明するためには、代謝経路を構成する分子群の1分子特性とそれら分子群がつくる分子ネットワークの時空間ダイナミクス、自発運動ダイナミクスを定量的に特徴付け、その知見に基づいて数理モデルを構築する必要がある。そのために、主に次の3つの研究項目を推進してきた。
(1)細胞運動および細胞内分子ダイナミクスを計測するための多階層イメージング技術の開発。
(2)細胞運動を定量的に解析し、記述するための統計解析法の開発。
(3)細胞運動の自発的なゆらぎを創発する細胞内自己組織化メカニズムの解明と数理モデル構築。
特に本年度は(1)の多階層イメージング技術を開発するために、1分子特性と分子ネットワークダイナミクスを同時にイメージング解析できるような顕微鏡システム(多階層イメージングシステム)のプロトタイプを構築した。イノシトールリン脂質代謝経路の自己組織化に関与することが明らかになっているPTEN分子を具体的な計測対象とし、顕微鏡システムの最適化を行なった。多階層イメージングにより,1分子の振る舞いと分子集団のダイナミクスを同時に可視化することが可能になった。今後は(2)の統計解析法を開発し,1分子特性(拡散係数・反応速度パラメーターなど)と分子集団ダイナミクス(自己組織化によって現れる振動の特徴量)の定量化を進める。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (8件) 図書 (4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Self-organization of the phosphatidylinositol lipids signaling for randomcell migration2010

    • 著者名/発表者名
      Arai, Y., Shibata, T., Matsuoka, S., Sato, M.J., Yanagida, T., Ueda, M.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA.

      巻: Vol.107 ページ: 12399-12404

    • 査読あり
  • [学会発表] 細胞内シグナルダイナミクスの定量イメージング2011

    • 著者名/発表者名
      上田昌宏
    • 学会等名
      画像処理と生物学の分野融合を目指したワークショップ
    • 発表場所
      理化学研究所和光キャンパス仁科ホール(埼玉県)(招待講演)
    • 年月日
      2011-03-28
  • [学会発表] Single-molecule imaging analysis of chemotactic signaling2011

    • 著者名/発表者名
      上田昌宏
    • 学会等名
      Dictyostelium meeting
    • 発表場所
      Johns Hopkins University (USA)
    • 年月日
      2011-03-10
  • [学会発表] 細胞内1分子イメージングを用いたシグナル伝達研究2010

    • 著者名/発表者名
      上田昌宏
    • 学会等名
      Promega Dynamic Connection
    • 発表場所
      RAVIMANA神戸(招待講演)
    • 年月日
      2010-12-09
  • [学会発表] 細胞内自己組織化による自発シグナル生成"Organized randomness"2010

    • 著者名/発表者名
      上田昌宏・柴田達夫
    • 学会等名
      定量生物の会
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所(招待講演)
    • 年月日
      2010-11-28
  • [学会発表] 細胞性粘菌の極性形成と走化性2010

    • 著者名/発表者名
      上田昌宏・柴田達夫
    • 学会等名
      細胞システムコロキウム『理論生物学』
    • 発表場所
      理化学研究所和光キャンパス鈴木梅太郎記念ホール(埼玉県)(招待講演)
    • 年月日
      2010-11-05
  • [学会発表] 細胞性粘菌Dictyostelium discoideumに学ぶ細胞内の確率的なシグナル2010

    • 著者名/発表者名
      上田昌宏
    • 学会等名
      つくば藻類プロテイストフォーラム
    • 発表場所
      筑波大学(招待講演)
    • 年月日
      2010-10-25
  • [学会発表] 細胞内自己組織化による自発シグナル生成"Organized randomness"2010

    • 著者名/発表者名
      上田昌宏
    • 学会等名
      第48回日本生物物理学会ランチョンセミナー
    • 発表場所
      東北大学川内北キャンパス(招待講演)
    • 年月日
      2010-09-20
  • [学会発表] 細胞内分子ダイナミクスのイメージング解析2010

    • 著者名/発表者名
      上田昌宏
    • 学会等名
      第62回日本細胞生物学会大会
    • 発表場所
      大阪国際会議場・大阪(招待講演)
    • 年月日
      2010-05-19
  • [図書] 実験医学(「分子から個体へと深化する脂質生物学」)2010

    • 著者名/発表者名
      松岡里実, 佐藤雅之, 上田昌宏
    • 総ページ数
      3266-3274
    • 出版者
      羊土社
  • [図書] Cell Signaling Reactions : Single-Molecule Kinetic Analysis.2010

    • 著者名/発表者名
      Sako, Y., Ueda, M.
    • 総ページ数
      330
    • 出版者
      Springer-Verlag
  • [図書] Statistical analysis of lateral diffusion and reaction kinetics of single molecules on membranes of living cells, In Cell Signaling Reactions : Single-Molecule Kinetic Analysis.2010

    • 著者名/発表者名
      Matsuoka, S.(共著)
    • 総ページ数
      265-296
    • 出版者
      Springer-Verlag
  • [図書] Single-molecule kinetic analysis of stochastic signal transduction mediated by G-protein coupled chemoattractant receptors, In Cell Signaling Reactions : Single-Molecule Kinetic Analysis.2010

    • 著者名/発表者名
      Miyanaga, Y., Ueda, M.(共著)
    • 総ページ数
      33-57
    • 出版者
      Springer-Verlag
  • [備考]

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/yanagida/teamSBC/

URL: 

公開日: 2012-07-19  

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