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Phodopus属ハムスターの種間雑種とニワトリ－ウズラ間の属間雑種の発育不全に着目し、トランスクリプトーム解析、メチル化解析によって、その原因となる遺伝子の発現変動とゲノムDNAのメチル化変動を明らかにした。異質四倍体であるアフリカツメガエル（Xenopus laevis）の同祖染色体のゲノム構成の詳細を明らかにし、さらに二倍体種のネッタイツメガエル（X. tropicalis）のゲノム情報との比較によって、アフリカツメガエルのゲノム進化の過程を解明した。さらに、ニホンウズラのゲノムアセンブルデータをさらに高度化し、ゲノムブラウザを開設することによって、ウズラゲノム情報の提供にも貢献した。
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