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2011 年度 実績報告書

同一種内異種ゲノムが引き起こすインセスト回避と生殖隔離の分子機構

計画研究

研究領域ゲノム・遺伝子相関:新しい遺伝学分野の創成
研究課題/領域番号 23113006
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

研究機関大阪教育大学

研究代表者

鈴木 剛  大阪教育大学, 教育学部, 准教授 (10314444)

研究分担者 諏訪部 圭太  三重大学, 大学院・生物資源学研究科, 准教授 (50451612)
渡辺 正夫  東北大学, 大学院・生命科学研究科, 教授 (90240522)
キーワード遺伝学 / 高等植物 / インセスト回避 / 生殖隔離 / 低分子RNA / 雄性生殖器官 / 遺伝子機能 / 分子間相互作用
研究概要

本研究組織では、アブラナ科植物の自家不和合性を人為的に制御し、インセスト回避に関わる分子機構を明らかにする。また、自家不和合性に関連した雌雄間の相互作用が同一種内で生殖隔離を生みだしている現象について、これを制御する遺伝子の機能と進化を調べることにより、「遺伝子機能の多様化」との関連を明らかにする。さらに、イネを用いて雄性生殖器官特異的低分子RNAを網羅的に解析することにより、「エピジェネティックな制御」による雌雄間での「ゲノム・遺伝子相関」に関わる分子の相互作用の理解を目指す。平成23年度は、以下の3つのプロジェクトについて、基盤となる実験を開始した。「シロイヌナズナを用いたインセスト回避機構解明」については、ハプロタイプBにおいて、突然変異により機能喪失している内在SRKの特徴について調査し、コード領域内の突然変異を明らかにした。今後は、変異を修復した正常型SRKをハプロタイプBシロイヌナズナに遺伝子導入することで自家不和合性が復元するかを調査する。「同一種内異種ゲノムが引き起こす新規生殖隔離遺伝子の実態解明」に関しては、Brassica rapaの同一種内新規生殖隔離に関わると考えられる柱頭側認識因子(SUI)、花粉側認識因子(PUI)について、相補性試験のための形質転換体を作出した。来年度以降、表現型の調査を行う。発現解析の結果、SUIは柱頭特異的、PUIは菊特異的な発現を示すことが分かり、また、PUIはゲノム中に重複していること明らかになった。「雌雄ゲノム・遺伝子相関因子の網羅的解析」については、イネ葯の発達ステージを4ステージに区分し、15~30塩基長のRNAを単離し、次世代シーケンサーに供試した。その結果、繭において全部で約4千万個のRNA塩基配列情報を獲得した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

「シロイヌナズナを用いたインセスト回避機構解明」「同一種内異種ゲノムが引き起こす新規生殖隔離遺伝子の実態解明」「雌雄ゲノム・遺伝子相関因子の網羅的解析」の3つのプロジェクトに関して、それぞれ基盤となる実験を開始することができ、来年度に向けた研究基盤を作ることができたため。

今後の研究の推進方策

今後の研究として、「シロイヌナズナを用いたインセスト回避機構解明」については、変異を修復した正常型SRKをハプロタイプBシロイヌナズナに遺伝子導入することで自家不和合性が復元するかを調査する。「同一種内異種ゲノムが引き起こす新規生殖隔離遺伝子の実態解明」に関しては、形質転換体の表現型調査を行い、高感度マッピングを行うとともに、様々なB.rapa系統を用いた多型解析を行い、遺伝子進化を考察する。「雌雄ゲノム・遺伝子相関因子の網羅的解析」については、得られた塩基配列情報をバイオインフォマティックス解析し、雌雄ゲノム・遺伝子相関因子のエピジェネティック制御に関する情報基盤を構築する。

  • 研究成果

    (28件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 9件) 学会発表 (16件) 図書 (3件)

  • [雑誌論文] Random BAC FISH of monocot plants reveals differential distribution of repetitive DNA elements in small and large chromosome species2012

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, G., Ogaki, Y., Hokimoto, N., et al
    • 雑誌名

      Plant Cell Rep

      巻: 31 ページ: 621-628

    • DOI

      DOI:10.1007/s00299-011-1178-8

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comprehensive network analysis of anther-expressed genes in rice by the combination of 33 laser microdissection and 143 spatiotemporal microarrays2011

    • 著者名/発表者名
      Aya, K., Suzuki, G., Suwabe, K., et al
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 6 ページ: e26162

    • DOI

      doi:10.1371/journal.pone.0026162

    • 査読あり
  • [雑誌論文] OryzaExpress : An integrated database of omics information and gene expression networks in rice2011

    • 著者名/発表者名
      Hamada, K, Hongo, K., Suwabe, K., et al
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol

      巻: 52 ページ: 220-229

    • DOI

      doi:10.1093/pcp/pcq195

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Auxin depletion in barley plants under high temperature conditions represses DNA proliferation in organelles and nuclei via transcriptional alterations2011

    • 著者名/発表者名
      Oshino, T., Miura, S., Kikuchi, S., Hamada, K., Yano, K., Watanabe, M., Higashitani, A.
    • 雑誌名

      Plant Cell Environ

      巻: 34 ページ: 284-290

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-3040.2010.02242.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] CPD photolyase repairs ultraviolet-B-induced CPDs in rice chloroplast and mitochondorial DNA2011

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, M., Teranishi, M., Ishida, H., Kawasaki, J., Takeuchi, A., Yamaya, T., Watanabe, M., Makino, A., Hidema, J.
    • 雑誌名

      Plant J

      巻: 66 ページ: 433-442

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-313X.2011.04500.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sexual reproduction is the default mode in apomictic Hieracium subgenus Pilosella where two dominant loci function to enable apomixis2011

    • 著者名/発表者名
      Koltunow, A.M.G., Johnson, S.D., Rodrigues, J.C.M., et al
    • 雑誌名

      Plant J

      巻: 66 ページ: 890-902

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-313X.2011.04556.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Coexistence of NtCENH3 and two retrotransposons in tobacco centromeres2011

    • 著者名/発表者名
      Nagaki, K., Shibata, F., Suzuki, G., Kanatani, A., Ozaki, S., Hironaka, A., Kashihara, K., Murata, M.
    • 雑誌名

      Chromosome Res

      巻: 19 ページ: 591-605

    • DOI

      DOI:10.1007/s10577-011-9219-2

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chromosomes carrying meiotic avoidance loci in three apomictic eudicot Hieracium subgenus Pilosella species share structural features with two monocot apomicts2011

    • 著者名/発表者名
      Okada, T., Ito, K., Johnson, S.D., Oelkers, K., Suzuki, G., Houben, A., Mukai, Y., Koltunow, A.M.G.
    • 雑誌名

      Plant Physiol

      巻: 157 ページ: 1327-1341

    • DOI

      10.1104/pp.111.181164

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transgenic rice plants harboring the grain hardness-locus region of Aegilops tauschii2011

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, G., Wada, H., Goto, H., Nakano, A., Oba, H., Deno, T., Rahman, S., Mukai, Y.
    • 雑誌名

      Plant Cell Rep

      巻: 30 ページ: 2293-2301

    • DOI

      DOI:10.1007/s00299-011-1134-7

    • 査読あり
  • [学会発表] NGS Transcriptome of Small RNAs in Rice Male Gametophyte Development2012

    • 著者名/発表者名
      Tomoaki Fujioka, 他
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XX
    • 発表場所
      San Diego, CA, USA
    • 年月日
      20120114-20120118
  • [学会発表] Improving the Agrobacterium-Mediated Transformation Protocol for Brachypodium Distachyon2012

    • 著者名/発表者名
      Seiya Goto, 他
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XX
    • 発表場所
      San Diego, CA, USA
    • 年月日
      20120114-20120118
  • [学会発表] The pollen specific LIM gene for pollen germination and pollen tube growth in Arabidopsis thaliana2012

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Sudo, 他
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XX
    • 発表場所
      San Diego, CA, USA
    • 年月日
      20120114-20120118
  • [学会発表] Laser Microdissection-Next Generation Sequence Transcriptome Analysis in the Papilla Cell of Brassica rapa2012

    • 著者名/発表者名
      Masaaki Osaka, 他
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XX
    • 発表場所
      San Diego, CA, USA
    • 年月日
      20120114-20120118
  • [学会発表] Analysis of Pollen Behavior on Brassica Self-Incompatibility2012

    • 著者名/発表者名
      Kenichiro Hiroi, 他
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XX
    • 発表場所
      San Diego, CA, USA
    • 年月日
      20120114-20120118
  • [学会発表] OryzaExpress : An integrated Database for Gene Expression Networks in Rice2012

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Hamada, 他
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XX
    • 発表場所
      San Diego, CA, USA
    • 年月日
      20120114-20120118
  • [学会発表] イネ雄性生殖器官におけるsmall RNAの網羅的解析2012

    • 著者名/発表者名
      藤岡智明, 他
    • 学会等名
      日本育種学会第121回講演会
    • 発表場所
      宇都宮大学
    • 年月日
      2012-03-30
  • [学会発表] レーザーマイクロダイセクションによるアブラナ科乳頭細胞の単離法の構築2012

    • 著者名/発表者名
      松田智貴, 他
    • 学会等名
      日本育種学会第121回講演会
    • 発表場所
      宇都宮大学
    • 年月日
      2012-03-29
  • [学会発表] LM-NGS法によるアブラナ科乳頭細胞のトランスクリプトーム解析2012

    • 著者名/発表者名
      大坂正明, 他
    • 学会等名
      日本育種学会第121回講演会
    • 発表場所
      宇都宮大学
    • 年月日
      2012-03-29
  • [学会発表] 自家不和合性、植物の生殖2012

    • 著者名/発表者名
      渡辺正夫
    • 学会等名
      県立鶴岡南高等学校理数科・特別講義
    • 発表場所
      山形県立鶴岡南高等学校
    • 年月日
      2012-03-17
  • [学会発表] 高等植物の自家不和合性2012

    • 著者名/発表者名
      渡辺正夫
    • 学会等名
      県立宮城第一高等学校・出前講義
    • 発表場所
      宮城県立宮城第一高等学校
    • 年月日
      2012-02-23
  • [学会発表] アブラナ科植物自家不和合性反応における花粉動態の解析2011

    • 著者名/発表者名
      広井健一郎, 他
    • 学会等名
      日本育種学会第120回講演会
    • 発表場所
      福井県立大学
    • 年月日
      20110923-20110924
  • [学会発表] 花の不思議な世界--りんごの花からりんごができるまで??--2011

    • 著者名/発表者名
      渡辺正夫
    • 学会等名
      市立美須賀小学校・市立立花小学校・ふるさと出前講義
    • 発表場所
      今治市立美須賀小学校・今治市立立花小学校
    • 年月日
      2011-11-28
  • [学会発表] 2年生特別講義(自家不和合性)2011

    • 著者名/発表者名
      渡辺正夫
    • 学会等名
      県立秋田南高等学校・集中講義
    • 発表場所
      秋田県立秋田南高等学校
    • 年月日
      2011-10-29
  • [学会発表] 自己と非自己の花粉を識別する植物の不思議:自家不和合性2011

    • 著者名/発表者名
      渡辺正夫
    • 学会等名
      県立小松高等学校・SSH集中講義
    • 発表場所
      石川県立小松高等学校
    • 年月日
      2011-10-07
  • [学会発表] 花の不思議な世界--りんごの花からリンゴができるまで??--2011

    • 著者名/発表者名
      渡辺正夫
    • 学会等名
      木町通小学校・5年生出前講義
    • 発表場所
      仙台市立木町通小学校
    • 年月日
      2011-09-15
  • [図書] The use of omics databases for plants. Sustainable agriculture and new biotechnologies2011

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, A., Suwabe, K., Yano, K.
    • 総ページ数
      533
    • 出版者
      CRC Press
  • [図書] 植物科学分野の文献調査法、農学・生命学のための学術情報リテラシー2011

    • 著者名/発表者名
      渡辺正夫
    • 総ページ数
      122
    • 出版者
      朝倉書店
  • [図書] 自家不和合性関連用語11項目,生物学辞典2011

    • 著者名/発表者名
      渡辺正夫、高山誠司、礒貝彰
    • 総ページ数
      1615
    • 出版者
      東京化学同人

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公開日: 2013-06-26  

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