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2014 年度 実績報告書

クロマチンリモデリング制御複合体の構造と機能の解析

計画研究

研究領域細胞シグナリング複合体によるシグナル検知・伝達・応答の構造的基礎
研究課題/領域番号 22121005
研究機関大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構

研究代表者

千田 俊哉  大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 教授 (30272868)

研究期間 (年度) 2010-04-01 – 2015-03-31
キーワードX線結晶構造解析 / クロマチン / ヌクレオソーム / 転写 / 複製 / CAF-I複合体 / HIRA
研究実績の概要

本申請で主なターゲットとするCAF-I複合体は、酵母からヒトまで進化上保存された複製依存のクロマチンアッセンブリー因子であり、p150, p60, p48という3種類のサブユニットから構成されるヘテロ三量体である。今年度は、出芽酵母CAF-I複合体を細胞内から高純度で精製することに成功した。精製の過程、特に濃縮のステップにおいて回収率が低かったため、様々な条件検討を行ったところ、回収率を向上させる条件を見出すことに成功した。その後、発見した条件で大量スケール(40L培養菌体)からの精製を行い、0.3mg/mL x 50uLの精製標品を得ることに成功した。電子顕微鏡にて負染色像観察を行ったところ、約10nmの均一な大きさの粒子が観察された。これらの粒子像から、試験的な単粒子解析像を得ることに成功した。
ヒトCAF-I複合体については、今年度までに昆虫細胞での大量発現系を構築することはできたが、大量精製においてはサブユニットの1つが非常に解離しやすいことが明らかになった。電子顕微鏡で約10nmの粒子を観察できたが、同時に小さなサイズの粒子も多数観察され、電子顕微鏡で観察された粒子像は不揃いになってしまっていた。サブユニットが解離する原因としては、a)複合体の形成に何らかの補助因子(分子シャペロンなど)が必要、b)サブユニットへの翻訳後修飾が必要、c)元来解離しやすいサブユニットである、などが考えられる。
ヒトHIRAについては、昨年度までに全長を単独で発現・精製することを試みたが極めて困難だったので、今年度は、相互作用因子との共発現や、一部ドメインの発現・結晶化を検討した。この中で、HIRAのC末端側ドメインについては結晶が得られており、現在、結晶の質を改善する試みを行っている。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Structure of a BAG6 (Bcl-2-associated Athanogene 6)-Ubl4a (Ubiquitin-like Protein 4a) Complex Reveals a Novel Binding Interface That Functions in Tail-anchored Protein Biogenesis.2015

    • 著者名/発表者名
      Kuwabara N, Minami R, Yokota N, Matsumoto H, Senda T, Kawahara H, Kato R.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 290 ページ: 9387-9398

    • DOI

      10.1074/jbc.M114.631804.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular mechanism of strict substrate specificity of an Extradiol Dioxygenase, DesB, derived from Sphingobium sp. SYK-6.2014

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto, K., Senda, M., Kasai, D., Fukuda, M., Masai, E. and Senda, T.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9 ページ: e92249

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0092249.

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 創薬等支援技術基盤プラットフォームにおける構造研究2015

    • 著者名/発表者名
      千田俊哉
    • 学会等名
      日本薬学会
    • 発表場所
      神戸・神戸学院大学/兵庫医療大学
    • 年月日
      2015-03-26
    • 招待講演
  • [学会発表] エピジェネティックおよび疾病関連タンパク質の構造生物学研究2014

    • 著者名/発表者名
      千田俊哉
    • 学会等名
      日本結晶学会
    • 発表場所
      東京・東京大学農学部弥生キャンパス
    • 年月日
      2014-11-01
    • 招待講演
  • [学会発表] ピロリ菌由来のがんタンパク質CagAの構造-機能相関研究2014

    • 著者名/発表者名
      千田俊哉
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      京都・国立京都国際会館
    • 年月日
      2014-10-16
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒストンシャペロンHIRA C domainの精製系の確立2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤優花里
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      京都・国立京都国際会館
    • 年月日
      2014-10-16
  • [学会発表] Structure and Function of an Oncoprotein CagA from Helicobacter Pylori2014

    • 著者名/発表者名
      千田俊哉
    • 学会等名
      8th Asia-Ocdania Forum for synchrotron radiation research
    • 発表場所
      新竹(台湾)・National Synchrotron Radiation Research Center
    • 年月日
      2014-09-16
    • 招待講演
  • [学会発表] Large-scale purification of general transcription factor TFIIF2014

    • 著者名/発表者名
      Naruhiko Adachi, Kyohei Aizawa, Yuka Yamaguchi, and Toshiya Senda
    • 学会等名
      Epigenetics & chromatin
    • 発表場所
      米国・コールドスプリングハーバー研究所
    • 年月日
      2014-09-09 – 2014-09-13
  • [備考] KEK, IMSS, SBRC

    • URL

      http://pfweis.kek.jp/index.html

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公開日: 2016-06-01  

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