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2016 年度 実績報告書

タンパク質の分泌を駆動する反復モータの作動原理の解明

計画研究

研究領域運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性
研究課題/領域番号 24117003
研究機関京都大学

研究代表者

森 博幸  京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 准教授 (10243271)

研究期間 (年度) 2012-06-28 – 2017-03-31
キーワードSecDF / プロトン駆動力 / タンパク質膜透過 / SecA ATPase / 細菌
研究実績の概要

細菌のタンパク質膜透過には、必須の駆動モーターSecA ATPase, SecYEGトランスロコンに加え、膜タンパク質複合体SecDFも重要な役割を果たす。SecDFは細胞質膜を挟んで形成されるプロトン駆動力 (PMF)を用いて、輸送基質タンパク質を引っ張り出すとのモデルを提案しているが、基質タンパク質が結合する正確な部位と、PMFを用いてどのように膜透過が駆動されているかの詳細は不明である。
上記問題を明らかにする目的で、SecDの非細胞質ドメイン(P1ドメイン)を対象とした部位特異的in vivo光架橋実験を行った。この手法は、変異型tRNA合成酵素と、変異型 tRNAを発現する細胞を用いることで、任意の位置に導入したamberコドンの部位に光反応性アミノ酸アナログpBPAを導入することのできる実験システムを利用した物で、生きた細胞内の一過的相互作用変化を高い空間分解能で測定することができる画期的な方法である。この手法を用いて得られた結果と変異解析の結果から、P1 domainの内部に存在する保存領域がSecD機能に重要であり、基質タンパク質MBPに近接することから、この部位が膜透過途上の基質タンパク質結合部位として働く新たなモデルを提案した。この結果は、共同研究の結果得られたSecDFの立体構造解析の結果とも合致する。
また、P1 ドメインが持つ2つのサブドメイン(Head, base)の近接部位に導入したpBPAの架橋形成効率を指標とした解析から、PMFを消失させることで、P1 head-base間の相互作用が大きく変化することを見出した。PMFにより駆動される膜透過能昂進のメカニズム解明に向けて、大きな進展と期待している。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2017 2016

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 2件、 招待講演 5件)

  • [雑誌論文] Tunnel formation inferred from the I form structures of the proton-driven protein secretion motor SecDF2017

    • 著者名/発表者名
      Furukawa, A., Yoshikaie, K., Mori, T., Mori, H., Morimoto, Y. V., Sugano, Y., Iwaki, S., Minamino, T., Sugita, Y., Tanaka, Y. and Tsukazaki, T.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] ビブリオ属細菌における二つのタンパク質膜透過促進因子の生理的意義と使い分け機構2017

    • 著者名/発表者名
      石井英治、森 博幸
    • 雑誌名

      医学の歩み

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

  • [雑誌論文] A novel SRP recognition sequence in the homeostatic control region of heat shock transcription factor sigma 322016

    • 著者名/発表者名
      Miyazaki, R., Yura, T., Suzuki, T. Dohmae, N., Mori, H. and Akiyama, Y.
    • 雑誌名

      Scientfic reports

      巻: 6 ページ: 24147

    • DOI

      doi:10.1038/srep24147

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] タンパク質膜透過を駆動するモータータンパク質のスナップショット2016

    • 著者名/発表者名
      古川 新 , 吉海江 国仁 , 森 貴治 , 森 博幸 , 森本 雄祐 , 菅野 泰功 , 岩木 薫大 , 南野 徹 , 杉田 有治 , 田中 良樹 , 塚崎 智也
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会シンポジウム「次世代研究者による動的構造生命」
    • 発表場所
      筑波
    • 年月日
      2016-11-25 – 2016-11-27
    • 招待講演
  • [学会発表] Nascent chain-monitored remodeling of the Sec machinery for salinity adaptation of marine bacteria.2016

    • 著者名/発表者名
      Mori, H., Ishii, E., Chiba, S., Sakashita, S., Ito, K. & Akiyama, Y.
    • 学会等名
      NASCENT CHAIN BIOLOGY
    • 発表場所
      山梨
    • 年月日
      2016-09-01 – 2016-09-03
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 2つの反復モーターによるタンパク質膜透過駆動メカニズム2016

    • 著者名/発表者名
      森 博幸
    • 学会等名
      第6回分子モーター討論会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2016-07-24 – 2016-07-25
    • 招待講演
  • [学会発表] Environmental adaptation of marine Vibrio by nascent chain-mediated remodeling of protein export machinery2016

    • 著者名/発表者名
      Mori, H.
    • 学会等名
      RNA2016 satellite-symposium “Nascent biology and Ribosome functions”
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2016-06-27 – 2016-06-27
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 部位特異的in vivo光架橋法を用いた生細胞内の動的タンパク質間相互作用解析2016

    • 著者名/発表者名
      森 博幸、宮崎亮次、町田裕紀子、三登一八、何あゆみ、秋山光市郎、大門康志、舛井千草、塚崎智也、成田新一郎、秋山芳展
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「人工的にカスタマイズされた蛋白質による生命現象の再構成」
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2016-06-07 – 2016-06-09
    • 招待講演

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公開日: 2018-01-16  

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