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2011 年度 実績報告書

DNA-タンパク質クロスリンクとクロマチンリモデリング

計画研究

研究領域ゲノム複製・修復・転写のカップリングと普遍的なクロマチン構造変換機構
研究課題/領域番号 22131010
研究機関広島大学

研究代表者

井出 博  広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (30223126)

キーワードDNA複製 / 転写 / ゲノム損傷 / クロマチンリモデリング
研究概要

生物のゲノムはDNAとタンパク質の複合体であり,複製および転写装置は結合タンパクを適切に処理しながらDNA合成と転写を行う。しかし,DNA損傷因子はしばしば結合タンパク質をDNAに固定化し,生じたDNA-タンパク質クロスリンク(DPC)損傷は複製と転写を阻害する。本研究では,DPC損傷で停止した複製装置および転写装置の複製・転写継続機構とこれに関わるクロマチンリモデリングの役割について研究を進めている。複製については,DPCがpolymerase blockあるいはhelicase blockのいずれとして作用するのか,in vitro系を用いて検討している。転写については,レポーターアッセイを用いたDPCの転写影響解析系を構築した。ルシフェラーゼ遺伝子発現はレポータープラスミドに含まれるDPC量依存的に低下することが明らかとなり,今後は,この系を用いて転写継続機構を調べていく。クロマチンリモデリングについては,酵母で相同組換えへの関与が示唆されているINO80クロマチンリモデリング複合体に注目し,同複合体サブユニットのノソクダウンを行った。RUVBL1サブユニットに対するshRNA発現プラスミド(4種)およびsiRNA(3種)のノックダウン効果をWestern法で調べた結果,前者では60-70%,また後者では40-60%のノックダウン効果が得られた。現在,shRNA安定発現細胞をクローニングしている。また,ACTR5についても同様な検討を行った。shRNA発現プラスミド(4種)では有意なノックダウン効果は得られなかったが,siRNA(3種)では20-70%のノックダウン効果が得られた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

DPC損傷で停止した複製装置および転写装置の複製・転写継続機構の研究は概ね計画通り進んでいるが,クロマチンリモデリング複合体サブユニットのノックダウンについては,さらに研究のスピードアップを図る必要がある。

今後の研究の推進方策

DPC損傷で停止した複製装置および転写装置の複製・転写継続機構の研究は概ね順調に進んでおり,in vitroおよびin vivo系を用いて研究を継続していく。クロマチンリモデリング複合体サブユニットのノックダウンについては,人員の投入等によりさらに研究のスピードアップを図る。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] T7 RNA polymerases backed up by covalently trapped proteins catalyze highly error prone transcription2012

    • 著者名/発表者名
      Nakano T.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 287 ページ: 6562-6572

    • DOI

      10.1074/jbc.M111.318410

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Repair and biochemical effects of DNA-protein crosslinks2011

    • 著者名/発表者名
      Ide H.
    • 雑誌名

      Mutation Research

      巻: 771 ページ: 113-122

    • DOI

      10.1016/j.mrfmmm.2010.12.007

    • 査読あり
  • [学会発表] Error prone transcription induced by DNA-protein crosslink damage2011

    • 著者名/発表者名
      井出博
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2011-12-15
  • [学会発表] DNA-タンパク質クロスリンク損傷の生成と生物影響2011

    • 著者名/発表者名
      井出博
    • 学会等名
      日本放射線影響学会54回大会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2011-11-18

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公開日: 2013-06-26  

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