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2015 年度 実績報告書

レトロトランスポゾンがもたらす非コードDNA領域のクロマチン構造変化

計画研究

研究領域ゲノムを支える非コードDNA領域の機能
研究課題/領域番号 23114006
研究機関東京工業大学

研究代表者

梶川 正樹  東京工業大学, 生命理工学研究科, 講師 (90361766)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2016-03-31
キーワード転移因子 / レトロトランスポゾン / DNAメチル化
研究実績の概要

レトロトランスポゾンは自身RNA配列を逆転写反応でコピーし宿主ゲノムに挿入することでそのコピー数を増幅する寄生性のDNA配列である。レトロトランスポゾンの転移・増幅は、宿主ゲノムの立場に立てば挿入変異である。すなわちレトロトランスポゾンは、内生のゲノム変異原である。このように危険な存在であるにもかかわらず、レトロトランスポゾンはほぼすべての真核生物のゲノム中に存在し、宿主ゲノムと共に存在している。加えて高等真核生物においては、そのかなりの領域(例えば哺乳類ではその約半分)がレトロトランスポゾンで構成されている。我々は、このレトロトランスポゾンが宿主ゲノムの遺伝子発現制御やその成り立ちにどのような影響を及ぼしているのか明らかにすることを目的にしている。本年度は、ゼブラフィッシュ受精卵のゲノムDNA中に人工転移させたレトロトランスポゾン配列のエピゲノム情報を世代を超えて解析した。その結果、新規転移したレトロトランスポゾン配列が抑制性のエピゲノム修飾を受けないことを発見した。これは、内生に既に存在するレトロトランスポゾンがエピゲノム修飾により抑制されているのとは対照的である。我々は、この新規転移レトロトランスポゾンの転写活性化状態が、世代を超えて、子および孫世代に伝わること、この転写活性化には、自身配列のプロモーター領域配列が必須であることを見出した。また、内生レトロトランスポゾンの転写が、ある特定の組織で高くなる現象も発見した。これらの知見は、レトロトランスポゾンが宿主ゲノムの発現制御に及ぼす影響を解析する上で有用である。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (1件)

すべて 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件)

  • [雑誌論文] LINE retrotransposition and host DNA repair machinery.2015

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi K, Kajikawa M, Okada N.
    • 雑誌名

      Mob Genet Elements.

      巻: 5 ページ: 92-97

    • DOI

      10.1080/2159256X.2015.1096998

    • 査読あり

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公開日: 2017-01-06  

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