大規模ゲノムシーケンスに基づく癌の個性の理解と分子標的の探索

2014 年度 実績報告書

• 研究領域: システム的統合理解に基づくがんの先端的診断、治療、予防法の開発
• 研究課題/領域番号: 22134006
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 小川 誠司 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (60292900)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2015-03-31
• キーワード: 大量並列シーケンス / がんゲノム / 腫瘍内多様性 / 分子標的

研究実績の概要

①がんのゲノムプロファイルの解析・新規分子標的の同定に関わる研究については、まず、1)成人T細胞白血病については次世代シーケンスを用いた統合的分子解析を行い(全ゲノム解析48例、全エクソン解析81例、RNAシーケンス57例、メチル化アレイ解析99例)、ATLの発症に関わる主要な遺伝子変異・ゲノム異常の全体像を明らかにした。また、2)低悪性度グリオーマについては、全体で756例に関する詳細なゲノム解析を行うことにより、同腫瘍のゲノム異常・DNAメチル化異常の全体像の解明をおこなった(Nature Genetics 2015)。
②がんの腫瘍内多様性の理解に関する研究については、全経過12年にわたって系統的に採取された症例を含む493例の再生不良性貧血について、詳細な遺伝子解析によるクローン進化と多様性の解析を行い、MDSの発症に至るクローン進化とこれに関わる重要な遺伝子変異を明らかにした(NEJM, in press)。また、食道癌の前駆病変について、高いシーケンス深度による微小クローン集団の解析を行い、腫瘍の発症にともなってしばしば正常組織にクローン進化が生じていることが明らかとなった。
③新規予後予測、治療の層別化、新規治療法の開発に関わる研究に関しては、低悪性度グリオーマ756例について、上記①で同定された変異と予後、病型、転移・再発の有無を含めた生物学的・臨床的パラメータとの相関を解析した。その結果、低悪性度グリオーマは遺伝子変異その他のゲノム異常の観点から3つの亜型に分類できること、またこれらは臨床的特徴・予後の点から独立した亜型であることが明らかとなった。これらの知見は同腫瘍の診断・治療選択に対して有用な可能性が示唆された。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] Somatic mutations and clonal hematopoiesis in aplastic anemia. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yoshizato T, Dumitriu B, Hosokawa K, Makishima H, Yoshida K, Townsley D, Sato-Otsubo A, Sato Y, Liu D, Hiromichi Suzuki H, Wu CO, Shiraishi Y, Clemente MJ, Kataoka K, Shiozawa Y, Okuno Y, Chiba K, Tanaka H, Nagata Y, Katagiri T, Kon A, Sanada M, Scheinberg P, Miyano S, Maciejewski JP, Nakao S, Young NS, Ogawa S.
  • 雑誌名: NEJM. 巻: 印刷中 ページ: 印刷中
  • DOI: inpress
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutational landscape and clonal architecture in grade II and III gliomas (2015)
  • 著者名/発表者名: Suzuki H, Aoki K, Natsume A, Ogawa S. et al.
  • 雑誌名: Nat Genet. 巻: 47 ページ: 458–468
  • DOI: 10.1038/ng.3273
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] Clonal Dynamics of Secondary MDS Derived from Aplastic Anemia (2015)
  • 著者名/発表者名: 小川誠司
  • 学会等名: 第30回名古屋癌治療国際シンポジウム
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2015-02-14 – 2015-02-14
  • 招待講演
• [学会発表] 成人Ｔ細胞性白血病の統合的分子解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小川誠司
  • 学会等名: 平成26年度文部科学省新学術領域 がん研究分野の特性等を踏まえた支援活動公開シンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-01-28 – 2015-01-28
• [学会発表] Chronological Analysis of Clonal Evolution in Acquired Aplastic Anemia (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshizato T, Ogawa S. et al.
  • 学会等名: 56th American Society of Hematology Annual meeting
  • 発表場所: San Francisco, USA
  • 年月日: 2014-12-08 – 2014-12-08
• [学会発表] low grade gliomaにおける時間的空間的なクローン進化説 (2014)
  • 著者名/発表者名: Aoki K, Ogawa S. et al.
  • 学会等名: 第32回日本脳腫瘍学会学術総会
  • 発表場所: 舞浜
  • 年月日: 2014-11-30 – 2014-11-30
• [学会発表] low grade gliomaにおける遺伝子変異の全貌 (2014)
  • 著者名/発表者名: 鈴木啓道,青木恒介,真田昌,大岡史治,本村和也,中村英夫,溝口昌弘,阿部竜也,村垣善浩,若林俊彦,小川誠司,夏目敦至
  • 学会等名: 第32回日本脳腫瘍学会学術集
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2014-11-30 – 2014-11-30
• [学会発表] Integrated molecular analysis of adult T-cell leukemia/lymphomas (2014)
  • 著者名/発表者名: 小川誠司
  • 学会等名: The 4th Japan-France Cancer Workshop
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2014-11-19 – 2014-11-19
  • 招待講演
• [学会発表] Mutational Landscape and Clonal Architecture in Low-grade Gliomas (2014)
  • 著者名/発表者名: Seishi Ogawa
  • 学会等名: FRONTIERS in Cancer Science 2014
  • 発表場所: シンガポール
  • 年月日: 2014-11-04 – 2014-11-04
  • 招待講演
• [学会発表] Complete chronological history of clonal evolution in sMDS from acquired aplastic anemia (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshizato T, Ogawa S. et al.
  • 学会等名: 第76回日本血液学会学術集会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2014-11-01 – 2014-11-01
• [学会発表] 全エクソンシークエンスを用いたlow gradegliomaにおけるクローン進化の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 鈴木啓道,青木恒介,大岡史治,本村和也,藤井正純,真田昌,中村英夫,溝口昌弘,阿部竜也,村垣善浩,若林俊彦,小川誠司,夏目敦至
  • 学会等名: 第73回 日本脳神経外科学会学術総会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-10-09 – 2014-10-09
• [学会発表] Chronological analysis of clonality in patients with SAA (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshizato T, Ogawa S. et al.
  • 学会等名: 第73回日本癌学会学術集会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-09-26 – 2014-09-26
• [学会発表] The landscape of somatic mutations in 760 cases with low-grade gliomas (2014)
  • 著者名/発表者名: Aoki K, Ogawa S. et al.
  • 学会等名: 第73回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-09-26 – 2014-09-26
• [学会発表] 低悪性度神経膠腫における全エクソーム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 鈴木啓道,夏目敦至,青木恒介,佐藤悠佑,吉田健一,永田安伸,白石友一,塩澤裕介,真田昌,宮野悟,若林俊彦,小川誠司
  • 学会等名: 第73回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-09-26 – 2014-09-26
• [学会発表] 低悪性度神経膠腫における全エクソーム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 鈴木啓道,夏目敦至,青木恒介,佐藤悠佑,白石友一,塩澤裕介,吉田健一,永田安伸,真田昌,宮野悟,若林俊彦,小川誠司
  • 学会等名: 平成26年度がん若手研究者ワークショップ
  • 発表場所: 茅野
  • 年月日: 2014-09-03 – 2014-09-03
• [学会発表] Chronological analysis of clonal evolution in acquired aplastic anemia (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshizato T, Ogawa S. et al.
  • 学会等名: The 18th Congress of European Hematology Association
  • 発表場所: Milan, Italy
  • 年月日: 2014-06-14 – 2014-06-14