ポストゲノム解析による感染体ー宿主ネットワーク

2016 年度 実績報告書

• 研究領域: ウイルス感染現象における宿主細胞コンピテンシーの分子基盤
• 研究課題/領域番号: 24115007
• 研究機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所
• 研究代表者: 夏目 徹 国立研究開発法人産業技術総合研究所, その他部局等, 研究センター長 (00357683)
• 研究分担者: 伊庭 英夫 千葉大学, 真菌医学研究センター, 特任教授 (60111449)
• 研究期間 (年度): 2012-06-28 – 2017-03-31
• キーワード: 質量分析 / 新生タンパク質 / HSV-1ウイルス / インフルエンザウイルス / ウイルス複製 / miRNA / ゴルジ装置 / 遺伝子抑制ネットワーク

研究実績の概要

夏目チームの目的は、プロテオミクス技術を用い、ウイルス感染をタンパク質レベルで包括的に理解することである。本年度は、東京大学・川口チームと共同研究を行い、質量分析により見出されたHSV-1ウイルスの新規タンパク質候補5種類のうち3種類について、確認検出用のタグ配列をウイルスゲノム組み込んだ組み替えウイルス作成、ウイルス感染時、実際にタンパク質として発現していることを確認した。さらに、検出された3種類の新規タンパク質のうち少なくとも１種類については、HSV-1がもつウイルス病原性に関わることを明らかとした。また、筑波大学・永田チームと共同研究を行い、質量分析により見出されたインフルエンザウイルスNS1タンパク質結合タンパク質Xについて、上皮細胞においては、インフルエンザに対する重要な宿主応答因子であるTNFαの発現抑制に関わっており、NS1はタンパク質Xの機能を増強する形でTNFαの発現抑制を行なっていることが明らかとした。
伊庭チームの目的は、広範なウイルスに対する宿主コンピテンシー制御活性をもつmiR-199-3p/-5pに注目して、その抑制活性の分子機構を探る点にある。本年度は、miR-199a/Brm/EGRが形成する遺伝子抑制ネットワークに立ち帰ってその全体像をとらえ、HSV-1に限らず広くウイルスに対して上皮細胞が内蔵するコンピテンシーの理解を進めることとした。特に不明であったBrmがEGR1/2/3/4遺伝子群の発現を抑制する機構に注目して、上皮細胞ではBrmの存在がMKL1/2に依存した転写因子SRFの標的遺伝子群の活性を抑制していること、EGRファミリー遺伝子群はこのようなSRF標的遺伝子の代表例ととらえられることを示した。さらにBrmはMKL1/2の発現に影響を与えてはおらず、MKL1/2タンパク質の細胞核内への局在を阻害することを示した。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

備考

伊庭先生所属千葉大学真菌医学研究センターホームページ: http://www.pf.chiba-u.ac.jp/

研究成果

• [雑誌論文] The role of the SWI/SNF chromation remodeling complex in maintaining the stemness of glioma initiating cells (2017)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Hiramatsu, Kazuyuki Kobayashi, Kyousuke Kobayashi, Takeshi Hraguchi, Yasushi Ino, Tomoki Toda ＆ Hideo Iba
  • 雑誌名: Sienctific Reports 巻: 7(1) ページ: 889
  • DOI: 10.1038/s41598-017-00982-3
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Robotic crowd biology with Maholo LabDroids. (2017)
  • 著者名/発表者名: YachieＮ,Robotic Biology Consortium, NatsumeＴ
  • 雑誌名: Nat Biotechnol. 巻: 35(4): ページ: 310-312.
  • DOI: 10.1038/nbt.3758.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A large-scale targeted proteomics assay resource based on an in vitro human proteome. (2017)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto M, Matsuzaki F, Oshikawa K, Goshima N, Mori M, Kawamura Y, Ogawa K, Fukuda E, Nakatsumi H, Natsume T, Fukui K, Horimoto K, Nagashima T, Funayama R, Nakayama K, Nakayama KI.
  • 雑誌名: Nat Methods 巻: 14(3) ページ: 251-258.
  • DOI: 10.1038/nmeth.4116.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] TMED10 Protein Interferes with Transforming Growth Factor (TGF)-β Signaling by Disrupting TGF-β Receptor Complex Formation. (2017)
  • 著者名/発表者名: Nakano N, Tsuchiya Y, Kako K, Umezaki K, Sano K, Ikeno S, Otsuka E, Shigeta M, Nakagawa A, Sakata N, Itoh F, Nakano Y, Iemura SI, van Dinther M, Natsume T, Ten Dijke P, Itoh S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 292(10) ページ: 4099-4112
  • DOI: 10.1074/jbc.M116.769109.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] USP15 attenuates IGF-I signaling by antagonizing Nedd4-induced IRS-2 ubiquitination. (2016)
  • 著者名/発表者名: Fukagai K, Waku T, Chowdhury AM, Kubo K, Matsumoto M, Kato H, Natsume T, Tsuruta F, Chiba T, Taniguchi H, Kobayashi A.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 478(1) ページ: 363-70.
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2017.01.101.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Functional profiling of asymmetrically-organized human CCT/TRiC chaperonin. (2016)
  • 著者名/発表者名: Araki K, Suenaga A, Kusano H, Tanaka R, Hatta T, Natsume T, Fukui K.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun. 巻: 481(3-4) ページ: 232-238
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.10.120.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Redox Sensitivities of Global Cellular Cysteine Residues under Reductive and Oxidative Stress. (2016)
  • 著者名/発表者名: Araki K, Kusano H, Sasaki N, Tanaka R, Hatta T, Fukui K, Natsume T.
  • 雑誌名: J Proteome Res. 巻: 15(8) ページ: 2548-59.
  • DOI: 10.1021/acs.jproteome.6b00087.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] WDR26 is a new partner of Axin1 in the canonical Wnt signaling pathway. (2016)
  • 著者名/発表者名: Goto T, Matsuzawa J, Iemura SI, Natsume T, Shibuya H．
  • 雑誌名: FEBS Lett 巻: 590(9) ページ: :1291-1303
  • DOI: 10.1002/1873-3468.12180.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Directed Evolution of a Cyclized Peptoid-Peptide Chimera against a Cell-Free Expressed Protein and Proteomic Profiling of the Interacting Proteins to Create a Protein-Protein Interaction Inhibitor. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kawakami T, Ogawa K, Hatta T, Goshima N, Natsume T．
  • 雑誌名: ACS Chem Biol 巻: 11(6) ページ: 1569-77
  • DOI: 10.1021/acschembio.5b01014.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The C-terminal cytoplasmic tail of hedgehog receptor Patched1 is a platform for E3 ubiquitin ligase complexes. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yamaki Y, Kagawa H, Hatta T, Natsume T, Kawahara H.
  • 雑誌名: Mol Cell Biochem 巻: 414(1-2) ページ: 1-12.
  • DOI: 10.1007/s11010-015-2643-4.
  • 査読あり / オープンアクセス