染色体動態解析およびゲノム比較進化解析のための情報処理技術の確立

2014 年度 研究成果報告書

• 研究領域: ゲノムアダプテーションのシステム的理解
• 研究課題/領域番号: 22125008
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東京工業大学
• 研究代表者: 伊藤 武彦 東京工業大学, 生命理工学研究科, 教授 (90501106)
• 研究分担者: 白髭 克彦 東京大学, 分子細胞学研究所, 教授 (90273854)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2015-03-31
• キーワード: 染色体動態 / バイオインフォマティクス

研究成果の概要

主にIlluminaシークエンサのデータを入力としたChIP-seq解析アルゴリズム、ゲノムアセンブル解析アルゴリズム、点/構造変異解析アルゴリズムを新規に開発、改良を実施し、個別のプログラムとしてまとめ、論文などを通じて公開を図った。
またこれらのアルゴリズムを用いて、新学術他班員などとの共同研究により、出芽酵母、分裂酵母、ヒト、マウス、病原性バクテリアなど種々の生物種のデータについて各種タンパク質局在プロファイルの解析、新規ゲノム配列決定、SNP検出、ゲノム構造変異解析を実施した。

自由記述の分野

ゲノム情報